Changeset 4791 for trunk


Ignore:
Timestamp:
Feb 2, 2021 9:37:33 AM (2 years ago)
Author:
toby
Message:

docs chapter numbering

Location:
trunk
Files:
1 added
3 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/GSASIIindex.py

    r4466 r4791  
    787787    return len(HKL),M20,X20,Aref,Vref,Z
    788788   
    789 def refinePeaks(peaks,ibrav,A,ifX20=True):
     789def refinePeaks(peaks,ibrav,A,ifX20=True,sg_type=None):
    790790    'needs a doc string'
    791791    dmin = getDmin(peaks)
    … …  
    795795    OK = False
    796796    tries = 0
    797     HKL = G2lat.GenHBravais(dmin,ibrav,A)
     797    sg_type = G2lat.make_sgtype(ibrav)
     798    HKL = G2lat.GenHBravais(dmin,ibrav,A,sg_type)
    798799    while len(HKL) > 2 and IndexPeaks(peaks,HKL)[0]:
    799800        Pwr = pwr - (tries % 2)
    … …  
    810811            continue
    811812        try:
    812             HKL = G2lat.GenHBravais(dmin,ibrav,A)
     813            HKL = G2lat.GenHBravais(dmin,ibrav,A,sg_type)
    813814        except FloatingPointError:
    814815            A = oldA
    … …  
    919920    return A
    920921
    921 def DoIndexPeaks(peaks,controls,bravais,dlg,ifX20=True):
     922def DoIndexPeaks(peaks,controls,bravais,dlg,ifX20=True,
     923            timeout=None,M20_min=2.0,X20_max=None,return_Nc=False):
    922924    'needs a doc string'
    923925   
    … …  
    963965                        N2 = 0
    964966                        while N2 < N2s[ibrav]:                                  #Table 2 step (iii)               
     967                            if timeout and time.time() - begin > timeout:
     968                                GoOn = False
     969                                break
     970
    965971                            if ibrav > 2:
    966972                                if not N2:
    … …  
    993999                                    a,b,c,alp,bet,gam = G2lat.A2cell(A)
    9941000                                    V = G2lat.calc_V(A)
    995                                     if M20 >= 2.0:
     1001                                    if (
     1002                                        (M20 >= M20_min) and
     1003                                        (X20_max is None or X20 <= X20_max)
     1004                                    ):
    9961005                                        cell = [M20,X20,ibrav,a,b,c,alp,bet,gam,V,False,False]
     1006                                        if return_Nc: cell.append(Nc)
    9971007                                        newcell = np.array(cell[3:10])
    9981008                                        if not np.allclose(newcell,lastcell):
    999                                             print ("%10.3f %3d %3d %10.5f %10.5f %10.5f %10.3f %10.3f %10.3f %10.2f %10.2f"  \
    1000                                                 %(M20,X20,Nc,a,b,c,alp,bet,gam,V,V1))
     1009                                            print ("%10.3f %3d %3d %10.5f %10.5f %10.5f %10.3f %10.3f %10.3f %10.2f %10.2f %s"
     1010                                                %(M20,X20,Nc,a,b,c,alp,bet,gam,V,V1,bravaisNames[ibrav]))
    10011011                                            cells.append(cell)
    10021012                                        lastcell = np.array(cell[3:10])
    … …  
    10181028                                    V1 = cells[0][9]
    10191029                                else:
    1020                                     V1 = 25
     1030                                    V1 = controls[3]
    10211031                                ncMax += Nobs
    10221032                                cycle += 1

  • trunk/GSASIIlattice.py

    r4636 r4791  
    11141114    raise ValueError('non-standard Bravais lattice center=%s, cell=%s' % (center,system))
    11151115
    1116 def GenHBravais(dmin,Bravais,A):
     1116def GenHBravais(dmin,Bravais,A, sg_type=None):
    11171117    """Generate the positionally unique powder diffraction reflections
    11181118     
    … …  
    11391139           
    11401140    :param A: reciprocal metric tensor elements as [G11,G22,G33,2*G12,2*G13,2*G23]
     1141    :param sg_type: alternate specification for Bravais lattice used in CCTBX
    11411142    :return: HKL unique d list of [h,k,l,d,-1] sorted with largest d first
    11421143           

  • trunk/docs/source/index.rst

    r4789 r4791  
    2020
    2121.. toctree::
     22    :maxdepth: 2
     23    :numbered: 4
    2224
    23   packages.rst
    24   GSASII.rst
    25   GSASIIobj.rst
    26   GSASIIutil.rst
    27   GSASIIGUIr.rst
    28   GSASIIGUI.rst
    29   GSASIIstruc.rst
    30   GSASIImapvars.rst
    31   GSASIIimage.rst
    32   GSASIImath.rst
    33   GSASIIindex.rst
    34   GSASIIplot.rst
    35   GSASIIpwd.rst
    36   SAS.rst
    37   GSASIIscriptable.rst
    38   GSASIIscripts.rst
    39   imports.rst
    40   exports.rst
    41   G2tools.rst
    42 
    43 .. only:: html
    44 
    45           `General Index <./genindex.html>`_
    46 
    47           `Module Index <./py-modindex.html>`_
    48 
     25    packages.rst
     26    GSASII.rst
     27    GSASIIobj.rst
     28    GSASIIutil.rst
     29    GSASIIGUIr.rst
     30    GSASIIGUI.rst
     31    GSASIIstruc.rst
     32    GSASIImapvars.rst
     33    GSASIIimage.rst
     34    GSASIImath.rst
     35    GSASIIindex.rst
     36    GSASIIplot.rst
     37    GSASIIpwd.rst
     38    SAS.rst
     39    GSASIIscriptable.rst
     40    GSASIIscripts.rst
     41    imports.rst
     42    exports.rst
     43    G2tools.rst
     44    indices.rst
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.