source: trunk/GSASIIgrid.py @ 445

Last change on this file since 445 was 445, checked in by toby, 10 years ago

1st stop on help fixes

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 75.2 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2011-12-16 21:30:04 +0000 (Fri, 16 Dec 2011) $
4# $Author: toby $
5# $Revision: 445 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 445 2011-12-16 21:30:04Z toby $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import numpy as np
14import os.path
15import wx.html        # could postpone this for quicker startup
16import webbrowser     # could postpone this for quicker startup
17import GSASIIpath
18import GSASIIplot as G2plt
19import GSASIIpwdGUI as G2pdG
20import GSASIIimgGUI as G2imG
21import GSASIIphsGUI as G2phG
22import GSASIIstruct as G2str
23#import GSASIImapvars as G2mv
24
25# globals we will use later
26__version__ = None # gets overridden in GSASII.py
27path2GSAS2 = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)) # save location of this file
28helpLocDict = {}
29htmlPanel = None
30htmlFrame = None
31helpMode = 'internal'    # need a global control to set this
32helpMode = 'browser'    # need a global control to set this
33htmlFirstUse = True
34
35[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
36    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
37    wxID_RELOADDRAWATOMS,
38] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(9)]
39
40[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
41] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
42
43[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
44    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
45    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD,
46] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(10)]
47
48[ wxID_IMCALIBRATE,wxID_IMRECALIBRATE,wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
49    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
50] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(8)]
51
52[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
53] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
54
55[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT, wxID_PAWLEYDELETE, wxID_PAWLEYESTIMATE,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(4)]
57
58[ wxID_INSTPRMRESET,wxID_CHANGEWAVETYPE,wxID_INSTCOPY,
59] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(3)]
60
61[ wxID_INDXRELOAD,
62] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
63
64[ wxID_UNDO,wxID_LSQPEAKFIT,wxID_LSQONECYCLE,wxID_RESETSIGGAM,wxID_CLEARPEAKS,
65] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(5)]
66
67[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
68] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
69
70[ wxID_BACKCOPY,
71] = [wx.NewId() for _init_coll_Back_Items in range(1)]
72
73[ wxID_LIMITCOPY,
74] = [wx.NewId() for _init_coll_Limit_Items in range(1)]
75
76[ wxID_SAMPLECOPY,
77] = [wx.NewId() for _init_coll_Sample_Items in range(1)]
78
79[ wxID_CONSTRAINTADD,wxID_EQUIVADD,wxID_HOLDADD,wxID_FUNCTADD,
80] = [wx.NewId() for _init_coll_Constraint_Items in range(4)]
81
82[ wxID_RESTRAINTADD,
83] = [wx.NewId() for _init_coll_Restraint_Items in range(1)]
84
85[ wxID_SELECTPHASE,
86] = [wx.NewId() for _init_coll_Refl_Items in range(1)]
87
88[ wxID_CLEARTEXTURE,wxID_REFINETEXTURE,
89] = [wx.NewId() for _init_coll_Texture_Items in range(2)]
90
91[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
92    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
93] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
94
95VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
96
97class MyHelp(wx.Menu):
98    '''This class creates the contents of a help menu.
99    The menu will start with two entries:
100      'Help on <helpType>': where helpType is a reference to an HTML page to
101      be opened
102      About: opens an About dialog using OnHelpAbout. N.B. on the Mac this
103      gets moved to the App menu to be consistent with Apple style.
104    NOTE: the title for this menu should be '&Help' so the wx handles
105    it correctly. BHT
106    '''
107    def __init__(self,frame,title='',helpType=None):
108        wx.Menu.__init__(self,title)
109        self.helpType = helpType
110        self.frame = frame
111        # add a help item only when helpType is specified
112        if helpType is not None:
113            helpobj = self.Append(text='Help on '+helpType,
114                                  id=wx.ID_ANY, kind=wx.ITEM_NORMAL)
115            frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelp, helpobj)
116        self.Append(help='', id=wx.ID_ABOUT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
117                    text='&About GSAS-II')
118        frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelpAbout, id=wx.ID_ABOUT)
119
120    def OnHelp(self,event):
121        '''Called when Help on... is pressed in a menu. Brings up
122        a web page for documentation.
123        '''
124        global helpLocDict
125        global helpMode
126        # look up a definition for help info from dict
127        helplink = helpLocDict.get(self.helpType)
128        if helplink is None:
129            # no defined link to use, create a default based on key
130            helplink = 'gsasII.html#'+self.helpType.replace(' ','_')
131            print helplink
132        helplink = os.path.join(path2GSAS2,'help',helplink)
133        if helpMode == 'internal':
134            global htmlPanel, htmlFrame
135            try:
136                htmlPanel.LoadFile(helplink)
137            except:
138                htmlFrame = wx.Frame(self.frame, -1, size=(610, 380))
139                htmlFrame.Show(True)
140                htmlFrame.SetTitle("HTML Window") # N.B. reset later in LoadFile
141                htmlPanel = MyHtmlPanel(htmlFrame,-1)
142                htmlPanel.LoadFile(helplink)
143        else:
144            global htmlFirstUse
145            #import webbrowser
146            if htmlFirstUse:
147                webbrowser.open_new("file://"+helplink)
148                htmlFirstUse = False
149            else:
150                webbrowser.open("file://"+helplink, new=0, autoraise=True)
151
152    def OnHelpAbout(self, event):
153        "Display an 'About GSAS-II' box"
154        global __version__
155        info = wx.AboutDialogInfo()
156        info.Name = 'GSAS-II'
157        info.Version = __version__
158        info.Copyright = '''
159Robert B. Von Dreele
160Argonne National Laboratory(C)
161This product includes software developed
162by the UChicago Argonne, LLC, as
163Operator of Argonne National Laboratory.         '''
164        info.Description = '''
165General Structure Analysis System - II
166'''
167        wx.AboutBox(info)
168
169class MyHtmlPanel(wx.Panel):
170    '''Defines a panel to display Help information'''
171    def __init__(self, frame, id):
172        self.frame = frame
173        wx.Panel.__init__(self, frame, id)
174        sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
175        back = wx.Button(self, -1, "Back")
176        back.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.OnBack)
177        sizer.Add(back, 0, wx.ALIGN_LEFT, 0)
178
179        #self.htmlwin = wx.html.HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
180        self.htmlwin = G2HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
181        sizer.Add(self.htmlwin, 1, wx.GROW|wx.ALL, 0)
182        self.SetSizer(sizer)
183        sizer.Fit(frame)       
184    def OnBack(self, event):
185        self.htmlwin.HistoryBack()
186    def LoadFile(self,file):
187        pos = file.rfind('#')
188        if pos != -1:
189            helpfile = file[:pos]
190            helpanchor = file[pos+1:]
191        else:
192            helpfile = file
193            helpanchor = None
194        self.htmlwin.LoadPage(helpfile)
195        if helpanchor is not None:
196            self.htmlwin.ScrollToAnchor(helpanchor)
197
198class G2HtmlWindow(wx.html.HtmlWindow):
199    '''Displays help information in a primitive HTML browser type window
200    '''
201    def __init__(self, parent, *args, **kwargs):
202        self.parent = parent
203        wx.html.HtmlWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs)
204    def LoadPage(self, *args, **kwargs):
205        wx.html.HtmlWindow.LoadPage(self, *args, **kwargs)
206        self.TitlePage()
207    def OnLinkClicked(self, *args, **kwargs):
208        wx.html.HtmlWindow.OnLinkClicked(self, *args, **kwargs)
209        self.TitlePage()
210    def HistoryBack(self, *args, **kwargs):
211        wx.html.HtmlWindow.HistoryBack(self, *args, **kwargs)
212        self.TitlePage()
213    def TitlePage(self):
214        self.parent.frame.SetTitle(self.GetOpenedPage() + ' -- ' + 
215                                   self.GetOpenedPageTitle())
216
217class DataFrame(wx.Frame):
218    def _init_coll_BlankMenu(self,parent):
219        parent.Append(menu=self.Blank,title='')
220               
221    def _init_coll_ConstraintMenu(self,parent):
222        parent.Append(menu=self.ConstraintEdit, title='Edit')
223        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Constraints'),title='&Help')
224       
225    def _init_coll_RestraintMenu(self,parent):
226        parent.Append(menu=self.RestraintEdit, title='Edit')
227        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Restraints'),title='&Help')
228       
229    def _init_coll_DataMenu(self,parent):
230        parent.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
231        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Data'),title='&Help')
232       
233    def _init_coll_DrawAtomsMenu(self,parent):
234        parent.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
235        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Atoms'),title='&Help')
236
237    def _init_coll_PawleyMenu(self,parent):
238        parent.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Operations')
239        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Pawley'),title='&Help')
240     
241    def _init_coll_IndPeaksMenu(self,parent):
242        parent.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Operations')
243        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Index Peaks'),title='&Help')
244                   
245    def _init_coll_ImageMenu(self,parent):
246        parent.Append(menu=self.ImageEdit, title='Operations')
247        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Images'),title='&Help')
248       
249    def _init_coll_BackMenu(self,parent):
250        parent.Append(menu=self.BackEdit, title='File')
251        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Background'),title='&Help')
252       
253    def _init_coll_LimitMenu(self,parent):
254        parent.Append(menu=self.LimitEdit, title='File')
255        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Limits'),title='&Help')
256       
257    def _init_coll_InstMenu(self,parent):
258        parent.Append(menu=self.InstEdit, title='Operations')
259        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Instrument Parameters'),title='&Help')
260       
261    def _init_coll_MaskMenu(self,parent):
262        parent.Append(menu=self.MaskEdit, title='Operations')
263        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Image Masks'),title='&Help')
264       
265    def _init_coll_SampleMenu(self,parent):
266        parent.Append(menu=self.SampleEdit, title='File')
267        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Sample Parameters'),title='&Help')
268       
269    def _init_coll_PeakMenu(self,parent):
270        parent.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
271        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Powder Peaks'),title='&Help')
272
273    def _init_coll_IndexMenu(self,parent):
274        parent.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
275        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Cell Indexing Refine'),title='&Help')
276       
277    def _init_coll_ReflMenu(self,parent):
278        parent.Append(menu=self.ReflEdit, title='Reflection List')
279        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Reflection List'),title='&Help')
280
281    def _init_coll_TextureMenu(self,parent):
282        parent.Append(menu=self.TextureEdit, title='Texture')
283        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Texture'),title='&Help')
284
285    def _init_coll_PDFMenu(self,parent):
286        parent.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
287        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='PDF Controls'),title='&Help')
288           
289    def _init_coll_Constraint_Items(self,parent):
290        parent.Append(id=wxID_HOLDADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add hold',
291            help='Add hold on a parameter value')
292        parent.Append(id=wxID_EQUIVADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add equivalence',
293            help='Add equivalence between parameter values')
294        parent.Append(id=wxID_CONSTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add constraint',
295            help='Add constraint on parameter values')
296        parent.Append(id=wxID_FUNCTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add function',
297            help='Add function of parameter values')
298       
299    def _init_coll_Restraint_Items(self,parent):
300        parent.Append(id=wxID_RESTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add restraint',
301            help='restraint dummy menu item')
302                   
303    def _init_coll_Sample_Items(self,parent):
304        parent.Append(id=wxID_SAMPLECOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
305            help='Copy refinable sample parameters to other histograms')
306                   
307    def _init_coll_Back_Items(self,parent):
308        parent.Append(id=wxID_BACKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
309            help='Copy background parameters to other histograms')
310                   
311    def _init_coll_Limit_Items(self,parent):
312        parent.Append(id=wxID_LIMITCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
313            help='Copy limits to other histograms')
314                   
315    def _init_coll_Data_Items(self,parent):
316        parent.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
317            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
318        parent.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
319            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
320        parent.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
321            help='Delete histograms from use for this phase')
322
323    def _init_coll_Texture_Items(self,parent):
324        self.RefineTexture = parent.Append(id=wxID_REFINETEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Refine texture', 
325            help='Refine the texture coefficients from sequential Pawley results')
326        self.ClearTexture = parent.Append(id=wxID_CLEARTEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear texture', 
327            help='Clear the texture coefficients' )
328           
329    def _init_coll_DrawAtom_Items(self,parent):
330        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
331            help='Select atoms first')
332        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
333            help='Select atoms first')
334        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
335            help='Select atoms first')
336        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
337            help='Resets all atom colors to defaults')
338        parent.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
339            help='View point is 1st atom selected')
340        parent.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
341            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
342        parent.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
343            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
344        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
345            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
346        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
347            help='Fill unit cell with selected atoms')
348        parent.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
349            help='Delete atoms from drawing set')
350
351    def _init_coll_Pawley_Items(self,parent):
352        parent.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
353            help='Initialize Pawley reflection list')
354#        parent.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
355#            help='Import Pawley reflection list')
356        parent.Append(id=wxID_PAWLEYESTIMATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley estimate',
357            help='Estimate initial Pawley intensities')
358        parent.Append(id=wxID_PAWLEYDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley delete',
359            help='Delete Pawley reflection list')
360
361    def _init_coll_IndPeaks_Items(self,parent):
362        parent.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
363            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
364           
365    def _init_coll_Refl_Items(self,parent):
366        self.SelectPhase = parent.Append(help='Select phase for reflection list',id=wxID_SELECTPHASE, 
367            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Select phase')
368           
369    def _init_coll_Image_Items(self,parent):
370        parent.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
371            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
372        parent.Append(help='Recalibrate detector by fitting to calibrant lines', 
373            id=wxID_IMRECALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Realibrate')
374        parent.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
375            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
376        parent.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
377            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
378        parent.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
379            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
380        parent.Append(help='Copy image controls to other images', 
381            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
382        parent.Append(help='Save image controls to file', 
383            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
384        parent.Append(help='Load image controls from file', 
385            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
386                   
387    def _init_coll_Mask_Items(self,parent):
388        parent.Append(help='Copy mask to other images', 
389            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
390        parent.Append(help='Save mask to file', 
391            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
392        parent.Append(help='Load mask from file', 
393            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
394
395    def _init_coll_Inst_Items(self,parent):
396        parent.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
397            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
398        parent.Append(help='Copy instrument profile parameters to other histograms', 
399            id=wxID_INSTCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy')       
400        parent.Append(help='Change radiation type (Ka12 - synch)', 
401            id=wxID_CHANGEWAVETYPE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Change radiation')
402
403    def _init_coll_Peak_Items(self,parent):
404        self.UnDo = parent.Append(help='Undo last least squares refinement', 
405            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
406        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_LSQPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ PeakFit', 
407            help='Peak fitting via least-squares' )
408        self.PFOneCycle = parent.Append(id=wxID_LSQONECYCLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ one cycle', 
409            help='One cycle of Peak fitting via least-squares' )
410        self.ResetSigGam = parent.Append(id=wxID_RESETSIGGAM, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
411            text='Reset sig and gam',help='Reset sigma and gamma to global fit' )
412        self.ClearPeaks = parent.Append(id=wxID_CLEARPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear peaks', 
413            help='Clear the peak list' )
414           
415    def _init_coll_Index_Items(self,parent):
416        self.IndexPeaks = parent.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
417            text='Index Cell')
418        self.CopyCell = parent.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
419            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
420        self.RefineCell = parent.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
421            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
422        self.MakeNewPhase = parent.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
423            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
424           
425    def _init_coll_PDF_Items(self,parent):
426        parent.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
427            text='Add element')
428        parent.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
429            text='Delete element')
430        parent.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
431            text='Copy controls')
432#        parent.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
433#            text='Load Controls')
434#        parent.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
435#            text='Save controls')
436        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
437            text='Compute PDF')
438        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
439            text='Compute all PDFs')
440           
441    def _init_utils(self):
442        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
443       
444        self.ConstraintMenu = wx.MenuBar()
445        self.RestraintMenu = wx.MenuBar()
446        self.DataMenu = wx.MenuBar()
447        self.TextureMenu = wx.MenuBar()
448        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
449        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
450        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
451        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
452        self.BackMenu = wx.MenuBar()
453        self.LimitMenu = wx.MenuBar()
454        self.InstMenu = wx.MenuBar()
455        self.SampleMenu = wx.MenuBar()
456        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
457        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
458        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
459        self.ReflMenu = wx.MenuBar()
460        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
461        self.ConstraintEdit = wx.Menu(title='')
462        self.RestraintEdit = wx.Menu(title='')
463        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
464        self.TextureEdit = wx.Menu(title='')
465        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
466        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
467        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
468        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
469        self.BackEdit = wx.Menu(title='')
470        self.LimitEdit = wx.Menu(title='')
471        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
472        self.SampleEdit = wx.Menu(title='')
473        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
474        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
475        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
476        self.ReflEdit = wx.Menu(title='')
477        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
478
479        self._init_coll_ConstraintMenu(self.ConstraintMenu)
480        self._init_coll_Constraint_Items(self.ConstraintEdit)
481        self._init_coll_RestraintMenu(self.RestraintMenu)
482        self._init_coll_Restraint_Items(self.RestraintEdit)
483        self._init_coll_DataMenu(self.DataMenu)
484        self._init_coll_Data_Items(self.DataEdit)
485        self._init_coll_TextureMenu(self.TextureMenu)
486        self._init_coll_Texture_Items(self.TextureEdit)
487        self._init_coll_DrawAtomsMenu(self.DrawAtomsMenu)
488        self._init_coll_DrawAtom_Items(self.DrawAtomEdit)
489        self._init_coll_PawleyMenu(self.PawleyMenu)
490        self._init_coll_Pawley_Items(self.PawleyEdit)
491        self._init_coll_ImageMenu(self.ImageMenu)
492        self._init_coll_Image_Items(self.ImageEdit)
493        self._init_coll_MaskMenu(self.MaskMenu)
494        self._init_coll_Mask_Items(self.MaskEdit)
495        self._init_coll_BackMenu(self.BackMenu)
496        self._init_coll_Back_Items(self.BackEdit)
497        self._init_coll_LimitMenu(self.LimitMenu)
498        self._init_coll_Limit_Items(self.LimitEdit)
499        self._init_coll_InstMenu(self.InstMenu)
500        self._init_coll_Inst_Items(self.InstEdit)
501        self._init_coll_SampleMenu(self.SampleMenu)
502        self._init_coll_Sample_Items(self.SampleEdit)
503        self._init_coll_PeakMenu(self.PeakMenu)
504        self._init_coll_Peak_Items(self.PeakEdit)
505        self._init_coll_IndPeaksMenu(self.IndPeaksMenu)
506        self._init_coll_IndPeaks_Items(self.IndPeaksEdit)
507        self._init_coll_IndexMenu(self.IndexMenu)
508        self._init_coll_Index_Items(self.IndexEdit)
509        self._init_coll_ReflMenu(self.ReflMenu)
510        self._init_coll_Refl_Items(self.ReflEdit)
511        self._init_coll_PDFMenu(self.PDFMenu)
512        self._init_coll_PDF_Items(self.PDFEdit)
513        self.UnDo.Enable(False)
514        self.PeakFit.Enable(False)
515        self.PFOneCycle.Enable(False)
516        self.IndexPeaks.Enable(False)
517        self.CopyCell.Enable(False)
518        self.RefineCell.Enable(False)
519        self.MakeNewPhase.Enable(False)
520        self.RefineTexture.Enable(False)
521        self.ClearTexture.Enable(False)             #doesn't do anything!
522        ############################################################
523        # refactored Menu creation
524        ############################################################
525        # menu for Data Editing Window / Phase / Atoms tab
526        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
527        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
528        self.AtomsMenu.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
529        self.AtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Atoms'),title='&Help')
530        self.AtomsMenu.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Atoms'),title='&Help')
531        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
532            help='Inserted as an H atom')
533        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
534            help='Inserted as an H atom')
535        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
536            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
537        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
538            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
539        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
540            help='Select atoms to delete first')
541        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
542            help='Select atoms to refine first')
543        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
544            help='Select atoms to modify first')
545        self.AtomEdit.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
546            help='Select atoms to transform first')
547        self.AtomEdit.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
548            help='Reload atom drawing list')
549        # menu for Data Editing Window / Phase / General tab
550        self.DataGeneral = wx.MenuBar()
551        self.DataGeneral.Append(menu=MyHelp(self,helpType='General'),title='&Help')
552        # menu for Data Editing Window / Phase / Draw Options tab
553        self.DataDrawOptions = wx.MenuBar()
554        self.DataDrawOptions.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Options'),title='&Help')
555       
556    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
557        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
558            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
559        self._init_utils()
560        if name:
561            self.SetLabel(name)
562        self.Show()
563       
564    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
565        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
566        self.data = data
567        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
568        Size = self.GetSize()
569        xPos = clientSize[2]-Size[0]
570        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
571        self.dirname = ''
572        self.AtomGrid = []
573        self.selectedRow = 0
574       
575    def setSizePosLeft(self,Width):
576        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
577        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
578        Width[0] = max(Width[0],300)
579        self.SetSize(Width)
580        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
581       
582    def Clear(self):
583        self.ClearBackground()
584        self.DestroyChildren()
585                   
586class GSNoteBook(wx.Notebook):
587    def __init__(self, parent, name='',size = None):
588        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
589        if size: self.SetSize(size)
590                                                     
591    def Clear(self):       
592        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
593       
594    def FindPage(self,name):
595        numPage = self.GetPageCount()
596        for page in range(numPage):
597            if self.GetPageText(page) == name:
598                return page
599       
600class GSGrid(wg.Grid):
601    def __init__(self, parent, name=''):
602        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
603        self.SetSize(parent.GetClientSize())
604           
605    def Clear(self):
606        wg.Grid.ClearGrid(self)
607       
608    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
609        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
610        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
611       
612    def GetSelection(self):
613        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
614        return None
615                       
616class Table(wg.PyGridTableBase):
617    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
618        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
619        self.colLabels = colLabels
620        self.rowLabels = rowLabels
621        self.dataTypes = types
622        self.data = data
623       
624    def AppendRows(self, numRows=1):
625        self.data.append([])
626        return True
627       
628    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
629        if self.dataTypes:
630            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
631            if typeName == colType:
632                return True
633            else:
634                return False
635        else:
636            return False
637
638    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
639        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
640
641    def DeleteRow(self,pos):
642        data = self.GetData()
643        self.SetData([])
644        new = []
645        for irow,row in enumerate(data):
646            if irow <> pos:
647                new.append(row)
648        self.SetData(new)
649       
650    def GetColLabelValue(self, col):
651        if self.colLabels:
652            return self.colLabels[col]
653           
654    def GetData(self):
655        data = []
656        for row in range(self.GetNumberRows()):
657            data.append(self.GetRowValues(row))
658        return data
659       
660    def GetNumberCols(self):
661        try:
662            return len(self.colLabels)
663        except TypeError:
664            return None
665       
666    def GetNumberRows(self):
667        return len(self.data)
668       
669    def GetRowLabelValue(self, row):
670        if self.rowLabels:
671            return self.rowLabels[row]
672       
673    def GetColValues(self, col):
674        data = []
675        for row in range(self.GetNumberRows()):
676            data.append(self.GetValue(row, col))
677        return data
678       
679    def GetRowValues(self, row):
680        data = []
681        for col in range(self.GetNumberCols()):
682            data.append(self.GetValue(row, col))
683        return data
684       
685    def GetTypeName(self, row, col):
686        try:
687            return self.dataTypes[col]
688        except TypeError:
689            return None
690
691    def GetValue(self, row, col):
692        try:
693            return self.data[row][col]
694        except IndexError:
695            return None
696           
697    def InsertRows(self, pos, rows):
698        for row in range(rows):
699            self.data.insert(pos,[])
700            pos += 1
701       
702    def IsEmptyCell(self,row,col):
703        try:
704            return not self.data[row][col]
705        except IndexError:
706            return True
707       
708    def OnKeyPress(self, event):
709        dellist = self.GetSelectedRows()
710        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
711            grid = self.GetView()
712            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
713               
714    def SetColLabelValue(self, col, label):
715        numcols = self.GetNumberCols()
716        if col > numcols-1:
717            self.colLabels.append(label)
718        else:
719            self.colLabels[col]=label
720       
721    def SetData(self,data):
722        for row in range(len(data)):
723            self.SetRowValues(row,data[row])
724               
725    def SetRowLabelValue(self, row, label):
726        self.rowLabels[row]=label
727           
728    def SetRowValues(self,row,data):
729        self.data[row] = data
730           
731    def SetValue(self, row, col, value):
732        def innerSetValue(row, col, value):
733            try:
734                self.data[row][col] = value
735            except TypeError:
736                return
737            except IndexError:
738                print row,col,value
739                # add a new row
740                if row > self.GetNumberRows():
741                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
742                elif col > self.GetNumberCols():
743                    for row in range(self.GetNumberRows):
744                        self.data[row].append('')
745                print self.data
746                self.data[row][col] = value
747        innerSetValue(row, col, value)
748               
749def UpdateNotebook(self,data):       
750    if data:
751        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
752        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
753            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
754        for line in data:
755            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
756            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
757           
758def UpdateControls(self,data):
759    #patch
760    if 'deriv type' not in data:
761        data = {}
762        data['deriv type'] = 'analytical'
763        data['min dM/M'] = 0.0001
764        data['shift factor'] = 1.
765    if 'shift factor' not in data:
766        data['shift factor'] = 1.       
767    #end patch
768    '''
769    #Fourier controls
770    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
771    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
772    #distance/angle controls
773    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
774    '''
775       
776    def SetStatusLine(text):
777        Status.SetStatusText(text)                                     
778       
779    def OnConvergence(event):
780        try:
781            value = max(1.e-9,min(1.0,float(Cnvrg.GetValue())))
782        except ValueError:
783            value = 0.0001
784        data['min dM/M'] = value
785        Cnvrg.SetValue('%.2g'%(value))
786       
787    def OnDerivType(event):
788        data['deriv type'] = derivSel.GetValue()
789        derivSel.SetValue(data['deriv type'])
790       
791    def OnFactor(event):
792        try:
793            value = min(max(float(Factr.GetValue()),0.00001),100.)
794        except ValueError:
795            value = 1.0
796        data['shift factor'] = value
797        Factr.SetValue('%.5f'%(value))
798       
799    def OnSelectData(event):
800        choices = ['All',]+GetPatternTreeDataNames(self,['PWDR',])
801        sel = []
802        if 'Seq Data' in data:
803            for item in data['Seq Data']:
804                sel.append(choices.index(item))
805        names = []
806        dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select data:','Sequential refinement',choices)
807        dlg.SetSelections(sel)
808        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
809            sel = dlg.GetSelections()
810            for i in sel: names.append(choices[i])
811            if 'All' in names:
812                names = choices[1:]
813            data['Seq Data'] = names               
814        dlg.Destroy()
815        reverseSel.Enable(True)
816       
817    def OnReverse(event):
818        data['Reverse Seq'] = reverseSel.GetValue()
819       
820    if self.dataDisplay:
821        self.dataDisplay.Destroy()
822    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
823        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
824    SetStatusLine('')
825    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
826    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
827    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
828    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
829    mainSizer.Add((5,5),0)
830    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
831    LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=6,vgap=5,hgap=5)
832    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement derivatives: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
833    Choice=['analytic','numeric']
834    derivSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['deriv type'],choices=Choice,
835        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
836    derivSel.SetValue(data['deriv type'])
837    derivSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnDerivType)   
838    LSSizer.Add(derivSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
839    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min delta-M/M: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
840    Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2g'%(data['min dM/M']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
841    Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
842    Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
843    LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
844    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Initial shift factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
845    Factr = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.5f'%(data['shift factor']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
846    Factr.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnFactor)
847    Factr.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnFactor)
848    LSSizer.Add(Factr,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
849    mainSizer.Add(LSSizer)
850    mainSizer.Add((5,5),0)
851   
852    SeqSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
853    SeqSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Sequential Refinement Powder Data: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
854    selSeqData = wx.Button(self.dataDisplay,-1,label=' Select data')
855    selSeqData.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnSelectData)
856    SeqSizer.Add(selSeqData,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
857    SeqSizer.Add((5,0),0)
858    reverseSel = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label=' Reverse order?')
859    reverseSel.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnReverse)
860    if 'Seq Data' not in data:
861        reverseSel.Enable(False)
862    if 'Reverse Seq' in data:
863        reverseSel.SetValue(data['Reverse Seq'])
864    SeqSizer.Add(reverseSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
865   
866   
867    mainSizer.Add(SeqSizer)
868    mainSizer.Add((5,5),0)
869       
870    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
871
872    mainSizer.Add((5,5),0)
873    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Distance/angle Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
874       
875    mainSizer.Layout()   
876    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
877    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
878    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
879     
880def UpdateComments(self,data):                   
881    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
882    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
883        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
884    for line in data:
885        if line[-1] == '\n':
886            self.dataDisplay.AppendText(line)
887        else:
888            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
889           
890def UpdateSeqResults(self,data):
891    """
892    input:
893        data - dictionary
894            'histNames' - list of histogram names in order as processed by Sequential Refinement
895            'varyList' - list of variables - identical over all refinements insequence
896            histName - dictionaries for all data sets processed:
897                'variables'- result[0] from leastsq call
898                'varyList' - list of variables; same as above
899                'sig' - esds for variables
900                'covMatrix' - covariance matrix from individual refinement
901                'title' - histogram name; same as dict item name
902                'newAtomDict' - new atom parameters after shifts applied
903                'newCellDict' - new cell parameters after shifts to A0-A5 applied'
904    """
905    if not data:
906        print 'No sequential refinement results'
907        return
908    histNames = data['histNames']
909       
910    def GetSampleParms():
911        sampleParmDict = {'Temperature':[],'Pressure':[],'Humidity':[],'Voltage':[],'Force':[],}
912        sampleParm = {}
913        for name in histNames:
914            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root,name)
915            sampleData = self.PatternTree.GetItemPyData(GetPatternTreeItemId(self,Id,'Sample Parameters'))
916            for item in sampleParmDict:
917                sampleParmDict[item].append(sampleData[item])
918        for item in sampleParmDict:
919            frstValue = sampleParmDict[item][0]
920            if np.any(np.array(sampleParmDict[item])-frstValue):
921                sampleParm[item] = sampleParmDict[item]           
922        return sampleParm
923           
924    def GetSigData(parm):
925        sigData = []
926        for name in histNames:
927            sigList = data[name]['sig']
928            if colLabels[parm] in atomList:
929                sigData.append(sigList[colLabels.index(atomList[colLabels[parm]])])
930            elif colLabels[parm] in cellList:
931                sigData.append(sigList[colLabels.index(cellList[colLabels[parm]])])
932            else:
933                sigData.append(sigList[parm])
934        return sigData
935   
936    def Select(event):
937        cols = self.dataDisplay.GetSelectedCols()
938        rows = self.dataDisplay.GetSelectedRows()
939        if cols:
940            plotData = []
941            plotSig = []
942            plotNames = []
943            for col in cols:
944                plotData.append(self.SeqTable.GetColValues(col))
945                plotSig.append(GetSigData(col))
946                plotNames.append(self.SeqTable.GetColLabelValue(col))
947            plotData = np.array(plotData)
948            G2plt.PlotSeq(self,plotData,plotSig,plotNames,sampleParms)
949        elif rows:
950            name = histNames[rows[0]]
951            G2plt.PlotCovariance(self,Data=data[name])
952               
953    if self.dataDisplay:
954        self.dataDisplay.Destroy()
955    cellList = {}
956    newCellDict = data[histNames[0]]['newCellDict']
957    for item in newCellDict:
958        if item in data['varyList']:
959            cellList[newCellDict[item][0]] = item
960    atomList = {}
961    newAtomDict = data[histNames[0]]['newAtomDict']
962    for item in newAtomDict:
963        if item in data['varyList']:
964            atomList[newAtomDict[item][0]] = item
965    sampleParms = GetSampleParms()
966    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
967    self.dataFrame.SetLabel('Sequental refinement results')
968    self.dataFrame.CreateStatusBar()
969    colLabels = data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys()
970    Types = len(data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys())*[wg.GRID_VALUE_FLOAT,]
971    seqList = [list(data[name]['variables']) for name in histNames]
972   
973    for i,item in enumerate(seqList):
974        newAtomDict = data[histNames[i]]['newAtomDict']
975        newCellDict = data[histNames[i]]['newCellDict']
976        item += [newAtomDict[atomList[parm]][1] for parm in atomList.keys()]
977        item += [newCellDict[cellList[parm]][1] for parm in cellList.keys()]
978    self.SeqTable = Table(seqList,colLabels=colLabels,rowLabels=histNames,types=Types)
979    self.dataDisplay = GSGrid(parent=self.dataFrame)
980    self.dataDisplay.SetTable(self.SeqTable, True)
981    self.dataDisplay.EnableEditing(False)
982    self.dataDisplay.Bind(wg.EVT_GRID_LABEL_LEFT_DCLICK, Select)
983    self.dataDisplay.SetRowLabelSize(8*len(histNames[0]))       #pretty arbitrary 8
984    self.dataDisplay.SetMargins(0,0)
985    self.dataDisplay.AutoSizeColumns(True)
986    self.dataFrame.setSizePosLeft([700,350])
987   
988def UpdateConstraints(self,data):             
989#    data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
990    if not data:
991        data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
992    Histograms,Phases = self.GetUsedHistogramsAndPhasesfromTree()
993    AtomDict = dict([Phases[phase]['pId'],Phases[phase]['Atoms']] for phase in Phases)
994    Natoms,phaseVary,phaseDict,pawleyLookup,FFtable,BLtable = G2str.GetPhaseData(Phases,Print=False)
995    phaseList = []
996    for item in phaseDict:
997        if item.split(':')[2] not in ['Ax','Ay','Az','Amul','AI/A','Atype','SHorder']:
998            phaseList.append(item)
999    phaseList.sort()
1000    phaseAtNames = {}
1001    for item in phaseList:
1002        Split = item.split(':')
1003        if Split[2][:2] in ['AU','Af','dA']:
1004            phaseAtNames[item] = AtomDict[int(Split[0])][int(Split[3])][0]
1005        else:
1006            phaseAtNames[item] = ''
1007           
1008    hapVary,hapDict,controlDict = G2str.GetHistogramPhaseData(Phases,Histograms,Print=False)
1009    hapList = hapDict.keys()
1010    hapList.sort()
1011    histVary,histDict,controlDict = G2str.GetHistogramData(Histograms,Print=False)
1012    histList = []
1013    for item in histDict:
1014        if item.split(':')[2] not in ['Omega','Type','Chi','Phi','Azimuth','Gonio. radius','Lam1','Lam2','Back']:
1015            histList.append(item)
1016    histList.sort()
1017    Indx = {}
1018    scope = {}                          #filled out later
1019    self.Page = [0,'phs']
1020   
1021    def GetPHlegends(Phases,Histograms):
1022        plegend = '\n In p::name'
1023        hlegend = '\n In :h:name'
1024        phlegend = '\n In p:h:name'
1025        for phase in Phases:
1026            plegend += '\n p:: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':: for '+phase
1027            count = 0
1028            for histogram in Phases[phase]['Histograms']:
1029                if count < 3:
1030                    phlegend += '\n p:h: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+phase+' in '+histogram
1031                else:
1032                    phlegend += '\n ... etc.'
1033                    break
1034                count += 1
1035        count = 0
1036        for histogram in Histograms:
1037            if count < 3:
1038                hlegend += '\n :h: = :'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+histogram
1039            else:
1040                hlegend += '\n ... etc.'
1041                break
1042            count += 1
1043        return plegend,hlegend,phlegend
1044       
1045    def FindEquivVarb(name,nameList):
1046        outList = []
1047        namelist = [name.split(':')[2],]
1048        if 'dA' in name:
1049            namelist = ['dAx','dAy','dAz']
1050        elif 'AU' in name:
1051            namelist = ['AUiso','AU11','AU22','AU33','AU12','AU13','AU23']
1052        for item in nameList:
1053            key = item.split(':')[2]
1054            if key in namelist and item != name:
1055                outList.append(item)
1056        return outList
1057       
1058    def SelectVarbs(page,FrstVarb,varList,legend,constType):
1059        #future -  add 'all:all:name', '0:all:name', etc. to the varList
1060        if page[1] == 'phs':
1061            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in varList]
1062            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',atchoice)
1063        else:
1064            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',varList)
1065        varbs = [FrstVarb,]
1066        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1067            sel = dlg.GetSelections()
1068            for x in sel:
1069                varbs.append(varList[x])
1070        dlg.Destroy()
1071        if len(varbs) > 1:
1072            if 'equivalence' in constType:
1073                constr = []
1074                for item in varbs[1:]:
1075                    constr += [[[1.0,FrstVarb],[-1.0,item],None,None],]
1076                return constr           #multiple constraints
1077            elif 'function' in constType:
1078                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1079                return [constr+[0.0,False]]         #just one constraint
1080            else:       #'constraint'
1081                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1082                return [constr+[1.0,None]]          #just one constraint - default sum to one
1083        return []
1084             
1085    def OnAddHold(event):
1086        for phase in Phases:
1087            Phase = Phases[phase]
1088            Atoms = Phase['Atoms']
1089        constr = []
1090        page = self.Page
1091        choice = scope[page[1]]
1092        if page[1] == 'phs':
1093            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1094            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1095        else:   
1096            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1097        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1098            sel = dlg.GetSelection()
1099            FrstVarb = choice[2][sel]
1100            data[choice[3]] += [[[0.0,FrstVarb],None,None],]
1101        dlg.Destroy()
1102        choice[4]()
1103       
1104    def OnAddEquivalence(event):
1105        constr = []
1106        page = self.Page
1107        choice = scope[page[1]]
1108        if page[1] == 'phs':
1109            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1110            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1111        else:   
1112            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1113        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1114            sel = dlg.GetSelection()
1115            FrstVarb = choice[2][sel]
1116            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1117            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'equivalence')
1118            if len(constr) > 0:
1119                data[choice[3]] += constr
1120        dlg.Destroy()
1121        choice[4]()
1122   
1123    def OnAddFunction(event):
1124        constr = []
1125        page = self.Page
1126        choice = scope[page[1]]
1127        if page[1] == 'phs':
1128            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1129            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1130        else:   
1131            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1132        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1133            sel = dlg.GetSelection()
1134            FrstVarb = choice[2][sel]
1135            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1136            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'function')
1137            if len(constr) > 0:
1138                data[choice[3]] += constr
1139        dlg.Destroy()
1140        choice[4]()
1141                       
1142    def OnAddConstraint(event):
1143        constr = []
1144        page = self.Page
1145        choice = scope[page[1]]
1146        if page[1] == 'phs':
1147            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1148            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1149        else:   
1150            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1151        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1152            sel = dlg.GetSelection()
1153            FrstVarb = choice[2][sel]
1154            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1155            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'constraint')
1156            if len(constr) > 0:
1157                data[choice[3]] += constr
1158        dlg.Destroy()
1159        choice[4]()
1160                       
1161    def ConstSizer(name,pageDisplay):
1162        constSizer = wx.FlexGridSizer(1,4,0,0)
1163        for Id,item in enumerate(data[name]):
1164            constDel = wx.Button(pageDisplay,-1,'Delete',style=wx.BU_EXACTFIT)
1165            constDel.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstDel)
1166            Indx[constDel.GetId()] = [Id,name]
1167            if len(item) < 4:
1168                constSizer.Add((5,5),0)
1169                constSizer.Add(constDel)
1170                eqString = ' FIXED   '+item[0][1]+'   '
1171            else:
1172                constEdit = wx.Button(pageDisplay,-1,'Edit',style=wx.BU_EXACTFIT)
1173                constEdit.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstEdit)
1174                Indx[constEdit.GetId()] = [Id,name]
1175                constSizer.Add(constEdit)           
1176                constSizer.Add(constDel)
1177                if isinstance(item[-1],bool):
1178                    eqString = ' FUNCT   '
1179                elif isinstance(item[-2],float):
1180                    eqString = ' CONSTR  '
1181                else:
1182                    eqString = ' EQUIV   '
1183                for term in item[:-2]:
1184                    eqString += '%+.3f*%s '%(term[0],term[1])
1185                if isinstance(item[-2],float):
1186                    eqString += ' = %.3f'%(item[-2])+'  '
1187                else:
1188                    eqString += ' = 0   '
1189            constSizer.Add(wx.StaticText(pageDisplay,-1,eqString),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1190            if isinstance(item[-1],bool):
1191                constRef = wx.CheckBox(pageDisplay,-1,label=' Refine?')                   
1192                constRef.SetValue(item[-1])
1193                constRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnConstRef)
1194                Indx[constRef.GetId()] = item
1195                constSizer.Add(constRef,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1196            else:
1197                constSizer.Add((5,5),0)
1198        return constSizer
1199               
1200    def OnConstRef(event):
1201        Obj = event.GetEventObject()
1202        Indx[Obj.GetId()][-1] = Obj.GetValue()
1203       
1204    def OnConstDel(event):
1205        Obj = event.GetEventObject()
1206        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1207        del(data[name][Id])
1208        OnPageChanged(None)       
1209       
1210    def OnConstEdit(event):
1211        Obj = event.GetEventObject()
1212        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1213        const = data[name][Id][-2]       
1214        if isinstance(data[name][Id][-1],bool):
1215            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1216            constType = 'Function'
1217            extra = '; sum = new variable'
1218        elif isinstance(data[name][Id][-2],float):
1219            items = data[name][Id][:-2]+[[const,'= fixed value'],[]]
1220            constType = 'Constraint'
1221            extra = ' sum = constant'
1222        else:
1223            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1224            constType = 'Equivalence'
1225            extra = '; sum = 0'
1226        dlg = self.SumDialog(self,constType,'Enter value for each term in constraint'+extra,'',items)
1227        try:
1228            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1229                result = dlg.GetData()
1230                if isinstance(data[name][Id][-2],float):
1231                    data[name][Id][:-2] = result[:-2]
1232                    data[name][Id][-2] = result[-2][0]
1233                else:
1234                    data[name][Id][:-2] = result[:-1]
1235        finally:
1236            dlg.Destroy()           
1237        OnPageChanged(None)                     
1238   
1239    def UpdateHAPConstr():
1240        HAPConstr.DestroyChildren()
1241        HAPDisplay = wx.Panel(HAPConstr)
1242        HAPSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1243        HAPSizer.Add((5,5),0)
1244        HAPSizer.Add(ConstSizer('HAP',HAPDisplay))
1245        HAPDisplay.SetSizer(HAPSizer,True)
1246        Size = HAPSizer.GetMinSize()
1247        Size[0] += 40
1248        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1249        HAPDisplay.SetSize(Size)
1250        HAPConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1251        Size[1] = min(Size[1],250)
1252        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1253       
1254    def UpdateHistConstr():
1255        HistConstr.DestroyChildren()
1256        HistDisplay = wx.Panel(HistConstr)
1257        HistSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1258        HistSizer.Add((5,5),0)       
1259        HistSizer.Add(ConstSizer('Hist',HistDisplay))
1260        HistDisplay.SetSizer(HistSizer,True)
1261        Size = HistSizer.GetMinSize()
1262        Size[0] += 40
1263        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1264        HistDisplay.SetSize(Size)
1265        HistConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1266        Size[1] = min(Size[1],250)
1267        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1268       
1269    def UpdatePhaseConstr():
1270        PhaseConstr.DestroyChildren()
1271        PhaseDisplay = wx.Panel(PhaseConstr)
1272        PhaseSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1273        PhaseSizer.Add((5,5),0)       
1274        PhaseSizer.Add(ConstSizer('Phase',PhaseDisplay))
1275        PhaseDisplay.SetSizer(PhaseSizer,True)
1276        Size = PhaseSizer.GetMinSize()
1277        Size[0] += 40
1278        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1279        PhaseDisplay.SetSize(Size)
1280        PhaseConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1281        Size[1] = min(Size[1],250)
1282        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1283   
1284    def OnPageChanged(event):
1285        if event:       #page change event!
1286            page = event.GetSelection()
1287        else:
1288            page = self.dataDisplay.GetSelection()
1289        oldPage = self.dataDisplay.ChangeSelection(page)
1290        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1291        if text == 'Histogram/Phase constraints':
1292            self.Page = [page,'hap']
1293            UpdateHAPConstr()
1294        elif text == 'Histogram constraints':
1295            self.Page = [page,'hst']
1296            UpdateHistConstr()
1297        elif text == 'Phase constraints':
1298            self.Page = [page,'phs']
1299            UpdatePhaseConstr()
1300
1301    def SetStatusLine(text):
1302        Status.SetStatusText(text)                                     
1303       
1304    plegend,hlegend,phlegend = GetPHlegends(Phases,Histograms)
1305    scope = {'hst':['Histogram variables:',hlegend,histList,'Hist',UpdateHistConstr],
1306        'hap':['HAP variables:',phlegend,hapList,'HAP',UpdateHAPConstr],
1307        'phs':['Phase variables:',plegend,phaseList,'Phase',UpdatePhaseConstr]}
1308    if self.dataDisplay:
1309        self.dataDisplay.Destroy()
1310    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1311    self.dataFrame.SetLabel('Constraints')
1312    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1313        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1314    SetStatusLine('')
1315   
1316    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1317    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddConstraint, id=wxID_CONSTRAINTADD)
1318    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddFunction, id=wxID_FUNCTADD)
1319    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddEquivalence, id=wxID_EQUIVADD)
1320    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddHold, id=wxID_HOLDADD)
1321    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1322   
1323    PhaseConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1324    self.dataDisplay.AddPage(PhaseConstr,'Phase constraints')
1325    HAPConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1326    self.dataDisplay.AddPage(HAPConstr,'Histogram/Phase constraints')
1327    HistConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1328    self.dataDisplay.AddPage(HistConstr,'Histogram constraints')
1329    UpdatePhaseConstr()
1330
1331    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)
1332   
1333   
1334def UpdateRestraints(self,data):
1335
1336    def OnAddRestraint(event):
1337        page = self.dataDisplay.GetSelection()
1338        print self.dataDisplay.GetPageText(page)
1339
1340    def UpdateAtomRestr():
1341        AtomRestr.DestroyChildren()
1342        dataDisplay = wx.Panel(AtomRestr)
1343        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1344        mainSizer.Add((5,5),0)
1345        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Atom restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1346        mainSizer.Add((5,5),0)
1347
1348
1349        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1350        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1351        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1352        dataDisplay.SetSize(Size)
1353        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1354       
1355    def UpdatePhaseRestr():
1356        PhaseRestr.DestroyChildren()
1357        dataDisplay = wx.Panel(PhaseRestr)
1358        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1359        mainSizer.Add((5,5),0)
1360        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Phase restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1361        mainSizer.Add((5,5),0)
1362
1363
1364        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1365        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1366        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1367        dataDisplay.SetSize(Size)
1368        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1369   
1370    def OnPageChanged(event):
1371        page = event.GetSelection()
1372        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1373        if text == 'Atom restraints':
1374            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1375            UpdateAtomRestr()
1376        elif text == 'Phase restraints':
1377            UpdatePhaseRestr()
1378            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1379        event.Skip()
1380
1381    if self.dataDisplay:
1382        self.dataDisplay.Destroy()
1383    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1384    self.dataFrame.SetLabel('restraints')
1385    self.dataFrame.CreateStatusBar()
1386    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddRestraint, id=wxID_RESTRAINTADD)
1387    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1388   
1389    PhaseRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1390    self.dataDisplay.AddPage(PhaseRestr,'Phase restraints')
1391    AtomRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1392    self.dataDisplay.AddPage(AtomRestr,'Atom restraints')
1393    UpdatePhaseRestr()
1394#    AtomRestrData = data['AtomRestr']
1395
1396    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)       
1397             
1398def UpdateHKLControls(self,data):
1399   
1400    def OnScaleSlider(event):
1401        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
1402        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
1403        data['Scale'] = scale*10.
1404        G2plt.PlotSngl(self)
1405       
1406    def OnLayerSlider(event):
1407        layer = layerSel.GetValue()
1408        data['Layer'] = layer
1409        G2plt.PlotSngl(self)
1410       
1411    def OnSelZone(event):
1412        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
1413        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1414       
1415    def OnSelType(event):
1416        data['Type'] = typeSel.GetValue()
1417        G2plt.PlotSngl(self)
1418       
1419    def SetStatusLine():
1420        Status.SetStatusText("look at me!!!")
1421                                     
1422    if self.dataDisplay:
1423        self.dataDisplay.Destroy()
1424    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1425        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1426    SetStatusLine()
1427    zones = ['100','010','001']
1428    HKLmax = data['HKLmax']
1429    HKLmin = data['HKLmin']
1430    if data['ifFc']:
1431        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
1432    else:
1433        typeChoices = ['Fosq','Fo']
1434    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
1435    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1436    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1437    mainSizer.Add((5,10),0)
1438   
1439    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1440    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
1441        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1442    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
1443        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
1444    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1445    scaleSel.SetLineSize(100)
1446    scaleSel.SetPageSize(900)
1447    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
1448    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1449   
1450    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1451    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
1452        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1453    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
1454        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1455    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
1456    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1457    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
1458        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
1459    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
1460        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1461    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
1462    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1463    zoneSizer.Add((10,0),0)   
1464    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1465       
1466    izone = zones.index(data['Zone'])
1467    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1468    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
1469        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1470    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
1471        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
1472    layerSel.SetLineSize(1)
1473    layerSel.SetLineSize(5)
1474    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
1475    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1476    layerSizer.Add((10,0),0)   
1477    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1478
1479       
1480    mainSizer.Layout()   
1481    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1482    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1483    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1484
1485def GetPatternTreeDataNames(self,dataTypes):
1486    names = []
1487    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(self.root)       
1488    while item:
1489        name = self.PatternTree.GetItemText(item)
1490        if name[:4] in dataTypes:
1491            names.append(name)
1492        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(self.root, cookie)
1493    return names
1494                         
1495def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
1496    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
1497    while item:
1498        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
1499            return item
1500        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
1501    return 0               
1502
1503def MovePatternTreeToGrid(self,item):
1504   
1505#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
1506   
1507    oldPage = 0
1508    if self.dataFrame:
1509        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1510        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
1511            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1512            self.dataDisplay.Clear() 
1513            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
1514            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1515        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
1516            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1517            self.dataDisplay.Clear() 
1518            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
1519            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1520        if 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
1521            if self.dataDisplay: 
1522                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
1523        self.dataFrame.Clear()
1524        self.dataFrame.SetLabel('')
1525    else:
1526        #create the frame for the data item window
1527        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
1528
1529    self.dataFrame.Raise()           
1530    self.PickId = 0
1531    parentID = self.root
1532    self.ExportPattern.Enable(False)
1533    if item != self.root:
1534        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1535    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
1536        self.PatternId = item
1537        self.PickId = item
1538        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
1539            self.PatternId = 0
1540            self.ExportPattern.Enable(False)
1541            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1542            UpdateNotebook(self,data)
1543        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
1544            self.PatternId = 0
1545            self.ExportPattern.Enable(False)
1546            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1547            if not data:           #fill in defaults
1548                data = {
1549                    #least squares controls
1550                    'deriv type':'analytic','min dM/M':0.0001,'shift factor':1.0,
1551                    #Fourier controls
1552                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
1553                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
1554                    #distance/angle controls
1555                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
1556                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1557            self.Refine.Enable(True)
1558            self.SeqRefine.Enable(True)
1559            UpdateControls(self,data)
1560        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sequental results':
1561            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1562            UpdateSeqResults(self,data)           
1563        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Covariance':
1564            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1565            G2plt.PlotCovariance(self)
1566        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Constraints':
1567            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1568            UpdateConstraints(self,data)
1569        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Restraints':
1570            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1571            UpdateRestraints(self,data)
1572        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1573            self.Image = item
1574            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
1575        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1576            G2plt.PlotPowderLines(self)
1577        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1578            self.ExportPattern.Enable(True)
1579            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
1580        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1581            self.Sngl = item
1582            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1583        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1584            self.PatternId = item
1585            self.ExportPDF.Enable(True)
1586            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1587           
1588    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1589        self.PickId = item
1590        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1591        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
1592    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1593        self.PickId = item
1594        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1595        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
1596    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1597        self.PickId = item
1598        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1599        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
1600    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1601        self.PickId = item
1602        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1603        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
1604    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
1605        self.PickId = item
1606        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
1607        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
1608    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
1609        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1610        self.PickId = item
1611        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1612        UpdateComments(self,data)
1613    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
1614        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
1615        self.PickId = item
1616        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1617        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
1618            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
1619        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1620        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
1621        G2plt.PlotImage(self)
1622    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
1623        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
1624        self.PickId = item
1625        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1626        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1627        G2imG.UpdateMasks(self,data)
1628        G2plt.PlotImage(self)
1629    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
1630        self.PickId = item
1631        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1632        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1633        UpdateHKLControls(self,data)
1634        G2plt.PlotSngl(self)
1635    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
1636        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1637        self.ExportPDF.Enable(True)
1638        self.PickId = item
1639        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1640        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
1641        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
1642        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1643        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
1644        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
1645    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
1646        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1647        self.ExportPeakList.Enable(True)
1648        self.PickId = item
1649        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1650        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
1651        G2plt.PlotPatterns(self)
1652    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
1653        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1654        self.PickId = item
1655        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1656        G2pdG.UpdateBackground(self,data)
1657        G2plt.PlotPatterns(self)
1658    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
1659        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1660        self.PickId = item
1661        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1662        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
1663        G2plt.PlotPatterns(self)
1664    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
1665        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1666        self.PickId = item
1667        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1668        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
1669        G2plt.PlotPeakWidths(self)
1670    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
1671        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1672        self.PickId = item
1673        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1674
1675        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
1676            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
1677                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,
1678                'Force':0.0,'Gonio. radius':200.0}
1679            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
1680   
1681        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
1682        G2plt.PlotPatterns(self)
1683    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
1684        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1685        self.ExportPeakList.Enable(True)
1686        self.PickId = item
1687        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1688        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
1689        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1690            G2plt.PlotPowderLines(self)
1691        else:
1692            G2plt.PlotPatterns(self)
1693    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
1694        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1695        self.PickId = item
1696        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1697        if not data:
1698            data.append([0,0.0,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, zero value, max Nc/No, start volume
1699            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
1700            data.append([])                                 #empty cell list
1701            data.append([])                                 #empty dmin
1702            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1703        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
1704        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1705            G2plt.PlotPowderLines(self)
1706        else:
1707            G2plt.PlotPatterns(self)
1708    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Reflection Lists':
1709        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1710        self.PickId = item
1711        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1712        self.RefList = ''
1713        if len(data):
1714            self.RefList = data.keys()[0]
1715        G2pdG.UpdateReflectionGrid(self,data)
1716        G2plt.PlotPatterns(self)
1717     
1718#def OnHelp(event):
1719#    Obj = event.GetEventObject()
1720#    line = 'Help on '+Obj.GetTitle()
1721#    for child in Obj.GetChildren():
1722#        if 'NoteBook' in str(type(child)):
1723#            notebook = child.GetCurrentPage().GetParent()
1724#            line = 'Help on '+notebook.GetPageText(notebook.GetSelection())
1725#    print line
1726#    print 'Real help will come here as HTML pages'
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.