source: trunk/GSASIIimgGUI.py @ 1374

Last change on this file since 1374 was 1374, checked in by vondreele, 8 years ago

recalibrate enable issues
save/load image controls

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 76.2 KB
Line 
1# -*- coding: utf-8 -*-
2#GSASII - image data display routines
3########### SVN repository information ###################
4# $Date: 2014-06-05 20:07:57 +0000 (Thu, 05 Jun 2014) $
5# $Author: vondreele $
6# $Revision: 1374 $
7# $URL: trunk/GSASIIimgGUI.py $
8# $Id: GSASIIimgGUI.py 1374 2014-06-05 20:07:57Z vondreele $
9########### SVN repository information ###################
10'''
11*GSASIIimgGUI: Image GUI*
12-------------------------
13
14Control image display and processing
15
16'''
17import wx
18import wx.lib.scrolledpanel as wxscroll
19import matplotlib as mpl
20import math
21import time
22import copy
23import cPickle
24import GSASIIpath
25GSASIIpath.SetVersionNumber("$Revision: 1374 $")
26import GSASIIimage as G2img
27import GSASIImath as G2mth
28import GSASIIplot as G2plt
29import GSASIIIO as G2IO
30import GSASIIgrid as G2gd
31import numpy as np
32
33VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
34WACV = wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL
35
36# trig functions in degrees
37sind = lambda x: math.sin(x*math.pi/180.)
38tand = lambda x: math.tan(x*math.pi/180.)
39cosd = lambda x: math.cos(x*math.pi/180.)
40asind = lambda x: 180.*math.asin(x)/math.pi
41
42################################################################################
43##### Image Controls
44################################################################################                   
45def UpdateImageControls(G2frame,data,masks):
46    '''Shows and handles the controls on the "Image Controls"
47    data tree entry
48    '''
49    import ImageCalibrants as calFile
50#patch
51    if 'GonioAngles' not in data:
52        data['GonioAngles'] = [0.,0.,0.]
53    if 'DetDepth' not in data:
54        data['DetDepth'] = 0.
55        data['DetDepthRef'] = False
56    if 'SampleAbs' not in data:
57        data['SampleShape'] = 'Cylinder'
58        data['SampleAbs'] = [0.0,False]
59    if 'binType' not in data:
60        if 'PWDR' in data['type']:
61            data['binType'] = '2-theta'
62        elif 'SASD' in data['type']:
63            data['binType'] = 'log(q)'
64#end patch
65
66   
67# Menu items
68           
69    def OnCalibrate(event):       
70        G2frame.dataFrame.ImageEdit.Enable(id=G2gd.wxID_IMRECALIBRATE,enable=True)   
71        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Select > 4 points on 1st used ring; LB to pick, RB on point to delete else RB to finish')
72        G2frame.ifGetRing = True
73       
74    def OnRecalibrate(event):
75        G2img.ImageRecalibrate(G2frame,data,masks)
76        UpdateImageControls(G2frame,data,masks)
77       
78    def OnClearCalib(event):
79        data['ring'] = []
80        data['rings'] = []
81        data['ellipses'] = []
82#        G2frame.dataFrame.ImageEdit.Enable(id=G2gd.wxID_IMRECALIBRATE,enable=False)   
83        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
84           
85    def OnIntegrate(event):
86        blkSize = 128   #this seems to be optimal; will break in polymask if >1024
87        Nx,Ny = data['size']
88        nXBlks = (Nx-1)/blkSize+1
89        nYBlks = (Ny-1)/blkSize+1
90        Nup = nXBlks*nYBlks*3+3
91        dlg = wx.ProgressDialog("Elapsed time","2D image integration",Nup,
92            style = wx.PD_ELAPSED_TIME|wx.PD_AUTO_HIDE)
93        try:
94            sumImg = G2frame.ImageZ
95            darkImg,darkScale = data['dark image']
96            if darkImg:
97                Did = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root, darkImg)
98                Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(Did)
99                darkImage = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)
100                sumImg += darkImage*darkScale
101            backImg,backScale = data['background image']           
102            if backImg:     #ignores any transmission effect in the background image
103                Bid = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root, backImg)
104                Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(Bid)
105                backImage = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)
106                Bdata = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,Bid,'Image Controls'))
107                BdarkImg,BdarkScale = Bdata['dark image']
108                if BdarkImg:
109                    BDid = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root,BdarkImg)
110                    Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(BDid)
111                    BdarkImage = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)
112                    backImage += BdarkImage*BdarkScale               
113                sumImg += backImage*backScale
114            G2frame.Integrate = G2img.ImageIntegrate(sumImg,data,masks,blkSize,dlg)
115#            G2plt.PlotIntegration(G2frame,newPlot=True)
116            Id = G2IO.SaveIntegration(G2frame,G2frame.PickId,data)
117            G2frame.PatternId = Id
118            G2frame.PatternTree.SelectItem(Id)
119            G2frame.PatternTree.Expand(Id)
120        finally:
121            dlg.Destroy()
122        for item in G2frame.MakePDF: item.Enable(True)
123       
124    def OnIntegrateAll(event):
125        print 'integrate all'
126        TextList = [[False,'All IMG',0]]
127        Names = []
128        if G2frame.PatternTree.GetCount():
129            id, cookie = G2frame.PatternTree.GetFirstChild(G2frame.root)
130            while id:
131                name = G2frame.PatternTree.GetItemText(id)
132                Names.append(name)
133                if 'IMG' in name:
134                    TextList.append([False,name,id])
135                id, cookie = G2frame.PatternTree.GetNextChild(G2frame.root, cookie)
136            if len(TextList) == 1:
137                G2frame.ErrorDialog('Nothing to integrate','There must some "IMG" patterns')
138                return
139            dlg = G2frame.CopyDialog(G2frame,'Image integration controls','Select images to integrate:',TextList)
140            try:
141                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
142                    result = dlg.GetData()
143                    if result[0][0]:                    #the 'All IMG' is True
144                        result = TextList[1:]
145                        for item in result: item[0] = True
146                    G2frame.EnablePlot = False
147                    for item in result:
148                        ifintegrate,name,id = item
149                        if ifintegrate:
150                            Id = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Image Controls')
151                            Data = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(Id)
152                            blkSize = 128   #this seems to be optimal; will break in polymask if >1024
153                            Nx,Ny = Data['size']
154                            nXBlks = (Nx-1)/blkSize+1
155                            nYBlks = (Ny-1)/blkSize+1
156                            Nup = nXBlks*nYBlks*3+3
157                            dlgp = wx.ProgressDialog("Elapsed time","2D image integration",Nup,
158                                style = wx.PD_ELAPSED_TIME|wx.PD_AUTO_HIDE)
159                            try:
160                                id = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root, name)
161                                Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(id)
162                                image = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)
163                                backImage = []
164                                if Data['background image'][0]:
165                                    backImg = Data['background image'][0]
166                                    backScale = Data['background image'][1]
167                                    id = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root, backImg)
168                                    Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(id)
169                                    backImage = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)*backScale
170                                try:
171                                    Masks = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(
172                                        G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,G2frame.Image, 'Masks'))
173                                except TypeError:       #missing Masks
174                                    Imin,Imax = Data['Range']
175                                    Masks = {'Points':[],'Rings':[],'Arcs':[],'Polygons':[],'Frames':[],'Thresholds':[(Imin,Imax),[Imin,Imax]]}
176                                    G2frame.PatternTree.SetItemPyData(
177                                        G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,G2frame.Image, 'Masks'),Masks)
178                                if len(backImage):                               
179                                    G2frame.Integrate = G2img.ImageIntegrate(image+backImage,Data,Masks,blkSize,dlgp)
180                                else:
181                                    G2frame.Integrate = G2img.ImageIntegrate(image,Data,Masks,blkSize,dlgp)
182                                pId = G2IO.SaveIntegration(G2frame,Id,Data)
183                            finally:
184                                dlgp.Destroy()
185                    else:
186                        G2frame.EnablePlot = True
187                        G2frame.PatternTree.SelectItem(pId)
188                        G2frame.PatternTree.Expand(pId)
189                        G2frame.PatternId = pId
190                       
191            finally:
192                dlg.Destroy()
193       
194    def OnCopyControls(event):
195        import copy
196        TextList = [[False,'All IMG',0]]
197        Names = []
198        if G2frame.PatternTree.GetCount():
199            id, cookie = G2frame.PatternTree.GetFirstChild(G2frame.root)
200            while id:
201                name = G2frame.PatternTree.GetItemText(id)
202                Names.append(name)
203                if 'IMG' in name:
204                    if id == G2frame.Image:
205                        Source = name
206                        Data = copy.deepcopy(G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Image Controls')))
207                        Data['showLines'] = True
208                        Data['ring'] = []
209                        Data['rings'] = []
210                        Data['ellipses'] = []
211                        Data['setDefault'] = False
212                    else:
213                        TextList.append([False,name,id])
214                id, cookie = G2frame.PatternTree.GetNextChild(G2frame.root, cookie)
215            if len(TextList) == 1:
216                G2frame.ErrorDialog('Nothing to copy controls to','There must be more than one "IMG" pattern')
217                return
218            dlg = G2frame.CopyDialog(G2frame,'Copy image controls','Copy controls from '+Source+' to:',TextList)
219            try:
220                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
221                    result = dlg.GetData()
222                    if result[0][0]:
223                        result = TextList[1:]
224                        for item in result: item[0] = True
225                    for i,item in enumerate(result):
226                        ifcopy,name,id = item
227                        if ifcopy:
228                            oldData = copy.deepcopy(G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Image Controls')))
229                            Data['range'] = oldData['range']
230                            Data['size'] = oldData['size']
231                            Data['GonioAngles'] = oldData.get('GonioAngles', [0.,0.,0.])
232                            Data['ring'] = []
233                            Data['rings'] = []
234                            Data['ellipses'] = []
235                            G2frame.PatternTree.SetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Image Controls'),copy.deepcopy(Data))
236            finally:
237                dlg.Destroy()
238               
239    def OnSaveControls(event):
240        dlg = wx.FileDialog(G2frame, 'Choose image controls file', '.', '', 
241            'image control files (*.imctrl)|*.imctrl',wx.FD_SAVE|wx.FD_OVERWRITE_PROMPT|wx.CHANGE_DIR)
242        try:
243            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
244                filename = dlg.GetPath()
245                File = open(filename,'w')
246                save = {}
247                keys = ['type','wavelength','calibrant','distance','center',
248                    'tilt','rotation','azmthOff','fullIntegrate','LRazimuth',
249                    'IOtth','outAzimuths','invert_x','invert_y','DetDepth',
250                    'calibskip','pixLimit','cutoff','calibdmin','chisq',
251                    'binType','SampleShape','PolaVal','SampleAbs','dark image','background image']
252                for key in keys:
253                    if key not in data:     #uncalibrated!
254                        continue
255                    File.write(key+':'+str(data[key])+'\n')
256                File.close()
257        finally:
258            dlg.Destroy()
259       
260    def OnLoadControls(event):
261        cntlList = ['wavelength','distance','tilt','invert_x','invert_y','type',
262            'fullIntegrate','outAzimuths','LRazimuth','IOtth','azmthOff','DetDepth',
263            'calibskip','pixLimit','cutoff','calibdmin','chisq',
264            'PolaVal','SampleAbs','dark image','background image']
265        dlg = wx.FileDialog(G2frame, 'Choose image controls file', '.', '', 
266            'image control files (*.imctrl)|*.imctrl',wx.OPEN|wx.CHANGE_DIR)
267        try:
268            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
269                filename = dlg.GetPath()
270                File = open(filename,'r')
271                save = {}
272                S = File.readline()
273                while S:
274                    if S[0] == '#':
275                        S = File.readline()
276                        continue
277                    [key,val] = S[:-1].split(':')
278                    if key in ['type','calibrant','binType','SampleShape',]:    #strings
279                        save[key] = val
280                    elif key in ['rotation']:
281                        save[key] = float(val)
282                    elif key in ['center',]:
283                        if ',' in val:
284                            save[key] = eval(val)
285                        else:
286                            vals = val.strip('[] ').split()
287                            save[key] = [float(vals[0]),float(vals[1])] 
288                    elif key in cntlList:
289                        save[key] = eval(val)
290                    S = File.readline()
291                data.update(save)
292                UpdateImageControls(G2frame,data,masks)
293                G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
294               
295                File.close()
296        finally:
297            dlg.Destroy()
298           
299# Sizers
300                                       
301    def ComboSizer():
302
303        def OnDataType(event):
304            data['type'] = typeSel.GetValue()[:4]
305            if 'SASD' in data['type']:
306                data['SampleAbs'][0] = np.exp(-data['SampleAbs'][0]) #switch from muT to trans!
307                if data['binType'] == '2-theta': data['binType'] = 'log(q)'  #switch default bin type
308            elif 'PWDR' in data['type']:
309                data['SampleAbs'][0] = -np.log(data['SampleAbs'][0])  #switch from trans to muT!
310                if data['binType'] == 'log(q)': data['binType'] = '2-theta'  #switch default bin type                 
311            wx.CallAfter(UpdateImageControls,G2frame,data,masks)
312   
313        def OnNewColorBar(event):
314            data['color'] = colSel.GetValue()
315            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
316       
317        def OnAzmthOff(event):
318            try:
319                azmthoff = float(azmthOff.GetValue())
320                data['azmthOff'] = azmthoff
321            except ValueError:
322                pass
323            azmthOff.SetValue("%.2f"%(data['azmthOff']))          #reset in case of error 
324            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
325       
326        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
327        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Type of image data: '),0,WACV)
328        typeSel = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=typeDict[data['type']],choices=typeList,
329            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
330        typeSel.SetValue(data['type'])
331        typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnDataType)
332        comboSizer.Add(typeSel,0,WACV)
333        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Color bar '),0,WACV)
334        colSel = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=data['color'],choices=colorList,
335            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN|wx.CB_SORT)
336        colSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnNewColorBar)
337        comboSizer.Add(colSel,0,WACV)
338        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Azimuth offset '),0,WACV)
339        azmthOff = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.2f" % (data['azmthOff'])),
340            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
341        azmthOff.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnAzmthOff)
342        azmthOff.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnAzmthOff)
343        comboSizer.Add(azmthOff,0,WACV)
344        return comboSizer
345       
346    def MaxSizer():
347               
348        def OnMaxVal(event):
349            try:
350                value = min(data['range'][0][1],int(maxVal.GetValue()))
351                if value < data['range'][1][0]+1:
352                    raise ValueError
353                data['range'][1][1] = value
354            except ValueError:
355                pass
356            maxVal.SetValue('%.0f'%(data['range'][1][1]))
357            DeltOne = data['range'][1][1]-max(0.0,data['range'][0][0])
358            sqrtDeltOne = math.sqrt(DeltOne)
359            maxSel.SetValue(int(100*sqrtDeltOne/sqrtDeltZero))
360            minSel.SetValue(int(100*(data['range'][1][0]/DeltOne)))
361            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
362           
363        def OnMinVal(event):
364            try:
365                value = int(minVal.GetValue())
366                if value > data['range'][1][1]-1:
367                    raise ValueError
368                data['range'][1][0] = value
369            except ValueError:
370                pass
371            minVal.SetValue('%.0f'%(data['range'][1][0]))
372            minSel.SetValue(int(100*(data['range'][1][0]-max(0.0,data['range'][0][0]))/DeltOne))
373            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
374           
375        def OnMaxSlider(event):
376            sqrtDeltZero = math.sqrt(data['range'][0][1])
377            imax = int(maxSel.GetValue())*sqrtDeltZero/100.
378            data['range'][1][1] = imax**2
379            data['range'][1][0] = max(0.0,min(data['range'][1][1]-1,data['range'][1][0]))
380            DeltOne = max(1.0,data['range'][1][1]-data['range'][1][0])
381            minSel.SetValue(int(100*(data['range'][1][0]/DeltOne)))
382            maxVal.SetValue('%.0f'%(data['range'][1][1]))
383            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
384           
385        def OnMinSlider(event):
386            DeltOne = data['range'][1][1]-data['range'][1][0]
387            imin = int(minSel.GetValue())*DeltOne/100.
388            data['range'][1][0] = max(0.0,min(data['range'][1][1]-1,imin))
389            minVal.SetValue('%.0f'%(data['range'][1][0]))
390            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
391           
392        maxSizer = wx.FlexGridSizer(2,3,0,5)
393        maxSizer.AddGrowableCol(1,1)
394        maxSizer.SetFlexibleDirection(wx.HORIZONTAL)
395        sqrtDeltZero = math.sqrt(data['range'][0][1]-max(0.0,data['range'][0][0]))
396        DeltOne = data['range'][1][1]-max(0.0,data['range'][0][0])
397        sqrtDeltOne = math.sqrt(DeltOne)
398        maxSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Max intensity'),0,WACV)
399        maxSel = wx.Slider(parent=G2frame.dataDisplay,style=wx.SL_HORIZONTAL,
400            value=int(100*sqrtDeltOne/sqrtDeltZero))
401        maxSizer.Add(maxSel,1,wx.EXPAND)
402        maxSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnMaxSlider)
403        maxVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value='%.0f'%(data['range'][1][1]))
404        maxVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnMaxVal)   
405        maxVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnMaxVal)
406        maxSizer.Add(maxVal,0,WACV)   
407        maxSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Min intensity'),0,WACV)
408        minSel = wx.Slider(parent=G2frame.dataDisplay,style=wx.SL_HORIZONTAL,
409            value=int(100*(data['range'][1][0]-max(0.0,data['range'][0][0]))/DeltOne))
410        maxSizer.Add(minSel,1,wx.EXPAND)
411        minSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnMinSlider)
412        minVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value='%.0f'%(data['range'][1][0]))
413        minVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnMinVal)   
414        minVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnMinVal)
415        maxSizer.Add(minVal,0,WACV)
416        return maxSizer
417       
418    def CalibCoeffSizer():
419       
420        def OnWavelength(event):
421            try:
422                wave = float(waveSel.GetValue())
423                if wave < .01:
424                    raise ValueError
425                data['wavelength'] = wave
426            except ValueError:
427                pass
428            waveSel.SetValue("%7.5f" % (data['wavelength']))          #reset in case of error
429           
430        def OnDetDepthRef(event):
431            data['DetDepthRef'] = penSel.GetValue()
432           
433        def OnDetDepth(event):
434            try:
435                data['DetDepth'] = float(penVal.GetValue())
436            except ValueError:
437                pass
438            penVal.SetValue("%6.3f" % (data['DetDepth']))          #reset in case of error                     
439           
440        calibSizer = wx.FlexGridSizer(5,2,5,5)
441        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Calibration coefficients'),0,WACV)   
442        calibSizer.Add((5,0),0)       
443        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Beam center X,Y'),0,WACV)
444        cent = data['center']
445        centText = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%7.2f,%7.2f" % (cent[0],cent[1])),style=wx.TE_READONLY)
446        centText.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
447        calibSizer.Add(centText,0,WACV)       
448        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Wavelength'),0,WACV)
449        waveSel = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%7.5f" % (data['wavelength'])),
450            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
451        waveSel.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnWavelength)
452        waveSel.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnWavelength)
453        calibSizer.Add(waveSel,0,WACV)             
454        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Distance'),0,WACV)
455        distSel = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%8.2f"%(data['distance'])),style=wx.TE_READONLY)
456        distSel.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
457        calibSizer.Add(distSel,0,WACV)
458        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Tilt angle'),0,WACV)
459        tiltSel = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%9.3f"%(data['tilt'])),style=wx.TE_READONLY)
460        tiltSel.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
461        calibSizer.Add(tiltSel,0,WACV)
462        calibSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Tilt rotation'),0,WACV)
463        rotSel = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%9.3f"%(data['rotation'])),style=wx.TE_READONLY)
464        rotSel.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
465        calibSizer.Add(rotSel,0,WACV)
466        if 'PWDR' in data['type']:
467            penSel = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Penetration?')
468            calibSizer.Add(penSel,0,WACV)
469            penSel.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnDetDepthRef)
470            penSel.SetValue(data['DetDepthRef'])
471            penVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%6.5f" % (data['DetDepth'])),
472                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
473            penVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnDetDepth)
474            penVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnDetDepth)
475            calibSizer.Add(penVal,0,WACV)             
476       
477        return calibSizer
478   
479    def IntegrateSizer():
480       
481        def OnNewBinType(event):
482            data['binType'] = binSel.GetValue()
483       
484        def OnIOtth(event):
485            Ltth = max(float(G2frame.InnerTth.GetValue()),0.001)
486            Utth = float(G2frame.OuterTth.GetValue())
487            if Ltth > Utth:
488                Ltth,Utth = Utth,Ltth
489            data['IOtth'] = [Ltth,Utth]
490            G2frame.InnerTth.SetValue("%8.3f" % (Ltth))
491            G2frame.OuterTth.SetValue("%8.2f" % (Utth))
492            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
493       
494        def OnLRazim(event):
495            Lazm = int(G2frame.Lazim.GetValue())%360
496            Razm = int(G2frame.Razim.GetValue())%360
497            if Lazm > Razm:
498                Razm += 360
499            if data['fullIntegrate']:
500                Razm = Lazm+360
501            G2frame.Lazim.SetValue("%6d" % (Lazm))
502            G2frame.Razim.SetValue("%6d" % (Razm))
503            data['LRazimuth'] = [Lazm,Razm]
504            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
505       
506        def OnNumOutChans(event):
507            try:
508                numChans = int(outChan.GetValue())
509                if numChans < 10:
510                    raise ValueError
511                data['outChannels'] = numChans
512            except ValueError:
513                pass
514            outChan.SetValue(str(data['outChannels']))          #reset in case of error       
515       
516        def OnNumOutAzms(event):
517            try:
518                numAzms = int(outAzim.GetValue())
519                if numAzms < 1:
520                    raise ValueError
521                data['outAzimuths'] = numAzms           
522            except ValueError:
523                pass
524            outAzim.SetValue(str(data['outAzimuths']))          #reset in case of error       
525            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
526       
527        def OnOblique(event):
528            if data['Oblique'][1]:
529                data['Oblique'][1] = False
530            else:
531                data['Oblique'][1] = True
532               
533        def OnObliqVal(event):
534            try:
535                value = float(obliqVal.GetValue())
536                if 0.01 <= value <= 0.99:
537                    data['Oblique'][0] = value
538                else:
539                    raise ValueError
540            except ValueError:
541                pass
542            obliqVal.SetValue('%.3f'%(data['Oblique'][0]))
543                           
544        def OnSamAbs(event):
545            if data['SampleAbs'][1]:
546                data['SampleAbs'][1] = False
547            else:
548                data['SampleAbs'][1] = True
549               
550        def OnSamAbsVal(event):
551            try:
552                value = float(samabsVal.GetValue())
553                minmax = [0.,2.]
554                if 'SASD' in data['type']:
555                    minmax = [.05,1.0]
556                if minmax[0] <= value <= minmax[1]:
557                    data['SampleAbs'][0] = value
558                else:
559                    raise ValueError
560            except ValueError:
561                pass
562            samabsVal.SetValue('%.3f'%(data['SampleAbs'][0]))
563                           
564        def OnShowLines(event):
565            if data['showLines']:
566                data['showLines'] = False
567            else:
568                data['showLines'] = True
569            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
570           
571        def OnFullIntegrate(event):
572            Lazm =int(G2frame.Lazim.GetValue())
573            if data['fullIntegrate']:
574                data['fullIntegrate'] = False
575                data['LRazimuth'] = [Lazm,Lazm+20]
576            else:
577                data['fullIntegrate'] = True
578                data['LRazimuth'] = [Lazm,Lazm+360]
579            UpdateImageControls(G2frame,data,masks)
580            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
581           
582        def OnSetDefault(event):
583            import copy
584            if data['setDefault']:
585                G2frame.imageDefault = {}
586                data['setDefault'] = False
587            else:
588                G2frame.imageDefault = copy.copy(data)
589                data['setDefault'] = True
590               
591        def OnCenterAzm(event):
592            if data['centerAzm']:
593                data['centerAzm'] = False
594            else:
595                data['centerAzm'] = True
596            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
597               
598        def OnApplyPola(event):
599            if data['PolaVal'][1]:
600                data['PolaVal'][1] = False
601            else:
602                data['PolaVal'][1] = True
603               
604        def OnPolaVal(event):
605            try:
606                value = float(polaVal.GetValue())
607                if 0.001 <= value <= 0.999:
608                    data['PolaVal'][0] = value
609                else:
610                    raise ValueError
611            except ValueError:
612                pass
613            polaVal.SetValue('%.3f'%(data['PolaVal'][0]))
614                           
615        dataSizer = wx.FlexGridSizer(5,2,5,3)
616        dataSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Integration coefficients'),0,WACV)   
617        dataSizer.Add((5,0),0)
618        if 'PWDR' in data['type']:
619            binChoice = ['2-theta','q']
620        elif 'SASD' in data['type']:
621            binChoice = ['q','log(q)']
622        dataSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Bin style: Constant step bins in'),0,WACV)           
623        binSel = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=data['binType'],choices=binChoice,
624            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN|wx.CB_SORT)
625        binSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnNewBinType)
626        dataSizer.Add(binSel,0,WACV)
627        dataSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Inner/Outer 2-theta'),0,WACV)           
628        IOtth = data['IOtth']
629        littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
630        G2frame.InnerTth = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
631            value=("%8.3f" % (IOtth[0])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
632        G2frame.InnerTth.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnIOtth)
633        G2frame.InnerTth.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnIOtth)
634        littleSizer.Add(G2frame.InnerTth,0,WACV)
635        G2frame.OuterTth = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
636            value=("%8.2f" % (IOtth[1])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
637        G2frame.OuterTth.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnIOtth)
638        G2frame.OuterTth.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnIOtth)
639        littleSizer.Add(G2frame.OuterTth,0,WACV)
640        dataSizer.Add(littleSizer,0,)
641        dataSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Start/End azimuth'),0,WACV)
642        LRazim = data['LRazimuth']
643        littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
644        G2frame.Lazim = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
645            value=("%6d" % (LRazim[0])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
646        G2frame.Lazim.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnLRazim)
647        G2frame.Lazim.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnLRazim)
648        littleSizer.Add(G2frame.Lazim,0,WACV)
649        G2frame.Razim = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
650            value=("%6d" % (LRazim[1])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
651        G2frame.Razim.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnLRazim)
652        G2frame.Razim.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnLRazim)
653        if data['fullIntegrate']:
654            G2frame.Razim.Enable(False)
655            G2frame.Razim.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
656            G2frame.Razim.SetValue("%6d" % (LRazim[0]+360))
657        littleSizer.Add(G2frame.Razim,0,WACV)
658        dataSizer.Add(littleSizer,0,)
659        dataSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' No. 2-theta/azimuth bins'),0,WACV)
660        littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
661        outChan = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=str(data['outChannels']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
662        outChan.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnNumOutChans)
663        outChan.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnNumOutChans)
664        littleSizer.Add(outChan,0,WACV)
665        outAzim = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=str(data['outAzimuths']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
666        outAzim.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnNumOutAzms)
667        outAzim.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnNumOutAzms)
668        littleSizer.Add(outAzim,0,WACV)
669        dataSizer.Add(littleSizer,0,)
670        littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
671        samabs = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Apply sample absorption?')
672        dataSizer.Add(samabs,0,WACV)
673        samabs.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnSamAbs)
674        samabs.SetValue(data['SampleAbs'][1])
675        if 'PWDR' in data['type']:
676            littleSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label='mu/R (0.00-2.0) '),0,WACV)
677        elif 'SASD' in data['type']:
678            littleSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label='transmission '),0,WACV)
679        samabsVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value='%.3f'%(data['SampleAbs'][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)           
680        samabsVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnSamAbsVal)
681        samabsVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnSamAbsVal)
682        littleSizer.Add(samabsVal,0,WACV)
683        dataSizer.Add(littleSizer,0,)
684        if 'PWDR' in data['type']:
685            littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
686            oblique = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Apply detector absorption?')
687            dataSizer.Add(oblique,0,WACV)
688            oblique.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnOblique)
689            oblique.SetValue(data['Oblique'][1])
690            littleSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label='Value (0.01-0.99)  '),0,WACV)
691            obliqVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value='%.3f'%(data['Oblique'][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
692            obliqVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnObliqVal)
693            obliqVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnObliqVal)
694            littleSizer.Add(obliqVal,0,WACV)
695            dataSizer.Add(littleSizer,0,)
696        if 'SASD' in data['type']:
697            littleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
698            setPolariz = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Apply polarization?')
699            dataSizer.Add(setPolariz,0,WACV)
700            setPolariz.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnApplyPola)
701            setPolariz.SetValue(data['PolaVal'][1])
702            littleSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label='Value (0.001-0.999)  '),0,WACV)
703            polaVal = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value='%.3f'%(data['PolaVal'][0]),
704                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
705            polaVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnPolaVal)
706            polaVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnPolaVal)
707            littleSizer.Add(polaVal,0,WACV)
708            dataSizer.Add(littleSizer,0,)
709       
710        showLines = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Show integration limits?')
711        dataSizer.Add(showLines,0,WACV)
712        showLines.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnShowLines)
713        showLines.SetValue(data['showLines'])
714        fullIntegrate = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Do full integration?')
715        dataSizer.Add(fullIntegrate,0,WACV)
716        fullIntegrate.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnFullIntegrate)
717        fullIntegrate.SetValue(data['fullIntegrate'])
718        setDefault = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Use as default for all images?')
719        dataSizer.Add(setDefault,0,WACV)
720        setDefault.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnSetDefault)
721        setDefault.SetValue(data['setDefault'])
722        centerAzm = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Azimuth at bin center?')
723        dataSizer.Add(centerAzm,0,WACV)
724        centerAzm.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnCenterAzm)
725        centerAzm.SetValue(data['centerAzm'])
726        return dataSizer
727       
728    def BackSizer():
729       
730        def OnBackImage(event):
731            data['background image'][0] = backImage.GetValue()
732           
733        def OnDarkImage(event):
734            data['dark image'][0] = darkImage.GetValue()
735
736        def OnBackMult(event):
737            try:
738                mult = float(backMult.GetValue())
739                data['background image'][1] = mult
740            except ValueError:
741                pass
742            backMult.SetValue("%.3f" % (data['background image'][1]))          #reset in case of error
743       
744        def OnDarkMult(event):
745            try:
746                mult = float(darkMult.GetValue())
747                data['dark image'][1] = mult
748            except ValueError:
749                pass
750            darkMult.SetValue("%.3f" % (data['dark image'][1]))          #reset in case of error
751       
752        backSizer = wx.FlexGridSizer(1,4,5,5)
753
754        backSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,' Dark image'),0,WACV)
755        Choices = ['',]+G2gd.GetPatternTreeDataNames(G2frame,['IMG ',])
756        darkImage = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=data['dark image'][0],choices=Choices,
757            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
758        darkImage.Bind(wx.EVT_COMBOBOX,OnDarkImage)
759        backSizer.Add(darkImage)
760        backSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,' multiplier'),0,WACV)
761        darkMult =  wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (data['dark image'][1])),
762            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
763        darkMult.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnDarkMult)
764        darkMult.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnDarkMult)
765        backSizer.Add(darkMult,0,WACV)
766
767        backSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,' Background image'),0,WACV)
768        Choices = ['',]+G2gd.GetPatternTreeDataNames(G2frame,['IMG ',])
769        backImage = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=data['background image'][0],choices=Choices,
770            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
771        backImage.Bind(wx.EVT_COMBOBOX,OnBackImage)
772        backSizer.Add(backImage)
773        backSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,' multiplier'),0,WACV)
774        backMult =  wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (data['background image'][1])),
775            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
776        backMult.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnBackMult)
777        backMult.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnBackMult)
778        backSizer.Add(backMult,0,WACV)
779        return backSizer
780                       
781    def CalibSizer():
782               
783        def OnNewCalibrant(event):
784            data['calibrant'] = calSel.GetValue()
785            data['calibskip'] = calFile.Calibrants[data['calibrant']][3]
786            limits = calFile.Calibrants[data['calibrant']][4]
787            data['calibdmin'],data['pixLimit'],data['cutoff'] = limits
788            pixLimit.SetValue(str(limits[1]))
789            cutOff.SetValue('%.1f'%(limits[2]))
790            calibSkip.SetValue(str(data['calibskip']))
791            calibDmin.SetValue('%.1f'%(limits[0]))
792           
793        def OnCalibSkip(event):
794            data['calibskip'] = int(calibSkip.GetValue())
795           
796        def OnCalibDmin(event):
797            try:
798                dmin = float(calibDmin.GetValue())
799                if dmin < 0.25:
800                    raise ValueError
801                data['calibdmin'] = dmin
802            except ValueError:
803                pass
804            calibDmin.SetValue("%.2f"%(data['calibdmin']))          #reset in case of error 
805                   
806        def OnCutOff(event):
807            try:
808                cutoff = float(cutOff.GetValue())
809                if cutoff < 0.1:
810                    raise ValueError
811                data['cutoff'] = cutoff
812            except ValueError:
813                pass
814            cutOff.SetValue("%.1f"%(data['cutoff']))          #reset in case of error 
815       
816        def OnPixLimit(event):
817            data['pixLimit'] = int(pixLimit.GetValue())
818           
819        def OnSetRings(event):
820            if data['setRings']:
821                data['setRings'] = False
822            else:
823                data['setRings'] = True
824            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
825   
826        calibSizer = wx.FlexGridSizer(2,3,5,5)
827        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)   
828        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Calibrant '),0,WACV)
829        calSel = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=data['calibrant'],choices=calList,
830            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN|wx.CB_SORT)
831        calSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnNewCalibrant)
832        comboSizer.Add(calSel,0,WACV)
833        calibSizer.Add(comboSizer,0)
834       
835        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)   
836        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Calib lines to skip   '),0,WACV)
837        calibSkip  = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=str(data['calibskip']),choices=[str(i) for i in range(25)],
838            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
839        calibSkip.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnCalibSkip)
840        comboSizer.Add(calibSkip,0,WACV)
841        calibSizer.Add(comboSizer,0)
842       
843        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)       
844        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Min calib d-spacing '),0,WACV)
845        calibDmin = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.2f" % (data['calibdmin'])),
846            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
847        calibDmin.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnCalibDmin)
848        calibDmin.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnCalibDmin)
849        comboSizer.Add(calibDmin,0,WACV)
850        calibSizer.Add(comboSizer,0)
851       
852        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
853        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Min ring I/Ib '),0,WACV)
854        cutOff = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.1f" % (data['cutoff'])),
855            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
856        cutOff.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnCutOff)
857        cutOff.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnCutOff)
858        comboSizer.Add(cutOff,0,WACV)
859        calibSizer.Add(comboSizer,0)
860       
861        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
862        comboSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Pixel search range '),0,WACV)
863        pixLimit = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=str(data['pixLimit']),choices=['1','2','5','10','15','20'],
864            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
865        pixLimit.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnPixLimit)
866        comboSizer.Add(pixLimit,0,WACV)
867        calibSizer.Add(comboSizer,0)
868       
869        comboSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
870        setRings = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='Show ring picks?')
871        comboSizer.Add(setRings,0)
872        setRings.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnSetRings)
873        setRings.SetValue(data['setRings'])
874        calibSizer.Add(comboSizer,0)
875        return calibSizer
876       
877    def GonioSizer():
878       
879        ValObj = {}
880       
881        def OnGonioAngle(event):
882            Obj = event.GetEventObject()
883            item = ValObj[Obj.GetId()]
884            try:
885                value = float(Obj.GetValue())
886            except ValueError:
887                value = data['GonioAngles'][item]
888            data['GonioAngles'][item] = value
889            Obj.SetValue('%8.2f'%(value))
890       
891        gonioSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
892        names = ['Omega','Chi','Phi']
893        gonioSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,'Sample goniometer angles: '),0,WACV)
894        for i,name in enumerate(names):
895            gonioSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,name),0,WACV)
896            angle = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,-1,value='%8.2f'%(data['GonioAngles'][i]),
897                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
898            angle.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnGonioAngle)
899            angle.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnGonioAngle)
900            ValObj[angle.GetId()] = i
901            gonioSizer.Add(angle,0,WACV)
902        return gonioSizer
903       
904# Image Controls main code             
905                           
906    #fix for old files:
907    if 'azmthOff' not in data:
908        data['azmthOff'] = 0.0
909    if 'background image' not in data:
910        data['background image'] = ['',-1.0]
911    if 'dark image' not in data:
912        data['dark image'] = ['',-1.0]
913    if 'centerAzm' not in data:
914        data['centerAzm'] = False
915    if 'Oblique' not in data:
916        data['Oblique'] = [0.5,False]
917    if 'PolaVal' not in data:
918        data['PolaVal'] = [0.99,False]
919    #end fix
920   
921    colorList = [m for m in mpl.cm.datad.keys() if not m.endswith("_r")]
922    calList = [m for m in calFile.Calibrants.keys()]
923    typeList = ['PWDR - powder diffraction data','SASD - small angle scattering data',
924        'REFL - reflectometry data']
925    if not data.get('type'):                        #patch for old project files
926        data['type'] = 'PWDR'
927    typeDict = {'PWDR':typeList[0],'SASD':typeList[1],'REFL':typeList[2]}
928    if G2frame.dataDisplay:
929        G2frame.dataDisplay.Destroy()
930    G2gd.SetDataMenuBar(G2frame,G2frame.dataFrame.ImageMenu)
931    if not G2frame.dataFrame.GetStatusBar():
932        G2frame.dataFrame.CreateStatusBar()
933    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnCalibrate, id=G2gd.wxID_IMCALIBRATE)
934    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnRecalibrate, id=G2gd.wxID_IMRECALIBRATE)
935    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnClearCalib, id=G2gd.wxID_IMCLEARCALIB)
936    if 'chisq' not in data:
937        G2frame.dataFrame.ImageEdit.Enable(id=G2gd.wxID_IMRECALIBRATE,enable=False)   
938    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnIntegrate, id=G2gd.wxID_IMINTEGRATE)
939    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnIntegrateAll, id=G2gd.wxID_INTEGRATEALL)
940    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnCopyControls, id=G2gd.wxID_IMCOPYCONTROLS)
941    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnSaveControls, id=G2gd.wxID_IMSAVECONTROLS)
942    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnLoadControls, id=G2gd.wxID_IMLOADCONTROLS)
943    G2frame.dataDisplay = wx.Panel(G2frame.dataFrame)
944
945    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
946    mainSizer.Add((5,10),0)   
947    mainSizer.Add(ComboSizer(),0,wx.ALIGN_LEFT)
948    mainSizer.Add((5,5),0)           
949    mainSizer.Add(MaxSizer(),0,wx.ALIGN_LEFT|wx.EXPAND)
950   
951    mainSizer.Add((5,5),0)
952    DataSizer = wx.FlexGridSizer(1,2,5,5)
953    DataSizer.Add(CalibCoeffSizer(),0)
954    DataSizer.Add(IntegrateSizer(),0)       
955    mainSizer.Add(DataSizer,0)
956    mainSizer.Add((5,5),0)           
957    mainSizer.Add(BackSizer(),0)
958    mainSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Calibration controls:'),0,WACV)
959    mainSizer.Add((5,5),0)
960    mainSizer.Add(CalibSizer(),0,WACV)
961    mainSizer.Add((5,5),0)
962    mainSizer.Add(GonioSizer(),0,WACV)   
963       
964    mainSizer.Layout()   
965    G2frame.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
966    fitSize = mainSizer.Fit(G2frame.dataFrame)
967    G2frame.dataFrame.setSizePosLeft(fitSize)
968    G2frame.dataDisplay.SetSize(fitSize)
969   
970################################################################################
971##### Masks
972################################################################################
973   
974def UpdateMasks(G2frame,data):
975    '''Shows and handles the controls on the "Masks"
976    data tree entry
977    '''
978   
979    def OnTextMsg(event):
980        Obj = event.GetEventObject()
981        Obj.SetToolTipString('Drag this mask on 2D Powder Image with mouse to change ')
982       
983    def OnThreshold(event):
984        try:
985            lower = max(int(lowerThreshold.GetValue()),thresh[0][0])
986        except ValueError:
987            lower = thresh[0][0]
988        try:
989            upper = min(int(upperThreshold.GetValue()),thresh[0][1])
990        except ValueError:
991            upper = thresh[0][1]
992        data['Thresholds'][1] = [lower,upper]
993        lowerThreshold.SetValue("%8d" % (lower))
994        upperThreshold.SetValue("%8d" % (upper))
995        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
996       
997    def OnSpotDiameter(event):
998        Obj = event.GetEventObject()
999        try:
1000            diameter = min(100.,max(0.1,float(Obj.GetValue())))
1001        except ValueError:
1002            diameter = 1.0
1003        Obj.SetValue("%.2f"%(diameter))
1004        data['Points'][spotIds.index(Obj.GetId())][2] = diameter
1005        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1006       
1007    def OnDeleteSpot(event):
1008        Obj = event.GetEventObject()
1009        del(data['Points'][delSpotId.index(Obj)])
1010        UpdateMasks(G2frame,data)
1011        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1012       
1013    def OnRingThickness(event):
1014        Obj = event.GetEventObject()
1015        try:
1016            thick = min(1.0,max(0.001,float(Obj.GetValue())))
1017        except ValueError:
1018            thick = 0.1
1019        Obj.SetValue("%.3f"%(thick))
1020        data['Rings'][ringIds.index(Obj.GetId())][1] = thick
1021        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1022       
1023    def OnDeleteRing(event):
1024        Obj = event.GetEventObject()
1025        del(data['Rings'][delRingId.index(Obj)])
1026        UpdateMasks(G2frame,data)
1027        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1028
1029    def OnArcThickness(event):
1030        Obj = event.GetEventObject()
1031        try:
1032            thick = min(20.0,max(0.001,float(Obj.GetValue())))
1033        except ValueError:
1034            thick = 0.1
1035        Obj.SetValue("%.3f"%(thick))
1036        data['Arcs'][arcIds.index(Obj.GetId())][2] = thick
1037        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1038       
1039    def OnDeleteArc(event):
1040        Obj = event.GetEventObject()
1041        del(data['Arcs'][delArcId.index(Obj)])
1042        UpdateMasks(G2frame,data)
1043        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1044
1045    def OnDeletePoly(event):
1046        Obj = event.GetEventObject()
1047        del(data['Polygons'][delPolyId.index(Obj)])
1048        UpdateMasks(G2frame,data)
1049        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1050
1051    def OnDeleteFrame(event):
1052        data['Frames'] = []
1053        UpdateMasks(G2frame,data)
1054        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1055
1056    def OnCopyMask(event):
1057        import copy
1058        TextList = [[False,'All IMG',0]]
1059        Names = []
1060        if G2frame.PatternTree.GetCount():
1061            id, cookie = G2frame.PatternTree.GetFirstChild(G2frame.root)
1062            while id:
1063                name = G2frame.PatternTree.GetItemText(id)
1064                Names.append(name)
1065                if 'IMG' in name:
1066                    if id == G2frame.Image:
1067                        Source = name
1068                        Mask = copy.deepcopy(G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Masks')))
1069                    else:
1070                        TextList.append([False,name,id])
1071                id, cookie = G2frame.PatternTree.GetNextChild(G2frame.root, cookie)
1072            if len(TextList) == 1:
1073                G2frame.ErrorDialog('Nothing to copy mask to','There must be more than one "IMG" pattern')
1074                return
1075            dlg = G2frame.CopyDialog(G2frame,'Copy mask information','Copy mask from '+Source+' to:',TextList)
1076            try:
1077                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1078                    result = dlg.GetData()
1079                    if result[0][0]:
1080                        result = TextList[1:]
1081                        for item in result: item[0] = True
1082                    for i,item in enumerate(result):
1083                        ifcopy,name,id = item
1084                        if ifcopy:
1085                            mask = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Masks'))
1086                            Mask['Thresholds'][0] = mask['Thresholds'][0]
1087                            Mask['Thresholds'][1][1] = min(mask['Thresholds'][1][1],Mask['Thresholds'][1][1])
1088                            mask.update(Mask)                               
1089                            G2frame.PatternTree.SetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Masks'),copy.deepcopy(mask))
1090            finally:
1091                dlg.Destroy()
1092               
1093    def OnSaveMask(event):
1094        dlg = wx.FileDialog(G2frame, 'Choose image mask file', '.', '', 
1095            'image mask files (*.immask)|*.immask',wx.FD_SAVE|wx.FD_OVERWRITE_PROMPT|wx.CHANGE_DIR)
1096        try:
1097            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1098                filename = dlg.GetPath()
1099                File = open(filename,'w')
1100                save = {}
1101                keys = ['Points','Rings','Arcs','Polygons','Frames','Thresholds']
1102                for key in keys:
1103                    File.write(key+':'+str(data[key])+'\n')
1104                File.close()
1105        finally:
1106            dlg.Destroy()
1107       
1108    def OnLoadMask(event):
1109        dlg = wx.FileDialog(G2frame, 'Choose image mask file', '.', '', 
1110            'image mask files (*.immask)|*.immask',wx.OPEN|wx.CHANGE_DIR)
1111        try:
1112            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1113                filename = dlg.GetPath()
1114                File = open(filename,'r')
1115                save = {}
1116                oldThreshold = data['Thresholds'][0]
1117                S = File.readline()
1118                while S:
1119                    if S[0] == '#':
1120                        S = File.readline()
1121                        continue
1122                    [key,val] = S[:-1].split(':')
1123                    if key in ['Points','Rings','Arcs','Polygons','Frames','Thresholds']:
1124                        save[key] = eval(val)
1125                        if key == 'Thresholds':
1126                            save[key][0] = oldThreshold
1127                            save[key][1][1] = min(oldThreshold[1],save[key][1][1])
1128                    S = File.readline()
1129                data.update(save)
1130                UpdateMasks(G2frame,data)
1131                G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1132               
1133                File.close()
1134        finally:
1135            dlg.Destroy()
1136           
1137    def OnNewSpotMask(event):
1138        'Start a new spot mask'
1139        G2frame.MaskKey = 's'
1140        G2plt.OnStartMask(G2frame)
1141       
1142    def OnNewArcMask(event):
1143        'Start a new arc mask'
1144        G2frame.MaskKey = 'a'
1145        G2plt.OnStartMask(G2frame)
1146       
1147    def OnNewRingMask(event):
1148        'Start a new ring mask'
1149        G2frame.MaskKey = 'r'
1150        G2plt.OnStartMask(G2frame)
1151       
1152    def OnNewPolyMask(event):
1153        'Start a new polygon mask'
1154        G2frame.MaskKey = 'p'
1155        G2plt.OnStartMask(G2frame)
1156       
1157    def OnNewFrameMask(event):
1158        'Start a new Frame mask'
1159        G2frame.MaskKey = 'f'
1160        G2plt.OnStartMask(G2frame)
1161               
1162    if G2frame.dataDisplay:
1163        G2frame.dataDisplay.Destroy()
1164    G2gd.SetDataMenuBar(G2frame,G2frame.dataFrame.MaskMenu)
1165    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnCopyMask, id=G2gd.wxID_MASKCOPY)
1166    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnLoadMask, id=G2gd.wxID_MASKLOAD)
1167    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnSaveMask, id=G2gd.wxID_MASKSAVE)
1168    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnNewSpotMask, id=G2gd.wxID_NEWMASKSPOT)
1169    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnNewArcMask, id=G2gd.wxID_NEWMASKARC)
1170    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnNewRingMask, id=G2gd.wxID_NEWMASKRING)
1171    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnNewPolyMask, id=G2gd.wxID_NEWMASKPOLY)
1172    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnNewFrameMask, id=G2gd.wxID_NEWMASKFRAME)
1173    if not G2frame.dataFrame.GetStatusBar():
1174        Status = G2frame.dataFrame.CreateStatusBar()
1175    if G2frame.MaskKey == 'f':
1176        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Frame mask active - LB pick next point, RB close polygon')
1177    elif G2frame.MaskKey == 'p':
1178        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Polygon mask active - LB pick next point, RB close polygon')
1179    elif G2frame.MaskKey == 's':
1180        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Spot mask active - LB pick spot location')
1181    elif G2frame.MaskKey == 'a':
1182        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Arc mask active - LB pick arc location')
1183    elif G2frame.MaskKey == 'r':
1184        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Ring mask active - LB pick ring location')
1185    else:
1186        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText("To add mask: On 2D Powder Image, key a:arc, r:ring, s:spot, p:polygon, f:frame")
1187    G2frame.dataDisplay = wx.Panel(G2frame.dataFrame)
1188    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1189    mainSizer.Add((5,10),0)
1190
1191    thresh = data['Thresholds']         #min/max intensity range
1192    spots = data['Points']               #x,y,radius in mm
1193    rings = data['Rings']               #radius, thickness
1194    polygons = data['Polygons']         #3+ x,y pairs
1195    if 'Frames' not in data:
1196        data['Frames'] = []
1197    frame = data['Frames']             #3+ x,y pairs
1198    arcs = data['Arcs']                 #radius, start/end azimuth, thickness
1199   
1200    littleSizer = wx.FlexGridSizer(2,3,0,5)
1201    littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Lower/Upper limits '),0,WACV)
1202    Text = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,value=("%8d" % (thresh[0][0])),style=wx.TE_READONLY)
1203    littleSizer.Add(Text,0,WACV)
1204    Text.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1205    Text = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,value=("%8d" % (thresh[0][1])),style=wx.TE_READONLY)
1206    littleSizer.Add(Text,0,WACV)
1207    Text.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1208    littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Lower/Upper thresholds '),0,WACV)
1209    lowerThreshold = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
1210        value=("%8d" % (thresh[1][0])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1211    lowerThreshold.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnThreshold)
1212    lowerThreshold.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnThreshold)
1213    littleSizer.Add(lowerThreshold,0,WACV)
1214    upperThreshold = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,
1215        value=("%8d" % (thresh[1][1])),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1216    upperThreshold.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnThreshold)
1217    upperThreshold.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnThreshold)
1218    littleSizer.Add(upperThreshold,0,WACV)
1219    mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1220    spotIds = []
1221    delSpotId = []
1222    if spots:
1223        littleSizer = wx.FlexGridSizer(len(spots)+2,3,0,5)
1224        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Spot masks:'),0,WACV)
1225        littleSizer.Add((5,0),0)
1226        littleSizer.Add((5,0),0)
1227        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' position, mm'),0,WACV)
1228        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' diameter, mm'),0,WACV)
1229        littleSizer.Add((5,0),0)
1230        for spot in spots:
1231            if spot:
1232                x,y,d = spot
1233                spotText = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.2f,%.2f" % (x,y)),
1234                    style=wx.TE_READONLY)
1235                spotText.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1236                littleSizer.Add(spotText,0,WACV)
1237                spotText.Bind(wx.EVT_ENTER_WINDOW,OnTextMsg)
1238                spotDiameter = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.2f" % (d)),
1239                    style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1240                littleSizer.Add(spotDiameter,0,WACV)
1241                spotDiameter.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnSpotDiameter)
1242                spotDiameter.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnSpotDiameter)
1243                spotIds.append(spotDiameter.GetId())
1244                spotDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1245                spotDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeleteSpot)
1246                delSpotId.append(spotDelete)
1247                littleSizer.Add(spotDelete,0,WACV)
1248        mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1249    ringIds = []
1250    delRingId = []
1251    if rings:
1252        littleSizer = wx.FlexGridSizer(len(rings)+2,3,0,5)
1253        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Ring masks:'),0,WACV)
1254        littleSizer.Add((5,0),0)
1255        littleSizer.Add((5,0),0)
1256        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' 2-theta,deg'),0,WACV)
1257        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' thickness, deg'),0,WACV)
1258        littleSizer.Add((5,0),0)
1259        for ring in rings:
1260            if ring:
1261                tth,thick = ring
1262                ringText = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (tth)),
1263                    style=wx.TE_READONLY)
1264                ringText.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1265                ringText.Bind(wx.EVT_ENTER_WINDOW,OnTextMsg)
1266                littleSizer.Add(ringText,0,WACV)
1267                ringThick = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (thick)),
1268                    style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1269                littleSizer.Add(ringThick,0,WACV)
1270                ringThick.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnRingThickness)
1271                ringThick.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnRingThickness)
1272                ringIds.append(ringThick.GetId())
1273                ringDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1274                ringDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeleteRing)
1275                delRingId.append(ringDelete)
1276                littleSizer.Add(ringDelete,0,WACV)
1277        mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1278    arcIds = []
1279    delArcId = []
1280    if arcs:
1281        littleSizer = wx.FlexGridSizer(len(rings)+2,4,0,5)
1282        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Arc masks:'),0,WACV)
1283        littleSizer.Add((5,0),0)
1284        littleSizer.Add((5,0),0)
1285        littleSizer.Add((5,0),0)
1286        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' 2-theta,deg'),0,WACV)
1287        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' azimuth, deg'),0,WACV)
1288        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' thickness, deg'),0,WACV)
1289        littleSizer.Add((5,0),0)
1290        for arc in arcs:
1291            if arc:
1292                tth,azimuth,thick = arc
1293                arcText = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (tth)),
1294                    style=wx.TE_READONLY)
1295                arcText.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1296                arcText.Bind(wx.EVT_ENTER_WINDOW,OnTextMsg)
1297                littleSizer.Add(arcText,0,WACV)
1298                azmText = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%d,%d" % (azimuth[0],azimuth[1])),
1299                    style=wx.TE_READONLY)
1300                azmText.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1301                azmText.Bind(wx.EVT_ENTER_WINDOW,OnTextMsg)
1302                littleSizer.Add(azmText,0,WACV)
1303                arcThick = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.3f" % (thick)),
1304                    style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1305                littleSizer.Add(arcThick,0,WACV)
1306                arcThick.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnArcThickness)
1307                arcThick.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnArcThickness)
1308                arcIds.append(arcThick.GetId())
1309                arcDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1310                arcDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeleteArc)
1311                delArcId.append(arcDelete)
1312                littleSizer.Add(arcDelete,0,WACV)
1313        mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1314    polyIds = []
1315    delPolyId = []
1316    delFrameId = []
1317    if polygons:
1318        littleSizer = wx.FlexGridSizer(len(polygons)+2,2,0,5)
1319        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Polygon masks:'),0,WACV)
1320        littleSizer.Add((5,0),0)
1321        for polygon in polygons:
1322            if polygon:
1323                polyList = []
1324                for x,y in polygon:
1325                    polyList.append("%.2f, %.2f"%(x,y))
1326                polyText = wx.ComboBox(G2frame.dataDisplay,value=polyList[0],choices=polyList,style=wx.CB_READONLY)
1327                littleSizer.Add(polyText,0,WACV)
1328                polyDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1329                polyDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeletePoly)
1330                delPolyId.append(polyDelete)
1331                littleSizer.Add(polyDelete,0,WACV)
1332        mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1333    if frame:
1334        littleSizer = wx.FlexGridSizer(3,2,0,5)
1335        littleSizer.Add(wx.StaticText(parent=G2frame.dataDisplay,label=' Frame mask:'),0,
1336            WACV)
1337        littleSizer.Add((5,0),0)
1338        frameList = []
1339        for x,y in frame:
1340            frameList.append("%.2f, %.2f"%(x,y))
1341        frameText = wx.ComboBox(G2frame.dataDisplay,value=frameList[0],choices=frameList,style=wx.CB_READONLY)
1342        littleSizer.Add(frameText,0,WACV)
1343        frameDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1344        frameDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeleteFrame)
1345        delFrameId.append(frameDelete)
1346        littleSizer.Add(frameDelete,0,WACV)
1347        mainSizer.Add(littleSizer,0,)
1348    if (frame or polygons):
1349        mainSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,
1350            label=' For frame and polygons: on plot RB vertex drag to move, LB vertex drag to insert'),0,WACV)
1351    mainSizer.Layout()   
1352    G2frame.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1353    G2frame.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(G2frame.dataFrame))
1354    Size = mainSizer.Fit(G2frame.dataFrame)
1355    Size[0] = 450
1356    G2frame.dataFrame.setSizePosLeft(Size)   
1357
1358################################################################################
1359##### Stress/Strain
1360################################################################################
1361
1362def UpdateStressStrain(G2frame,data):
1363    '''Shows and handles the controls on the "Stress/Strain"
1364    data tree entry
1365    '''
1366   
1367    def OnAppendDzero(event):
1368        data['d-zero'].append({'Dset':1.0,'Dcalc':0.0,'pixLimit':10,'cutoff':1.0,
1369            'ImxyObs':[[],[]],'ImtaObs':[[],[]],'ImtaCalc':[[],[]],'Emat':[1.0,1.0,1.0]})
1370        UpdateStressStrain(G2frame,data)
1371       
1372    def OnUpdateDzero(event):
1373        for item in data['d-zero']:
1374            if item['Dcalc']:   #skip unrefined ones
1375                item['Dset'] = item['Dcalc']
1376        UpdateStressStrain(G2frame,data)
1377           
1378    def OnCopyStrSta(event):
1379        import copy
1380        TextList = [[False,'All IMG',0]]
1381        Names = []
1382        if G2frame.PatternTree.GetCount():
1383            id, cookie = G2frame.PatternTree.GetFirstChild(G2frame.root)
1384            while id:
1385                name = G2frame.PatternTree.GetItemText(id)
1386                Names.append(name)
1387                if 'IMG' in name:
1388                    if id == G2frame.Image:
1389                        Source = name
1390                        Data = copy.deepcopy(G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Stress/Strain')))
1391                    else:
1392                        TextList.append([False,name,id])
1393                id, cookie = G2frame.PatternTree.GetNextChild(G2frame.root, cookie)
1394            if len(TextList) == 1:
1395                G2frame.ErrorDialog('Nothing to copy controls to','There must be more than one "IMG" pattern')
1396                return
1397            dlg = G2frame.CopyDialog(G2frame,'Copy stress/strain controls','Copy controls from '+Source+' to:',TextList)
1398            try:
1399                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1400                    result = dlg.GetData()
1401                    if result[0][0]:
1402                        result = TextList[1:]
1403                        for item in result: item[0] = True
1404                    for i,item in enumerate(result):
1405                        ifcopy,name,id = item
1406                        if ifcopy:
1407                            G2frame.PatternTree.SetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Stress/Strain'),copy.deepcopy(Data))
1408            finally:
1409                dlg.Destroy()
1410
1411    def OnLoadStrSta(event):
1412        print 'Load stress/strain data - does nothing yet'
1413        event.Skip()
1414
1415    def OnSaveStrSta(event):
1416        dlg = wx.FileDialog(G2frame, 'Choose stress/strain file', '.', '', 
1417            'image control files (*.strsta)|*.strsta',wx.FD_SAVE|wx.FD_OVERWRITE_PROMPT|wx.CHANGE_DIR)
1418        try:
1419            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1420                filename = dlg.GetPath()
1421                File = open(filename,'w')
1422                save = {}
1423                keys = ['Type','Sample phi','Sample z']
1424                keys2 = ['Dset','Dcalc','pixLimit','cutoff','Emat']
1425                File.write('{\n\t')
1426                for key in keys:
1427                    if key in 'strain':
1428                        File.write("'"+key+"':["+str(data[key][0])+','+str(data[key][1])+','+str(data[key][2])+'],')
1429                    else:
1430                        File.write("'"+key+"':"+str(data[key])+',')
1431                File.write('\n\t'+"'d-zero':[\n")
1432                for data2 in data['d-zero']:
1433                    File.write('\t\t{')
1434                    for key in keys2:
1435                        File.write("'"+key+"':"+':'+str(data2[key])+',')
1436                    File.write("'ImxyObs':[[],[]],'ImtaObs':[[],[]],'Imtacalc':[[],[]]},\n")
1437                File.write('\t]\n}')
1438                File.close()
1439        finally:
1440            dlg.Destroy()
1441
1442    def OnFitStrSta(event):
1443        Controls = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(
1444            G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,G2frame.Image, 'Image Controls'))
1445        G2img.FitStrSta(G2frame.ImageZ,data,Controls)
1446        print 'Strain fitting finished'
1447        UpdateStressStrain(G2frame,data)
1448        G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1449        G2plt.PlotStrain(G2frame,data,newPlot=True)
1450       
1451    def OnAllFitStrSta(event):
1452        TextList = [[False,'All IMG',0]]
1453        Names = []
1454        if G2frame.PatternTree.GetCount():
1455            id, cookie = G2frame.PatternTree.GetFirstChild(G2frame.root)
1456            while id:
1457                name = G2frame.PatternTree.GetItemText(id)
1458                Names.append(name)
1459                if 'IMG' in name:
1460                    TextList.append([False,name,id])
1461                id, cookie = G2frame.PatternTree.GetNextChild(G2frame.root, cookie)
1462            if len(TextList) == 1:
1463                G2frame.ErrorDialog('Nothing to fit','There must some "IMG" patterns')
1464                return
1465            dlg = G2frame.CopyDialog(G2frame,'Stress/Strain fitting','Select images to fit:',TextList)
1466            try:
1467                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1468                    result = dlg.GetData()
1469                    if result[0][0]:                    #the 'All IMG' is True
1470                        result = TextList[1:]
1471                        for item in result: item[0] = True
1472                    for item in result:
1473                        ifFit,name,id = item
1474                        if ifFit:
1475                            Controls = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Image Controls'))
1476                            StaCtrls = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,id, 'Stress/Strain'))
1477                            id = G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame, G2frame.root, name)
1478                            Npix,imagefile = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(id)
1479                            image = G2IO.GetImageData(G2frame,imagefile,True)
1480                            G2img.FitStrSta(image,StaCtrls,Controls)
1481                            G2plt.PlotStrain(G2frame,StaCtrls,newPlot=True)
1482            finally:
1483                dlg.Destroy()
1484            print 'All images fitted'
1485       
1486    def SamSizer():
1487       
1488        def OnStrainType(event):
1489            data['Type'] = strType.GetValue()
1490       
1491        def OnSamPhi(event):
1492            try:
1493                value = float(samPhi.GetValue())
1494            except ValueError:
1495                value = data['Sample phi']
1496            data['Sample phi'] = value
1497            samPhi.SetValue("%.3f" % (data['Sample phi']))
1498               
1499        def OnSamZ(event):
1500            try:
1501                value = float(samZ.GetValue())
1502            except ValueError:
1503                value = data['Sample z']
1504            data['Sample z'] = value
1505            samZ.SetValue("%.3f" % (data['Sample z']))
1506               
1507        samSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1508        samSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=' Strain type: '),0,WACV)
1509        strType = wx.ComboBox(G2frame.dataDisplay,value=data['Type'],choices=['True','Conventional'],
1510            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1511        strType.SetValue(data['Type'])
1512        strType.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnStrainType)
1513        samSizer.Add(strType,0,WACV)
1514       
1515        samSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=' Sample phi: '),0,WACV)
1516        samPhi = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,-1,value=("%.3f" % (data['Sample phi'])),
1517            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1518        samSizer.Add(samPhi,0,WACV)
1519        samPhi.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnSamPhi)
1520        samPhi.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnSamPhi)
1521        samSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=' Sample delta-z(mm): '),0,WACV)
1522        samZ = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,-1,value=("%.3f" % (data['Sample z'])),
1523            style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1524        samSizer.Add(samZ,0,WACV)
1525        samZ.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnSamZ)
1526        samZ.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnSamZ)
1527        return samSizer
1528       
1529    def DzeroSizer():
1530   
1531        def OnDzero(event):
1532            Obj = event.GetEventObject()
1533            try:
1534                value = min(20.0,max(0.25,float(Obj.GetValue())))
1535            except ValueError:
1536                value = 1.0
1537            Obj.SetValue("%.5f"%(value))
1538            data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]]['Dset'] = value
1539            data['d-zero'] = G2mth.sortArray(data['d-zero'],'Dset',reverse=True)
1540            Ring,R = G2img.MakeStrStaRing(data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]],G2frame.ImageZ,Controls)
1541            if len(Ring):
1542                data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]].update(R)
1543            else:
1544                G2frame.ErrorDialog('Strain peak selection','WARNING - No points found for this ring selection')
1545               
1546            UpdateStressStrain(G2frame,data)
1547            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event,newPlot=False)
1548            G2plt.PlotStrain(G2frame,data,newPlot=True)
1549           
1550        def OnDeleteDzero(event):
1551            Obj = event.GetEventObject()
1552            del(data['d-zero'][delIndx.index(Obj)])
1553            UpdateStressStrain(G2frame,data)
1554            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event,newPlot=True)
1555            G2plt.PlotStrain(G2frame,data,newPlot=True)
1556       
1557        def OnCutOff(event):
1558            Obj = event.GetEventObject()
1559            try:
1560                value = min(10.0,max(0.5,float(Obj.GetValue())))
1561            except ValueError:
1562                value = 1.0
1563            Obj.SetValue("%.1f"%(value))
1564            data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]]['cutoff'] = value
1565            Ring,R = G2img.MakeStrStaRing(data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]],G2frame.ImageZ,Controls)
1566            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1567            G2plt.PlotStrain(G2frame,data,newPlot=True)
1568       
1569        def OnPixLimit(event):
1570            Obj = event.GetEventObject()
1571            data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]]['pixLimit'] = int(Obj.GetValue())
1572            Ring,R = G2img.MakeStrStaRing(data['d-zero'][Indx[Obj.GetId()]],G2frame.ImageZ,Controls)
1573            G2plt.PlotExposedImage(G2frame,event=event)
1574            G2plt.PlotStrain(G2frame,data,newPlot=True)
1575           
1576        Indx = {}
1577        delIndx = []   
1578        dzeroSizer = wx.FlexGridSizer(1,8,5,5)
1579        for id,dzero in enumerate(data['d-zero']):
1580            dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=(' d-zero #%d: '%(id))),0,WACV)
1581            dZero = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,-1,value=('%.5f'%(dzero['Dset'])),
1582                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1583            dzeroSizer.Add(dZero,0,WACV)
1584            dZero.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnDzero)
1585            dZero.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnDzero)
1586            Indx[dZero.GetId()] = id
1587            dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=(' d-zero ave: %.5f'%(dzero['Dcalc']))),0,WACV)
1588               
1589            dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label=' Min ring I/Ib '),0,WACV)
1590            cutOff = wx.TextCtrl(parent=G2frame.dataDisplay,value=("%.1f" % (dzero['cutoff'])),
1591                style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
1592            cutOff.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnCutOff)
1593            cutOff.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnCutOff)
1594            Indx[cutOff.GetId()] = id
1595            dzeroSizer.Add(cutOff,0,WACV)
1596       
1597            dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,label=' Pixel search range '),0,WACV)
1598            pixLimit = wx.ComboBox(parent=G2frame.dataDisplay,value=str(dzero['pixLimit']),choices=['1','2','5','10','15','20'],
1599                style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1600            pixLimit.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnPixLimit)
1601            Indx[pixLimit.GetId()] = id
1602            dzeroSizer.Add(pixLimit,0,WACV)               
1603               
1604            dzeroDelete = wx.CheckBox(parent=G2frame.dataDisplay,label='delete?')
1605            dzeroDelete.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnDeleteDzero)
1606            delIndx.append(dzeroDelete)
1607            dzeroSizer.Add(dzeroDelete,0,WACV)
1608           
1609            dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=(' Strain tensor:')),WACV)
1610            names = ['e11','e12','e22']
1611            for i in range(3):
1612                dzeroSizer.Add(wx.StaticText(G2frame.dataDisplay,-1,label=names[i]),0,WACV)
1613                tensorElem = wx.TextCtrl(G2frame.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(dzero['Emat'][i]),style=wx.TE_READONLY)
1614                tensorElem.SetBackgroundColour(VERY_LIGHT_GREY)
1615                dzeroSizer.Add(tensorElem,0,WACV)
1616            dzeroSizer.Add((5,5),0)             
1617        return dzeroSizer
1618       
1619    if G2frame.dataDisplay:
1620        G2frame.dataDisplay.Destroy()
1621    Controls = G2frame.PatternTree.GetItemPyData(
1622        G2gd.GetPatternTreeItemId(G2frame,G2frame.Image, 'Image Controls'))       
1623    G2gd.SetDataMenuBar(G2frame,G2frame.dataFrame.StrStaMenu)
1624    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAppendDzero, id=G2gd.wxID_APPENDDZERO)
1625    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnUpdateDzero, id=G2gd.wxID_UPDATEDZERO)
1626    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnFitStrSta, id=G2gd.wxID_STRSTAFIT)
1627    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAllFitStrSta, id=G2gd.wxID_STRSTAALLFIT)
1628    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnCopyStrSta, id=G2gd.wxID_STRSTACOPY)
1629    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnLoadStrSta, id=G2gd.wxID_STRSTALOAD)
1630    G2frame.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnSaveStrSta, id=G2gd.wxID_STRSTASAVE)   
1631    if not G2frame.dataFrame.GetStatusBar():
1632        Status = G2frame.dataFrame.CreateStatusBar()
1633    if G2frame.StrainKey == 'a':    #probably doesn't happen
1634        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText('Add strain ring active - LB pick d-zero value')
1635    else:
1636        G2frame.dataFrame.GetStatusBar().SetStatusText("To add strain data: On 2D Powder Image, key a:add ring")
1637       
1638    G2frame.dataDisplay = wxscroll.ScrolledPanel(G2frame.dataFrame)
1639    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1640    mainSizer.Add((5,10),0)
1641    mainSizer.Add(SamSizer())
1642    mainSizer.Add((5,10),0)
1643    mainSizer.Add(DzeroSizer())
1644   
1645    mainSizer.Layout()   
1646    G2frame.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1647    G2frame.dataDisplay.SetAutoLayout(1)
1648    G2frame.dataDisplay.SetupScrolling()
1649    Size = mainSizer.Fit(G2frame.dataFrame)
1650    Size[0] += 25
1651    G2frame.dataDisplay.SetSize(Size)
1652    G2frame.dataFrame.setSizePosLeft(Size)   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.