Changeset 4315


Ignore:
Timestamp:
Feb 17, 2020 5:33:38 AM (20 months ago)
Author:
vondreele
Message:

more fixes to documentation tables.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/GSASIIobj.py

    r4313 r4315  
    114114  key            sub-key        explanation
    115115=============  ===============  ====================================================
    116 newCellDict    \                (dict) lattice parameters computed by
     116newCellDict    \                (dict) ith lattice parameters computed by
    117117                                :func:`GSASIIstrMath.GetNewCellParms`
    118 title          \                Name of gpx file(?) (str)
    119 variables      \                Values for all N refined variables
     118title          \                (str) Name of gpx file(?)
     119variables      \                (list) Values for all N refined variables
    120120                                (list of float values, length N,
    121121                                ordered to match varyList)
    122 sig            \                Uncertainty values for all N refined variables
     122sig            \                (list) Uncertainty values for all N refined variables
    123123                                (list of float values, length N,
    124124                                ordered to match varyList)
    125 varyList       \                List of directly refined variables
    126                                 (list of str values, length N)
    127 newAtomDict    \                dict with atom position values computed in
    128                                 :func:`GSASIIstrMath.ApplyXYZshifts` (dict)
    129 Rvals          \                R-factors, GOF, Marquardt value for last
    130                                 refinement cycle (dict)
    131 \              Nobs             Number of observed data points (int)
    132 \              Rwp              overall weighted profile R-factor (%, float)
    133 \              chisq            :math:`\sum w*(I_{obs}-I_{calc})^2`                               
     125varyList       \                (list of str values, length N) List of directly refined variables
     126                               
     127newAtomDict    \                (dict) atom position values computed in
     128                                :func:`GSASIIstrMath.ApplyXYZshifts`
     129Rvals          \                (dict) R-factors, GOF, Marquardt value for last
     130                                refinement cycle
     131\              Nobs             (int) Number of observed data points
     132\              Rwp              (float) overall weighted profile R-factor (%)
     133\              chisq            (float) :math:`\sum w*(I_{obs}-I_{calc})^2`                               
    134134                                for all data.
    135                                 Note: this is not the reduced :math:`\chi^2`. (float)
    136 \              lamMax           Marquardt value applied to Hessian diagonal
    137                                 (float)
    138 \              GOF              The goodness-of-fit, aka square root of
    139                                 the reduced chi squared. (float)
    140 covMatrix      \                The (NxN) covVariance matrix (np.array)
     135                                Note: this is not the reduced :math:`\chi^2`.
     136\              lamMax           (float) Marquardt value applied to Hessian diagonal
     137\              GOF              (float) The goodness-of-fit, aka square root of
     138                                the reduced chi squared.
     139covMatrix      \                (np.array) The (NxN) covVariance matrix
    141140=============  ===============  ====================================================
    142141
     
    158157  key         sub-key           explanation
    159158==========  ===============     =====================================================================================================
    160 General         \               Overall information for the phase (dict)
    161   \         3Dproj              projections for 3D pole distribution plots
    162   \         AngleRadii          Default radius for each atom used to compute
    163                                 interatomic angles (list of floats)
    164   \         AtomMass            List of masses for atoms
    165   \         AtomPtrs            list of four locations (cx,ct,cs & cu) to use to pull info
    166                                 from the atom records (list)
    167   \         AtomTypes           List of atom types
    168   \         BondRadii           Default radius for each atom used to compute
    169                                 interatomic distances (list of floats)
    170   \         Cell                List with 8 items: cell refinement flag (bool)
     159General         \               (dict) Overall information for the phase
     160  \         3Dproj              (list of str) projections for 3D pole distribution plots
     161  \         AngleRadii          (list of floats) Default radius for each atom used to compute
     162                                interatomic angles
     163  \         AtomMass            (list of floats) Masses for atoms
     164  \         AtomPtrs            (list of int) four locations (cx,ct,cs & cu) to use to pull info
     165                                from the atom records
     166  \         AtomTypes           (llist of str) Atom types
     167  \         BondRadii           (list of floats) Default radius for each atom used to compute
     168                                interatomic distances
     169  \         Cell                (list with 8 items) cell refinement flag (bool)
    171170                                a, b, c, (Angstrom, float)
    172171                                alpha, beta & gamma (degrees, float)
    173172                                volume (:math:`A^3`, float)
    174   \         Color               Colors for atoms (list of (r,b,g) triplets)
    175   \         Compare             dict of polygon comparison parameters
    176   \         Data plot type      data plot type ('Mustrain', 'Size' or
    177                                 'Preferred orientation') for powder data (str)
    178   \         DisAglCtls          Dict with distance/angle search controls,
     173  \         Color               (list of (r,b,g) triplets) Colors for atoms
     174  \         Compare             (dict) Polygon comparison parameters
     175  \         Data plot type      (str) data plot type ('Mustrain', 'Size' or
     176                                'Preferred orientation') for powder data
     177  \         DisAglCtls          (dDict) with distance/angle search controls,
    179178                                which has keys 'Name', 'AtomTypes',
    180179                                'BondRadii', 'AngleRadii' which are as above
     
    183182                                a multiplier for bond and angle search range
    184183                                [typically (0.85,0.85)].
    185   \         F000X               x-ray F(000) intensity (float)
    186   \         F000N               neutron F(000) intensity (float)
    187   \         Flip                dict of Charge flip controls
    188   \         HydIds              dict geometrically generated hydrogen atoms
    189   \         Isotope             dict of isotopes for each atom type
    190   \         Isotopes            dict of scattering lengths for each isotope
     184  \         F000X               (float) x-ray F(000) intensity
     185  \         F000N               (float) neutron F(000) intensity
     186  \         Flip                (dict) Charge flip controls
     187  \         HydIds              (dict) geometrically generated hydrogen atoms
     188  \         Isotope             (dict) Isotopes for each atom type
     189  \         Isotopes            (dict) Scattering lengths for each isotope
    191190                                combination for each element in phase
    192   \         MCSA controls       Monte Carlo-Simulated Annealing controls (dict)
    193   \         Map                 dict of map parameters
    194   \         Mass                Mass of unit cell contents in g/mol
    195   \         Modulated           bool True if phase modulated
    196   \         Mydir               directory of current .gpx file (str)
    197   \         Name                phase name (str)
    198   \         Type                'nuclear' or 'macromolecular' for now (str)
    199   \         NoAtoms             Number of atoms per unit cell of each type (dict)
    200   \         POhkl               March-Dollase preferred orientation direction
    201   \         Pawley dmin         maximum Q (as d-space) to use for Pawley
    202                                 extraction (float)
    203   \         Pawley dmax         minimum Q (as d-space) to use for Pawley
    204                                 extraction (float)
    205   \         Pawley neg wt       Restraint value for negative Pawley intensities
    206                                 (float)
    207   \         SGData              Space group details as a
    208                                 :ref:`space group (SGData) object <SGData_table>`
     191  \         MCSA controls       (dict) Monte Carlo-Simulated Annealing controls
     192  \         Map                 (dict) Map parameters
     193  \         Mass                (float) Mass of unit cell contents in g/mol
     194  \         Modulated           (bool) True if phase modulated
     195  \         Mydir               (str) Directory of current .gpx file
     196  \         Name                (str) Phase name
     197  \         NoAtoms             (dict) Number of atoms per unit cell of each type
     198  \         POhkl               (list) March-Dollase preferred orientation direction
     199  \         Pawley dmin         (float) maximum Q (as d-space) to use for Pawley extraction
     200  \         Pawley dmax         (float) minimum Q (as d-space) to use for Pawley extraction
     201  \         Pawley neg wt       (float) Restraint value for negative Pawley intensities
     202  \         SGData              (object <SGData_table>`) Space group details as a :ref:`space group (SGData)
    209203                                as defined in :func:`GSASIIspc.SpcGroup`.
    210   \         SH Texture          dict of spherical harmonic preferred orientation
    211                                 parameters
    212   \         Super               int dimension of super group (0,1 only)
    213   \         Type                str phase type (e.g. 'nuclear')
    214   \         Z                   dict of atomic numbers for each atom type
    215   \         doDysnomia          bool flag for max ent map modification via Dysnomia
    216   \         doPawley            bool Flag for Pawley intensity extraction
    217   \         vdWRadii            dict of van der Waals radii for each atom type
    218 ranId           \               unique random number Id for phase (int)
    219 pId             \               Phase Id number for current project (int).
    220 Atoms           \               Atoms in phase as a list of lists. The outer list
     204  \         SH Texture          (dict) Spherical harmonic preferred orientation parameters
     205  \         Super               (int) dimension of super group (0,1 only)
     206  \         Type                (str) phase type (e.g. 'nuclear')
     207  \         Z                   (dict) Atomic numbers for each atom type
     208  \         doDysnomia          (bool) flag for max ent map modification via Dysnomia
     209  \         doPawley            (bool) Flag for Pawley intensity extraction
     210  \         vdWRadii            (dict) Van der Waals radii for each atom type
     211ranId           \               (int) unique random number Id for phase
     212pId             \               (int) Phase Id number for current project.
     213Atoms           \               (list of lists) Atoms in phase as a list of lists. The outer list
    221214                                is for each atom, the inner list contains varying
    222215                                items depending on the type of phase, see
    223216                                the :ref:`Atom Records <Atoms_table>` description.
    224                                 (list of lists)
    225 Drawing         \               Display parameters (dict)
    226 \           Atoms               A list of lists with an entry for each atom
    227                                 that is plotted.
    228 \           Plane               list Controls for contour density plane display
    229 \           Quaternion          Viewing quaternion (4 element np.array)
    230 \           Zclip               clipping distance in Angstrom (float)
    231 \           Zstep               Step to de/increase Z-clip (float)
    232 \           atomPtrs            positions of x, type, site sym, ADP flag in Draw Atoms (list)
    233 \           backColor           background for plot as and R,G,B triplet
     217Drawing         \               (dict) Display parameters
     218\           Atoms               (list of lists) with an entry for each atom that is drawn
     219\           Plane               (list) Controls for contour density plane display
     220\           Quaternion          (4 element np.array) Viewing quaternion
     221\           Zclip               (float) clipping distance in A
     222\           Zstep               (float) Step to de/increase Z-clip
     223\           atomPtrs            (list) positions of x, type, site sym, ADP flag in Draw Atoms
     224\           backColor           (list) background for plot as and R,G,B triplet
    234225                                (default = [0, 0, 0], black).
    235                                 (list with three atoms)
    236 \           ballScale           Size of spheres in ball-and-stick display (float)
    237 \           bondList            dict with bonds
    238 \           bondRadius          Size of bonds in Angstrom (float)
    239 \           cameraPos           Viewing position in Angstrom for plot (float)
    240 \           contourLevel        map contour level in :math:`e/A^3` (float)
    241 \           contourMax          float map contour maximum
    242 \           depthFog            True if use depthFog on plot - set currently as False (bool)
    243 \           ellipseProb         Probability limit for display of thermal
    244                                 ellipsoids in % (float).
    245 \           magMult             float multiplier for magnetic moment arrows
    246 \           mapSize             float x & y dimensions of contourmap (fixed internally)
    247 \           modelView           4,4 array from openGL drawing transofmation matrix
    248 \           oldxy               previous view point (list with two floats)
    249 \           radiusFactor        Distance ratio for searching for bonds. ? Bonds
     226\           ballScale           (float) Radius of spheres in ball-and-stick display
     227\           bondList            (dict) Bonds
     228\           bondRadius          (float) Radius of binds in A
     229\           cameraPos           (float) Viewing position in A for plot
     230\           contourLevel        (float) map contour level in :math:`e/\\unicode{x212B}^3`
     231\           contourMax          (float) map contour maximum
     232\           depthFog            (bool) True if use depthFog on plot - set currently as False
     233\           ellipseProb         (float) Probability limit for display of thermal
     234                                ellipsoids in % .
     235\           magMult             (float) multiplier for magnetic moment arrows
     236\           mapSize             (float) x & y dimensions of contourmap (fixed internally)
     237\           modelView           (4,4 array) from openGL drawing transofmation matrix
     238\           oldxy               (list with two floats) previous view point
     239\           radiusFactor        (float) Distance ratio for searching for bonds. Bonds
    250240                                are located that are within r(Ra+Rb) and (Ra+Rb)/r
    251241                                where Ra and Rb are the atomic radii.
    252 \           selectedAtoms       List of selected atoms (list of int values)
    253 \           showABC             Flag to show view point triplet (bool). True=show.
    254 \           showHydrogen        Flag to control plotting of H atoms.
    255 \           showRigidBodies     Flag to highlight rigid body placement
    256 \           showSlice           flag to show contour map
    257 \           sizeH               Size ratio for H atoms (float)
    258 \           unitCellBox         Flag to control display of the unit cell.
    259 \           vdwScale            Multiplier of van der Waals radius for
    260                                 display of vdW spheres.
    261 \           viewDir             cartesian viewing direction (np.array with three
    262                                 elements)
    263 \           viewPoint           list of lists. First item in list is [x,y,z]
     242\           selectedAtoms       (list of int values) List of selected atoms
     243\           showABC             (bool) Flag to show view point triplet. True=show.
     244\           showHydrogen        (bool) Flag to control plotting of H atoms.
     245\           showRigidBodies     (bool) Flag to highlight rigid body placement
     246\           showSlice           (bool) flag to show contour map
     247\           sizeH               (float) Size ratio for H atoms
     248\           unitCellBox         (bool) Flag to control display of the unit cell.
     249\           vdwScale            (float) Multiplier of van der Waals radius for display of vdW spheres.
     250\           viewDir             (np.array with three floats) cartesian viewing direction
     251\           viewPoint           (list of lists) First item in list is [x,y,z]
    264252                                in fractional coordinates for the center of
    265253                                the plot. Second item list of previous & current
     
    267255RBModels        \               Rigid body assignments (note Rigid body definitions
    268256                                are stored in their own main top-level tree entry.)
    269 RMC             \               dict RMCProfile & rmcfull controls
    270 Pawley ref      \               Pawley reflections
    271 Histograms      \               A dict of dicts. The key for the outer dict is
     257RMC             \               (dict) RMCProfile & rmcfull controls
     258Pawley ref      \               (list) Pawley reflections
     259Histograms      \               (dict of dicts) The key for the outer dict is
    272260                                the histograms tied to this phase. The inner
    273261                                dict contains the combined phase/histogram
     
    275263                                size and strain parameters. The following are the
    276264                                keys to the inner dict. (dict)
    277 \           Babinet             For protein crystallography. Dictionary with two
     265\           Babinet             (dict) For protein crystallography. Dictionary with two
    278266                                entries, 'BabA', 'BabU'
    279 \           Extinction          Extinction parameter (list of float, bool)
    280 \           HStrain             Hydrostatic strain. List of two lists. The first is
     267\           Extinction          (list of float, bool) Extinction parameter
     268\           HStrain             (list of two lists) Hydrostatic strain. The first is
    281269                                a list of the HStrain parameters (1, 2, 3, 4, or 6
    282270                                depending on unit cell), the second is a list of boolean
    283271                                refinement parameters (same length)
    284 \           Histogram           The name of the associated histogram (str)
    285 \           LeBail              Flag for LeBail extraction (bool)
    286 \           Mustrain            List of microstrain parameters, in order:
    287                                  0. Type, one of  u'isotropic', u'uniaxial', u'generalized'
    288                                  1. Isotropic/uniaxial parameters - list of 3 floats
    289                                  2. Refinement flags - list of 3 bools
    290                                  3. Microstrain axis - list of 3 ints, [h, k, l]
    291                                  4. Generalized mustrain parameters - list of 2-6 floats, depending on space group
    292                                  5. Generalized refinement flags - list of bools, corresponding to the parameters of (4)
    293 \           Pref.Ori.           Preferred Orientation (8 parameters in list, Items marked SH are used only for Spherical Harmonics).
    294                                   0. Type, 'MD' for March-Dollase or 'SH' for Spherical Harmonics
    295                                   1. Value, float
    296                                   2. Refinement flag, bool
    297                                   3. Preferred direction, list of ints, [h, k, l]
    298                                   4. SH - number of terms, int
    299                                   5. SH - dict
    300                                   6. SH - list
    301                                   7. SH - float
    302 \           Scale               Phase fraction, list of [float, bool].
    303 \           Show                bool
     272\           Histogram           (str) The name of the associated histogram
     273\           LeBail              (bool) Flag for LeBail extraction
     274\           Mustrain            (list) Microstrain parameters, in order:
     275   
     276                                0. Type, one of  u'isotropic', u'uniaxial', u'generalized'
     277                                1. Isotropic/uniaxial parameters - list of 3 floats
     278                                2. Refinement flags - list of 3 bools
     279                                3. Microstrain axis - list of 3 ints, [h, k, l]
     280                                4. Generalized mustrain parameters - list of 2-6
     281                                  floats, depending on space group
     282                                5. Generalized refinement flags - list of bools,
     283                                  corresponding to the parameters of (4)
     284\           Pref.Ori.           (list) Preferred Orientation. List of eight parameters.
     285                                Items marked SH are only used for Spherical Harmonics.
     286                               
     287                                0. (str) Type, 'MD' for March-Dollase or 'SH' for Spherical Harmonics
     288                                1. (float) Value
     289                                2. (bool) Refinement flag
     290                                3. (list) Preferred direction, list of ints, [h, k, l]
     291                                4. (int) SH - number of terms
     292                                5. (dict) SH - 
     293                                6. (list) SH
     294                                7. (float) SH
     295\           Scale               (list of [float, bool]) Phase fraction & refine flag
    304296\           Size                List of crystallite size parameters, in order:
    305                                   0. Type, one of  u'isotropic', u'uniaxial', u'ellipsoidal'
    306                                   1. Isotropic/uniaxial parameters - list of 3 floats
    307                                   2. Refinement flags - list of 3 bools
    308                                   3. Size axis - list of 3 ints, [h, k, l]
    309                                   4. Ellipsoidal size parameters - list of 6 floats
    310                                   5. Ellipsoidal refinement flags - list of bools, corresponding to the parameters of (4)
    311 \           Use                 bool
    312 \           newLeBail           Whether to perform a new LeBail extraction
    313 MCSA            \               Monte-Carlo simulated annealing parameters (dict)
     297                                0. (str) Type, one of  u'isotropic', u'uniaxial', u'ellipsoidal'
     298                                1. (list) Isotropic/uniaxial parameters - list of 3 floats
     299                                2. (list) Refinement flags - list of 3 bools
     300                                3. (list) Size axis - list of 3 ints, [h, k, l]
     301                                4. (list) Ellipsoidal size parameters - list of 6 floats
     302                                5. (list) Ellipsoidal refinement flags - list of bools,
     303                                  corresponding to the parameters of (4)
     304\           Use                 (bool) True if this histogram is to be used in refinement
     305\           newLeBail           (bool) Whether to perform a new LeBail extraction
     306MCSA            \               (dict) Monte-Carlo simulated annealing parameters
    314307==========  ===============     =====================================================================================================
    315308
     
    333326  key         sub-key           explanation
    334327==========  ===============     ====================================================
    335 Vector      RBId                vector rigid bodies (dict of dict)
    336 \           AtInfo              Drad, Color: atom drawing radius & color for each atom type (dict)
    337 \           RBname              Name assigned by user to rigid body (str)
    338 \           VectMag             vector magnitudes in Angstrom (list)
    339 \           rbXYZ               Cartesian coordinates for Vector rigid body (list of 3 float)
    340 \           rbRef               3 assigned reference atom nos. in rigid body for origin
    341                                 definition, use center of atoms flag (list of 3 int & 1 bool)
    342 \           VectRef             refinement flags for VectMag values (list of bool)
    343 \           rbTypes             Atom types for each atom in rigid body (list of str)
    344 \           rbVect              Cartesian vectors for each translation used to build rigid body (list of lists)
    345 \           useCount            Number of times rigid body is used in any structure (int)
    346 Residue     RBId                residue rigid bodies (dict of dict)
    347 \           AtInfo              Drad, Color: atom drawing radius & color for each atom type(dict)
    348 \           RBname              Name assigned by user to rigid body (str)
    349 \           rbXYZ               Cartesian coordinates for Residue rigid body (list of 3 float)
    350 \           rbTypes             Atom types for each atom in rigid body (list of str)
    351 \           atNames             Names of each atom in rigid body (e.g. C1,N2...) (list of str)
    352 \           rbRef               3 assigned reference atom nos. in rigid body for origin
    353                                 definition, use center of atoms flag (list of 3 int & 1 bool)
    354 \           rbSeq               Orig,Piv,angle,Riding (list): definition of internal rigid body
     328Vector      RBId                (dict of dict) vector rigid bodies
     329\           AtInfo              (dict) Drad, Color: atom drawing radius & color for each atom type
     330\           RBname              (str) Name assigned by user to rigid body
     331\           VectMag             (list) vector magnitudes in A
     332\           rbXYZ               (list of 3 float Cartesian coordinates for Vector rigid body )
     333\           rbRef               (list of 3 int & 1 bool) 3 assigned reference atom nos. in rigid body for origin
     334                                 definition, use center of atoms flag
     335\           VectRef             (list of bool refinement flags for VectMag values )
     336\           rbTypes             (list of str) Atom types for each atom in rigid body
     337\           rbVect              (list of lists) Cartesian vectors for each translation used to build rigid body
     338\           useCount            (int) Number of times rigid body is used in any structure
     339Residue     RBId                (dict of dict) residue rigid bodies
     340\           AtInfo              (dict) Drad, Color: atom drawing radius & color for each atom type
     341\           RBname              (str) Name assigned by user to rigid body
     342\           rbXYZ               (list of 3 float) Cartesian coordinates for Residue rigid body
     343\           rbTypes             (list of str) Atom types for each atom in rigid body
     344\           atNames             (list of str) Names of each atom in rigid body (e.g. C1,N2...)
     345\           rbRef               (list of 3 int & 1 bool) 3 assigned reference atom nos. in rigid body for origin
     346                                definition, use center of atoms flag
     347\           rbSeq               (list) Orig,Piv,angle,Riding : definition of internal rigid body
    355348                                torsion; origin atom (int), pivot atom (int), torsion angle (float),
    356349                                riding atoms (list of int)
    357 \           SelSeq              [int,int] used by SeqSizer to identify objects
    358 \           useCount            Number of times rigid body is used in any structure (int)
    359 RBIds           \               unique Ids generated upon creation of each rigid body (dict)
    360 \           Vector              Ids for each Vector rigid body (list)
    361 \           Residue             Ids for each Residue rigid body (list)
     350\           SelSeq              (int,int) used by SeqSizer to identify objects
     351\           useCount            (int)Number of times rigid body is used in any structure
     352RBIds           \               (dict) unique Ids generated upon creation of each rigid body
     353\           Vector              (list) Ids for each Vector rigid body
     354\           Residue             (list) Ids for each Residue rigid body
    362355==========  ===============     ====================================================
    363356
     
    380373  key         explanation
    381374==========  ========================================================================================
    382 BNSlattsym  BNS magnetic space group symbol and centering vector (mag)
    383 GenFlg      list of symmetry generators indices (mag)
    384 GenSym      list of names for each generator (mag)
    385 MagMom      list of "time reversals" for each magnetic operator (mag)
    386 MagPtGp     Magnetic point group symbol (mag)
    387 MagSpGrp    Magnetic space group symbol (mag)
    388 OprNames    names for each space group operation (mag)
    389 SGCen       Symmetry cell centering vectors. A (n,3) np.array
     375BNSlattsym  mag - (str) BNS magnetic space group symbol and centering vector
     376GenFlg      mag - (list) symmetry generators indices
     377GenSym      mag - (list) names for each generator
     378MagMom      mag - (list) "time reversals" for each magnetic operator
     379MagPtGp     mag - (str) Magnetic point group symbol
     380MagSpGrp    mag - (str) Magnetic space group symbol
     381OprNames    mag - (list) names for each space group operation
     382SGCen       (np.array) Symmetry cell centering vectors. A (n,3) np.array
    390383            of centers. Will always have at least one row: ``np.array([[0, 0, 0]])``
    391 SGFixed     bool, only True if phase mported from a magnetic cif file
     384SGFixed     (bool) Only True if phase mported from a magnetic cif file
    392385            then the space group can not be changed by the user because
    393386            operator set from cif may be nonstandard
    394 SGGen       list of generators
    395 SGGray      True if space group is a gray group (incommensurate magnetic structures)
    396 SGInv       True if centrosymmetric, False if not (bool)
    397 SGLatt      (str) Lattice centering type. Will be one of:
    398                P, A, B, C, I, F, R
    399 
     387SGGen       (list) generators
     388SGGray      (bool) True if space group is a gray group (incommensurate magnetic structures)
     389SGInv       (bool) True if centrosymmetric, False if not
     390SGLatt      (str)Lattice centering type. Will be one of
     391            P, A, B, C, I, F, R
    400392SGLaue      (str) one of the following 14 Laue classes:
    401               -1, 2/m, mmm, 4/m, 4/mmm, 3R, 3mR, 3, 3m1, 31m, 6/m, 6/mmm, m3, m3m
    402 
    403 SGOps       symmetry operations as a list of form ``[[M1,T1], [M2,T2],...]``
    404             where :math:`M_n` is a 3x3 np.array and :math:`T_n` is a length 3 np.array.
     393            -1, 2/m, mmm, 4/m, 4/mmm, 3R,
     394              3mR, 3, 3m1, 31m, 6/m, 6/mmm, m3, m3m
     395SGOps       (list) symmetry operations as a list of form
     396            ``[[M1,T1], [M2,T2],...]``
     397            where :math:`M_n` is a 3x3 np.array
     398            and :math:`T_n` is a length 3 np.array.
    405399            Atom coordinates are transformed where the
    406400            Asymmetric unit coordinates [X is (x,y,z)]
    407             are transformed using :math:`X^\prime = M_n*X+T_n`
    408 SGPolax     Axes for space group polarity. Will be one of:
    409                '', 'x', 'y', 'x y', 'z', 'x z', 'y z','xyz'.
    410 
    411             In the case where axes are arbitrary, '111' is used (P 1, and ?).
    412 SGPtGrp     Point group f the space group
     401            are transformed using
     402            :math:`X^\prime = M_n*X+T_n`
     403SGPolax     (str) Axes for space group polarity. Will be one of
     404            '', 'x', 'y', 'x y', 'z', 'x z', 'y z',
     405            'xyz'. In the case where axes are arbitrary
     406            '111' is used (P 1, and ?).
     407SGPtGrp     (str) Point group of the space group
    413408SGUniq      unique axis if monoclinic. Will be
    414409            a, b, or c for monoclinic space groups.
    415             Will be blank for non-monoclinic. (str)
    416 SGSpin      list of spin flip operatiors (+1 or -1) for the space group operations (mag)
    417 SGSys       (str) symmetry unit cell: type one of:
    418               'triclinic', 'monoclinic', 'orthorhombic',
    419               'tetragonal', 'rhombohedral', 'trigonal',
    420               'hexagonal', 'cubic'
    421 SSGK1       list of superspace multipliers
    422 SpGrp       (str) space group symbol
    423 SpnFlp      list of magnetic spin flips for every magnetic space group operator (mag)
     410            Will be blank for non-monoclinic.
     411SGSpin      mag - (list) of spin flip operatiors (+1 or -1) for the space group operations
     412SGSys       (str) symmetry unit cell: type one of
     413            'triclinic', 'monoclinic', 'orthorhombic',
     414            'tetragonal', 'rhombohedral', 'trigonal',
     415            'hexagonal', 'cubic'
     416SSGK1       (list) Superspace multipliers
     417SpGrp       (str) space group symbol 
     418SpnFlp      mag - (list) Magnetic spin flips for every magnetic space group operator
    424419==========  ========================================================================================
    425420
     
    439434  key         explanation
    440435==========  ====================================================
    441 SSpGrp      superspace group symbol extension to space group
     436SSGCen      (list) 4D cell centering vectors [0,0,0,0] at least
     437SSGK1       (list) Superspace multipliers
     438SSGOps      (list) 4D symmetry operations as [M,T] so that M*x+T = x'
     439SSpGrp      (str) superspace group symbol extension to space group
    442440            symbol, accidental spaces removed
    443 SSGCen      4D cell centering vectors [0,0,0,0] at least
    444 SSGOps      4D symmetry operations as [M,T] so that M*x+T = x'
     441modQ        (list) modulation/propagation vector
     442modSymb     (list of str) Modulation symbols
    445443==========  ====================================================
    446444
     
    468466location            explanation
    469467==============      ====================================================
    470 ct-4                mm - residue number (str)
    471 ct-3                mm - residue name (e.g. ALA) (str)
    472 ct-2                mm - chain label (str)
    473 ct-1                atom label (str)
    474 ct                  atom type (str)
    475 ct+1                refinement flags; combination of 'F', 'X', 'U', 'M' (str)
    476 cx,cx+1,cx+2        the x,y and z coordinates (3 floats)
    477 cx+3                site occupancy (float)
    478 cx+4,5,6            mg - atom magnetic moment along a,b,c in Bohr magnetons
    479 cs                  site symmetry (str)
    480 cs+1                site multiplicity (int)
    481 cia                 ADP flag: Isotropic ('I') or Anisotropic ('A')
    482 cia+1               Uiso (float)
    483 cia+2...cia+7       U11, U22, U33, U12, U13, U23 (6 floats)
    484 atom[cia+8]         unique atom identifier (int)
     468ct-4                mm - (str) residue number
     469ct-3                mm - (str) residue name (e.g. ALA)
     470ct-2                mm - (str) chain label
     471ct-1                (str) atom label
     472ct                  (str) atom type
     473ct+1                (str) refinement flags; combination of 'F', 'X', 'U', 'M'
     474cx,cx+1,cx+2        (3 floats) the x,y and z coordinates
     475cx+3                (float) site occupancy
     476cx+4,cx+5,cx+6      mg - (list) atom magnetic moment along a,b,c in Bohr magnetons
     477cs                  (str) site symmetry
     478cs+1                (int) site multiplicity
     479cia                 (str) ADP flag: Isotropic ('I') or Anisotropic ('A')
     480cia+1               (float) Uiso
     481cia+2...cia+7       (6 floats) U11, U22, U33, U12, U13, U23
     482atom[cia+8]         (int) unique atom identifier
    485483
    486484==============      ====================================================
     
    508506location            explanation
    509507==============   ===================================================================================
    510 ct-4                mm - residue number (str)
    511 ct-3                mm - residue name (e.g. ALA) (str)
    512 ct-2                mm - chain label (str)
    513 ct-1                atom label (str)
    514 ct                  atom type (str)
    515 cx,cx+1,cx+2        the x,y and z coordinates (3 floats)
    516 cx+3,4,5            mg - atom magnetic moment along a,b,c in Bohr magnetons
    517 cs-1                Sym Op symbol; sym. op number + unit cell id (e.g. '1,0,-1') (str)
    518 cs                  atom drawing style; e.g. 'balls & sticks' (str)
    519 cs+1                atom label style (e.g. 'name') (str)
    520 cs+2                atom color (RBG triplet) (int)
    521 cs+3                ADP flag: Isotropic ('I') or Anisotropic ('A')
    522 cs+4                Uiso (float)
    523 cs+5...cs+11        U11, U22, U33, U12, U13, U23 (6 floats)
    524 ci                  unique atom identifier; matches source atom Id in Atom Records (int)
     508ct-4                mm - (str) residue number
     509ct-3                mm - (str) residue name (e.g. ALA)
     510ct-2                mm - (str) chain label
     511ct-1                (str) atom label
     512ct                  (str) atom type
     513cx,cx+1,cx+2        (3 floats) the x,y and z coordinates
     514cx+3,cx+4,cx+5      mg - (3 floats) atom magnetic moment along a,b,c in Bohr magnetons
     515cs-1                (str) Sym Op symbol; sym. op number + unit cell id (e.g. '1,0,-1')
     516cs                  (str) atom drawing style; e.g. 'balls & sticks'
     517cs+1                (str) atom label style (e.g. 'name')
     518cs+2                (int) atom color (RBG triplet)
     519cs+3                (str) ADP flag: Isotropic ('I') or Anisotropic ('A')
     520cs+4                (float) Uiso
     521cs+5...cs+11        (6 floats) U11, U22, U33, U12, U13, U23
     522ci                  (int) unique atom identifier; matches source atom Id in Atom Records
    525523==============   ===================================================================================
    526524
     
    549547  key                      sub-key          explanation
    550548======================  ===============  ===========================================================
    551 Comments                    \               Text strings extracted from the original powder
     549Comments                    \               (list of str) Text strings extracted from the original powder
    552550                                            data header. These cannot be changed by the user;
    553551                                            it may be empty.
    554 Limits                      \               A list of two two element lists, as [[Ld,Hd],[L,H]]
     552Limits                      \               (list) two two element lists, as [[Ld,Hd],[L,H]]
    555553                                            where L and Ld are the current and default lowest
    556554                                            two-theta value to be used and
    557555                                            where H and Hd are the current and default highest
    558556                                            two-theta value to be used.
    559 Reflection Lists            \               A dict with an entry for each phase in the
     557Reflection Lists            \               (dict of dicts) with an entry for each phase in the
    560558                                            histogram. The contents of each dict item
    561559                                            is a dict containing reflections, as described in
    562560                                            the :ref:`Powder Reflections <PowderRefl_table>`
    563561                                            description.
    564 Instrument Parameters         \             The instrument parameters contains a list of two dicts.
    565                                             The contents of the first dict differs between 
    566                                             the :ref:`constant wavelength (CW) <CWPowder_table>`
    567                                             and the :ref:`time-of-flight (TOF) <TOFPowder_table>`
    568                                             cases. See below for the descriptions of
    569                                             the :ref:`CW <CWPowder_table>`
    570                                             and :ref:`TOF <TOFPowder_table>` contents.
    571 wtFactor                    \               A weighting factor to increase or decrease
    572                                             the leverage of data in the histogram (float).
     562Instrument Parameters       \               (dict) The instrument parameters uses different dicts
     563                                            for the constant wavelength (CW) and time-of-flight (TOF)
     564                                            cases. See below for the descriptions of each.
     565wtFactor                    \               (float) A weighting factor to increase or decrease
     566                                            the leverage of data in the histogram .
    573567                                            A value of 1.0 weights the data with their
    574568                                            standard uncertainties and a larger value
    575569                                            increases the weighting of the data (equivalent
    576570                                            to decreasing the uncertainties).
    577 Sample Parameters           \               Specifies a dict with parameters that describe how
     571Sample Parameters           \               (dict) Parameters that describe how
    578572                                            the data were collected, as listed
    579573                                            below. Refinable parameters are a list containing
     
    581575                                            specifies if the value is refined, otherwise
    582576                                            the value is a float unless otherwise noted.
    583 \                       Scale               The histogram scale factor (refinable)
    584 \                       Absorption          The sample absorption coefficient as
     577\                           Scale           The histogram scale factor (refinable)
     578\                           Absorption      The sample absorption coefficient as
    585579                                            :math:`\\mu r` where r is the radius
    586580                                            (refinable). Only valid for Debye-Scherrer geometry.
    587 \                       SurfaceRoughA       Surface roughness parameter A as defined by
     581\                           SurfaceRoughA   Surface roughness parameter A as defined by
    588582                                            Surotti, *J. Appl. Cryst*, **5**, 325-331, 1972.
    589583                                            (refinable - only valid for Bragg-Brentano geometry)
    590 \                       SurfaceRoughB       Surface roughness parameter B (refinable -
     584\                           SurfaceRoughB   Surface roughness parameter B (refinable -
    591585                                            only valid for Bragg-Brentano geometry)
    592 \                       DisplaceX,          Sample displacement from goniometer center
    593                         DisplaceY           where Y is along the beam direction and
     586\                           DisplaceX,      Sample displacement from goniometer center
     587                            DisplaceY       where Y is along the beam direction and
    594588                                            X is perpendicular. Units are :math:`\\mu m`
    595589                                            (refinable).
    596 \                       Phi, Chi,           Goniometer sample setting angles, in degrees.
    597                         Omega
    598 \                       Gonio. radius       Radius of the diffractometer in mm
    599 \                       InstrName          A name for the instrument, used in preparing
    600                                             a CIF (str).
    601 \                       Force,              Variables that describe how the measurement
    602                         Temperature,        was performed. Not used directly in
    603                         Humidity,           any computations.
    604                         Pressure,
    605                         Voltage
    606 \                       ranId              The random-number Id for the histogram
     590\                           Phi, Chi,       Goniometer sample setting angles, in degrees.
     591                            Omega
     592\                           Gonio. radius   Radius of the diffractometer in mm
     593\                           InstrName       (str) A name for the instrument, used in preparing
     594                                            a CIF .
     595\                           Force,          Variables that describe how the measurement
     596                            Temperature,    was performed. Not used directly in
     597                            Humidity,       any computations.
     598                            Pressure,
     599                            Voltage
     600\                           ranId           (int) The random-number Id for the histogram
    607601                                            (same value as where top-level key is ranId)
    608 \                       Type                Type of diffraction data, may be 'Debye-Scherrer'
    609                                             or 'Bragg-Brentano' (str).
    610 \                       Diffuse             not in use?
    611 hId                         \               The number assigned to the histogram when
     602\                           Type            (str) Type of diffraction data, may be 'Debye-Scherrer'
     603                                            or 'Bragg-Brentano' .
     604hId                         \               (int) The number assigned to the histogram when
    612605                                            the project is loaded or edited (can change)
    613 ranId                       \               A random number id for the histogram
     606ranId                       \               (int) A random number id for the histogram
    614607                                            that does not change
    615 Background                  \               The background is stored as a list with where
     608Background                  \               (list) The background is stored as a list with where
    616609                                            the first item in the list is list and the second
    617610                                            item is a dict. The list contains the background
     
    619612                                            Debye diffuse terms and background peaks.
    620613                                            (TODO: this needs to be expanded.)
    621 Data                        \               The data consist of a list of 6 np.arrays
     614Data                        \               (list) The data consist of a list of 6 np.arrays
    622615                                            containing in order:
    623616
    624                                               0. the x-postions (two-theta in degrees),
    625                                               1. the intensity values (Yobs),
    626                                               2. the weights for each Yobs value
    627                                               3. the computed intensity values (Ycalc)
    628                                               4. the background values
    629                                               5. Yobs-Ycalc
     617                                            0. the x-postions (two-theta in degrees),
     618                                            1. the intensity values (Yobs),
     619                                            2. the weights for each Yobs value
     620                                            3. the computed intensity values (Ycalc)
     621                                            4. the background values
     622                                            5. Yobs-Ycalc
    630623======================  ===============  ===========================================================
    631624
     
    645638and a refinement flag which can have a value of True, False or 0 where 0 indicates a value that
    646639cannot be refined. The first and second values are floats unless otherwise noted.
     640Items not refined are noted as [*]
    647641
    648642.. tabularcolumns:: |p{1in}|p{4in}|
    649643
    650 ======================  ===========================================================
    651   key                   explanation
    652 ======================  ===========================================================
    653 Type                     Histogram type (str):
    654                           * 'PXC' for constant wavelength x-ray
    655                           * 'PNC' for constant wavelength neutron
    656 Bank                     Data set number in a multidata file (usually 1)
    657 Lam                      Specifies a wavelength in Angstrom
    658 Lam1                     Specifies the primary wavelength in
    659                          Angstrom, used in place of Lam
    660                          when an :math:`\\alpha_1, \\alpha_2`
    661                          source is used.
    662 Lam2                     Specifies the secondary wavelength in
    663                          Angstrom, used with Lam1
    664 I(L2)/I(L1)              Ratio of Lam2 to Lam1, used with Lam1
    665 Zero                     Two-theta zero correction in *degrees*
    666 Azimuth                  Azimuthal setting angle for data recorded
    667                          with differing setting angles
    668 U, V, W                  Cagliotti profile coefficients
    669                          for Gaussian instrumental broadening, where the
    670                          FWHM goes as
    671                          :math:`U \\tan^2\\theta + V \\tan\\theta + W`
    672 X, Y, Z                  Cauchy (Lorentzian) instrumental broadening
    673                          coefficients
    674 SH/L                     Variant of the Finger-Cox-Jephcoat asymmetric
    675                          peak broadening ratio. Note that this is the
    676                          sum of S/L and H/L where S is
    677                          sample height, H is the slit height and
    678                          L is the goniometer diameter.
    679 Polariz                  Polarization coefficient.
    680 ======================  ===========================================================
     644======================      ===============  ===========================================================
     645  key                           sub-key        explanation
     646======================      ===============  ===========================================================
     647Instrument Parameters[0]    Type [*]            (str) Histogram type:
     648                                                * 'PXC' for constant wavelength x-ray
     649                                                * 'PNC' for constant wavelength neutron
     650\                           Bank [*]            (int) Data set number in a multidata file (usually 1)
     651\                           Lam                 (float) Specifies a wavelength in :math:`\\unicode{x212B}`
     652\                           Lam1 [*]            (float) Specifies the primary wavelength in
     653                                                :math:`\\unicode{x212B}`, used in place of Lam
     654                                                when an :math:`\\alpha_1, \\alpha_2`
     655                                                source is used.
     656\                           Lam2 [*]            (float) Specifies the secondary wavelength in
     657                                                :math:`\\unicode{x212B}`, used with Lam1
     658\                           I(L2)/I(L1)         (float) Ratio of Lam2 to Lam1, used with Lam1
     659\                           Zero                (float) Two-theta zero correction in *degrees*
     660\                           Azimuth [*]         (float) Azimuthal setting angle for data recorded with differing setting angles
     661\                           U, V, W             (float) Cagliotti profile coefficients
     662                                                for Gaussian instrumental broadening, where the
     663                                                FWHM goes as
     664                                                :math:`U \\tan^2\\theta + V \\tan\\theta + W`
     665\                           X, Y, Z             (float) Cauchy (Lorentzian) instrumental broadening coefficients
     666\                           SH/L                (float) Variant of the Finger-Cox-Jephcoat asymmetric
     667                                                peak broadening ratio. Note that this is the
     668                                                sum of S/L and H/L where S is
     669                                                sample height, H is the slit height and
     670                                                L is the goniometer diameter.
     671\                           Polariz.            (float) Polarization coefficient.
     672Instrument Parameters[1]                        (empty dict)
     673======================  ===============      ===========================================================
    681674
    682675.. _TOFPowder_table:
     
    695688and a refinement flag which can have a value of True, False or 0 where 0 indicates a value that
    696689cannot be refined. The first and second values are floats unless otherwise noted.
     690Items not refined are noted as [*]
    697691
    698692.. tabularcolumns:: |p{1.5in}|p{4in}|
    699693
    700 =========================  ===========================================================
    701   key                       explanation
    702 =========================  ===========================================================
    703 Type                        (str) Histogram type:
    704                               * 'PNT' for time of flight neutron
    705 Bank                        (int) Data set number in a multidata file
    706 2-theta                     Nominal scattering angle for the detector
    707 fltPath                     Total flight path source-sample-detector
    708 Azimuth                     Azimuth angle for detector right hand rotation
    709                             from horizontal away from source
    710 difC,difA,difB              Diffractometer constants for conversion of d-spacing to TOF
    711                             in microseconds
    712 Zero                        Zero point offset (microseconds)
    713 alpha                       Exponential rise profile coefficients
    714 beta-0,beta-1,beta-q        Exponential decay profile coefficients
    715 sig-0,sig-1,sig-2,sig-q     Gaussian profile coefficients
    716 X,Y,Z                       Lorentzian profile coefficients 
    717 =========================  ===========================================================
     694======================      ===============  ===========================================================
     695  key                           sub-key         explanation
     696======================      ===============  ===========================================================
     697Instrument Parameters[0]    Type [*]            (str) Histogram type:
     698                                                * 'PNT' for time of flight neutron
     699\                           Bank                (int) Data set number in a multidata file
     700\                           2-theta [*]         (float) Nominal scattering angle for the detector
     701\                           fltPath [*]         (float) Total flight path source-sample-detector
     702\                           Azimuth [*]         (float) Azimuth angle for detector right hand rotation
     703                                                from horizontal away from source
     704\                           difC,difA,          (float) Diffractometer constants for conversion of d-spacing to TOF
     705                            difB                in microseconds
     706\                           Zero                (float) Zero point offset (microseconds)
     707\                           alpha               (float) Exponential rise profile coefficients
     708\                           beta-0              (float) Exponential decay profile coefficients
     709                            beta-1
     710                            beta-q
     711\                           sig-0               (float) Gaussian profile coefficients
     712                            sig-1
     713                            sig-2
     714                            sig-q   
     715\                           X,Y,Z               (float) Lorentzian profile coefficients
     716Instrument Parameters[1]    Pdabc               (list of 4 float lists) Originally created for use in gsas as optional tables
     717                                                of d, alp, bet, d-true; for a reflection alpha & beta are obtained via interpolation
     718                                                from the d-spacing and these tables. The d-true column is apparently unused.
     719 
     720======================      ===============  ===========================================================
    718721
    719722.. _PowderRefl_table:
     
    734737==========  ====================================================
    735738 0,1,2          h,k,l (float)
    736  3              multiplicity
    737  4              d-space, Angstrom
    738  5              pos, two-theta
    739  6              sig, Gaussian width
    740  7              gam, Lorenzian width
    741  8              :math:`F_{obs}^2`
    742  9              :math:`F_{calc}^2`
    743  10             reflection phase, in degrees
    744  11             intensity correction for reflection, this times
     739 3              (int) multiplicity
     740 4              (float) d-space, :math:`\\unicode{x212B}`
     741 5              (float) pos, two-theta
     742 6              (float) sig, Gaussian width
     743 7              (float) gam, Lorenzian width
     744 8              (float) :math:`F_{obs}^2`
     745 9              (float) :math:`F_{calc}^2`
     746 10             (float) reflection phase, in degrees
     747 11             (float) intensity correction for reflection, this times
    745748                :math:`F_{obs}^2` or :math:`F_{calc}^2` gives Iobs or Icalc
    746  12             Preferred orientation correction
    747  13             Transmission (absorption correction)
    748  14             Extinction correction
     749 12             (float) Preferred orientation correction
     750 13             (float) Transmission (absorption correction)
     751 14             (float) Extinction correction
    749752==========  ====================================================
    750753
     
    773776  key                      sub-key          explanation
    774777======================  ===============     ====================================================
    775 Data                        \               A dict that contains the
     778Data                        \               (dict) that contains the
    776779                                            reflection table,
    777780                                            as described in the
     
    780783                                            description.
    781784
    782 Instrument Parameters       \               A list containing two dicts where the possible
     785Instrument Parameters       \               (list) containing two dicts where the possible
    783786                                            keys in each dict are listed below. The value
    784787                                            for most items is a list containing two values:
     
    786789                                            The first and second
    787790                                            values are floats unless otherwise noted.
    788 \                         Lam               Specifies a wavelength in Angstrom
    789                                             (two floats)
    790 \                           Type            Histogram type (two str values):
    791                                              * 'SXC' for constant wavelength x-ray
    792                                              * 'SNC' for constant wavelength neutron
    793                                              * 'SNT' for time of flight neutron
    794 \                           InstrName       A name for the instrument, used in preparing
    795                                             a CIF (str).
    796 
    797 wtFactor                    \               A weighting factor to increase or decrease
    798                                             the leverage of data in the histogram (float).
     791\                           Lam             (two floats) Specifies a wavelength in :math:`\\unicode{x212B}`
     792\                           Type            (two str values) Histogram type :
     793                                            * 'SXC' for constant wavelength x-ray
     794                                            * 'SNC' for constant wavelength neutron
     795                                            * 'SNT' for time of flight neutron
     796\                           InstrName       (str) A name for the instrument, used in preparing a CIF
     797wtFactor                    \               (float) A weighting factor to increase or decrease
     798                                            the leverage of data in the histogram.
    799799                                            A value of 1.0 weights the data with their
    800800                                            standard uncertainties and a larger value
     
    802802                                            to decreasing the uncertainties).
    803803
    804 hId                         \               The number assigned to the histogram when
     804hId                         \               (int) The number assigned to the histogram when
    805805                                            the project is loaded or edited (can change)
    806 ranId                       \               A random number id for the histogram
     806ranId                       \               (int) A random number id for the histogram
    807807                                            that does not change
    808808======================  ===============     ====================================================
     
    824824  index         explanation
    825825==========  ====================================================
    826  0,1,2          h,k,l (float)
    827  3              multiplicity
    828  4              d-space, Angstrom
    829  5              :math:`F_{obs}^2`
    830  6              :math:`\sigma(F_{obs}^2)`
    831  7              :math:`F_{calc}^2`
    832  8              :math:`F_{obs}^2T`
    833  9              :math:`F_{calc}^2T`
    834  10             reflection phase, in degrees
    835  11             intensity correction for reflection, this times
    836                 :math:`F_{obs}^2` or :math:`F_{calc}^2`
    837                 gives Iobs or Icalc
     826 0,1,2          (float) h,k,l
     827 3              (int) multiplicity
     828 4              (float) d-space, :math:`\\unicode{x212B}`
     829 5              (float) :math:`F_{obs}^2`
     830 6              (float) :math:`\sigma(F_{obs}^2)`
     831 7              (float) :math:`F_{calc}^2`
     832 8              (float) :math:`F_{obs}^2T`
     833 9              (float) :math:`F_{calc}^2T`
     834 10             (float) reflection phase, in degrees
     835 11             (float) intensity correction for reflection, this times
     836                 :math:`F_{obs}^2` or :math:`F_{calc}^2`
     837                 gives Iobs or Icalc
    838838==========  ====================================================
    839839
     
    861861  key                      sub-key              explanation
    862862======================  ======================  ====================================================
    863 Comments                    \                   Text strings extracted from the original image data
     863Comments                    \                   (list of str) Text strings extracted from the original image data
    864864                                                header or a metafile. These cannot be changed by
    865865                                                the user; it may be empty.
     
    19791979        'ranId':ran.randint(0,sys.maxsize),
    19801980        'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],
    1981         'DisplaceX':[0.0,False],'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],
     1981        'DisplaceX':[0.0,False],'DisplaceY':[0.0,False],
    19821982        'Temperature':300.,'Pressure':0.1,'Time':0.0,
    19831983        'FreePrm1':0.,'FreePrm2':0.,'FreePrm3':0.,
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.