source: trunk/exports/G2export_pwdr.py @ 1675

Last change on this file since 1675 was 1675, checked in by vondreele, 7 years ago

fix but in export powder fxye file. Bad format for profile coeffs.

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 7.2 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2# -*- coding: utf-8 -*-
3########### SVN repository information ###################
4# $Date: 2015-02-27 20:31:31 +0000 (Fri, 27 Feb 2015) $
5# $Author: vondreele $
6# $Revision: 1675 $
7# $URL: trunk/exports/G2export_pwdr.py $
8# $Id: G2export_pwdr.py 1675 2015-02-27 20:31:31Z vondreele $
9########### SVN repository information ###################
10'''
11*Module G2export_pwdr: Export powder input files*
12-------------------------------------------------
13
14Creates files used by GSAS (FXYE) & TOPAS (XYE) as input
15
16'''
17import os.path
18import numpy as np
19import GSASIIpath
20GSASIIpath.SetVersionNumber("$Revision: 1675 $")
21import GSASIIIO as G2IO
22import GSASIIpy3 as G2py3
23import GSASIIobj as G2obj
24
25class ExportPowderFXYE(G2IO.ExportBaseclass):
26    '''Used to create a FXYE file for a powder data set
27
28    :param wx.Frame G2frame: reference to main GSAS-II frame
29    '''
30    def __init__(self,G2frame):
31        super(self.__class__,self).__init__( # fancy way to say <parentclass>.__init__
32            G2frame=G2frame,
33            formatName = 'GSAS FXYE file',
34            extension='.fxye',
35            longFormatName = 'Export powder data as GSAS FXYE (column) file'
36            )
37        self.exporttype = ['powder']
38        self.multiple = True
39
40    def WriteInstFile(self,hist,Inst):
41        '''Write an instrument parameter file
42        '''
43        prmname = os.path.splitext(self.filename)[0] + '.prm'
44        prmname = os.path.join(self.dirname,prmname)
45        self.OpenFile(prmname)
46        self.Write( '            123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890        ')
47        self.Write( 'INS   BANK      1                                                               ')
48        self.Write(('INS   HTYPE   %sR                                                              ')%(Inst['Type'][0]))
49        if 'Lam1' in Inst:              #Ka1 & Ka2
50            self.Write(('INS  1 ICONS%10.7f%10.7f    0.0000               0.990    0     0.500   ')%(Inst['Lam1'][0],Inst['Lam2'][0]))
51        elif 'Lam' in Inst:             #single wavelength
52            self.Write(('INS  1 ICONS%10.7f%10.7f    0.0000               0.990    0     0.500   ')%(Inst['Lam'][1],0.0))
53        self.Write( 'INS  1 IRAD     0                                                               ')
54        self.Write( 'INS  1I HEAD                                                                    ')
55        self.Write( 'INS  1I ITYP    0    0.0000  180.0000         1                                 ')
56        self.Write(('INS  1DETAZM%10.3f                                                          ')%(Inst['Azimuth'][0]))
57        self.Write( 'INS  1PRCF1     3    8   0.00100                                                ')
58        self.Write(('INS  1PRCF11%15.6e%15.6e%15.6e%15.6e   ')%(Inst['U'][1],Inst['V'][1],Inst['W'][1],0.0))
59        self.Write(('INS  1PRCF12%15.6e%15.6e%15.6e%15.6e   ')%(Inst['X'][1],Inst['Y'][1],Inst['SH/L'][1]/2.,Inst['SH/L'][1]/2.))
60        self.CloseFile()
61        print('Parameters from '+str(hist)+' written to file '+str(prmname))
62        return prmname
63
64    def Exporter(self,event=None):
65        '''Export one or more sets of powder data as FXYE file(s)
66        '''
67        # the export process starts here
68        self.InitExport(event)
69        # load all of the tree into a set of dicts
70        self.loadTree()
71        if self.ExportSelect( # set export parameters
72            AskFile='single' # get a file name/directory to save in
73            ): return
74        filenamelist = []
75        for hist in self.histnam:
76            if len(self.histnam) > 1:
77                # multiple files: create a unique name from the histogram
78                fileroot = G2obj.MakeUniqueLabel(self.MakePWDRfilename(hist),filenamelist)
79                # create an instrument parameter file
80                self.filename = os.path.join(self.dirname,fileroot + self.extension)
81            else:
82                # use the supplied name, but force the extension
83                self.filename= os.path.splitext(self.filename)[0] + self.extension
84               
85            histblk = self.Histograms[hist]
86            prmname = self.WriteInstFile(hist,histblk['Instrument Parameters'][0])
87           
88            self.OpenFile()
89            self.Write(hist[5:])
90            self.Write('Instrument parameter file:'+os.path.split(prmname)[1])
91            x = 100*np.array(histblk['Data'][0])
92            # convert weights to sigmas; use largest weight as minimum esd
93            s = np.sqrt(np.maximum(0.,np.array(histblk['Data'][2])))
94            s[s==0] = np.max(s)
95            s = 1./s
96            self.Write('BANK 1 %d %d CONS %.2f %.2f 0 0 FXYE' % (
97                len(x),len(x),x[0],(x[1]-x[0])
98                ))
99#            for X,Y,S in zip(x,histblk['Data'][1],s):
100#                self.Write("{:15.6g} {:15.6g} {:15.6g}".format(X,Y,S))
101            for XYS in zip(x,histblk['Data'][1],s):
102                line = ''
103                for val in XYS:
104                    line += G2py3.FormatPadValue(val,(15,6))
105                self.Write(line)
106            self.CloseFile()
107            print('Histogram '+str(hist)+' written to file '+str(self.fullpath))
108
109
110class ExportPowderXYE(G2IO.ExportBaseclass):
111    '''Used to create a Topas XYE file for a powder data set
112
113    :param wx.Frame G2frame: reference to main GSAS-II frame
114    '''
115    def __init__(self,G2frame):
116        super(self.__class__,self).__init__( # fancy way to say <parentclass>.__init__
117            G2frame=G2frame,
118            formatName = 'Topas XYE file',
119            extension='.xye',
120            longFormatName = 'Export powder data as Topas XYE (column) file'
121            )
122        self.exporttype = ['powder']
123        self.multiple = True
124
125    def Exporter(self,event=None):
126        '''Export one or more sets of powder data as XYE file(s)
127        '''
128        # the export process starts here
129        self.InitExport(event)
130        # load all of the tree into a set of dicts
131        self.loadTree()
132        if self.ExportSelect( # set export parameters
133            AskFile='single' # get a file name/directory to save in
134            ): return
135        filenamelist = []
136        for hist in self.histnam:
137            if len(self.histnam) > 1:
138                # multiple files: create a unique name from the histogram
139                fileroot = G2obj.MakeUniqueLabel(self.MakePWDRfilename(hist),filenamelist)
140                # create an instrument parameter file
141                self.filename = os.path.join(self.dirname,fileroot + self.extension)
142            else:
143                # use the supplied name, but force the extension
144                self.filename= os.path.splitext(self.filename)[0] + self.extension
145
146            self.OpenFile()
147            histblk = self.Histograms[hist]
148            self.Write('/*')    #The ugly c comment delimiter used in topas!
149            self.Write('# '+hist[5:])  #evidently this by itself fails in topas
150            self.Write('*/')
151            x = np.array(histblk['Data'][0])
152            # convert weights to sigmas; use largest weight as minimum esd
153            s = np.sqrt(np.maximum(0.,np.array(histblk['Data'][2])))
154            s[s==0] = np.max(s)
155            s = 1./s
156            for XYS in zip(x,histblk['Data'][1],s):
157                line = ''
158                for val in XYS:
159                    line += G2py3.FormatPadValue(val,(15,6))
160                self.Write(line)
161            self.CloseFile()
162            print('Histogram '+str(hist)+' written to file '+str(self.fullpath))
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.