source: trunk/GSASIIgrid.py @ 459

Last change on this file since 459 was 459, checked in by vondreele, 10 years ago

fix bug in GenAtom? - didn't eliminate special position duplicates
refactor DisAglDialog? to have a reset & save results to general
begin torsion & distance/angle calcs in drawing

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 75.1 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2012-01-30 18:49:40 +0000 (Mon, 30 Jan 2012) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 459 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 459 2012-01-30 18:49:40Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import sys
14import numpy as np
15import os.path
16import wx.html        # could postpone this for quicker startup
17import webbrowser     # could postpone this for quicker startup
18import GSASIIpath
19import GSASIIplot as G2plt
20import GSASIIpwdGUI as G2pdG
21import GSASIIimgGUI as G2imG
22import GSASIIphsGUI as G2phG
23import GSASIIstruct as G2str
24#import GSASIImapvars as G2mv
25
26# globals we will use later
27__version__ = None # gets overridden in GSASII.py
28path2GSAS2 = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)) # save location of this file
29helpLocDict = {}
30htmlPanel = None
31htmlFrame = None
32if sys.platform.lower().startswith('win'): 
33    helpMode = 'internal'    # need a global control to set this
34else:
35    helpMode = 'browser'    # need a global control to set this
36htmlFirstUse = True
37
38[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
39    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
40    wxID_RELOADDRAWATOMS,wxID_ATOMSDISAGL,
41] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(10)]
42
43[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
44] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
45
46[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
47    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
48    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD, wxID_DRAWDISAGL, wxID_DRAWTORSION,
49] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(12)]
50
51[ wxID_IMCALIBRATE,wxID_IMRECALIBRATE,wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
52    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
53] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(8)]
54
55[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
57
58[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT, wxID_PAWLEYDELETE, wxID_PAWLEYESTIMATE,
59] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(4)]
60
61[ wxID_INSTPRMRESET,wxID_CHANGEWAVETYPE,wxID_INSTCOPY,
62] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(3)]
63
64[ wxID_INDXRELOAD,
65] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
66
67[ wxID_UNDO,wxID_LSQPEAKFIT,wxID_LSQONECYCLE,wxID_RESETSIGGAM,wxID_CLEARPEAKS,
68] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(5)]
69
70[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
71] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
72
73[ wxID_BACKCOPY,
74] = [wx.NewId() for _init_coll_Back_Items in range(1)]
75
76[ wxID_LIMITCOPY,
77] = [wx.NewId() for _init_coll_Limit_Items in range(1)]
78
79[ wxID_SAMPLECOPY,
80] = [wx.NewId() for _init_coll_Sample_Items in range(1)]
81
82[ wxID_CONSTRAINTADD,wxID_EQUIVADD,wxID_HOLDADD,wxID_FUNCTADD,
83] = [wx.NewId() for _init_coll_Constraint_Items in range(4)]
84
85[ wxID_RESTRAINTADD,
86] = [wx.NewId() for _init_coll_Restraint_Items in range(1)]
87
88[ wxID_SELECTPHASE,
89] = [wx.NewId() for _init_coll_Refl_Items in range(1)]
90
91[ wxID_CLEARTEXTURE,wxID_REFINETEXTURE,
92] = [wx.NewId() for _init_coll_Texture_Items in range(2)]
93
94[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
95    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
96] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
97
98VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
99
100def ShowHelp(helpType,frame):
101    '''Called to bring up a web page for documentation.'''
102    global helpLocDict
103    global helpMode
104    # look up a definition for help info from dict
105    helplink = helpLocDict.get(helpType)
106    if helplink is None:
107        # no defined link to use, create a default based on key
108        helplink = 'gsasII.html#'+helpType.replace(' ','_')
109        print helplink
110    helplink = os.path.join(path2GSAS2,'help',helplink)
111    if helpMode == 'internal':
112        global htmlPanel, htmlFrame
113        try:
114            htmlPanel.LoadFile(helplink)
115            htmlFrame.Raise()
116        except:
117            htmlFrame = wx.Frame(frame, -1, size=(610, 380))
118            htmlFrame.Show(True)
119            htmlFrame.SetTitle("HTML Window") # N.B. reset later in LoadFile
120            htmlPanel = MyHtmlPanel(htmlFrame,-1)
121            htmlPanel.LoadFile(helplink)
122    else:
123        global htmlFirstUse
124        #import webbrowser
125        if htmlFirstUse:
126            webbrowser.open_new("file://"+helplink)
127            htmlFirstUse = False
128        else:
129            webbrowser.open("file://"+helplink, new=0, autoraise=True)
130
131class MyHelp(wx.Menu):
132    '''This class creates the contents of a help menu.
133    The menu will start with two entries:
134      'Help on <helpType>': where helpType is a reference to an HTML page to
135      be opened
136      About: opens an About dialog using OnHelpAbout. N.B. on the Mac this
137      gets moved to the App menu to be consistent with Apple style.
138    NOTE: the title for this menu should be '&Help' so the wx handles
139    it correctly. BHT
140    '''
141    def __init__(self,frame,title='',helpType=None):
142        wx.Menu.__init__(self,title)
143        self.helpType = helpType
144        self.frame = frame
145        # add a help item only when helpType is specified
146        if helpType is not None:
147            helpobj = self.Append(text='Help on '+helpType,
148                                  id=wx.ID_ANY, kind=wx.ITEM_NORMAL)
149            frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelp, helpobj)
150        self.Append(help='', id=wx.ID_ABOUT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
151                    text='&About GSAS-II')
152        frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelpAbout, id=wx.ID_ABOUT)
153
154    def OnHelp(self,event):
155        '''Called when Help on... is pressed in a menu. Brings up
156        a web page for documentation.
157        '''
158        ShowHelp(self.helpType,self.frame)
159
160    def OnHelpAbout(self, event):
161        "Display an 'About GSAS-II' box"
162        global __version__
163        info = wx.AboutDialogInfo()
164        info.Name = 'GSAS-II'
165        info.Version = __version__
166        info.Copyright = '''
167Robert B. Von Dreele
168Argonne National Laboratory(C)
169This product includes software developed
170by the UChicago Argonne, LLC, as
171Operator of Argonne National Laboratory.         '''
172        info.Description = '''
173General Structure Analysis System - II
174'''
175        wx.AboutBox(info)
176
177class MyHtmlPanel(wx.Panel):
178    '''Defines a panel to display Help information'''
179    def __init__(self, frame, id):
180        self.frame = frame
181        wx.Panel.__init__(self, frame, id)
182        sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
183        back = wx.Button(self, -1, "Back")
184        back.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.OnBack)
185        sizer.Add(back, 0, wx.ALIGN_LEFT, 0)
186
187        #self.htmlwin = wx.html.HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
188        self.htmlwin = G2HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
189        sizer.Add(self.htmlwin, 1, wx.GROW|wx.ALL, 0)
190        self.SetSizer(sizer)
191        sizer.Fit(frame)       
192    def OnBack(self, event):
193        self.htmlwin.HistoryBack()
194    def LoadFile(self,file):
195        pos = file.rfind('#')
196        if pos != -1:
197            helpfile = file[:pos]
198            helpanchor = file[pos+1:]
199        else:
200            helpfile = file
201            helpanchor = None
202        self.htmlwin.LoadPage(helpfile)
203        if helpanchor is not None:
204            self.htmlwin.ScrollToAnchor(helpanchor)
205
206class G2HtmlWindow(wx.html.HtmlWindow):
207    '''Displays help information in a primitive HTML browser type window
208    '''
209    def __init__(self, parent, *args, **kwargs):
210        self.parent = parent
211        wx.html.HtmlWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs)
212    def LoadPage(self, *args, **kwargs):
213        wx.html.HtmlWindow.LoadPage(self, *args, **kwargs)
214        self.TitlePage()
215    def OnLinkClicked(self, *args, **kwargs):
216        wx.html.HtmlWindow.OnLinkClicked(self, *args, **kwargs)
217        self.TitlePage()
218    def HistoryBack(self, *args, **kwargs):
219        wx.html.HtmlWindow.HistoryBack(self, *args, **kwargs)
220        self.TitlePage()
221    def TitlePage(self):
222        self.parent.frame.SetTitle(self.GetOpenedPage() + ' -- ' + 
223                                   self.GetOpenedPageTitle())
224
225class DataFrame(wx.Frame):
226
227    def _init_menus(self):
228       
229# define all GSAS-II menus       
230       
231        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
232       
233# Controls
234        self.ControlsMenu = wx.MenuBar()
235        self.ControlsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Controls'),title='&Help')
236       
237# Notebook
238        self.DataNotebookMenu = wx.MenuBar()
239        self.DataNotebookMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Notebook'),title='&Help')
240       
241# Comments
242        self.DataCommentsMenu = wx.MenuBar()
243        self.DataCommentsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Comments'),title='&Help')
244       
245# Constraints
246        self.ConstraintMenu = wx.MenuBar()
247        self.ConstraintEdit = wx.Menu(title='')
248        self.ConstraintMenu.Append(menu=self.ConstraintEdit, title='Edit')
249        self.ConstraintMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Constraints'),title='&Help')
250        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_HOLDADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add hold',
251            help='Add hold on a parameter value')
252        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_EQUIVADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add equivalence',
253            help='Add equivalence between parameter values')
254        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_CONSTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add constraint',
255            help='Add constraint on parameter values')
256        self.ConstraintEdit.Append(id=wxID_FUNCTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add function',
257            help='Add function of parameter values')
258           
259# Restraints
260        self.RestraintMenu = wx.MenuBar()
261        self.RestraintEdit = wx.Menu(title='')
262        self.RestraintMenu.Append(menu=self.RestraintEdit, title='Edit')
263        self.RestraintMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Restraints'),title='&Help')
264        self.RestraintEdit.Append(id=wxID_RESTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add restraint',
265            help='restraint dummy menu item')
266           
267# PDR / Limits
268        self.LimitMenu = wx.MenuBar()
269        self.LimitEdit = wx.Menu(title='')
270        self.LimitMenu.Append(menu=self.LimitEdit, title='File')
271        self.LimitMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Limits'),title='&Help')
272        self.LimitEdit.Append(id=wxID_LIMITCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
273            help='Copy limits to other histograms')
274           
275# PDR / Background
276        self.BackMenu = wx.MenuBar()
277        self.BackEdit = wx.Menu(title='')
278        self.BackMenu.Append(menu=self.BackEdit, title='File')
279        self.BackMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Background'),title='&Help')
280        self.BackEdit.Append(id=wxID_BACKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
281            help='Copy background parameters to other histograms')
282           
283# PDR / Instrument Parameters
284        self.InstMenu = wx.MenuBar()
285        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
286        self.InstMenu.Append(menu=self.InstEdit, title='Operations')
287        self.InstMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Instrument Parameters'),title='&Help')
288        self.InstEdit.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
289            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
290        self.InstEdit.Append(help='Copy instrument profile parameters to other histograms', 
291            id=wxID_INSTCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy')
292        self.InstEdit.Append(help='Change radiation type (Ka12 - synch)', 
293            id=wxID_CHANGEWAVETYPE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Change radiation')
294       
295# PDR / Sample Parameters
296        self.SampleMenu = wx.MenuBar()
297        self.SampleEdit = wx.Menu(title='')
298        self.SampleMenu.Append(menu=self.SampleEdit, title='File')
299        self.SampleMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Sample Parameters'),title='&Help')
300        self.SampleEdit.Append(id=wxID_SAMPLECOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
301            help='Copy refinable sample parameters to other histograms')
302
303# PDR / Peak List
304        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
305        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
306        self.PeakMenu.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
307        self.PeakMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Powder Peaks'),title='&Help')
308        self.UnDo = self.PeakEdit.Append(help='Undo last least squares refinement', 
309            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
310        self.PeakFit = self.PeakEdit.Append(id=wxID_LSQPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ PeakFit', 
311            help='Peak fitting via least-squares' )
312        self.PFOneCycle = self.PeakEdit.Append(id=wxID_LSQONECYCLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ one cycle', 
313            help='One cycle of Peak fitting via least-squares' )
314        self.PeakEdit.Append(id=wxID_RESETSIGGAM, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
315            text='Reset sig and gam',help='Reset sigma and gamma to global fit' )
316        self.PeakEdit.Append(id=wxID_CLEARPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear peaks', 
317            help='Clear the peak list' )
318        self.UnDo.Enable(False)
319        self.PeakFit.Enable(False)
320        self.PFOneCycle.Enable(False)
321       
322# PDR / Index Peak List
323        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
324        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
325        self.IndPeaksMenu.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Operations')
326        self.IndPeaksMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Index Peaks'),title='&Help')
327        self.IndPeaksEdit.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
328            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
329       
330# PDR / Unit Cells List
331        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
332        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
333        self.IndexMenu.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
334        self.IndexMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Cell Indexing Refine'),title='&Help')
335        self.IndexPeaks = self.IndexEdit.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
336            text='Index Cell')
337        self.CopyCell = self.IndexEdit.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
338            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
339        self.RefineCell = self.IndexEdit.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
340            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
341        self.MakeNewPhase = self.IndexEdit.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
342            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
343        self.IndexPeaks.Enable(False)
344        self.CopyCell.Enable(False)
345        self.RefineCell.Enable(False)
346        self.MakeNewPhase.Enable(False)
347       
348# PDR / Reflection Lists
349        self.ReflMenu = wx.MenuBar()
350        self.ReflEdit = wx.Menu(title='')
351        self.ReflMenu.Append(menu=self.ReflEdit, title='Reflection List')
352        self.ReflMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Reflection List'),title='&Help')
353        self.SelectPhase = self.ReflEdit.Append(help='Select phase for reflection list',id=wxID_SELECTPHASE, 
354            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Select phase')
355       
356# IMG / Image Controls
357        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
358        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
359        self.ImageMenu.Append(menu=self.ImageEdit, title='Operations')
360        self.ImageMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Images'),title='&Help')
361        self.ImageEdit.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
362            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
363        self.ImageEdit.Append(help='Recalibrate detector by fitting to calibrant lines', 
364            id=wxID_IMRECALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Realibrate')
365        self.ImageEdit.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
366            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
367        self.ImageEdit.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
368            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
369        self.ImageEdit.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
370            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
371        self.ImageEdit.Append(help='Copy image controls to other images', 
372            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
373        self.ImageEdit.Append(help='Save image controls to file', 
374            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
375        self.ImageEdit.Append(help='Load image controls from file', 
376            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
377           
378# IMG / Masks
379        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
380        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
381        self.MaskMenu.Append(menu=self.MaskEdit, title='Operations')
382        self.MaskMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Image Masks'),title='&Help')
383        self.MaskEdit.Append(help='Copy mask to other images', 
384            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
385        self.MaskEdit.Append(help='Save mask to file', 
386            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
387        self.MaskEdit.Append(help='Load mask from file', 
388            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
389           
390# PDF / PDF Controls
391        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
392        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
393        self.PDFMenu.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
394        self.PDFMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='PDF Controls'),title='&Help')
395        self.PDFEdit.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
396            text='Add element')
397        self.PDFEdit.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
398            text='Delete element')
399        self.PDFEdit.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
400            text='Copy controls')
401#        self.PDFEdit.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
402#            text='Load Controls')
403#        self.PDFEdit.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
404#            text='Save controls')
405        self.PDFEdit.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
406            text='Compute PDF')
407        self.PDFEdit.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
408            text='Compute all PDFs')
409           
410# Phase / General tab
411        self.DataGeneral = wx.MenuBar()
412        self.DataGeneral.Append(menu=MyHelp(self,helpType='General'),title='&Help')
413       
414# Phase / Atoms tab
415        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
416        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
417        self.AtomCompute = wx.Menu(title='')
418        self.AtomsMenu.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
419        self.AtomsMenu.Append(menu=self.AtomCompute, title='Compute')
420        self.AtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Atoms'),title='&Help')
421        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
422            help='Inserted as an H atom')
423        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
424            help='Inserted as an H atom')
425        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
426            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
427        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
428            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
429        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
430            help='Select atoms to delete first')
431        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
432            help='Select atoms to refine first')
433        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
434            help='Select atoms to modify first')
435        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
436            help='Select atoms to transform first')
437        self.AtomEdit.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
438            help='Reload atom drawing list')
439        self.AtomCompute.Append(id=wxID_ATOMSDISAGL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Distances & Angles',
440            help='Compute distances & angles for selected atoms')   
441                 
442# Phase / Data tab
443        self.DataMenu = wx.MenuBar()
444        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
445        self.DataMenu.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
446        self.DataMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Data'),title='&Help')
447        self.DataEdit.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
448            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
449        self.DataEdit.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
450            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
451        self.DataEdit.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
452            help='Delete histograms from use for this phase')
453           
454# Phase / Texture tab
455        self.TextureMenu = wx.MenuBar()
456        self.TextureEdit = wx.Menu(title='')
457        self.TextureMenu.Append(menu=self.TextureEdit, title='Texture')
458        self.TextureMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Texture'),title='&Help')
459        self.TextureEdit.Append(id=wxID_REFINETEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Refine texture', 
460            help='Refine the texture coefficients from sequential Pawley results')
461        self.TextureEdit.Append(id=wxID_CLEARTEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear texture', 
462            help='Clear the texture coefficients' )
463           
464# Phase / Pawley tab
465        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
466        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
467        self.PawleyMenu.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Operations')
468        self.PawleyMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Pawley'),title='&Help')
469        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
470            help='Initialize Pawley reflection list')
471        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYESTIMATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley estimate',
472            help='Estimate initial Pawley intensities')
473        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley delete',
474            help='Delete Pawley reflection list')
475#        self.PawleyEdit.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
476#            help='Import Pawley reflection list')
477
478# Phase / Draw Options tab
479        self.DataDrawOptions = wx.MenuBar()
480        self.DataDrawOptions.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Options'),title='&Help')
481       
482# Phase / Draw Atoms tab
483        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
484        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
485        self.DrawAtomCompute = wx.Menu(title='')
486        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
487        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=self.DrawAtomCompute,title='Compute')
488        self.DrawAtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Atoms'),title='&Help')
489        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
490            help='Select atoms first')
491        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
492            help='Select atoms first')
493        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
494            help='Select atoms first')
495        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
496            help='Resets all atom colors to defaults')
497        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
498            help='View point is 1st atom selected')
499        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
500            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
501        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
502            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
503        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
504            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
505        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
506            help='Fill unit cell with selected atoms')
507        self.DrawAtomEdit.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
508            help='Delete atoms from drawing set')
509        self.DrawAtomCompute.Append(id=wxID_DRAWDISAGL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Distances & Angles',
510            help='Compute distances & angles for selected atoms')   
511        self.DrawAtomCompute.Append(id=wxID_DRAWTORSION, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Torsions',
512            help='Compute torsion angle for 4 selected atoms')   
513           
514# end of GSAS-II menu definitions
515       
516    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
517        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
518            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
519        self._init_menus()
520        if name:
521            self.SetLabel(name)
522        self.Show()
523       
524    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
525        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
526        self.data = data
527        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
528        Size = self.GetSize()
529        xPos = clientSize[2]-Size[0]
530        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
531        self.dirname = ''
532        self.AtomGrid = []
533        self.selectedRow = 0
534       
535    def setSizePosLeft(self,Width):
536        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
537        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
538        Width[0] = max(Width[0],300)
539        self.SetSize(Width)
540        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
541       
542    def Clear(self):
543        self.ClearBackground()
544        self.DestroyChildren()
545                   
546class GSNoteBook(wx.Notebook):
547    def __init__(self, parent, name='',size = None):
548        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
549        if size: self.SetSize(size)
550                                                     
551    def Clear(self):       
552        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
553       
554    def FindPage(self,name):
555        numPage = self.GetPageCount()
556        for page in range(numPage):
557            if self.GetPageText(page) == name:
558                return page
559       
560class GSGrid(wg.Grid):
561    def __init__(self, parent, name=''):
562        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
563        self.SetSize(parent.GetClientSize())
564           
565    def Clear(self):
566        wg.Grid.ClearGrid(self)
567       
568    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
569        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
570        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
571       
572    def GetSelection(self):
573        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
574        return None
575                       
576class Table(wg.PyGridTableBase):
577    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
578        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
579        self.colLabels = colLabels
580        self.rowLabels = rowLabels
581        self.dataTypes = types
582        self.data = data
583       
584    def AppendRows(self, numRows=1):
585        self.data.append([])
586        return True
587       
588    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
589        if self.dataTypes:
590            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
591            if typeName == colType:
592                return True
593            else:
594                return False
595        else:
596            return False
597
598    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
599        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
600
601    def DeleteRow(self,pos):
602        data = self.GetData()
603        self.SetData([])
604        new = []
605        for irow,row in enumerate(data):
606            if irow <> pos:
607                new.append(row)
608        self.SetData(new)
609       
610    def GetColLabelValue(self, col):
611        if self.colLabels:
612            return self.colLabels[col]
613           
614    def GetData(self):
615        data = []
616        for row in range(self.GetNumberRows()):
617            data.append(self.GetRowValues(row))
618        return data
619       
620    def GetNumberCols(self):
621        try:
622            return len(self.colLabels)
623        except TypeError:
624            return None
625       
626    def GetNumberRows(self):
627        return len(self.data)
628       
629    def GetRowLabelValue(self, row):
630        if self.rowLabels:
631            return self.rowLabels[row]
632       
633    def GetColValues(self, col):
634        data = []
635        for row in range(self.GetNumberRows()):
636            data.append(self.GetValue(row, col))
637        return data
638       
639    def GetRowValues(self, row):
640        data = []
641        for col in range(self.GetNumberCols()):
642            data.append(self.GetValue(row, col))
643        return data
644       
645    def GetTypeName(self, row, col):
646        try:
647            return self.dataTypes[col]
648        except TypeError:
649            return None
650
651    def GetValue(self, row, col):
652        try:
653            return self.data[row][col]
654        except IndexError:
655            return None
656           
657    def InsertRows(self, pos, rows):
658        for row in range(rows):
659            self.data.insert(pos,[])
660            pos += 1
661       
662    def IsEmptyCell(self,row,col):
663        try:
664            return not self.data[row][col]
665        except IndexError:
666            return True
667       
668    def OnKeyPress(self, event):
669        dellist = self.GetSelectedRows()
670        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
671            grid = self.GetView()
672            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
673               
674    def SetColLabelValue(self, col, label):
675        numcols = self.GetNumberCols()
676        if col > numcols-1:
677            self.colLabels.append(label)
678        else:
679            self.colLabels[col]=label
680       
681    def SetData(self,data):
682        for row in range(len(data)):
683            self.SetRowValues(row,data[row])
684               
685    def SetRowLabelValue(self, row, label):
686        self.rowLabels[row]=label
687           
688    def SetRowValues(self,row,data):
689        self.data[row] = data
690           
691    def SetValue(self, row, col, value):
692        def innerSetValue(row, col, value):
693            try:
694                self.data[row][col] = value
695            except TypeError:
696                return
697            except IndexError:
698                print row,col,value
699                # add a new row
700                if row > self.GetNumberRows():
701                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
702                elif col > self.GetNumberCols():
703                    for row in range(self.GetNumberRows):
704                        self.data[row].append('')
705                print self.data
706                self.data[row][col] = value
707        innerSetValue(row, col, value)
708               
709def UpdateNotebook(self,data):       
710    if data:
711        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
712        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
713            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
714        for line in data:
715            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
716            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
717           
718def UpdateControls(self,data):
719    #patch
720    if 'deriv type' not in data:
721        data = {}
722        data['deriv type'] = 'analytic Jacobian'
723        data['min dM/M'] = 0.0001
724        data['shift factor'] = 1.
725    if 'shift factor' not in data:
726        data['shift factor'] = 1.
727    if 'max cyc' not in data:
728        data['max cyc'] = 3       
729    #end patch
730    '''
731    #Fourier controls
732    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
733    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
734    '''
735    def SeqSizer():
736       
737        def OnSelectData(event):
738            choices = ['All',]+GetPatternTreeDataNames(self,['PWDR',])
739            sel = []
740            if 'Seq Data' in data:
741                for item in data['Seq Data']:
742                    sel.append(choices.index(item))
743            names = []
744            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select data:','Sequential refinement',choices)
745            dlg.SetSelections(sel)
746            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
747                sel = dlg.GetSelections()
748                for i in sel: names.append(choices[i])
749                if 'All' in names:
750                    names = choices[1:]
751                data['Seq Data'] = names               
752            dlg.Destroy()
753            reverseSel.Enable(True)
754           
755        def OnReverse(event):
756            data['Reverse Seq'] = reverseSel.GetValue()
757                   
758        seqSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
759        seqSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Sequential Refinement Powder Data: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
760        selSeqData = wx.Button(self.dataDisplay,-1,label=' Select data')
761        selSeqData.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnSelectData)
762        seqSizer.Add(selSeqData,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
763        seqSizer.Add((5,0),0)
764        reverseSel = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label=' Reverse order?')
765        reverseSel.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnReverse)
766        if 'Seq Data' not in data:
767            reverseSel.Enable(False)
768        if 'Reverse Seq' in data:
769            reverseSel.SetValue(data['Reverse Seq'])
770        seqSizer.Add(reverseSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
771        return seqSizer
772       
773    def LSSizer():       
774       
775        def OnDerivType(event):
776            data['deriv type'] = derivSel.GetValue()
777            derivSel.SetValue(data['deriv type'])
778            wx.CallAfter(UpdateControls,self,data)
779           
780        def OnConvergence(event):
781            try:
782                value = max(1.e-9,min(1.0,float(Cnvrg.GetValue())))
783            except ValueError:
784                value = 0.0001
785            data['min dM/M'] = value
786            Cnvrg.SetValue('%.2g'%(value))
787           
788        def OnMaxCycles(event):
789            data['max cyc'] = int(maxCyc.GetValue())
790            maxCyc.SetValue(str(data['max cyc']))
791                       
792        def OnFactor(event):
793            try:
794                value = min(max(float(Factr.GetValue()),0.00001),100.)
795            except ValueError:
796                value = 1.0
797            data['shift factor'] = value
798            Factr.SetValue('%.5f'%(value))
799       
800        LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=6,vgap=5,hgap=5)
801        LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement derivatives: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
802        Choice=['analytic Jacobian','numeric','analytic Hessian']
803        derivSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['deriv type'],choices=Choice,
804            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
805        derivSel.SetValue(data['deriv type'])
806        derivSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnDerivType)
807           
808        LSSizer.Add(derivSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
809        LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min delta-M/M: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
810        Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2g'%(data['min dM/M']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
811        Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
812        Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
813        LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
814        if 'Hessian' in data['deriv type']:
815            LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max cycles: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
816            Choice = ['0','1','2','3','5','10','15','20']
817            maxCyc = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=str(data['max cyc']),choices=Choice,
818                style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
819            maxCyc.SetValue(str(data['max cyc']))
820            maxCyc.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnMaxCycles)
821            LSSizer.Add(maxCyc,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
822        else:
823            LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Initial shift factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
824            Factr = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.5f'%(data['shift factor']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
825            Factr.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnFactor)
826            Factr.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnFactor)
827            LSSizer.Add(Factr,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
828        return LSSizer
829       
830    if self.dataDisplay:
831        self.dataDisplay.Destroy()
832    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
833        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
834        Status.SetStatusText('')
835    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
836    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
837    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ControlsMenu)
838    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
839    mainSizer.Add((5,5),0)
840    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)   
841    mainSizer.Add(LSSizer())
842    mainSizer.Add((5,5),0)
843    mainSizer.Add(SeqSizer())
844    mainSizer.Add((5,5),0)
845       
846    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
847
848    mainSizer.Layout()   
849    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
850    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
851    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
852     
853def UpdateComments(self,data):                   
854    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
855    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
856        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
857    for line in data:
858        if line[-1] == '\n':
859            self.dataDisplay.AppendText(line)
860        else:
861            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
862           
863def UpdateSeqResults(self,data):
864    """
865    input:
866        data - dictionary
867            'histNames' - list of histogram names in order as processed by Sequential Refinement
868            'varyList' - list of variables - identical over all refinements insequence
869            histName - dictionaries for all data sets processed:
870                'variables'- result[0] from leastsq call
871                'varyList' - list of variables; same as above
872                'sig' - esds for variables
873                'covMatrix' - covariance matrix from individual refinement
874                'title' - histogram name; same as dict item name
875                'newAtomDict' - new atom parameters after shifts applied
876                'newCellDict' - new cell parameters after shifts to A0-A5 applied'
877    """
878    if not data:
879        print 'No sequential refinement results'
880        return
881    histNames = data['histNames']
882       
883    def GetSampleParms():
884        sampleParmDict = {'Temperature':[],'Pressure':[],'Humidity':[],'Voltage':[],'Force':[],}
885        sampleParm = {}
886        for name in histNames:
887            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root,name)
888            sampleData = self.PatternTree.GetItemPyData(GetPatternTreeItemId(self,Id,'Sample Parameters'))
889            for item in sampleParmDict:
890                sampleParmDict[item].append(sampleData[item])
891        for item in sampleParmDict:
892            frstValue = sampleParmDict[item][0]
893            if np.any(np.array(sampleParmDict[item])-frstValue):
894                sampleParm[item] = sampleParmDict[item]           
895        return sampleParm
896           
897    def GetSigData(parm):
898        sigData = []
899        for name in histNames:
900            sigList = data[name]['sig']
901            if colLabels[parm] in atomList:
902                sigData.append(sigList[colLabels.index(atomList[colLabels[parm]])])
903            elif colLabels[parm] in cellList:
904                sigData.append(sigList[colLabels.index(cellList[colLabels[parm]])])
905            else:
906                sigData.append(sigList[parm])
907        return sigData
908   
909    def Select(event):
910        cols = self.dataDisplay.GetSelectedCols()
911        rows = self.dataDisplay.GetSelectedRows()
912        if cols:
913            plotData = []
914            plotSig = []
915            plotNames = []
916            for col in cols:
917                plotData.append(self.SeqTable.GetColValues(col))
918                plotSig.append(GetSigData(col))
919                plotNames.append(self.SeqTable.GetColLabelValue(col))
920            plotData = np.array(plotData)
921            G2plt.PlotSeq(self,plotData,plotSig,plotNames,sampleParms)
922        elif rows:
923            name = histNames[rows[0]]
924            G2plt.PlotCovariance(self,Data=data[name])
925               
926    if self.dataDisplay:
927        self.dataDisplay.Destroy()
928    cellList = {}
929    newCellDict = data[histNames[0]]['newCellDict']
930    for item in newCellDict:
931        if item in data['varyList']:
932            cellList[newCellDict[item][0]] = item
933    atomList = {}
934    newAtomDict = data[histNames[0]]['newAtomDict']
935    for item in newAtomDict:
936        if item in data['varyList']:
937            atomList[newAtomDict[item][0]] = item
938    sampleParms = GetSampleParms()
939    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
940    self.dataFrame.SetLabel('Sequental refinement results')
941    self.dataFrame.CreateStatusBar()
942    colLabels = data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys()
943    Types = len(data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys())*[wg.GRID_VALUE_FLOAT,]
944    seqList = [list(data[name]['variables']) for name in histNames]
945   
946    for i,item in enumerate(seqList):
947        newAtomDict = data[histNames[i]]['newAtomDict']
948        newCellDict = data[histNames[i]]['newCellDict']
949        item += [newAtomDict[atomList[parm]][1] for parm in atomList.keys()]
950        item += [newCellDict[cellList[parm]][1] for parm in cellList.keys()]
951    self.SeqTable = Table(seqList,colLabels=colLabels,rowLabels=histNames,types=Types)
952    self.dataDisplay = GSGrid(parent=self.dataFrame)
953    self.dataDisplay.SetTable(self.SeqTable, True)
954    self.dataDisplay.EnableEditing(False)
955    self.dataDisplay.Bind(wg.EVT_GRID_LABEL_LEFT_DCLICK, Select)
956    self.dataDisplay.SetRowLabelSize(8*len(histNames[0]))       #pretty arbitrary 8
957    self.dataDisplay.SetMargins(0,0)
958    self.dataDisplay.AutoSizeColumns(True)
959    self.dataFrame.setSizePosLeft([700,350])
960   
961def UpdateConstraints(self,data):             
962#    data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
963    if not data:
964        data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
965    Histograms,Phases = self.GetUsedHistogramsAndPhasesfromTree()
966    AtomDict = dict([Phases[phase]['pId'],Phases[phase]['Atoms']] for phase in Phases)
967    Natoms,phaseVary,phaseDict,pawleyLookup,FFtable,BLtable = G2str.GetPhaseData(Phases,Print=False)
968    phaseList = []
969    for item in phaseDict:
970        if item.split(':')[2] not in ['Ax','Ay','Az','Amul','AI/A','Atype','SHorder']:
971            phaseList.append(item)
972    phaseList.sort()
973    phaseAtNames = {}
974    for item in phaseList:
975        Split = item.split(':')
976        if Split[2][:2] in ['AU','Af','dA']:
977            phaseAtNames[item] = AtomDict[int(Split[0])][int(Split[3])][0]
978        else:
979            phaseAtNames[item] = ''
980           
981    hapVary,hapDict,controlDict = G2str.GetHistogramPhaseData(Phases,Histograms,Print=False)
982    hapList = hapDict.keys()
983    hapList.sort()
984    histVary,histDict,controlDict = G2str.GetHistogramData(Histograms,Print=False)
985    histList = []
986    for item in histDict:
987        if item.split(':')[2] not in ['Omega','Type','Chi','Phi','Azimuth','Gonio. radius','Lam1','Lam2','Back']:
988            histList.append(item)
989    histList.sort()
990    Indx = {}
991    scope = {}                          #filled out later
992    self.Page = [0,'phs']
993   
994    def GetPHlegends(Phases,Histograms):
995        plegend = '\n In p::name'
996        hlegend = '\n In :h:name'
997        phlegend = '\n In p:h:name'
998        for phase in Phases:
999            plegend += '\n p:: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':: for '+phase
1000            count = 0
1001            for histogram in Phases[phase]['Histograms']:
1002                if count < 3:
1003                    phlegend += '\n p:h: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+phase+' in '+histogram
1004                else:
1005                    phlegend += '\n ... etc.'
1006                    break
1007                count += 1
1008        count = 0
1009        for histogram in Histograms:
1010            if count < 3:
1011                hlegend += '\n :h: = :'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+histogram
1012            else:
1013                hlegend += '\n ... etc.'
1014                break
1015            count += 1
1016        return plegend,hlegend,phlegend
1017       
1018    def FindEquivVarb(name,nameList):
1019        outList = []
1020        namelist = [name.split(':')[2],]
1021        if 'dA' in name:
1022            namelist = ['dAx','dAy','dAz']
1023        elif 'AU' in name:
1024            namelist = ['AUiso','AU11','AU22','AU33','AU12','AU13','AU23']
1025        for item in nameList:
1026            key = item.split(':')[2]
1027            if key in namelist and item != name:
1028                outList.append(item)
1029        return outList
1030       
1031    def SelectVarbs(page,FrstVarb,varList,legend,constType):
1032        #future -  add 'all:all:name', '0:all:name', etc. to the varList
1033        if page[1] == 'phs':
1034            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in varList]
1035            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',atchoice)
1036        else:
1037            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',varList)
1038        varbs = [FrstVarb,]
1039        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1040            sel = dlg.GetSelections()
1041            for x in sel:
1042                varbs.append(varList[x])
1043        dlg.Destroy()
1044        if len(varbs) > 1:
1045            if 'equivalence' in constType:
1046                constr = []
1047                for item in varbs[1:]:
1048                    constr += [[[1.0,FrstVarb],[-1.0,item],None,None],]
1049                return constr           #multiple constraints
1050            elif 'function' in constType:
1051                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1052                return [constr+[0.0,False]]         #just one constraint
1053            else:       #'constraint'
1054                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1055                return [constr+[1.0,None]]          #just one constraint - default sum to one
1056        return []
1057             
1058    def OnAddHold(event):
1059        for phase in Phases:
1060            Phase = Phases[phase]
1061            Atoms = Phase['Atoms']
1062        constr = []
1063        page = self.Page
1064        choice = scope[page[1]]
1065        if page[1] == 'phs':
1066            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1067            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1068        else:   
1069            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1070        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1071            sel = dlg.GetSelection()
1072            FrstVarb = choice[2][sel]
1073            data[choice[3]] += [[[0.0,FrstVarb],None,None],]
1074        dlg.Destroy()
1075        choice[4]()
1076       
1077    def OnAddEquivalence(event):
1078        constr = []
1079        page = self.Page
1080        choice = scope[page[1]]
1081        if page[1] == 'phs':
1082            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1083            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1084        else:   
1085            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1086        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1087            sel = dlg.GetSelection()
1088            FrstVarb = choice[2][sel]
1089            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1090            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'equivalence')
1091            if len(constr) > 0:
1092                data[choice[3]] += constr
1093        dlg.Destroy()
1094        choice[4]()
1095   
1096    def OnAddFunction(event):
1097        constr = []
1098        page = self.Page
1099        choice = scope[page[1]]
1100        if page[1] == 'phs':
1101            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1102            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1103        else:   
1104            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1105        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1106            sel = dlg.GetSelection()
1107            FrstVarb = choice[2][sel]
1108            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1109            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'function')
1110            if len(constr) > 0:
1111                data[choice[3]] += constr
1112        dlg.Destroy()
1113        choice[4]()
1114                       
1115    def OnAddConstraint(event):
1116        constr = []
1117        page = self.Page
1118        choice = scope[page[1]]
1119        if page[1] == 'phs':
1120            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1121            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1122        else:   
1123            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1124        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1125            sel = dlg.GetSelection()
1126            FrstVarb = choice[2][sel]
1127            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1128            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'constraint')
1129            if len(constr) > 0:
1130                data[choice[3]] += constr
1131        dlg.Destroy()
1132        choice[4]()
1133                       
1134    def ConstSizer(name,pageDisplay):
1135        constSizer = wx.FlexGridSizer(1,4,0,0)
1136        for Id,item in enumerate(data[name]):
1137            constDel = wx.Button(pageDisplay,-1,'Delete',style=wx.BU_EXACTFIT)
1138            constDel.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstDel)
1139            Indx[constDel.GetId()] = [Id,name]
1140            if len(item) < 4:
1141                constSizer.Add((5,5),0)
1142                constSizer.Add(constDel)
1143                eqString = ' FIXED   '+item[0][1]+'   '
1144            else:
1145                constEdit = wx.Button(pageDisplay,-1,'Edit',style=wx.BU_EXACTFIT)
1146                constEdit.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstEdit)
1147                Indx[constEdit.GetId()] = [Id,name]
1148                constSizer.Add(constEdit)           
1149                constSizer.Add(constDel)
1150                if isinstance(item[-1],bool):
1151                    eqString = ' FUNCT   '
1152                elif isinstance(item[-2],float):
1153                    eqString = ' CONSTR  '
1154                else:
1155                    eqString = ' EQUIV   '
1156                for term in item[:-2]:
1157                    eqString += '%+.3f*%s '%(term[0],term[1])
1158                if isinstance(item[-2],float):
1159                    eqString += ' = %.3f'%(item[-2])+'  '
1160                else:
1161                    eqString += ' = 0   '
1162            constSizer.Add(wx.StaticText(pageDisplay,-1,eqString),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1163            if isinstance(item[-1],bool):
1164                constRef = wx.CheckBox(pageDisplay,-1,label=' Refine?')                   
1165                constRef.SetValue(item[-1])
1166                constRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnConstRef)
1167                Indx[constRef.GetId()] = item
1168                constSizer.Add(constRef,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1169            else:
1170                constSizer.Add((5,5),0)
1171        return constSizer
1172               
1173    def OnConstRef(event):
1174        Obj = event.GetEventObject()
1175        Indx[Obj.GetId()][-1] = Obj.GetValue()
1176       
1177    def OnConstDel(event):
1178        Obj = event.GetEventObject()
1179        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1180        del(data[name][Id])
1181        OnPageChanged(None)       
1182       
1183    def OnConstEdit(event):
1184        Obj = event.GetEventObject()
1185        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1186        const = data[name][Id][-2]       
1187        if isinstance(data[name][Id][-1],bool):
1188            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1189            constType = 'Function'
1190            extra = '; sum = new variable'
1191        elif isinstance(data[name][Id][-2],float):
1192            items = data[name][Id][:-2]+[[const,'= fixed value'],[]]
1193            constType = 'Constraint'
1194            extra = ' sum = constant'
1195        else:
1196            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1197            constType = 'Equivalence'
1198            extra = '; sum = 0'
1199        dlg = self.SumDialog(self,constType,'Enter value for each term in constraint'+extra,'',items)
1200        try:
1201            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1202                result = dlg.GetData()
1203                if isinstance(data[name][Id][-2],float):
1204                    data[name][Id][:-2] = result[:-2]
1205                    data[name][Id][-2] = result[-2][0]
1206                else:
1207                    data[name][Id][:-2] = result[:-1]
1208        finally:
1209            dlg.Destroy()           
1210        OnPageChanged(None)                     
1211   
1212    def UpdateHAPConstr():
1213        HAPConstr.DestroyChildren()
1214        HAPDisplay = wx.Panel(HAPConstr)
1215        HAPSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1216        HAPSizer.Add((5,5),0)
1217        HAPSizer.Add(ConstSizer('HAP',HAPDisplay))
1218        HAPDisplay.SetSizer(HAPSizer,True)
1219        Size = HAPSizer.GetMinSize()
1220        Size[0] += 40
1221        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1222        HAPDisplay.SetSize(Size)
1223        HAPConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1224        Size[1] = min(Size[1],250)
1225        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1226       
1227    def UpdateHistConstr():
1228        HistConstr.DestroyChildren()
1229        HistDisplay = wx.Panel(HistConstr)
1230        HistSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1231        HistSizer.Add((5,5),0)       
1232        HistSizer.Add(ConstSizer('Hist',HistDisplay))
1233        HistDisplay.SetSizer(HistSizer,True)
1234        Size = HistSizer.GetMinSize()
1235        Size[0] += 40
1236        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1237        HistDisplay.SetSize(Size)
1238        HistConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1239        Size[1] = min(Size[1],250)
1240        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1241       
1242    def UpdatePhaseConstr():
1243        PhaseConstr.DestroyChildren()
1244        PhaseDisplay = wx.Panel(PhaseConstr)
1245        PhaseSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1246        PhaseSizer.Add((5,5),0)       
1247        PhaseSizer.Add(ConstSizer('Phase',PhaseDisplay))
1248        PhaseDisplay.SetSizer(PhaseSizer,True)
1249        Size = PhaseSizer.GetMinSize()
1250        Size[0] += 40
1251        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1252        PhaseDisplay.SetSize(Size)
1253        PhaseConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1254        Size[1] = min(Size[1],250)
1255        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1256   
1257    def OnPageChanged(event):
1258        if event:       #page change event!
1259            page = event.GetSelection()
1260        else:
1261            page = self.dataDisplay.GetSelection()
1262        oldPage = self.dataDisplay.ChangeSelection(page)
1263        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1264        if text == 'Histogram/Phase constraints':
1265            self.Page = [page,'hap']
1266            UpdateHAPConstr()
1267        elif text == 'Histogram constraints':
1268            self.Page = [page,'hst']
1269            UpdateHistConstr()
1270        elif text == 'Phase constraints':
1271            self.Page = [page,'phs']
1272            UpdatePhaseConstr()
1273
1274    def SetStatusLine(text):
1275        Status.SetStatusText(text)                                     
1276       
1277    plegend,hlegend,phlegend = GetPHlegends(Phases,Histograms)
1278    scope = {'hst':['Histogram variables:',hlegend,histList,'Hist',UpdateHistConstr],
1279        'hap':['HAP variables:',phlegend,hapList,'HAP',UpdateHAPConstr],
1280        'phs':['Phase variables:',plegend,phaseList,'Phase',UpdatePhaseConstr]}
1281    if self.dataDisplay:
1282        self.dataDisplay.Destroy()
1283    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1284    self.dataFrame.SetLabel('Constraints')
1285    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1286        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1287    SetStatusLine('')
1288   
1289    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1290    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddConstraint, id=wxID_CONSTRAINTADD)
1291    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddFunction, id=wxID_FUNCTADD)
1292    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddEquivalence, id=wxID_EQUIVADD)
1293    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddHold, id=wxID_HOLDADD)
1294    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1295   
1296    PhaseConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1297    self.dataDisplay.AddPage(PhaseConstr,'Phase constraints')
1298    HAPConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1299    self.dataDisplay.AddPage(HAPConstr,'Histogram/Phase constraints')
1300    HistConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1301    self.dataDisplay.AddPage(HistConstr,'Histogram constraints')
1302    UpdatePhaseConstr()
1303
1304    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)
1305   
1306   
1307def UpdateRestraints(self,data):
1308
1309    def OnAddRestraint(event):
1310        page = self.dataDisplay.GetSelection()
1311        print self.dataDisplay.GetPageText(page)
1312
1313    def UpdateAtomRestr():
1314        AtomRestr.DestroyChildren()
1315        dataDisplay = wx.Panel(AtomRestr)
1316        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1317        mainSizer.Add((5,5),0)
1318        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Atom restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1319        mainSizer.Add((5,5),0)
1320
1321
1322        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1323        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1324        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1325        dataDisplay.SetSize(Size)
1326        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1327       
1328    def UpdatePhaseRestr():
1329        PhaseRestr.DestroyChildren()
1330        dataDisplay = wx.Panel(PhaseRestr)
1331        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1332        mainSizer.Add((5,5),0)
1333        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Phase restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1334        mainSizer.Add((5,5),0)
1335
1336
1337        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1338        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1339        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1340        dataDisplay.SetSize(Size)
1341        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1342   
1343    def OnPageChanged(event):
1344        page = event.GetSelection()
1345        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1346        if text == 'Atom restraints':
1347            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1348            UpdateAtomRestr()
1349        elif text == 'Phase restraints':
1350            UpdatePhaseRestr()
1351            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1352        event.Skip()
1353
1354    if self.dataDisplay:
1355        self.dataDisplay.Destroy()
1356    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1357    self.dataFrame.SetLabel('restraints')
1358    self.dataFrame.CreateStatusBar()
1359    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddRestraint, id=wxID_RESTRAINTADD)
1360    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1361   
1362    PhaseRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1363    self.dataDisplay.AddPage(PhaseRestr,'Phase restraints')
1364    AtomRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1365    self.dataDisplay.AddPage(AtomRestr,'Atom restraints')
1366    UpdatePhaseRestr()
1367#    AtomRestrData = data['AtomRestr']
1368
1369    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)       
1370             
1371def UpdateHKLControls(self,data):
1372   
1373    def OnScaleSlider(event):
1374        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
1375        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
1376        data['Scale'] = scale*10.
1377        G2plt.PlotSngl(self)
1378       
1379    def OnLayerSlider(event):
1380        layer = layerSel.GetValue()
1381        data['Layer'] = layer
1382        G2plt.PlotSngl(self)
1383       
1384    def OnSelZone(event):
1385        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
1386        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1387       
1388    def OnSelType(event):
1389        data['Type'] = typeSel.GetValue()
1390        G2plt.PlotSngl(self)
1391       
1392    def SetStatusLine():
1393        Status.SetStatusText("look at me!!!")
1394                                     
1395    if self.dataDisplay:
1396        self.dataDisplay.Destroy()
1397    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1398        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1399    SetStatusLine()
1400    zones = ['100','010','001']
1401    HKLmax = data['HKLmax']
1402    HKLmin = data['HKLmin']
1403    if data['ifFc']:
1404        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
1405    else:
1406        typeChoices = ['Fosq','Fo']
1407    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
1408    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1409    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1410    mainSizer.Add((5,10),0)
1411   
1412    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1413    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
1414        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1415    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
1416        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
1417    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1418    scaleSel.SetLineSize(100)
1419    scaleSel.SetPageSize(900)
1420    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
1421    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1422   
1423    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1424    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
1425        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1426    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
1427        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1428    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
1429    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1430    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
1431        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
1432    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
1433        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1434    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
1435    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1436    zoneSizer.Add((10,0),0)   
1437    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1438       
1439    izone = zones.index(data['Zone'])
1440    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1441    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
1442        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1443    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
1444        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
1445    layerSel.SetLineSize(1)
1446    layerSel.SetLineSize(5)
1447    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
1448    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1449    layerSizer.Add((10,0),0)   
1450    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1451
1452       
1453    mainSizer.Layout()   
1454    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1455    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1456    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1457
1458def GetPatternTreeDataNames(self,dataTypes):
1459    names = []
1460    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(self.root)       
1461    while item:
1462        name = self.PatternTree.GetItemText(item)
1463        if name[:4] in dataTypes:
1464            names.append(name)
1465        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(self.root, cookie)
1466    return names
1467                         
1468def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
1469    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
1470    while item:
1471        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
1472            return item
1473        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
1474    return 0               
1475
1476def MovePatternTreeToGrid(self,item):
1477   
1478#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
1479   
1480    oldPage = 0
1481    if self.dataFrame:
1482        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1483        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
1484            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1485            self.dataDisplay.Clear() 
1486            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
1487            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1488        elif self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
1489            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1490            self.dataDisplay.Clear() 
1491            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
1492            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1493        elif 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
1494            if self.dataDisplay: 
1495                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
1496        self.dataFrame.Clear()
1497        self.dataFrame.SetLabel('')
1498    else:
1499        #create the frame for the data item window
1500        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
1501
1502    self.dataFrame.Raise()           
1503    self.PickId = 0
1504    parentID = self.root
1505    self.ExportPattern.Enable(False)
1506    defWid = [250,150]
1507    if item != self.root:
1508        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1509    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
1510        self.PatternId = item
1511        self.PickId = item
1512        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
1513            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.DataNotebookMenu)
1514            self.PatternId = 0
1515            self.ExportPattern.Enable(False)
1516            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1517            UpdateNotebook(self,data)
1518        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
1519            self.PatternId = 0
1520            self.ExportPattern.Enable(False)
1521            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1522            if not data:           #fill in defaults
1523                data = {
1524                    #least squares controls
1525                    'deriv type':'analytic Jacobian','min dM/M':0.0001,'shift factor':1.0,'max cyc':3,
1526                    #Fourier controls
1527                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
1528                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
1529                    #distance/angle controls
1530                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
1531                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1532            self.Refine.Enable(True)
1533            self.SeqRefine.Enable(True)
1534            UpdateControls(self,data)
1535        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sequental results':
1536            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1537            UpdateSeqResults(self,data)           
1538        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Covariance':
1539            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1540            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1541            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1542                        value='See plot window for covariance display')
1543            G2plt.PlotCovariance(self)
1544        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Constraints':
1545            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1546            UpdateConstraints(self,data)
1547        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Restraints':
1548            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1549            UpdateRestraints(self,data)
1550        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1551            self.Image = item
1552            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
1553        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1554            G2plt.PlotPowderLines(self)
1555        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1556            self.ExportPattern.Enable(True)
1557            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1558            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1559                style=wx.TE_MULTILINE,
1560                value='See plot window for powder data display\nor select a data item in histogram')
1561            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
1562        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1563            self.Sngl = item
1564            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1565        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1566            self.PatternId = item
1567            self.ExportPDF.Enable(True)
1568            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1569        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Phases':
1570            self.dataFrame.setSizePosLeft(defWid)
1571            wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
1572                value='Select one phase to see its parameters')           
1573    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1574        self.PickId = item
1575        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1576        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
1577    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1578        self.PickId = item
1579        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1580        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
1581    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1582        self.PickId = item
1583        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1584        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
1585    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1586        self.PickId = item
1587        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1588        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
1589    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
1590        self.PickId = item
1591        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
1592        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
1593    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
1594        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.DataCommentsMenu)
1595        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1596        self.PickId = item
1597        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1598        UpdateComments(self,data)
1599    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
1600        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
1601        self.PickId = item
1602        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1603        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
1604            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
1605        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1606        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
1607        G2plt.PlotImage(self)
1608    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
1609        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
1610        self.PickId = item
1611        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1612        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1613        G2imG.UpdateMasks(self,data)
1614        G2plt.PlotImage(self)
1615    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
1616        self.PickId = item
1617        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1618        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1619        UpdateHKLControls(self,data)
1620        G2plt.PlotSngl(self)
1621    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
1622        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1623        self.ExportPDF.Enable(True)
1624        self.PickId = item
1625        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1626        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
1627        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
1628        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1629        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
1630        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
1631    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
1632        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1633        self.ExportPeakList.Enable(True)
1634        self.PickId = item
1635        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1636        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
1637        G2plt.PlotPatterns(self)
1638    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
1639        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1640        self.PickId = item
1641        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1642        G2pdG.UpdateBackground(self,data)
1643        G2plt.PlotPatterns(self)
1644    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
1645        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1646        self.PickId = item
1647        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1648        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
1649        G2plt.PlotPatterns(self)
1650    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
1651        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1652        self.PickId = item
1653        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1654        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
1655        G2plt.PlotPeakWidths(self)
1656    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
1657        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1658        self.PickId = item
1659        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1660
1661        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
1662            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
1663                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,
1664                'Force':0.0,'Gonio. radius':200.0}
1665            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
1666   
1667        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
1668        G2plt.PlotPatterns(self)
1669    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
1670        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1671        self.ExportPeakList.Enable(True)
1672        self.PickId = item
1673        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1674        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
1675        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1676            G2plt.PlotPowderLines(self)
1677        else:
1678            G2plt.PlotPatterns(self)
1679    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
1680        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1681        self.PickId = item
1682        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1683        if not data:
1684            data.append([0,0.0,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, zero value, max Nc/No, start volume
1685            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
1686            data.append([])                                 #empty cell list
1687            data.append([])                                 #empty dmin
1688            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1689        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
1690        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1691            G2plt.PlotPowderLines(self)
1692        else:
1693            G2plt.PlotPatterns(self)
1694    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Reflection Lists':
1695        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1696        self.PickId = item
1697        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1698        self.RefList = ''
1699        if len(data):
1700            self.RefList = data.keys()[0]
1701        G2pdG.UpdateReflectionGrid(self,data)
1702        G2plt.PlotPatterns(self)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.