source: trunk/GSASIIgrid.py @ 467

Last change on this file since 467 was 467, checked in by vondreele, 10 years ago

more on file directories
fix for image controls & mask save
modify image controls data

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 75.3 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2012-02-01 22:03:51 +0000 (Wed, 01 Feb 2012) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 467 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 467 2012-02-01 22:03:51Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import sys
14import numpy as np
15import os.path
16import wx.html        # could postpone this for quicker startup
17import webbrowser     # could postpone this for quicker startup
18import GSASIIpath
19import GSASIIplot as G2plt
20import GSASIIpwdGUI as G2pdG
21import GSASIIimgGUI as G2imG
22import GSASIIphsGUI as G2phG
23import GSASIIstruct as G2str
24#import GSASIImapvars as G2mv
25
26# globals we will use later
27__version__ = None # gets overridden in GSASII.py
28path2GSAS2 = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)) # save location of this file
29helpLocDict = {}
30htmlPanel = None
31htmlFrame = None
32if sys.platform.lower().startswith('win'): 
33    helpMode = 'internal'    # need a global control to set this
34else:
35    helpMode = 'browser'    # need a global control to set this
36htmlFirstUse = True
37
38[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
39    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
40    wxID_RELOADDRAWATOMS,wxID_ATOMSDISAGL,
41] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(10)]
42
43[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
44] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
45
46[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
47    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
48    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD, wxID_DRAWDISAGL, wxID_DRAWTORSION, wxID_DRAWPLANE,
49] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(13)]
50
51[ wxID_IMCALIBRATE,wxID_IMRECALIBRATE,wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
52    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
53] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(8)]
54
55[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
57
58[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT, wxID_PAWLEYDELETE, wxID_PAWLEYESTIMATE,
59] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(4)]
60
61[ wxID_INSTPRMRESET,wxID_CHANGEWAVETYPE,wxID_INSTCOPY,
62] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(3)]
63
64[ wxID_INDXRELOAD,
65] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
66
67[ wxID_UNDO,wxID_LSQPEAKFIT,wxID_LSQONECYCLE,wxID_RESETSIGGAM,wxID_CLEARPEAKS,
68] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(5)]
69
70[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
71] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
72
73[ wxID_BACKCOPY,
74] = [wx.NewId() for _init_coll_Back_Items in range(1)]
75
76[ wxID_LIMITCOPY,
77] = [wx.NewId() for _init_coll_Limit_Items in range(1)]
78
79[ wxID_SAMPLECOPY,
80] = [wx.NewId() for _init_coll_Sample_Items in range(1)]
81
82[ wxID_CONSTRAINTADD,wxID_EQUIVADD,wxID_HOLDADD,wxID_FUNCTADD,
83] = [wx.NewId() for _init_coll_Constraint_Items in range(4)]
84
85[ wxID_RESTRAINTADD,
86] = [wx.NewId() for _init_coll_Restraint_Items in range(1)]
87
88[ wxID_SELECTPHASE,
89] = [wx.NewId() for _init_coll_Refl_Items in range(1)]
90
91[ wxID_CLEARTEXTURE,wxID_REFINETEXTURE,
92] = [wx.NewId() for _init_coll_Texture_Items in range(2)]
93
94[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
95    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
96] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
97
98VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
99
100def ShowHelp(helpType,frame):
101    '''Called to bring up a web page for documentation.'''
102    global helpLocDict
103    global helpMode
104    # look up a definition for help info from dict
105    helplink = helpLocDict.get(helpType)
106    if helplink is None:
107        # no defined link to use, create a default based on key
108        helplink = 'gsasII.html#'+helpType.replace(' ','_')
109        print helplink
110    helplink = os.path.join(path2GSAS2,'help',helplink)
111    if helpMode == 'internal':
112        global htmlPanel, htmlFrame
113        try:
114            htmlPanel.LoadFile(helplink)
115            htmlFrame.Raise()
116        except:
117            htmlFrame = wx.Frame(frame, -1, size=(610, 380))
118            htmlFrame.Show(True)
119            htmlFrame.SetTitle("HTML Window") # N.B. reset later in LoadFile
120            htmlPanel = MyHtmlPanel(htmlFrame,-1)
121            htmlPanel.LoadFile(helplink)
122    else:
123        global htmlFirstUse
124        #import webbrowser
125        if htmlFirstUse:
126            webbrowser.open_new("file://"+helplink)
127            htmlFirstUse = False
128        else:
129            webbrowser.open("file://"+helplink, new=0, autoraise=True)
130
131class MyHelp(wx.Menu):
132    '''This class creates the contents of a help menu.
133    The menu will start with two entries:
134      'Help on <helpType>': where helpType is a reference to an HTML page to
135      be opened
136      About: opens an About dialog using OnHelpAbout. N.B. on the Mac this
137      gets moved to the App menu to be consistent with Apple style.
138    NOTE: the title for this menu should be '&Help' so the wx handles
139    it correctly. BHT
140    '''
141    def __init__(self,frame,title='',helpType=None):
142        wx.Menu.__init__(self,title)
143        self.helpType = helpType
144        self.frame = frame
145        # add a help item only when helpType is specified
146        if helpType is not None:
147            helpobj = self.Append(text='Help on '+helpType,
148                                  id=wx.ID_ANY, kind=wx.ITEM_NORMAL)
149            frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelp, helpobj)
150        self.Append(help='', id=wx.ID_ABOUT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
151                    text='&About GSAS-II')
152        frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelpAbout, id=wx.ID_ABOUT)
153
154    def OnHelp(self,event):
155        '''Called when Help on... is pressed in a menu. Brings up
156        a web page for documentation.
157        '''
158        ShowHelp(self.helpType,self.frame)
159
160    def OnHelpAbout(self, event):
161        "Display an 'About GSAS-II' box"
162        global __version__
163        info = wx.AboutDialogInfo()
164        info.Name = 'GSAS-II'
165        info.Version = __version__
166        info.Copyright = '''
167Robert B. Von Dreele
168Argonne National Laboratory(C)
169This product includes software developed
170by the UChicago Argonne, LLC, as
171Operator of Argonne National Laboratory.         '''
172        info.Description = '''
173General Structure Analysis System - II
174'''
175        wx.AboutBox(info)
176
177class MyHtmlPanel(wx.Panel):
178    '''Defines a panel to display Help information'''
179    def __init__(self, frame, id):
180        self.frame = frame
181        wx.Panel.__init__(self, frame, id)
182        sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
183        back = wx.Button(self, -1, "Back")
184        back.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.OnBack)
185        sizer.Add(back, 0, wx.ALIGN_LEFT, 0)
186
187        #self.htmlwin = wx.html.HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
188        self.htmlwin = G2HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
189        sizer.Add(self.htmlwin, 1, wx.GROW|wx.ALL, 0)
190        self.SetSizer(sizer)
191        sizer.Fit(frame)       
192    def OnBack(self, event):
193        self.htmlwin.HistoryBack()
194    def LoadFile(self,file):
195        pos = file.rfind('#')
196        if pos != -1:
197            helpfile = file[:pos]
198            helpanchor = file[pos+1:]
199        else:
200            helpfile = file
201            helpanchor = None
202        self.htmlwin.LoadPage(helpfile)
203        if helpanchor is not None:
204            self.htmlwin.ScrollToAnchor(helpanchor)
205
206class G2HtmlWindow(wx.html.HtmlWindow):
207    '''Displays help information in a primitive HTML browser type window
208    '''
209    def __init__(self, parent, *args, **kwargs):
210        self.parent = parent
211        wx.html.HtmlWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs)
212    def LoadPage(self, *args, **kwargs):
213        wx.html.HtmlWindow.LoadPage(self, *args, **kwargs)
214        self.TitlePage()
215    def OnLinkClicked(self, *args, **kwargs):
216        wx.html.HtmlWindow.OnLinkClicked(self, *args, **kwargs)
217        self.TitlePage()
218    def HistoryBack(self, *args, **kwargs):
219        wx.html.HtmlWindow.HistoryBack(self, *args, **kwargs)
220        self.TitlePage()
221    def TitlePage(self):
222        self.parent.frame.SetTitle(self.GetOpenedPage() + ' -- ' + 
223                                   self.GetOpenedPageTitle())
224
225class DataFrame(wx.Frame):
226
227    def _init_menus(self):
228       
229# define all GSAS-II menus       
230       
231        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
232       
233# Controls
234        self.ControlsMenu = wx.MenuBar()
235        self.ControlsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Controls'),title='&Help')
236       
237# Notebook
238        self.DataNotebookMenu = wx.MenuBar()
239        self.DataNotebookMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Notebook'),title='&Help')
240       
241# Comments
242        self.DataCommentsMenu = wx.MenuBar()
243        self.DataCommentsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Comments'),title='&Help')
244       
245# Constraints
246        self.ConstraintMenu = wx.MenuBar()
247        self.ConstraintEdit = wx.Menu(title='')
248        self.ConstraintMenu.Append(menu=self.ConstraintEdit, title='Edit')
249        self.ConstraintMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Constraints'),title='&Help')
250        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_HOLDADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add hold',
251            help='Add hold on a parameter value')
252        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_EQUIVADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add equivalence',
253            help='Add equivalence between parameter values')
254        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_CONSTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add constraint',
255            help='Add constraint on parameter values')
256        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_FUNCTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add function',
257            help='Add function of parameter values')
258           
259# Restraints
260        self.RestraintMenu = wx.MenuBar()
261        self.RestraintEdit = wx.Menu(title='')
262        self.RestraintMenu.Append(menu=self.RestraintEdit, title='Edit')
263        self.RestraintMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Restraints'),title='&Help')
264        self.RestraintEdit.Append(id=wxID_RESTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add restraint',
265            help='restraint dummy menu item')
266           
267# PDR / Limits
268        self.LimitMenu = wx.MenuBar()
269        self.LimitEdit = wx.Menu(title='')
270        self.LimitMenu.Append(menu=self.LimitEdit, title='File')
271        self.LimitMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Limits'),title='&Help')
272        self.LimitEdit.Append(id=wxID_LIMITCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
273            help='Copy limits to other histograms')
274           
275# PDR / Background
276        self.BackMenu = wx.MenuBar()
277        self.BackEdit = wx.Menu(title='')
278        self.BackMenu.Append(menu=self.BackEdit, title='File')
279        self.BackMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Background'),title='&Help')
280        self.BackEdit.Append(id=wxID_BACKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
281            help='Copy background parameters to other histograms')
282           
283# PDR / Instrument Parameters
284        self.InstMenu = wx.MenuBar()
285        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
286        self.InstMenu.Append(menu=self.InstEdit, title='Operations')
287        self.InstMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Instrument Parameters'),title='&Help')
288        self.InstEdit.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
289            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
290        self.InstEdit.Append(help='Copy instrument profile parameters to other histograms', 
291            id=wxID_INSTCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy')
292        self.InstEdit.Append(help='Change radiation type (Ka12 - synch)', 
293            id=wxID_CHANGEWAVETYPE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Change radiation')
294       
295# PDR / Sample Parameters
296        self.SampleMenu = wx.MenuBar()
297        self.SampleEdit = wx.Menu(title='')
298        self.SampleMenu.Append(menu=self.SampleEdit, title='File')
299        self.SampleMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Sample Parameters'),title='&Help')
300        self.SampleEdit.Append(id=wxID_SAMPLECOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
301            help='Copy refinable sample parameters to other histograms')
302
303# PDR / Peak List
304        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
305        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
306        self.PeakMenu.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
307        self.PeakMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Powder Peaks'),title='&Help')
308        self.UnDo = self.PeakEdit.Append(help='Undo last least squares refinement', 
309            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
310        self.PeakFit = self.PeakEdit.Append(id=wxID_LSQPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ PeakFit', 
311            help='Peak fitting via least-squares' )
312        self.PFOneCycle = self.PeakEdit.Append(id=wxID_LSQONECYCLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ one cycle', 
313            help='One cycle of Peak fitting via least-squares' )
314        self.PeakEdit.Append(id=wxID_RESETSIGGAM, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
315            text='Reset sig and gam',help='Reset sigma and gamma to global fit' )
316        self.PeakEdit.Append(id=wxID_CLEARPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear peaks', 
317            help='Clear the peak list' )
318        self.UnDo.Enable(False)
319        self.PeakFit.Enable(False)
320        self.PFOneCycle.Enable(False)
321       
322# PDR / Index Peak List
323        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
324        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
325        self.IndPeaksMenu.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Operations')
326        self.IndPeaksMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Index Peaks'),title='&Help')
327        self.IndPeaksEdit.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
328            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
329       
330# PDR / Unit Cells List
331        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
332        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
333        self.IndexMenu.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
334        self.IndexMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Cell Indexing Refine'),title='&Help')
335        self.IndexPeaks = self.IndexEdit.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
336            text='Index Cell')
337        self.CopyCell = self.IndexEdit.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
338            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
339        self.RefineCell = self.IndexEdit.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
340            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
341        self.MakeNewPhase = self.IndexEdit.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
342            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
343        self.IndexPeaks.Enable(False)
344        self.CopyCell.Enable(False)
345        self.RefineCell.Enable(False)
346        self.MakeNewPhase.Enable(False)
347       
348# PDR / Reflection Lists
349        self.ReflMenu = wx.MenuBar()
350        self.ReflEdit = wx.Menu(title='')
351        self.ReflMenu.Append(menu=self.ReflEdit, title='Reflection List')
352        self.ReflMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Reflection List'),title='&Help')
353        self.SelectPhase = self.ReflEdit.Append(help='Select phase for reflection list',id=wxID_SELECTPHASE, 
354            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Select phase')
355       
356# IMG / Image Controls
357        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
358        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
359        self.ImageMenu.Append(menu=self.ImageEdit, title='Operations')
360        self.ImageMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Images'),title='&Help')
361        self.ImageEdit.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
362            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
363        self.ImageEdit.Append(help='Recalibrate detector by fitting to calibrant lines', 
364            id=wxID_IMRECALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Realibrate')
365        self.ImageEdit.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
366            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
367        self.ImageEdit.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
368            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
369        self.ImageEdit.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
370            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
371        self.ImageEdit.Append(help='Copy image controls to other images', 
372            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
373        self.ImageEdit.Append(help='Save image controls to file', 
374            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
375        self.ImageEdit.Append(help='Load image controls from file', 
376            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
377           
378# IMG / Masks
379        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
380        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
381        self.MaskMenu.Append(menu=self.MaskEdit, title='Operations')
382        self.MaskMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Image Masks'),title='&Help')
383        self.MaskEdit.Append(help='Copy mask to other images', 
384            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
385        self.MaskEdit.Append(help='Save mask to file', 
386            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
387        self.MaskEdit.Append(help='Load mask from file', 
388            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
389           
390# PDF / PDF Controls
391        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
392        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
393        self.PDFMenu.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
394        self.PDFMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='PDF Controls'),title='&Help')
395        self.PDFEdit.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
396            text='Add element')
397        self.PDFEdit.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
398            text='Delete element')
399        self.PDFEdit.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
400            text='Copy controls')
401#        self.PDFEdit.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
402#            text='Load Controls')
403#        self.PDFEdit.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
404#            text='Save controls')
405        self.PDFEdit.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
406            text='Compute PDF')
407        self.PDFEdit.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
408            text='Compute all PDFs')
409           
410# Phase / General tab
411        self.DataGeneral = wx.MenuBar()
412        self.DataGeneral.Append(menu=MyHelp(self,helpType='General'),title='&Help')
413       
414# Phase / Atoms tab
415        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
416        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
417        self.AtomCompute = wx.Menu(title='')
418        self.AtomsMenu.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
419        self.AtomsMenu.Append(menu=self.AtomCompute, title='Compute')
420        self.AtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Atoms'),title='&Help')
421        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
422            help='Inserted as an H atom')
423        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
424            help='Inserted as an H atom')
425        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
426            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
427        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
428            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
429        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
430            help='Select atoms to delete first')
431        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
432            help='Select atoms to refine first')
433        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
434            help='Select atoms to modify first')
435        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
436            help='Select atoms to transform first')
437        self.AtomEdit.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
438            help='Reload atom drawing list')
439        self.AtomCompute.Append(id=wxID_ATOMSDISAGL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Distances & Angles',
440            help='Compute distances & angles for selected atoms')   
441                 
442# Phase / Data tab
443        self.DataMenu = wx.MenuBar()
444        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
445        self.DataMenu.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
446        self.DataMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Data'),title='&Help')
447        self.DataEdit.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
448            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
449        self.DataEdit.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
450            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
451        self.DataEdit.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
452            help='Delete histograms from use for this phase')
453           
454# Phase / Texture tab
455        self.TextureMenu = wx.MenuBar()
456        self.TextureEdit = wx.Menu(title='')
457        self.TextureMenu.Append(menu=self.TextureEdit, title='Texture')
458        self.TextureMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Texture'),title='&Help')
459        self.TextureEdit.Append(id=wxID_REFINETEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Refine texture', 
460            help='Refine the texture coefficients from sequential Pawley results')
461        self.TextureEdit.Append(id=wxID_CLEARTEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear texture', 
462            help='Clear the texture coefficients' )
463           
464# Phase / Pawley tab
465        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
466        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
467        self.PawleyMenu.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Operations')
468        self.PawleyMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Pawley'),title='&Help')
469        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
470            help='Initialize Pawley reflection list')
471        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYESTIMATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley estimate',
472            help='Estimate initial Pawley intensities')
473        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley delete',
474            help='Delete Pawley reflection list')
475#        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
476#            help='Import Pawley reflection list')
477
478# Phase / Draw Options tab
479        self.DataDrawOptions = wx.MenuBar()
480        self.DataDrawOptions.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Options'),title='&Help')
481       
482# Phase / Draw Atoms tab
483        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
484        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
485        self.DrawAtomCompute = wx.Menu(title='')
486        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
487        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=self.DrawAtomCompute,title='Compute')
488        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Atoms'),title='&Help')
489        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
490            help='Select atoms first')
491        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
492            help='Select atoms first')
493        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
494            help='Select atoms first')
495        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
496            help='Resets all atom colors to defaults')
497        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
498            help='View point is 1st atom selected')
499        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
500            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
501        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
502            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
503        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
504            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
505        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
506            help='Fill unit cell with selected atoms')
507        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
508            help='Delete atoms from drawing set')
509        self.DrawAtomCompute.Append(id=wxID_DRAWDISAGL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Distances & Angles',
510            help='Compute distances & angles for selected atoms')   
511        self.DrawAtomCompute.Append(id=wxID_DRAWTORSION, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Torsion angle',
512            help='Compute torsion angle for 4 selected atoms')   
513        self.DrawAtomCompute.Append(id=wxID_DRAWPLANE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Best plane',
514            help='Compute best plane for 3+ selected atoms')   
515           
516# end of GSAS-II menu definitions
517       
518    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
519        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
520            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
521        self._init_menus()
522        if name:
523            self.SetLabel(name)
524        self.Show()
525       
526    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
527        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
528        self.data = data
529        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
530        Size = self.GetSize()
531        xPos = clientSize[2]-Size[0]
532        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
533        self.AtomGrid = []
534        self.selectedRow = 0
535       
536    def setSizePosLeft(self,Width):
537        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
538        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
539        Width[0] = max(Width[0],300)
540        self.SetSize(Width)
541        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
542       
543    def Clear(self):
544        self.ClearBackground()
545        self.DestroyChildren()
546                   
547class GSNoteBook(wx.Notebook):
548    def __init__(self, parent, name='',size = None):
549        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
550        if size: self.SetSize(size)
551                                                     
552    def Clear(self):       
553        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
554       
555    def FindPage(self,name):
556        numPage = self.GetPageCount()
557        for page in range(numPage):
558            if self.GetPageText(page) == name:
559                return page
560       
561class GSGrid(wg.Grid):
562    def __init__(self, parent, name=''):
563        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
564        self.SetSize(parent.GetClientSize())
565           
566    def Clear(self):
567        wg.Grid.ClearGrid(self)
568       
569    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
570        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
571        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
572       
573    def GetSelection(self):
574        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
575        return None
576                       
577class Table(wg.PyGridTableBase):
578    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
579        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
580        self.colLabels = colLabels
581        self.rowLabels = rowLabels
582        self.dataTypes = types
583        self.data = data
584       
585    def AppendRows(self, numRows=1):
586        self.data.append([])
587        return True
588       
589    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
590        if self.dataTypes:
591            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
592            if typeName == colType:
593                return True
594            else:
595                return False
596        else:
597            return False
598
599    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
600        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
601
602    def DeleteRow(self,pos):
603        data = self.GetData()
604        self.SetData([])
605        new = []
606        for irow,row in enumerate(data):
607            if irow <> pos:
608                new.append(row)
609        self.SetData(new)
610       
611    def GetColLabelValue(self, col):
612        if self.colLabels:
613            return self.colLabels[col]
614           
615    def GetData(self):
616        data = []
617        for row in range(self.GetNumberRows()):
618            data.append(self.GetRowValues(row))
619        return data
620       
621    def GetNumberCols(self):
622        try:
623            return len(self.colLabels)
624        except TypeError:
625            return None
626       
627    def GetNumberRows(self):
628        return len(self.data)
629       
630    def GetRowLabelValue(self, row):
631        if self.rowLabels:
632            return self.rowLabels[row]
633       
634    def GetColValues(self, col):
635        data = []
636        for row in range(self.GetNumberRows()):
637            data.append(self.GetValue(row, col))
638        return data
639       
640    def GetRowValues(self, row):
641        data = []
642        for col in range(self.GetNumberCols()):
643            data.append(self.GetValue(row, col))
644        return data
645       
646    def GetTypeName(self, row, col):
647        try:
648            return self.dataTypes[col]
649        except TypeError:
650            return None
651
652    def GetValue(self, row, col):
653        try:
654            return self.data[row][col]
655        except IndexError:
656            return None
657           
658    def InsertRows(self, pos, rows):
659        for row in range(rows):
660            self.data.insert(pos,[])
661            pos += 1
662       
663    def IsEmptyCell(self,row,col):
664        try:
665            return not self.data[row][col]
666        except IndexError:
667            return True
668       
669    def OnKeyPress(self, event):
670        dellist = self.GetSelectedRows()
671        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
672            grid = self.GetView()
673            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
674               
675    def SetColLabelValue(self, col, label):
676        numcols = self.GetNumberCols()
677        if col > numcols-1:
678            self.colLabels.append(label)
679        else:
680            self.colLabels[col]=label
681       
682    def SetData(self,data):
683        for row in range(len(data)):
684            self.SetRowValues(row,data[row])
685               
686    def SetRowLabelValue(self, row, label):
687        self.rowLabels[row]=label
688           
689    def SetRowValues(self,row,data):
690        self.data[row] = data
691           
692    def SetValue(self, row, col, value):
693        def innerSetValue(row, col, value):
694            try:
695                self.data[row][col] = value
696            except TypeError:
697                return
698            except IndexError:
699                print row,col,value
700                # add a new row
701                if row > self.GetNumberRows():
702                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
703                elif col > self.GetNumberCols():
704                    for row in range(self.GetNumberRows):
705                        self.data[row].append('')
706                print self.data
707                self.data[row][col] = value
708        innerSetValue(row, col, value)
709               
710def UpdateNotebook(self,data):       
711    if data:
712        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
713        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
714            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
715        for line in data:
716            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
717            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
718           
719def UpdateControls(self,data):
720    #patch
721    if 'deriv type' not in data:
722        data = {}
723        data['deriv type'] = 'analytic Jacobian'
724        data['min dM/M'] = 0.0001
725        data['shift factor'] = 1.
726    if 'shift factor' not in data:
727        data['shift factor'] = 1.
728    if 'max cyc' not in data:
729        data['max cyc'] = 3       
730    #end patch
731    '''
732    #Fourier controls
733    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
734    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
735    '''
736    def SeqSizer():
737       
738        def OnSelectData(event):
739            choices = ['All',]+GetPatternTreeDataNames(self,['PWDR',])
740            sel = []
741            if 'Seq Data' in data:
742                for item in data['Seq Data']:
743                    sel.append(choices.index(item))
744            names = []
745            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select data:','Sequential refinement',choices)
746            dlg.SetSelections(sel)
747            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
748                sel = dlg.GetSelections()
749                for i in sel: names.append(choices[i])
750                if 'All' in names:
751                    names = choices[1:]
752                data['Seq Data'] = names               
753            dlg.Destroy()
754            reverseSel.Enable(True)
755           
756        def OnReverse(event):
757            data['Reverse Seq'] = reverseSel.GetValue()
758                   
759        seqSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
760        seqSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Sequential Refinement Powder Data: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
761        selSeqData = wx.Button(self.dataDisplay,-1,label=' Select data')
762        selSeqData.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnSelectData)
763        seqSizer.Add(selSeqData,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
764        seqSizer.Add((5,0),0)
765        reverseSel = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label=' Reverse order?')
766        reverseSel.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnReverse)
767        if 'Seq Data' not in data:
768            reverseSel.Enable(False)
769        if 'Reverse Seq' in data:
770            reverseSel.SetValue(data['Reverse Seq'])
771        seqSizer.Add(reverseSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
772        return seqSizer
773       
774    def LSSizer():       
775       
776        def OnDerivType(event):
777            data['deriv type'] = derivSel.GetValue()
778            derivSel.SetValue(data['deriv type'])
779            wx.CallAfter(UpdateControls,self,data)
780           
781        def OnConvergence(event):
782            try:
783                value = max(1.e-9,min(1.0,float(Cnvrg.GetValue())))
784            except ValueError:
785                value = 0.0001
786            data['min dM/M'] = value
787            Cnvrg.SetValue('%.2g'%(value))
788           
789        def OnMaxCycles(event):
790            data['max cyc'] = int(maxCyc.GetValue())
791            maxCyc.SetValue(str(data['max cyc']))
792                       
793        def OnFactor(event):
794            try:
795                value = min(max(float(Factr.GetValue()),0.00001),100.)
796            except ValueError:
797                value = 1.0
798            data['shift factor'] = value
799            Factr.SetValue('%.5f'%(value))
800       
801        LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=6,vgap=5,hgap=5)
802        LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement derivatives: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
803        Choice=['analytic Jacobian','numeric','analytic Hessian']
804        derivSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['deriv type'],choices=Choice,
805            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
806        derivSel.SetValue(data['deriv type'])
807        derivSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnDerivType)
808           
809        LSSizer.Add(derivSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
810        LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min delta-M/M: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
811        Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2g'%(data['min dM/M']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
812        Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
813        Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
814        LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
815        if 'Hessian' in data['deriv type']:
816            LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max cycles: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
817            Choice = ['0','1','2','3','5','10','15','20']
818            maxCyc = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=str(data['max cyc']),choices=Choice,
819                style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
820            maxCyc.SetValue(str(data['max cyc']))
821            maxCyc.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnMaxCycles)
822            LSSizer.Add(maxCyc,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
823        else:
824            LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Initial shift factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
825            Factr = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.5f'%(data['shift factor']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
826            Factr.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnFactor)
827            Factr.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnFactor)
828            LSSizer.Add(Factr,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
829        return LSSizer
830       
831    if self.dataDisplay:
832        self.dataDisplay.Destroy()
833    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
834        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
835        Status.SetStatusText('')
836    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
837    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
838    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ControlsMenu)
839    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
840    mainSizer.Add((5,5),0)
841    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)   
842    mainSizer.Add(LSSizer())
843    mainSizer.Add((5,5),0)
844    mainSizer.Add(SeqSizer())
845    mainSizer.Add((5,5),0)
846       
847    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
848
849    mainSizer.Layout()   
850    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
851    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
852    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
853     
854def UpdateComments(self,data):                   
855    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
856    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
857        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
858    for line in data:
859        if line[-1] == '\n':
860            self.dataDisplay.AppendText(line)
861        else:
862            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
863           
864def UpdateSeqResults(self,data):
865    """
866    input:
867        data - dictionary
868            'histNames' - list of histogram names in order as processed by Sequential Refinement
869            'varyList' - list of variables - identical over all refinements insequence
870            histName - dictionaries for all data sets processed:
871                'variables'- result[0] from leastsq call
872                'varyList' - list of variables; same as above
873                'sig' - esds for variables
874                'covMatrix' - covariance matrix from individual refinement
875                'title' - histogram name; same as dict item name
876                'newAtomDict' - new atom parameters after shifts applied
877                'newCellDict' - new cell parameters after shifts to A0-A5 applied'
878    """
879    if not data:
880        print 'No sequential refinement results'
881        return
882    histNames = data['histNames']
883       
884    def GetSampleParms():
885        sampleParmDict = {'Temperature':[],'Pressure':[],'Humidity':[],'Voltage':[],'Force':[],}
886        sampleParm = {}
887        for name in histNames:
888            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root,name)
889            sampleData = self.PatternTree.GetItemPyData(GetPatternTreeItemId(self,Id,'Sample Parameters'))
890            for item in sampleParmDict:
891                sampleParmDict[item].append(sampleData[item])
892        for item in sampleParmDict:
893            frstValue = sampleParmDict[item][0]
894            if np.any(np.array(sampleParmDict[item])-frstValue):
895                sampleParm[item] = sampleParmDict[item]           
896        return sampleParm
897           
898    def GetSigData(parm):
899        sigData = []
900        for name in histNames:
901            sigList = data[name]['sig']
902            if colLabels[parm] in atomList:
903                sigData.append(sigList[colLabels.index(atomList[colLabels[parm]])])
904            elif colLabels[parm] in cellList:
905                sigData.append(sigList[colLabels.index(cellList[colLabels[parm]])])
906            else:
907                sigData.append(sigList[parm])
908        return sigData
909   
910    def Select(event):
911        cols = self.dataDisplay.GetSelectedCols()
912        rows = self.dataDisplay.GetSelectedRows()
913        if cols:
914            plotData = []
915            plotSig = []
916            plotNames = []
917            for col in cols:
918                plotData.append(self.SeqTable.GetColValues(col))
919                plotSig.append(GetSigData(col))
920                plotNames.append(self.SeqTable.GetColLabelValue(col))
921            plotData = np.array(plotData)
922            G2plt.PlotSeq(self,plotData,plotSig,plotNames,sampleParms)
923        elif rows:
924            name = histNames[rows[0]]
925            G2plt.PlotCovariance(self,Data=data[name])
926               
927    if self.dataDisplay:
928        self.dataDisplay.Destroy()
929    cellList = {}
930    newCellDict = data[histNames[0]]['newCellDict']
931    for item in newCellDict:
932        if item in data['varyList']:
933            cellList[newCellDict[item][0]] = item
934    atomList = {}
935    newAtomDict = data[histNames[0]]['newAtomDict']
936    for item in newAtomDict:
937        if item in data['varyList']:
938            atomList[newAtomDict[item][0]] = item
939    sampleParms = GetSampleParms()
940    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
941    self.dataFrame.SetLabel('Sequental refinement results')
942    self.dataFrame.CreateStatusBar()
943    colLabels = data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys()
944    Types = len(data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys())*[wg.GRID_VALUE_FLOAT,]
945    seqList = [list(data[name]['variables']) for name in histNames]
946   
947    for i,item in enumerate(seqList):
948        newAtomDict = data[histNames[i]]['newAtomDict']
949        newCellDict = data[histNames[i]]['newCellDict']
950        item += [newAtomDict[atomList[parm]][1] for parm in atomList.keys()]
951        item += [newCellDict[cellList[parm]][1] for parm in cellList.keys()]
952    self.SeqTable = Table(seqList,colLabels=colLabels,rowLabels=histNames,types=Types)
953    self.dataDisplay = GSGrid(parent=self.dataFrame)
954    self.dataDisplay.SetTable(self.SeqTable, True)
955    self.dataDisplay.EnableEditing(False)
956    self.dataDisplay.Bind(wg.EVT_GRID_LABEL_LEFT_DCLICK, Select)
957    self.dataDisplay.SetRowLabelSize(8*len(histNames[0]))       #pretty arbitrary 8
958    self.dataDisplay.SetMargins(0,0)
959    self.dataDisplay.AutoSizeColumns(True)
960    self.dataFrame.setSizePosLeft([700,350])
961   
962def UpdateConstraints(self,data):             
963#    data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
964    if not data:
965        data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
966    Histograms,Phases = self.GetUsedHistogramsAndPhasesfromTree()
967    AtomDict = dict([Phases[phase]['pId'],Phases[phase]['Atoms']] for phase in Phases)
968    Natoms,phaseVary,phaseDict,pawleyLookup,FFtable,BLtable = G2str.GetPhaseData(Phases,Print=False)
969    phaseList = []
970    for item in phaseDict:
971        if item.split(':')[2] not in ['Ax','Ay','Az','Amul','AI/A','Atype','SHorder']:
972            phaseList.append(item)
973    phaseList.sort()
974    phaseAtNames = {}
975    for item in phaseList:
976        Split = item.split(':')
977        if Split[2][:2] in ['AU','Af','dA']:
978            phaseAtNames[item] = AtomDict[int(Split[0])][int(Split[3])][0]
979        else:
980            phaseAtNames[item] = ''
981           
982    hapVary,hapDict,controlDict = G2str.GetHistogramPhaseData(Phases,Histograms,Print=False)
983    hapList = hapDict.keys()
984    hapList.sort()
985    histVary,histDict,controlDict = G2str.GetHistogramData(Histograms,Print=False)
986    histList = []
987    for item in histDict:
988        if item.split(':')[2] not in ['Omega','Type','Chi','Phi','Azimuth','Gonio. radius','Lam1','Lam2','Back']:
989            histList.append(item)
990    histList.sort()
991    Indx = {}
992    scope = {}                          #filled out later
993    self.Page = [0,'phs']
994   
995    def GetPHlegends(Phases,Histograms):
996        plegend = '\n In p::name'
997        hlegend = '\n In :h:name'
998        phlegend = '\n In p:h:name'
999        for phase in Phases:
1000            plegend += '\n p:: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':: for '+phase
1001            count = 0
1002            for histogram in Phases[phase]['Histograms']:
1003                if count < 3:
1004                    phlegend += '\n p:h: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+phase+' in '+histogram
1005                else:
1006                    phlegend += '\n ... etc.'
1007                    break
1008                count += 1
1009        count = 0
1010        for histogram in Histograms:
1011            if count < 3:
1012                hlegend += '\n :h: = :'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+histogram
1013            else:
1014                hlegend += '\n ... etc.'
1015                break
1016            count += 1
1017        return plegend,hlegend,phlegend
1018       
1019    def FindEquivVarb(name,nameList):
1020        outList = []
1021        namelist = [name.split(':')[2],]
1022        if 'dA' in name:
1023            namelist = ['dAx','dAy','dAz']
1024        elif 'AU' in name:
1025            namelist = ['AUiso','AU11','AU22','AU33','AU12','AU13','AU23']
1026        for item in nameList:
1027            key = item.split(':')[2]
1028            if key in namelist and item != name:
1029                outList.append(item)
1030        return outList
1031       
1032    def SelectVarbs(page,FrstVarb,varList,legend,constType):
1033        #future -  add 'all:all:name', '0:all:name', etc. to the varList
1034        if page[1] == 'phs':
1035            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in varList]
1036            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',atchoice)
1037        else:
1038            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',varList)
1039        varbs = [FrstVarb,]
1040        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1041            sel = dlg.GetSelections()
1042            for x in sel:
1043                varbs.append(varList[x])
1044        dlg.Destroy()
1045        if len(varbs) > 1:
1046            if 'equivalence' in constType:
1047                constr = []
1048                for item in varbs[1:]:
1049                    constr += [[[1.0,FrstVarb],[-1.0,item],None,None],]
1050                return constr           #multiple constraints
1051            elif 'function' in constType:
1052                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1053                return [constr+[0.0,False]]         #just one constraint
1054            else:       #'constraint'
1055                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1056                return [constr+[1.0,None]]          #just one constraint - default sum to one
1057        return []
1058             
1059    def OnAddHold(event):
1060        for phase in Phases:
1061            Phase = Phases[phase]
1062            Atoms = Phase['Atoms']
1063        constr = []
1064        page = self.Page
1065        choice = scope[page[1]]
1066        if page[1] == 'phs':
1067            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1068            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1069        else:   
1070            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1071        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1072            sel = dlg.GetSelection()
1073            FrstVarb = choice[2][sel]
1074            data[choice[3]] += [[[0.0,FrstVarb],None,None],]
1075        dlg.Destroy()
1076        choice[4]()
1077       
1078    def OnAddEquivalence(event):
1079        constr = []
1080        page = self.Page
1081        choice = scope[page[1]]
1082        if page[1] == 'phs':
1083            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1084            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1085        else:   
1086            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1087        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1088            sel = dlg.GetSelection()
1089            FrstVarb = choice[2][sel]
1090            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1091            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'equivalence')
1092            if len(constr) > 0:
1093                data[choice[3]] += constr
1094        dlg.Destroy()
1095        choice[4]()
1096   
1097    def OnAddFunction(event):
1098        constr = []
1099        page = self.Page
1100        choice = scope[page[1]]
1101        if page[1] == 'phs':
1102            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1103            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1104        else:   
1105            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1106        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1107            sel = dlg.GetSelection()
1108            FrstVarb = choice[2][sel]
1109            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1110            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'function')
1111            if len(constr) > 0:
1112                data[choice[3]] += constr
1113        dlg.Destroy()
1114        choice[4]()
1115                       
1116    def OnAddConstraint(event):
1117        constr = []
1118        page = self.Page
1119        choice = scope[page[1]]
1120        if page[1] == 'phs':
1121            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1122            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1123        else:   
1124            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1125        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1126            sel = dlg.GetSelection()
1127            FrstVarb = choice[2][sel]
1128            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1129            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'constraint')
1130            if len(constr) > 0:
1131                data[choice[3]] += constr
1132        dlg.Destroy()
1133        choice[4]()
1134                       
1135    def ConstSizer(name,pageDisplay):
1136        constSizer = wx.FlexGridSizer(1,4,0,0)
1137        for Id,item in enumerate(data[name]):
1138            constDel = wx.Button(pageDisplay,-1,'Delete',style=wx.BU_EXACTFIT)
1139            constDel.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstDel)
1140            Indx[constDel.GetId()] = [Id,name]
1141            if len(item) < 4:
1142                constSizer.Add((5,5),0)
1143                constSizer.Add(constDel)
1144                eqString = ' FIXED   '+item[0][1]+'   '
1145            else:
1146                constEdit = wx.Button(pageDisplay,-1,'Edit',style=wx.BU_EXACTFIT)
1147                constEdit.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstEdit)
1148                Indx[constEdit.GetId()] = [Id,name]
1149                constSizer.Add(constEdit)           
1150                constSizer.Add(constDel)
1151                if isinstance(item[-1],bool):
1152                    eqString = ' FUNCT   '
1153                elif isinstance(item[-2],float):
1154                    eqString = ' CONSTR  '
1155                else:
1156                    eqString = ' EQUIV   '
1157                for term in item[:-2]:
1158                    eqString += '%+.3f*%s '%(term[0],term[1])
1159                if isinstance(item[-2],float):
1160                    eqString += ' = %.3f'%(item[-2])+'  '
1161                else:
1162                    eqString += ' = 0   '
1163            constSizer.Add(wx.StaticText(pageDisplay,-1,eqString),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1164            if isinstance(item[-1],bool):
1165                constRef = wx.CheckBox(pageDisplay,-1,label=' Refine?')                   
1166                constRef.SetValue(item[-1])
1167                constRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnConstRef)
1168                Indx[constRef.GetId()] = item
1169                constSizer.Add(constRef,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1170            else:
1171                constSizer.Add((5,5),0)
1172        return constSizer
1173               
1174    def OnConstRef(event):
1175        Obj = event.GetEventObject()
1176        Indx[Obj.GetId()][-1] = Obj.GetValue()
1177       
1178    def OnConstDel(event):
1179        Obj = event.GetEventObject()
1180        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1181        del(data[name][Id])
1182        OnPageChanged(None)       
1183       
1184    def OnConstEdit(event):
1185        Obj = event.GetEventObject()
1186        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1187        const = data[name][Id][-2]       
1188        if isinstance(data[name][Id][-1],bool):
1189            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1190            constType = 'Function'
1191            extra = '; sum = new variable'
1192        elif isinstance(data[name][Id][-2],float):
1193            items = data[name][Id][:-2]+[[const,'= fixed value'],[]]
1194            constType = 'Constraint'
1195            extra = ' sum = constant'
1196        else:
1197            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1198            constType = 'Equivalence'
1199            extra = '; sum = 0'
1200        dlg = self.SumDialog(self,constType,'Enter value for each term in constraint'+extra,'',items)
1201        try:
1202            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1203                result = dlg.GetData()
1204                if isinstance(data[name][Id][-2],float):
1205                    data[name][Id][:-2] = result[:-2]
1206                    data[name][Id][-2] = result[-2][0]
1207                else:
1208                    data[name][Id][:-2] = result[:-1]
1209        finally:
1210            dlg.Destroy()           
1211        OnPageChanged(None)                     
1212   
1213    def UpdateHAPConstr():
1214        HAPConstr.DestroyChildren()
1215        HAPDisplay = wx.Panel(HAPConstr)
1216        HAPSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1217        HAPSizer.Add((5,5),0)
1218        HAPSizer.Add(ConstSizer('HAP',HAPDisplay))
1219        HAPDisplay.SetSizer(HAPSizer,True)
1220        Size = HAPSizer.GetMinSize()
1221        Size[0] += 40
1222        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1223        HAPDisplay.SetSize(Size)
1224        HAPConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1225        Size[1] = min(Size[1],250)
1226        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1227       
1228    def UpdateHistConstr():
1229        HistConstr.DestroyChildren()
1230        HistDisplay = wx.Panel(HistConstr)
1231        HistSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1232        HistSizer.Add((5,5),0)       
1233        HistSizer.Add(ConstSizer('Hist',HistDisplay))
1234        HistDisplay.SetSizer(HistSizer,True)
1235        Size = HistSizer.GetMinSize()
1236        Size[0] += 40
1237        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1238        HistDisplay.SetSize(Size)
1239        HistConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1240        Size[1] = min(Size[1],250)
1241        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1242       
1243    def UpdatePhaseConstr():
1244        PhaseConstr.DestroyChildren()
1245        PhaseDisplay = wx.Panel(PhaseConstr)
1246        PhaseSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1247        PhaseSizer.Add((5,5),0)       
1248        PhaseSizer.Add(ConstSizer('Phase',PhaseDisplay))
1249        PhaseDisplay.SetSizer(PhaseSizer,True)
1250        Size = PhaseSizer.GetMinSize()
1251        Size[0] += 40
1252        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1253        PhaseDisplay.SetSize(Size)
1254        PhaseConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1255        Size[1] = min(Size[1],250)
1256        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1257   
1258    def OnPageChanged(event):
1259        if event:       #page change event!
1260            page = event.GetSelection()
1261        else:
1262            page = self.dataDisplay.GetSelection()
1263        oldPage = self.dataDisplay.ChangeSelection(page)
1264        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1265        if text == 'Histogram/Phase constraints':
1266            self.Page = [page,'hap']
1267            UpdateHAPConstr()
1268        elif text == 'Histogram constraints':
1269            self.Page = [page,'hst']
1270            UpdateHistConstr()
1271        elif text == 'Phase constraints':
1272            self.Page = [page,'phs']
1273            UpdatePhaseConstr()
1274
1275    def SetStatusLine(text):
1276        Status.SetStatusText(text)                                     
1277       
1278    plegend,hlegend,phlegend = GetPHlegends(Phases,Histograms)
1279    scope = {'hst':['Histogram variables:',hlegend,histList,'Hist',UpdateHistConstr],
1280        'hap':['HAP variables:',phlegend,hapList,'HAP',UpdateHAPConstr],
1281        'phs':['Phase variables:',plegend,phaseList,'Phase',UpdatePhaseConstr]}
1282    if self.dataDisplay:
1283        self.dataDisplay.Destroy()
1284    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1285    self.dataFrame.SetLabel('Constraints')
1286    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1287        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1288    SetStatusLine('')
1289   
1290    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1291    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddConstraint, id=wxID_CONSTRAINTADD)
1292    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddFunction, id=wxID_FUNCTADD)
1293    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddEquivalence, id=wxID_EQUIVADD)
1294    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddHold, id=wxID_HOLDADD)
1295    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1296   
1297    PhaseConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1298    self.dataDisplay.AddPage(PhaseConstr,'Phase constraints')
1299    HAPConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1300    self.dataDisplay.AddPage(HAPConstr,'Histogram/Phase constraints')
1301    HistConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1302    self.dataDisplay.AddPage(HistConstr,'Histogram constraints')
1303    UpdatePhaseConstr()
1304
1305    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)
1306   
1307   
1308def UpdateRestraints(self,data):
1309
1310    def OnAddRestraint(event):
1311        page = self.dataDisplay.GetSelection()
1312        print self.dataDisplay.GetPageText(page)
1313
1314    def UpdateAtomRestr():
1315        AtomRestr.DestroyChildren()
1316        dataDisplay = wx.Panel(AtomRestr)
1317        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1318        mainSizer.Add((5,5),0)
1319        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Atom restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1320        mainSizer.Add((5,5),0)
1321
1322
1323        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1324        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1325        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1326        dataDisplay.SetSize(Size)
1327        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1328       
1329    def UpdatePhaseRestr():
1330        PhaseRestr.DestroyChildren()
1331        dataDisplay = wx.Panel(PhaseRestr)
1332        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1333        mainSizer.Add((5,5),0)
1334        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Phase restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1335        mainSizer.Add((5,5),0)
1336
1337
1338        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1339        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1340        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1341        dataDisplay.SetSize(Size)
1342        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1343   
1344    def OnPageChanged(event):
1345        page = event.GetSelection()
1346        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1347        if text == 'Atom restraints':
1348            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1349            UpdateAtomRestr()
1350        elif text == 'Phase restraints':
1351            UpdatePhaseRestr()
1352            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1353        event.Skip()
1354
1355    if self.dataDisplay:
1356        self.dataDisplay.Destroy()
1357    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1358    self.dataFrame.SetLabel('restraints')
1359    self.dataFrame.CreateStatusBar()
1360    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddRestraint, id=wxID_RESTRAINTADD)
1361    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1362   
1363    PhaseRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1364    self.dataDisplay.AddPage(PhaseRestr,'Phase restraints')
1365    AtomRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1366    self.dataDisplay.AddPage(AtomRestr,'Atom restraints')
1367    UpdatePhaseRestr()
1368#    AtomRestrData = data['AtomRestr']
1369
1370    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)       
1371             
1372def UpdateHKLControls(self,data):
1373   
1374    def OnScaleSlider(event):
1375        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
1376        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
1377        data['Scale'] = scale*10.
1378        G2plt.PlotSngl(self)
1379       
1380    def OnLayerSlider(event):
1381        layer = layerSel.GetValue()
1382        data['Layer'] = layer
1383        G2plt.PlotSngl(self)
1384       
1385    def OnSelZone(event):
1386        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
1387        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1388       
1389    def OnSelType(event):
1390        data['Type'] = typeSel.GetValue()
1391        G2plt.PlotSngl(self)
1392       
1393    def SetStatusLine():
1394        Status.SetStatusText("look at me!!!")
1395                                     
1396    if self.dataDisplay:
1397        self.dataDisplay.Destroy()
1398    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1399        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1400    SetStatusLine()
1401    zones = ['100','010','001']
1402    HKLmax = data['HKLmax']
1403    HKLmin = data['HKLmin']
1404    if data['ifFc']:
1405        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
1406    else:
1407        typeChoices = ['Fosq','Fo']
1408    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
1409    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1410    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1411    mainSizer.Add((5,10),0)
1412   
1413    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1414    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
1415        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1416    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
1417        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
1418    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1419    scaleSel.SetLineSize(100)
1420    scaleSel.SetPageSize(900)
1421    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
1422    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1423   
1424    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1425    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
1426        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1427    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
1428        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1429    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
1430    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1431    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
1432        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
1433    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
1434        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1435    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
1436    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1437    zoneSizer.Add((10,0),0)   
1438    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1439       
1440    izone = zones.index(data['Zone'])
1441    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1442    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
1443        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1444    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
1445        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
1446    layerSel.SetLineSize(1)
1447    layerSel.SetLineSize(5)
1448    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
1449    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1450    layerSizer.Add((10,0),0)   
1451    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1452
1453       
1454    mainSizer.Layout()   
1455    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1456    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1457    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1458
1459def GetPatternTreeDataNames(self,dataTypes):
1460    names = []
1461    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(self.root)       
1462    while item:
1463        name = self.PatternTree.GetItemText(item)
1464        if name[:4] in dataTypes:
1465            names.append(name)
1466        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(self.root, cookie)
1467    return names
1468                         
1469def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
1470    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
1471    while item:
1472        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
1473            return item
1474        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
1475    return 0               
1476
1477def MovePatternTreeToGrid(self,item):
1478   
1479#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
1480   
1481    oldPage = 0
1482    if self.dataFrame:
1483        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1484        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
1485            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1486            self.dataDisplay.Clear() 
1487            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
1488            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1489        elif self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
1490            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1491            self.dataDisplay.Clear() 
1492            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
1493            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1494        elif 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
1495            if self.dataDisplay: 
1496                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
1497        self.dataFrame.Clear()
1498        self.dataFrame.SetLabel('')
1499    else:
1500        #create the frame for the data item window
1501        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
1502
1503    self.dataFrame.Raise()           
1504    self.PickId = 0
1505    parentID = self.root
1506    self.ExportPattern.Enable(False)
1507    defWid = [250,150]
1508    if item != self.root:
1509        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1510    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
1511        self.PatternId = item
1512        self.PickId = item
1513        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
1514            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.DataNotebookMenu)
1515            self.PatternId = 0
1516            self.ExportPattern.Enable(False)
1517            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1518            UpdateNotebook(self,data)
1519        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
1520            self.PatternId = 0
1521            self.ExportPattern.Enable(False)
1522            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1523            if not data:           #fill in defaults
1524                data = {
1525                    #least squares controls
1526                    'deriv type':'analytic Jacobian','min dM/M':0.0001,'shift factor':1.0,'max cyc':3,
1527                    #Fourier controls
1528                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
1529                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
1530                    #distance/angle controls
1531                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
1532                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1533            self.Refine.Enable(True)
1534            self.SeqRefine.Enable(True)
1535            UpdateControls(self,data)
1536        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sequental results':
1537            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1538            UpdateSeqResults(self,data)           
1539        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Covariance':
1540            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1541            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1542            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1543                        value='See plot window for covariance display')
1544            G2plt.PlotCovariance(self)
1545        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Constraints':
1546            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1547            UpdateConstraints(self,data)
1548        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Restraints':
1549            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1550            UpdateRestraints(self,data)
1551        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1552            self.Image = item
1553            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
1554        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1555            G2plt.PlotPowderLines(self)
1556        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1557            self.ExportPattern.Enable(True)
1558            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1559            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1560                style=wx.TE_MULTILINE,
1561                value='See plot window for powder data display\nor select a data item in histogram')
1562            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
1563        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1564            self.Sngl = item
1565            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1566        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1567            self.PatternId = item
1568            self.ExportPDF.Enable(True)
1569            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1570        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Phases':
1571            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1572            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1573                value='Select one phase to see its parameters')           
1574    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1575        self.PickId = item
1576        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1577        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
1578    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1579        self.PickId = item
1580        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1581        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
1582    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1583        self.PickId = item
1584        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1585        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
1586    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1587        self.PickId = item
1588        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1589        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
1590    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
1591        self.PickId = item
1592        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
1593        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
1594    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
1595        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.DataCommentsMenu)
1596        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1597        self.PickId = item
1598        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1599        UpdateComments(self,data)
1600    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
1601        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
1602        self.PickId = item
1603        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1604        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
1605            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
1606        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1607        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
1608        G2plt.PlotImage(self)
1609    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
1610        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
1611        self.PickId = item
1612        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1613        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1614        G2imG.UpdateMasks(self,data)
1615        G2plt.PlotImage(self)
1616    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
1617        self.PickId = item
1618        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1619        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1620        UpdateHKLControls(self,data)
1621        G2plt.PlotSngl(self)
1622    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
1623        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1624        self.ExportPDF.Enable(True)
1625        self.PickId = item
1626        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1627        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
1628        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
1629        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1630        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
1631        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
1632    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
1633        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1634        self.ExportPeakList.Enable(True)
1635        self.PickId = item
1636        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1637        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
1638        G2plt.PlotPatterns(self)
1639    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
1640        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1641        self.PickId = item
1642        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1643        G2pdG.UpdateBackground(self,data)
1644        G2plt.PlotPatterns(self)
1645    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
1646        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1647        self.PickId = item
1648        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1649        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
1650        G2plt.PlotPatterns(self)
1651    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
1652        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1653        self.PickId = item
1654        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1655        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
1656        G2plt.PlotPeakWidths(self)
1657    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
1658        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1659        self.PickId = item
1660        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1661
1662        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
1663            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
1664                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,
1665                'Force':0.0,'Gonio. radius':200.0}
1666            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
1667   
1668        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
1669        G2plt.PlotPatterns(self)
1670    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
1671        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1672        self.ExportPeakList.Enable(True)
1673        self.PickId = item
1674        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1675        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
1676        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1677            G2plt.PlotPowderLines(self)
1678        else:
1679            G2plt.PlotPatterns(self)
1680    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
1681        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1682        self.PickId = item
1683        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1684        if not data:
1685            data.append([0,0.0,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, zero value, max Nc/No, start volume
1686            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
1687            data.append([])                                 #empty cell list
1688            data.append([])                                 #empty dmin
1689            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1690        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
1691        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1692            G2plt.PlotPowderLines(self)
1693        else:
1694            G2plt.PlotPatterns(self)
1695    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Reflection Lists':
1696        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1697        self.PickId = item
1698        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1699        self.RefList = ''
1700        if len(data):
1701            self.RefList = data.keys()[0]
1702        G2pdG.UpdateReflectionGrid(self,data)
1703        G2plt.PlotPatterns(self)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.