source: trunk/GSASIIgrid.py @ 437

Last change on this file since 437 was 437, checked in by vondreele, 11 years ago

use wx.CallAfter?() - a few places it didn't work!
possible new 'RefineTexture?' using seqdata started

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 74.3 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2011-12-09 17:35:43 +0000 (Fri, 09 Dec 2011) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 437 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 437 2011-12-09 17:35:43Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import numpy as np
14import os.path
15import wx.html        # could postpone this for quicker startup
16import webbrowser     # could postpone this for quicker startup
17import GSASIIpath
18import GSASIIplot as G2plt
19import GSASIIpwdGUI as G2pdG
20import GSASIIimgGUI as G2imG
21import GSASIIphsGUI as G2phG
22import GSASIIstruct as G2str
23#import GSASIImapvars as G2mv
24
25# globals we will use later
26__version__ = None # gets overridden in GSASII.py
27path2GSAS2 = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)) # save location of this file
28helpLocDict = {}
29htmlPanel = None
30htmlFrame = None
31helpMode = 'internal'    # need a global control to set this
32helpMode = 'browser'    # need a global control to set this
33htmlFirstUse = True
34
35[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
36    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
37    wxID_RELOADDRAWATOMS,
38] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(9)]
39
40[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
41] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
42
43[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
44    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
45    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD,
46] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(10)]
47
48[ wxID_IMCALIBRATE,wxID_IMRECALIBRATE,wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
49    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
50] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(8)]
51
52[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
53] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
54
55[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT, wxID_PAWLEYDELETE, wxID_PAWLEYESTIMATE,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(4)]
57
58[ wxID_INSTPRMRESET,wxID_CHANGEWAVETYPE,wxID_INSTCOPY,
59] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(3)]
60
61[ wxID_INDXRELOAD,
62] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
63
64[ wxID_UNDO,wxID_LSQPEAKFIT,wxID_LSQONECYCLE,wxID_RESETSIGGAM,wxID_CLEARPEAKS,
65] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(5)]
66
67[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
68] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
69
70[ wxID_BACKCOPY,
71] = [wx.NewId() for _init_coll_Back_Items in range(1)]
72
73[ wxID_LIMITCOPY,
74] = [wx.NewId() for _init_coll_Limit_Items in range(1)]
75
76[ wxID_SAMPLECOPY,
77] = [wx.NewId() for _init_coll_Sample_Items in range(1)]
78
79[ wxID_CONSTRAINTADD,wxID_EQUIVADD,wxID_HOLDADD,wxID_FUNCTADD,
80] = [wx.NewId() for _init_coll_Constraint_Items in range(4)]
81
82[ wxID_RESTRAINTADD,
83] = [wx.NewId() for _init_coll_Restraint_Items in range(1)]
84
85[ wxID_SELECTPHASE,
86] = [wx.NewId() for _init_coll_Refl_Items in range(1)]
87
88[ wxID_CLEARTEXTURE,wxID_REFINETEXTURE,
89] = [wx.NewId() for _init_coll_Texture_Items in range(2)]
90
91[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
92    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
93] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
94
95VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
96
97class MyHelp(wx.Menu):
98    '''This class creates the contents of a help menu.
99    The menu will start with two entries:
100      'Help on <helpType>': where helpType is a reference to an HTML page to
101      be opened
102      About: opens an About dialog using OnHelpAbout. N.B. on the Mac this
103      gets moved to the App menu to be consistent with Apple style.
104    NOTE: the title for this menu should be '&Help' so the wx handles
105    it correctly. BHT
106    '''
107    def __init__(self,frame,title='',helpType=None):
108        wx.Menu.__init__(self,title)
109        self.helpType = helpType
110        self.frame = frame
111        # add a help item only when helpType is specified
112        if helpType is not None:
113            helpobj = self.Append(text='Help on '+helpType,
114                                  id=wx.ID_ANY, kind=wx.ITEM_NORMAL)
115            frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelp, helpobj)
116        self.Append(help='', id=wx.ID_ABOUT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
117                    text='&About GSAS-II')
118        frame.Bind(wx.EVT_MENU, self.OnHelpAbout, id=wx.ID_ABOUT)
119
120    def OnHelp(self,event):
121        '''Called when Help on... is pressed in a menu. Brings up
122        a web page for documentation.
123        '''
124        global helpLocDict
125        global helpMode
126        # look up a definition for help info from dict
127        helplink = helpLocDict.get(self.helpType)
128        if helplink is None:
129            # no defined link to use, create a default based on key
130            helplink = 'gsasII.html#'+self.helpType.replace(' ','_')
131            print helplink
132        helplink = os.path.join(path2GSAS2,'help',helplink)
133        if helpMode == 'internal':
134            global htmlPanel, htmlFrame
135            try:
136                htmlPanel.LoadFile(helplink)
137            except:
138                htmlFrame = wx.Frame(self.frame, -1, size=(610, 380))
139                htmlFrame.Show(True)
140                htmlFrame.SetTitle("HTML Window") # N.B. reset later in LoadFile
141                htmlPanel = MyHtmlPanel(htmlFrame,-1)
142                htmlPanel.LoadFile(helplink)
143        else:
144            global htmlFirstUse
145            #import webbrowser
146            if htmlFirstUse:
147                webbrowser.open_new("file://"+helplink)
148                htmlFirstUse = False
149            else:
150                webbrowser.open("file://"+helplink, new=0, autoraise=True)
151
152    def OnHelpAbout(self, event):
153        "Display an 'About GSAS-II' box"
154        global __version__
155        info = wx.AboutDialogInfo()
156        info.Name = 'GSAS-II'
157        info.Version = __version__
158        info.Copyright = '''
159Robert B. Von Dreele
160Argonne National Laboratory(C)
161This product includes software developed
162by the UChicago Argonne, LLC, as
163Operator of Argonne National Laboratory.         '''
164        info.Description = '''
165General Structure Analysis System - II
166'''
167        wx.AboutBox(info)
168
169class MyHtmlPanel(wx.Panel):
170    '''Defines a panel to display Help information'''
171    def __init__(self, frame, id):
172        self.frame = frame
173        wx.Panel.__init__(self, frame, id)
174        sizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
175        back = wx.Button(self, -1, "Back")
176        back.Bind(wx.EVT_BUTTON, self.OnBack)
177        sizer.Add(back, 0, wx.ALIGN_LEFT, 0)
178
179        #self.htmlwin = wx.html.HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
180        self.htmlwin = G2HtmlWindow(self, id, size=(602,310))
181        sizer.Add(self.htmlwin, 1, wx.GROW|wx.ALL, 0)
182        self.SetSizer(sizer)
183        sizer.Fit(frame)       
184    def OnBack(self, event):
185        self.htmlwin.HistoryBack()
186    def LoadFile(self,file):
187        pos = file.rfind('#')
188        if pos != -1:
189            helpfile = file[:pos]
190            helpanchor = file[pos+1:]
191        else:
192            helpfile = file
193            helpanchor = None
194        self.htmlwin.LoadPage(helpfile)
195        if helpanchor is not None:
196            self.htmlwin.ScrollToAnchor(helpanchor)
197
198class G2HtmlWindow(wx.html.HtmlWindow):
199    '''Displays help information in a primitive HTML browser type window
200    '''
201    def __init__(self, parent, *args, **kwargs):
202        self.parent = parent
203        wx.html.HtmlWindow.__init__(self, parent, *args, **kwargs)
204    def LoadPage(self, *args, **kwargs):
205        wx.html.HtmlWindow.LoadPage(self, *args, **kwargs)
206        self.TitlePage()
207    def OnLinkClicked(self, *args, **kwargs):
208        wx.html.HtmlWindow.OnLinkClicked(self, *args, **kwargs)
209        self.TitlePage()
210    def HistoryBack(self, *args, **kwargs):
211        wx.html.HtmlWindow.HistoryBack(self, *args, **kwargs)
212        self.TitlePage()
213    def TitlePage(self):
214        self.parent.frame.SetTitle(self.GetOpenedPage() + ' -- ' + 
215                                   self.GetOpenedPageTitle())
216
217class DataFrame(wx.Frame):
218    def _init_coll_BlankMenu(self,parent):
219        parent.Append(menu=self.Blank,title='')
220       
221    def _init_coll_AtomsMenu(self,parent):
222        parent.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
223        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Atoms'),title='&Help')
224       
225    def _init_coll_ConstraintMenu(self,parent):
226        parent.Append(menu=self.ConstraintEdit, title='Edit')
227        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Constraints'),title='&Help')
228       
229    def _init_coll_RestraintMenu(self,parent):
230        parent.Append(menu=self.RestraintEdit, title='Edit')
231        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Restraints'),title='&Help')
232       
233    def _init_coll_DataMenu(self,parent):
234        parent.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
235        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Data'),title='&Help')
236       
237    def _init_coll_DrawAtomsMenu(self,parent):
238        parent.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
239        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Draw Atoms'),title='&Help')
240
241    def _init_coll_PawleyMenu(self,parent):
242        parent.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Operations')
243        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Pawley'),title='&Help')
244     
245    def _init_coll_IndPeaksMenu(self,parent):
246        parent.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Operations')
247        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Index Peaks'),title='&Help')
248                   
249    def _init_coll_ImageMenu(self,parent):
250        parent.Append(menu=self.ImageEdit, title='Operations')
251        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Images'),title='&Help')
252       
253    def _init_coll_BackMenu(self,parent):
254        parent.Append(menu=self.BackEdit, title='File')
255        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Background'),title='&Help')
256       
257    def _init_coll_LimitMenu(self,parent):
258        parent.Append(menu=self.LimitEdit, title='File')
259        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Limits'),title='&Help')
260       
261    def _init_coll_InstMenu(self,parent):
262        parent.Append(menu=self.InstEdit, title='Operations')
263        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Instrument Parameters'),title='&Help')
264       
265    def _init_coll_MaskMenu(self,parent):
266        parent.Append(menu=self.MaskEdit, title='Operations')
267        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Image Masks'),title='&Help')
268       
269    def _init_coll_SampleMenu(self,parent):
270        parent.Append(menu=self.SampleEdit, title='File')
271        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Sample Parameters'),title='&Help')
272       
273    def _init_coll_PeakMenu(self,parent):
274        parent.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
275        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Powder Peaks'),title='&Help')
276
277    def _init_coll_IndexMenu(self,parent):
278        parent.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
279        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Cell Indexing Refine'),title='&Help')
280       
281    def _init_coll_ReflMenu(self,parent):
282        parent.Append(menu=self.ReflEdit, title='Reflection List')
283        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Reflection List'),title='&Help')
284
285    def _init_coll_TextureMenu(self,parent):
286        parent.Append(menu=self.TextureEdit, title='Texture')
287        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='Texture'),title='&Help')
288
289    def _init_coll_PDFMenu(self,parent):
290        parent.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
291        parent.Append(menu=MyHelp(self,helpType='PDF Controls'),title='&Help')
292
293    def _init_coll_Atom_Items(self,parent):
294        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
295            help='Inserted as an H atom')
296        parent.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
297            help='Inserted as an H atom')
298        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
299            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
300        parent.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
301            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
302        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
303            help='Select atoms to delete first')
304        parent.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
305            help='Select atoms to refine first')
306        parent.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
307            help='Select atoms to modify first')
308        parent.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
309            help='Select atoms to transform first')
310        parent.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
311            help='Reload atom drawing list')
312           
313    def _init_coll_Constraint_Items(self,parent):
314        parent.Append(id=wxID_HOLDADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add hold',
315            help='Add hold on a parameter value')
316        parent.Append(id=wxID_EQUIVADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add equivalence',
317            help='Add equivalence between parameter values')
318        parent.Append(id=wxID_CONSTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add constraint',
319            help='Add constraint on parameter values')
320        parent.Append(id=wxID_FUNCTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add function',
321            help='Add function of parameter values')
322       
323    def _init_coll_Restraint_Items(self,parent):
324        parent.Append(id=wxID_RESTRAINTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add restraint',
325            help='restraint dummy menu item')
326                   
327    def _init_coll_Sample_Items(self,parent):
328        parent.Append(id=wxID_SAMPLECOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
329            help='Copy refinable sample parameters to other histograms')
330                   
331    def _init_coll_Back_Items(self,parent):
332        parent.Append(id=wxID_BACKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
333            help='Copy background parameters to other histograms')
334                   
335    def _init_coll_Limit_Items(self,parent):
336        parent.Append(id=wxID_LIMITCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy',
337            help='Copy limits to other histograms')
338                   
339    def _init_coll_Data_Items(self,parent):
340        parent.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
341            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
342        parent.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
343            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
344        parent.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
345            help='Delete histograms from use for this phase')
346
347    def _init_coll_Texture_Items(self,parent):
348        self.RefineTexture = parent.Append(id=wxID_REFINETEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Refine texture', 
349            help='Refine the texture coefficients from sequential Pawley results')
350        self.ClearTexture = parent.Append(id=wxID_CLEARTEXTURE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear texture', 
351            help='Clear the texture coefficients' )
352           
353    def _init_coll_DrawAtom_Items(self,parent):
354        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
355            help='Select atoms first')
356        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
357            help='Select atoms first')
358        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
359            help='Select atoms first')
360        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
361            help='Resets all atom colors to defaults')
362        parent.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
363            help='View point is 1st atom selected')
364        parent.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
365            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
366        parent.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
367            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
368        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
369            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
370        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
371            help='Fill unit cell with selected atoms')
372        parent.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
373            help='Delete atoms from drawing set')
374
375    def _init_coll_Pawley_Items(self,parent):
376        parent.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
377            help='Initialize Pawley reflection list')
378#        parent.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
379#            help='Import Pawley reflection list')
380        parent.Append(id=wxID_PAWLEYESTIMATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley estimate',
381            help='Estimate initial Pawley intensities')
382        parent.Append(id=wxID_PAWLEYDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley delete',
383            help='Delete Pawley reflection list')
384
385    def _init_coll_IndPeaks_Items(self,parent):
386        parent.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
387            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
388           
389    def _init_coll_Refl_Items(self,parent):
390        self.SelectPhase = parent.Append(help='Select phase for reflection list',id=wxID_SELECTPHASE, 
391            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Select phase')
392           
393    def _init_coll_Image_Items(self,parent):
394        parent.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
395            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
396        parent.Append(help='Recalibrate detector by fitting to calibrant lines', 
397            id=wxID_IMRECALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Realibrate')
398        parent.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
399            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
400        parent.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
401            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
402        parent.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
403            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
404        parent.Append(help='Copy image controls to other images', 
405            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
406        parent.Append(help='Save image controls to file', 
407            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
408        parent.Append(help='Load image controls from file', 
409            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
410                   
411    def _init_coll_Mask_Items(self,parent):
412        parent.Append(help='Copy mask to other images', 
413            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
414        parent.Append(help='Save mask to file', 
415            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
416        parent.Append(help='Load mask from file', 
417            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
418
419    def _init_coll_Inst_Items(self,parent):
420        parent.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
421            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
422        parent.Append(help='Copy instrument profile parameters to other histograms', 
423            id=wxID_INSTCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy')       
424        parent.Append(help='Change radiation type (Ka12 - synch)', 
425            id=wxID_CHANGEWAVETYPE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Change radiation')
426
427    def _init_coll_Peak_Items(self,parent):
428        self.UnDo = parent.Append(help='Undo last least squares refinement', 
429            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
430        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_LSQPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ PeakFit', 
431            help='Peak fitting via least-squares' )
432        self.PFOneCycle = parent.Append(id=wxID_LSQONECYCLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ one cycle', 
433            help='One cycle of Peak fitting via least-squares' )
434        self.ResetSigGam = parent.Append(id=wxID_RESETSIGGAM, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
435            text='Reset sig and gam',help='Reset sigma and gamma to global fit' )
436        self.ClearPeaks = parent.Append(id=wxID_CLEARPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear peaks', 
437            help='Clear the peak list' )
438           
439    def _init_coll_Index_Items(self,parent):
440        self.IndexPeaks = parent.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
441            text='Index Cell')
442        self.CopyCell = parent.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
443            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
444        self.RefineCell = parent.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
445            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
446        self.MakeNewPhase = parent.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
447            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
448           
449    def _init_coll_PDF_Items(self,parent):
450        parent.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
451            text='Add element')
452        parent.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
453            text='Delete element')
454        parent.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
455            text='Copy controls')
456#        parent.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
457#            text='Load Controls')
458#        parent.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
459#            text='Save controls')
460        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
461            text='Compute PDF')
462        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
463            text='Compute all PDFs')
464           
465    def _init_utils(self):
466        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
467       
468        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
469        self.ConstraintMenu = wx.MenuBar()
470        self.RestraintMenu = wx.MenuBar()
471        self.DataMenu = wx.MenuBar()
472        self.TextureMenu = wx.MenuBar()
473        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
474        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
475        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
476        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
477        self.BackMenu = wx.MenuBar()
478        self.LimitMenu = wx.MenuBar()
479        self.InstMenu = wx.MenuBar()
480        self.SampleMenu = wx.MenuBar()
481        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
482        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
483        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
484        self.ReflMenu = wx.MenuBar()
485        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
486        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
487        self.ConstraintEdit = wx.Menu(title='')
488        self.RestraintEdit = wx.Menu(title='')
489        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
490        self.TextureEdit = wx.Menu(title='')
491        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
492        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
493        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
494        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
495        self.BackEdit = wx.Menu(title='')
496        self.LimitEdit = wx.Menu(title='')
497        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
498        self.SampleEdit = wx.Menu(title='')
499        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
500        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
501        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
502        self.ReflEdit = wx.Menu(title='')
503        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
504        self._init_coll_AtomsMenu(self.AtomsMenu)
505        self._init_coll_Atom_Items(self.AtomEdit)
506        self._init_coll_ConstraintMenu(self.ConstraintMenu)
507        self._init_coll_Constraint_Items(self.ConstraintEdit)
508        self._init_coll_RestraintMenu(self.RestraintMenu)
509        self._init_coll_Restraint_Items(self.RestraintEdit)
510        self._init_coll_DataMenu(self.DataMenu)
511        self._init_coll_Data_Items(self.DataEdit)
512        self._init_coll_TextureMenu(self.TextureMenu)
513        self._init_coll_Texture_Items(self.TextureEdit)
514        self._init_coll_DrawAtomsMenu(self.DrawAtomsMenu)
515        self._init_coll_DrawAtom_Items(self.DrawAtomEdit)
516        self._init_coll_PawleyMenu(self.PawleyMenu)
517        self._init_coll_Pawley_Items(self.PawleyEdit)
518        self._init_coll_ImageMenu(self.ImageMenu)
519        self._init_coll_Image_Items(self.ImageEdit)
520        self._init_coll_MaskMenu(self.MaskMenu)
521        self._init_coll_Mask_Items(self.MaskEdit)
522        self._init_coll_BackMenu(self.BackMenu)
523        self._init_coll_Back_Items(self.BackEdit)
524        self._init_coll_LimitMenu(self.LimitMenu)
525        self._init_coll_Limit_Items(self.LimitEdit)
526        self._init_coll_InstMenu(self.InstMenu)
527        self._init_coll_Inst_Items(self.InstEdit)
528        self._init_coll_SampleMenu(self.SampleMenu)
529        self._init_coll_Sample_Items(self.SampleEdit)
530        self._init_coll_PeakMenu(self.PeakMenu)
531        self._init_coll_Peak_Items(self.PeakEdit)
532        self._init_coll_IndPeaksMenu(self.IndPeaksMenu)
533        self._init_coll_IndPeaks_Items(self.IndPeaksEdit)
534        self._init_coll_IndexMenu(self.IndexMenu)
535        self._init_coll_Index_Items(self.IndexEdit)
536        self._init_coll_ReflMenu(self.ReflMenu)
537        self._init_coll_Refl_Items(self.ReflEdit)
538        self._init_coll_PDFMenu(self.PDFMenu)
539        self._init_coll_PDF_Items(self.PDFEdit)
540        self.UnDo.Enable(False)
541        self.PeakFit.Enable(False)
542        self.PFOneCycle.Enable(False)
543        self.IndexPeaks.Enable(False)
544        self.CopyCell.Enable(False)
545        self.RefineCell.Enable(False)
546        self.MakeNewPhase.Enable(False)
547        self.RefineTexture.Enable(False)
548        self.ClearTexture.Enable(False)             #doesn't do anything!
549       
550    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
551        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
552            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
553        self._init_utils()
554        if name:
555            self.SetLabel(name)
556        self.Show()
557       
558    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
559        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
560        self.data = data
561        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
562        Size = self.GetSize()
563        xPos = clientSize[2]-Size[0]
564        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
565        self.dirname = ''
566        self.AtomGrid = []
567        self.selectedRow = 0
568       
569    def setSizePosLeft(self,Width):
570        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
571        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
572        Width[0] = max(Width[0],300)
573        self.SetSize(Width)
574        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
575       
576    def Clear(self):
577        self.ClearBackground()
578        self.DestroyChildren()
579                   
580class GSNoteBook(wx.Notebook):
581    def __init__(self, parent, name='',size = None):
582        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
583        if size: self.SetSize(size)
584                                                     
585    def Clear(self):       
586        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
587       
588    def FindPage(self,name):
589        numPage = self.GetPageCount()
590        for page in range(numPage):
591            if self.GetPageText(page) == name:
592                return page
593       
594class GSGrid(wg.Grid):
595    def __init__(self, parent, name=''):
596        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
597        self.SetSize(parent.GetClientSize())
598           
599    def Clear(self):
600        wg.Grid.ClearGrid(self)
601       
602    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
603        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
604        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
605       
606    def GetSelection(self):
607        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
608        return None
609                       
610class Table(wg.PyGridTableBase):
611    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
612        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
613        self.colLabels = colLabels
614        self.rowLabels = rowLabels
615        self.dataTypes = types
616        self.data = data
617       
618    def AppendRows(self, numRows=1):
619        self.data.append([])
620        return True
621       
622    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
623        if self.dataTypes:
624            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
625            if typeName == colType:
626                return True
627            else:
628                return False
629        else:
630            return False
631
632    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
633        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
634
635    def DeleteRow(self,pos):
636        data = self.GetData()
637        self.SetData([])
638        new = []
639        for irow,row in enumerate(data):
640            if irow <> pos:
641                new.append(row)
642        self.SetData(new)
643       
644    def GetColLabelValue(self, col):
645        if self.colLabels:
646            return self.colLabels[col]
647           
648    def GetData(self):
649        data = []
650        for row in range(self.GetNumberRows()):
651            data.append(self.GetRowValues(row))
652        return data
653       
654    def GetNumberCols(self):
655        try:
656            return len(self.colLabels)
657        except TypeError:
658            return None
659       
660    def GetNumberRows(self):
661        return len(self.data)
662       
663    def GetRowLabelValue(self, row):
664        if self.rowLabels:
665            return self.rowLabels[row]
666       
667    def GetColValues(self, col):
668        data = []
669        for row in range(self.GetNumberRows()):
670            data.append(self.GetValue(row, col))
671        return data
672       
673    def GetRowValues(self, row):
674        data = []
675        for col in range(self.GetNumberCols()):
676            data.append(self.GetValue(row, col))
677        return data
678       
679    def GetTypeName(self, row, col):
680        try:
681            return self.dataTypes[col]
682        except TypeError:
683            return None
684
685    def GetValue(self, row, col):
686        try:
687            return self.data[row][col]
688        except IndexError:
689            return None
690           
691    def InsertRows(self, pos, rows):
692        for row in range(rows):
693            self.data.insert(pos,[])
694            pos += 1
695       
696    def IsEmptyCell(self,row,col):
697        try:
698            return not self.data[row][col]
699        except IndexError:
700            return True
701       
702    def OnKeyPress(self, event):
703        dellist = self.GetSelectedRows()
704        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
705            grid = self.GetView()
706            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
707               
708    def SetColLabelValue(self, col, label):
709        numcols = self.GetNumberCols()
710        if col > numcols-1:
711            self.colLabels.append(label)
712        else:
713            self.colLabels[col]=label
714       
715    def SetData(self,data):
716        for row in range(len(data)):
717            self.SetRowValues(row,data[row])
718               
719    def SetRowLabelValue(self, row, label):
720        self.rowLabels[row]=label
721           
722    def SetRowValues(self,row,data):
723        self.data[row] = data
724           
725    def SetValue(self, row, col, value):
726        def innerSetValue(row, col, value):
727            try:
728                self.data[row][col] = value
729            except TypeError:
730                return
731            except IndexError:
732                print row,col,value
733                # add a new row
734                if row > self.GetNumberRows():
735                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
736                elif col > self.GetNumberCols():
737                    for row in range(self.GetNumberRows):
738                        self.data[row].append('')
739                print self.data
740                self.data[row][col] = value
741        innerSetValue(row, col, value)
742               
743def UpdateNotebook(self,data):       
744    if data:
745        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
746        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
747            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
748        for line in data:
749            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
750            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
751           
752def UpdateControls(self,data):
753    #patch
754    if 'deriv type' not in data:
755        data = {}
756        data['deriv type'] = 'analytical'
757        data['min dM/M'] = 0.0001
758        data['shift factor'] = 1.
759    if 'shift factor' not in data:
760        data['shift factor'] = 1.       
761    #end patch
762    '''
763    #Fourier controls
764    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
765    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
766    #distance/angle controls
767    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
768    '''
769       
770    def SetStatusLine(text):
771        Status.SetStatusText(text)                                     
772       
773    def OnConvergence(event):
774        try:
775            value = max(1.e-9,min(1.0,float(Cnvrg.GetValue())))
776        except ValueError:
777            value = 0.0001
778        data['min dM/M'] = value
779        Cnvrg.SetValue('%.2g'%(value))
780       
781    def OnDerivType(event):
782        data['deriv type'] = derivSel.GetValue()
783        derivSel.SetValue(data['deriv type'])
784       
785    def OnFactor(event):
786        try:
787            value = min(max(float(Factr.GetValue()),0.00001),100.)
788        except ValueError:
789            value = 1.0
790        data['shift factor'] = value
791        Factr.SetValue('%.5f'%(value))
792       
793    def OnSelectData(event):
794        choices = ['All',]+GetPatternTreeDataNames(self,['PWDR',])
795        sel = []
796        if 'Seq Data' in data:
797            for item in data['Seq Data']:
798                sel.append(choices.index(item))
799        names = []
800        dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select data:','Sequential refinement',choices)
801        dlg.SetSelections(sel)
802        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
803            sel = dlg.GetSelections()
804            for i in sel: names.append(choices[i])
805            if 'All' in names:
806                names = choices[1:]
807            data['Seq Data'] = names               
808        dlg.Destroy()
809        reverseSel.Enable(True)
810       
811    def OnReverse(event):
812        data['Reverse Seq'] = reverseSel.GetValue()
813       
814    if self.dataDisplay:
815        self.dataDisplay.Destroy()
816    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
817        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
818    SetStatusLine('')
819    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
820    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
821    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
822    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
823    mainSizer.Add((5,5),0)
824    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
825    LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=6,vgap=5,hgap=5)
826    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement derivatives: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
827    Choice=['analytic','numeric']
828    derivSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['deriv type'],choices=Choice,
829        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
830    derivSel.SetValue(data['deriv type'])
831    derivSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnDerivType)   
832    LSSizer.Add(derivSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
833    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min delta-M/M: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
834    Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2g'%(data['min dM/M']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
835    Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
836    Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
837    LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
838    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Initial shift factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
839    Factr = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.5f'%(data['shift factor']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
840    Factr.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnFactor)
841    Factr.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnFactor)
842    LSSizer.Add(Factr,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
843    mainSizer.Add(LSSizer)
844    mainSizer.Add((5,5),0)
845   
846    SeqSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
847    SeqSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Sequential Refinement Powder Data: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
848    selSeqData = wx.Button(self.dataDisplay,-1,label=' Select data')
849    selSeqData.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnSelectData)
850    SeqSizer.Add(selSeqData,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
851    SeqSizer.Add((5,0),0)
852    reverseSel = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label=' Reverse order?')
853    reverseSel.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnReverse)
854    if 'Seq Data' not in data:
855        reverseSel.Enable(False)
856    if 'Reverse Seq' in data:
857        reverseSel.SetValue(data['Reverse Seq'])
858    SeqSizer.Add(reverseSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
859   
860   
861    mainSizer.Add(SeqSizer)
862    mainSizer.Add((5,5),0)
863       
864    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
865
866    mainSizer.Add((5,5),0)
867    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Distance/angle Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
868       
869    mainSizer.Layout()   
870    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
871    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
872    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
873     
874def UpdateComments(self,data):                   
875    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
876    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
877        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
878    for line in data:
879        if line[-1] == '\n':
880            self.dataDisplay.AppendText(line)
881        else:
882            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
883           
884def UpdateSeqResults(self,data):
885    """
886    input:
887        data - dictionary
888            'histNames' - list of histogram names in order as processed by Sequential Refinement
889            'varyList' - list of variables - identical over all refinements insequence
890            histName - dictionaries for all data sets processed:
891                'variables'- result[0] from leastsq call
892                'varyList' - list of variables; same as above
893                'sig' - esds for variables
894                'covMatrix' - covariance matrix from individual refinement
895                'title' - histogram name; same as dict item name
896                'newAtomDict' - new atom parameters after shifts applied
897                'newCellDict' - new cell parameters after shifts to A0-A5 applied'
898    """
899    if not data:
900        print 'No sequential refinement results'
901        return
902    histNames = data['histNames']
903       
904    def GetSampleParms():
905        sampleParmDict = {'Temperature':[],'Pressure':[],'Humidity':[],'Voltage':[],'Force':[],}
906        sampleParm = {}
907        for name in histNames:
908            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root,name)
909            sampleData = self.PatternTree.GetItemPyData(GetPatternTreeItemId(self,Id,'Sample Parameters'))
910            for item in sampleParmDict:
911                sampleParmDict[item].append(sampleData[item])
912        for item in sampleParmDict:
913            frstValue = sampleParmDict[item][0]
914            if np.any(np.array(sampleParmDict[item])-frstValue):
915                sampleParm[item] = sampleParmDict[item]           
916        return sampleParm
917           
918    def GetSigData(parm):
919        sigData = []
920        for name in histNames:
921            sigList = data[name]['sig']
922            if colLabels[parm] in atomList:
923                sigData.append(sigList[colLabels.index(atomList[colLabels[parm]])])
924            elif colLabels[parm] in cellList:
925                sigData.append(sigList[colLabels.index(cellList[colLabels[parm]])])
926            else:
927                sigData.append(sigList[parm])
928        return sigData
929   
930    def Select(event):
931        cols = self.dataDisplay.GetSelectedCols()
932        rows = self.dataDisplay.GetSelectedRows()
933        if cols:
934            plotData = []
935            plotSig = []
936            plotNames = []
937            for col in cols:
938                plotData.append(self.SeqTable.GetColValues(col))
939                plotSig.append(GetSigData(col))
940                plotNames.append(self.SeqTable.GetColLabelValue(col))
941            plotData = np.array(plotData)
942            G2plt.PlotSeq(self,plotData,plotSig,plotNames,sampleParms)
943        elif rows:
944            name = histNames[rows[0]]
945            G2plt.PlotCovariance(self,Data=data[name])
946               
947    if self.dataDisplay:
948        self.dataDisplay.Destroy()
949    cellList = {}
950    newCellDict = data[histNames[0]]['newCellDict']
951    for item in newCellDict:
952        if item in data['varyList']:
953            cellList[newCellDict[item][0]] = item
954    atomList = {}
955    newAtomDict = data[histNames[0]]['newAtomDict']
956    for item in newAtomDict:
957        if item in data['varyList']:
958            atomList[newAtomDict[item][0]] = item
959    sampleParms = GetSampleParms()
960    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
961    self.dataFrame.SetLabel('Sequental refinement results')
962    self.dataFrame.CreateStatusBar()
963    colLabels = data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys()
964    Types = len(data['varyList']+atomList.keys()+cellList.keys())*[wg.GRID_VALUE_FLOAT,]
965    seqList = [list(data[name]['variables']) for name in histNames]
966   
967    for i,item in enumerate(seqList):
968        newAtomDict = data[histNames[i]]['newAtomDict']
969        newCellDict = data[histNames[i]]['newCellDict']
970        item += [newAtomDict[atomList[parm]][1] for parm in atomList.keys()]
971        item += [newCellDict[cellList[parm]][1] for parm in cellList.keys()]
972    self.SeqTable = Table(seqList,colLabels=colLabels,rowLabels=histNames,types=Types)
973    self.dataDisplay = GSGrid(parent=self.dataFrame)
974    self.dataDisplay.SetTable(self.SeqTable, True)
975    self.dataDisplay.EnableEditing(False)
976    self.dataDisplay.Bind(wg.EVT_GRID_LABEL_LEFT_DCLICK, Select)
977    self.dataDisplay.SetRowLabelSize(8*len(histNames[0]))       #pretty arbitrary 8
978    self.dataDisplay.SetMargins(0,0)
979    self.dataDisplay.AutoSizeColumns(True)
980    self.dataFrame.setSizePosLeft([700,350])
981   
982def UpdateConstraints(self,data):             
983#    data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
984    if not data:
985        data.update({'Hist':[],'HAP':[],'Phase':[]})       #empty dict - fill it
986    Histograms,Phases = self.GetUsedHistogramsAndPhasesfromTree()
987    AtomDict = dict([Phases[phase]['pId'],Phases[phase]['Atoms']] for phase in Phases)
988    Natoms,phaseVary,phaseDict,pawleyLookup,FFtable,BLtable = G2str.GetPhaseData(Phases,Print=False)
989    phaseList = []
990    for item in phaseDict:
991        if item.split(':')[2] not in ['Ax','Ay','Az','Amul','AI/A','Atype','SHorder']:
992            phaseList.append(item)
993    phaseList.sort()
994    phaseAtNames = {}
995    for item in phaseList:
996        Split = item.split(':')
997        if Split[2][:2] in ['AU','Af','dA']:
998            phaseAtNames[item] = AtomDict[int(Split[0])][int(Split[3])][0]
999        else:
1000            phaseAtNames[item] = ''
1001           
1002    hapVary,hapDict,controlDict = G2str.GetHistogramPhaseData(Phases,Histograms,Print=False)
1003    hapList = hapDict.keys()
1004    hapList.sort()
1005    histVary,histDict,controlDict = G2str.GetHistogramData(Histograms,Print=False)
1006    histList = []
1007    for item in histDict:
1008        if item.split(':')[2] not in ['Omega','Type','Chi','Phi','Azimuth','Gonio. radius','Lam1','Lam2','Back']:
1009            histList.append(item)
1010    histList.sort()
1011    Indx = {}
1012    scope = {}                          #filled out later
1013    self.Page = [0,'phs']
1014   
1015    def GetPHlegends(Phases,Histograms):
1016        plegend = '\n In p::name'
1017        hlegend = '\n In :h:name'
1018        phlegend = '\n In p:h:name'
1019        for phase in Phases:
1020            plegend += '\n p:: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':: for '+phase
1021            for histogram in Phases[phase]['Histograms']:
1022                phlegend += '\n p:h: = '+str(Phases[phase]['pId'])+':'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+phase+' in '+histogram
1023        for histogram in Histograms:
1024            hlegend += '\n :h: = :'+str(Histograms[histogram]['hId'])+': for '+histogram
1025        return plegend,hlegend,phlegend
1026       
1027    def FindEquivVarb(name,nameList):
1028        outList = []
1029        namelist = [name.split(':')[2],]
1030        if 'dA' in name:
1031            namelist = ['dAx','dAy','dAz']
1032        elif 'AU' in name:
1033            namelist = ['AUiso','AU11','AU22','AU33','AU12','AU13','AU23']
1034        for item in nameList:
1035            key = item.split(':')[2]
1036            if key in namelist and item != name:
1037                outList.append(item)
1038        return outList
1039       
1040    def SelectVarbs(page,FrstVarb,varList,legend,constType):
1041        #future -  add 'all:all:name', '0:all:name', etc. to the varList
1042        if page[1] == 'phs':
1043            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in varList]
1044            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',atchoice)
1045        else:
1046            dlg = wx.MultiChoiceDialog(self,'Select more variables:'+legend,FrstVarb+' and:',varList)
1047        varbs = [FrstVarb,]
1048        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1049            sel = dlg.GetSelections()
1050            for x in sel:
1051                varbs.append(varList[x])
1052        dlg.Destroy()
1053        if len(varbs) > 1:
1054            if 'equivalence' in constType:
1055                constr = []
1056                for item in varbs[1:]:
1057                    constr += [[[1.0,FrstVarb],[-1.0,item],None,None],]
1058                return constr           #multiple constraints
1059            elif 'function' in constType:
1060                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1061                return [constr+[0.0,False]]         #just one constraint
1062            else:       #'constraint'
1063                constr = map(list,zip([1.0 for i in range(len(varbs))],varbs))
1064                return [constr+[1.0,None]]          #just one constraint - default sum to one
1065        return []
1066             
1067    def OnAddHold(event):
1068        for phase in Phases:
1069            Phase = Phases[phase]
1070            Atoms = Phase['Atoms']
1071        constr = []
1072        page = self.Page
1073        choice = scope[page[1]]
1074        if page[1] == 'phs':
1075            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1076            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1077        else:   
1078            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1079        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1080            sel = dlg.GetSelection()
1081            FrstVarb = choice[2][sel]
1082            data[choice[3]] += [[[0.0,FrstVarb],None,None],]
1083        dlg.Destroy()
1084        choice[4]()
1085       
1086    def OnAddEquivalence(event):
1087        constr = []
1088        page = self.Page
1089        choice = scope[page[1]]
1090        if page[1] == 'phs':
1091            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1092            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1093        else:   
1094            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1095        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1096            sel = dlg.GetSelection()
1097            FrstVarb = choice[2][sel]
1098            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1099            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'equivalence')
1100            if len(constr) > 0:
1101                data[choice[3]] += constr
1102        dlg.Destroy()
1103        choice[4]()
1104   
1105    def OnAddFunction(event):
1106        constr = []
1107        page = self.Page
1108        choice = scope[page[1]]
1109        if page[1] == 'phs':
1110            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1111            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1112        else:   
1113            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1114        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1115            sel = dlg.GetSelection()
1116            FrstVarb = choice[2][sel]
1117            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1118            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'function')
1119            if len(constr) > 0:
1120                data[choice[3]] += constr
1121        dlg.Destroy()
1122        choice[4]()
1123                       
1124    def OnAddConstraint(event):
1125        constr = []
1126        page = self.Page
1127        choice = scope[page[1]]
1128        if page[1] == 'phs':
1129            atchoice = [item+' for '+phaseAtNames[item] for item in choice[2]]
1130            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],atchoice)
1131        else:   
1132            dlg = wx.SingleChoiceDialog(self,'Select 1st variable:'+choice[1],choice[0],choice[2])
1133        if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1134            sel = dlg.GetSelection()
1135            FrstVarb = choice[2][sel]
1136            moreVarb = FindEquivVarb(FrstVarb,choice[2])
1137            constr = SelectVarbs(page,FrstVarb,moreVarb,choice[1],'constraint')
1138            if len(constr) > 0:
1139                data[choice[3]] += constr
1140        dlg.Destroy()
1141        choice[4]()
1142                       
1143    def ConstSizer(name,pageDisplay):
1144        constSizer = wx.FlexGridSizer(1,4,0,0)
1145        for Id,item in enumerate(data[name]):
1146            constDel = wx.Button(pageDisplay,-1,'Delete',style=wx.BU_EXACTFIT)
1147            constDel.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstDel)
1148            Indx[constDel.GetId()] = [Id,name]
1149            if len(item) < 4:
1150                constSizer.Add((5,5),0)
1151                constSizer.Add(constDel)
1152                eqString = ' FIXED   '+item[0][1]+'   '
1153            else:
1154                constEdit = wx.Button(pageDisplay,-1,'Edit',style=wx.BU_EXACTFIT)
1155                constEdit.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnConstEdit)
1156                Indx[constEdit.GetId()] = [Id,name]
1157                constSizer.Add(constEdit)           
1158                constSizer.Add(constDel)
1159                if isinstance(item[-1],bool):
1160                    eqString = ' FUNCT   '
1161                elif isinstance(item[-2],float):
1162                    eqString = ' CONSTR  '
1163                else:
1164                    eqString = ' EQUIV   '
1165                for term in item[:-2]:
1166                    eqString += '%+.3f*%s '%(term[0],term[1])
1167                if isinstance(item[-2],float):
1168                    eqString += ' = %.3f'%(item[-2])+'  '
1169                else:
1170                    eqString += ' = 0   '
1171            constSizer.Add(wx.StaticText(pageDisplay,-1,eqString),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1172            if isinstance(item[-1],bool):
1173                constRef = wx.CheckBox(pageDisplay,-1,label=' Refine?')                   
1174                constRef.SetValue(item[-1])
1175                constRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnConstRef)
1176                Indx[constRef.GetId()] = item
1177                constSizer.Add(constRef,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1178            else:
1179                constSizer.Add((5,5),0)
1180        return constSizer
1181               
1182    def OnConstRef(event):
1183        Obj = event.GetEventObject()
1184        Indx[Obj.GetId()][-1] = Obj.GetValue()
1185       
1186    def OnConstDel(event):
1187        Obj = event.GetEventObject()
1188        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1189        del(data[name][Id])
1190        OnPageChanged(None)       
1191       
1192    def OnConstEdit(event):
1193        Obj = event.GetEventObject()
1194        Id,name = Indx[Obj.GetId()]
1195        const = data[name][Id][-2]       
1196        if isinstance(data[name][Id][-1],bool):
1197            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1198            constType = 'Function'
1199            extra = '; sum = new variable'
1200        elif isinstance(data[name][Id][-2],float):
1201            items = data[name][Id][:-2]+[[const,'= fixed value'],[]]
1202            constType = 'Constraint'
1203            extra = ' sum = constant'
1204        else:
1205            items = data[name][Id][:-2]+[[],]
1206            constType = 'Equivalence'
1207            extra = '; sum = 0'
1208        dlg = self.SumDialog(self,constType,'Enter value for each term in constraint'+extra,'',items)
1209        try:
1210            if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
1211                result = dlg.GetData()
1212                if isinstance(data[name][Id][-2],float):
1213                    data[name][Id][:-2] = result[:-2]
1214                    data[name][Id][-2] = result[-2][0]
1215                else:
1216                    data[name][Id][:-2] = result[:-1]
1217        finally:
1218            dlg.Destroy()           
1219        OnPageChanged(None)                     
1220   
1221    def UpdateHAPConstr():
1222        HAPConstr.DestroyChildren()
1223        HAPDisplay = wx.Panel(HAPConstr)
1224        HAPSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1225        HAPSizer.Add((5,5),0)
1226        HAPSizer.Add(ConstSizer('HAP',HAPDisplay))
1227        HAPDisplay.SetSizer(HAPSizer,True)
1228        Size = HAPSizer.GetMinSize()
1229        Size[0] += 40
1230        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1231        HAPDisplay.SetSize(Size)
1232        HAPConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1233        Size[1] = min(Size[1],250)
1234        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1235       
1236    def UpdateHistConstr():
1237        HistConstr.DestroyChildren()
1238        HistDisplay = wx.Panel(HistConstr)
1239        HistSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1240        HistSizer.Add((5,5),0)       
1241        HistSizer.Add(ConstSizer('Hist',HistDisplay))
1242        HistDisplay.SetSizer(HistSizer,True)
1243        Size = HistSizer.GetMinSize()
1244        Size[0] += 40
1245        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1246        HistDisplay.SetSize(Size)
1247        HistConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1248        Size[1] = min(Size[1],250)
1249        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1250       
1251    def UpdatePhaseConstr():
1252        PhaseConstr.DestroyChildren()
1253        PhaseDisplay = wx.Panel(PhaseConstr)
1254        PhaseSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1255        PhaseSizer.Add((5,5),0)       
1256        PhaseSizer.Add(ConstSizer('Phase',PhaseDisplay))
1257        PhaseDisplay.SetSizer(PhaseSizer,True)
1258        Size = PhaseSizer.GetMinSize()
1259        Size[0] += 40
1260        Size[1] = max(Size[1],250) + 20
1261        PhaseDisplay.SetSize(Size)
1262        PhaseConstr.SetScrollbars(10,10,Size[0]/10-4,Size[1]/10-1)
1263        Size[1] = min(Size[1],250)
1264        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1265   
1266    def OnPageChanged(event):
1267        if event:       #page change event!
1268            page = event.GetSelection()
1269        else:
1270            page = self.dataDisplay.GetSelection()
1271        oldPage = self.dataDisplay.ChangeSelection(page)
1272        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1273        if text == 'Histogram/Phase constraints':
1274            self.Page = [page,'hap']
1275            UpdateHAPConstr()
1276        elif text == 'Histogram constraints':
1277            self.Page = [page,'hst']
1278            UpdateHistConstr()
1279        elif text == 'Phase constraints':
1280            self.Page = [page,'phs']
1281            UpdatePhaseConstr()
1282
1283    def SetStatusLine(text):
1284        Status.SetStatusText(text)                                     
1285       
1286    plegend,hlegend,phlegend = GetPHlegends(Phases,Histograms)
1287    scope = {'hst':['Histogram variables:',hlegend,histList,'Hist',UpdateHistConstr],
1288        'hap':['HAP variables:',phlegend,hapList,'HAP',UpdateHAPConstr],
1289        'phs':['Phase variables:',plegend,phaseList,'Phase',UpdatePhaseConstr]}
1290    if self.dataDisplay:
1291        self.dataDisplay.Destroy()
1292    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1293    self.dataFrame.SetLabel('Constraints')
1294    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1295        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1296    SetStatusLine('')
1297   
1298    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.ConstraintMenu)
1299    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddConstraint, id=wxID_CONSTRAINTADD)
1300    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddFunction, id=wxID_FUNCTADD)
1301    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddEquivalence, id=wxID_EQUIVADD)
1302    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddHold, id=wxID_HOLDADD)
1303    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1304   
1305    PhaseConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1306    self.dataDisplay.AddPage(PhaseConstr,'Phase constraints')
1307    HAPConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1308    self.dataDisplay.AddPage(HAPConstr,'Histogram/Phase constraints')
1309    HistConstr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1310    self.dataDisplay.AddPage(HistConstr,'Histogram constraints')
1311    UpdatePhaseConstr()
1312
1313    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)
1314   
1315   
1316def UpdateRestraints(self,data):
1317
1318    def OnAddRestraint(event):
1319        page = self.dataDisplay.GetSelection()
1320        print self.dataDisplay.GetPageText(page)
1321
1322    def UpdateAtomRestr():
1323        AtomRestr.DestroyChildren()
1324        dataDisplay = wx.Panel(AtomRestr)
1325        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1326        mainSizer.Add((5,5),0)
1327        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Atom restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1328        mainSizer.Add((5,5),0)
1329
1330
1331        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1332        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1333        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1334        dataDisplay.SetSize(Size)
1335        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1336       
1337    def UpdatePhaseRestr():
1338        PhaseRestr.DestroyChildren()
1339        dataDisplay = wx.Panel(PhaseRestr)
1340        mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1341        mainSizer.Add((5,5),0)
1342        mainSizer.Add(wx.StaticText(dataDisplay,-1,'Phase restraint data:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1343        mainSizer.Add((5,5),0)
1344
1345
1346        dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1347        Size = mainSizer.Fit(self.dataFrame)
1348        Size[1] += 26                           #compensate for status bar
1349        dataDisplay.SetSize(Size)
1350        self.dataFrame.setSizePosLeft(Size)
1351   
1352    def OnPageChanged(event):
1353        page = event.GetSelection()
1354        text = self.dataDisplay.GetPageText(page)
1355        if text == 'Atom restraints':
1356            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1357            UpdateAtomRestr()
1358        elif text == 'Phase restraints':
1359            UpdatePhaseRestr()
1360            self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1361        event.Skip()
1362
1363    if self.dataDisplay:
1364        self.dataDisplay.Destroy()
1365    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.RestraintMenu)
1366    self.dataFrame.SetLabel('restraints')
1367    self.dataFrame.CreateStatusBar()
1368    self.dataFrame.Bind(wx.EVT_MENU, OnAddRestraint, id=wxID_RESTRAINTADD)
1369    self.dataDisplay = GSNoteBook(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize())
1370   
1371    PhaseRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1372    self.dataDisplay.AddPage(PhaseRestr,'Phase restraints')
1373    AtomRestr = wx.ScrolledWindow(self.dataDisplay)
1374    self.dataDisplay.AddPage(AtomRestr,'Atom restraints')
1375    UpdatePhaseRestr()
1376#    AtomRestrData = data['AtomRestr']
1377
1378    self.dataDisplay.Bind(wx.EVT_NOTEBOOK_PAGE_CHANGED, OnPageChanged)       
1379             
1380def UpdateHKLControls(self,data):
1381   
1382    def OnScaleSlider(event):
1383        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
1384        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
1385        data['Scale'] = scale*10.
1386        G2plt.PlotSngl(self)
1387       
1388    def OnLayerSlider(event):
1389        layer = layerSel.GetValue()
1390        data['Layer'] = layer
1391        G2plt.PlotSngl(self)
1392       
1393    def OnSelZone(event):
1394        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
1395        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1396       
1397    def OnSelType(event):
1398        data['Type'] = typeSel.GetValue()
1399        G2plt.PlotSngl(self)
1400       
1401    def SetStatusLine():
1402        Status.SetStatusText("look at me!!!")
1403                                     
1404    if self.dataDisplay:
1405        self.dataDisplay.Destroy()
1406    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
1407        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
1408    SetStatusLine()
1409    zones = ['100','010','001']
1410    HKLmax = data['HKLmax']
1411    HKLmin = data['HKLmin']
1412    if data['ifFc']:
1413        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
1414    else:
1415        typeChoices = ['Fosq','Fo']
1416    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
1417    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1418    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
1419    mainSizer.Add((5,10),0)
1420   
1421    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1422    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
1423        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1424    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
1425        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
1426    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1427    scaleSel.SetLineSize(100)
1428    scaleSel.SetPageSize(900)
1429    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
1430    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1431   
1432    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1433    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
1434        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1435    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
1436        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1437    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
1438    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1439    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
1440        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
1441    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
1442        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
1443    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
1444    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1445    zoneSizer.Add((10,0),0)   
1446    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1447       
1448    izone = zones.index(data['Zone'])
1449    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
1450    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
1451        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
1452    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
1453        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
1454    layerSel.SetLineSize(1)
1455    layerSel.SetLineSize(5)
1456    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
1457    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
1458    layerSizer.Add((10,0),0)   
1459    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
1460
1461       
1462    mainSizer.Layout()   
1463    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
1464    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1465    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
1466
1467def GetPatternTreeDataNames(self,dataTypes):
1468    names = []
1469    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(self.root)       
1470    while item:
1471        name = self.PatternTree.GetItemText(item)
1472        if name[:4] in dataTypes:
1473            names.append(name)
1474        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(self.root, cookie)
1475    return names
1476                         
1477def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
1478    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
1479    while item:
1480        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
1481            return item
1482        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
1483    return 0               
1484
1485def MovePatternTreeToGrid(self,item):
1486   
1487#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
1488   
1489    oldPage = 0
1490    if self.dataFrame:
1491        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
1492        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
1493            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1494            self.dataDisplay.Clear() 
1495            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
1496            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1497        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
1498            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
1499            self.dataDisplay.Clear() 
1500            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
1501            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
1502        if 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
1503            if self.dataDisplay: 
1504                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
1505        self.dataFrame.Clear()
1506        self.dataFrame.SetLabel('')
1507    else:
1508        #create the frame for the data item window
1509        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
1510
1511    self.dataFrame.Raise()           
1512    self.PickId = 0
1513    parentID = self.root
1514    self.ExportPattern.Enable(False)
1515    if item != self.root:
1516        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1517    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
1518        self.PatternId = item
1519        self.PickId = item
1520        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
1521            self.PatternId = 0
1522            self.ExportPattern.Enable(False)
1523            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1524            UpdateNotebook(self,data)
1525        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
1526            self.PatternId = 0
1527            self.ExportPattern.Enable(False)
1528            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1529            if not data:           #fill in defaults
1530                data = {
1531                    #least squares controls
1532                    'deriv type':'analytic','min dM/M':0.0001,'shift factor':1.0,
1533                    #Fourier controls
1534                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
1535                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
1536                    #distance/angle controls
1537                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
1538                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1539            self.Refine.Enable(True)
1540            self.SeqRefine.Enable(True)
1541            UpdateControls(self,data)
1542        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sequental results':
1543            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1544            UpdateSeqResults(self,data)           
1545        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Covariance':
1546            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1547            G2plt.PlotCovariance(self)
1548        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Constraints':
1549            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1550            UpdateConstraints(self,data)
1551        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Restraints':
1552            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1553            UpdateRestraints(self,data)
1554        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1555            self.Image = item
1556            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
1557        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1558            G2plt.PlotPowderLines(self)
1559        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1560            self.ExportPattern.Enable(True)
1561            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
1562        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1563            self.Sngl = item
1564            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
1565        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1566            self.PatternId = item
1567            self.ExportPDF.Enable(True)
1568            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1569           
1570    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1571        self.PickId = item
1572        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1573        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
1574    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1575        self.PickId = item
1576        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1577        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
1578    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1579        self.PickId = item
1580        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1581        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
1582    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
1583        self.PickId = item
1584        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1585        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
1586    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
1587        self.PickId = item
1588        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
1589        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
1590    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
1591        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1592        self.PickId = item
1593        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1594        UpdateComments(self,data)
1595    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
1596        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
1597        self.PickId = item
1598        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1599        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
1600            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
1601        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1602        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
1603        G2plt.PlotImage(self)
1604    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
1605        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
1606        self.PickId = item
1607        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1608        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1609        G2imG.UpdateMasks(self,data)
1610        G2plt.PlotImage(self)
1611    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
1612        self.PickId = item
1613        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1614        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1615        UpdateHKLControls(self,data)
1616        G2plt.PlotSngl(self)
1617    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
1618        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1619        self.ExportPDF.Enable(True)
1620        self.PickId = item
1621        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1622        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
1623        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
1624        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
1625        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
1626        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
1627    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
1628        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1629        self.ExportPeakList.Enable(True)
1630        self.PickId = item
1631        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1632        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
1633        G2plt.PlotPatterns(self)
1634    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
1635        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1636        self.PickId = item
1637        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1638        G2pdG.UpdateBackgroundGrid(self,data)
1639        G2plt.PlotPatterns(self)
1640    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
1641        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1642        self.PickId = item
1643        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1644        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
1645        G2plt.PlotPatterns(self)
1646    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
1647        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1648        self.PickId = item
1649        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1650        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
1651        G2plt.PlotPeakWidths(self)
1652    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
1653        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1654        self.PickId = item
1655        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1656
1657        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
1658            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
1659                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,
1660                'Force':0.0,'Gonio. radius':200.0}
1661            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
1662   
1663        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
1664        G2plt.PlotPatterns(self)
1665    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
1666        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1667        self.ExportPeakList.Enable(True)
1668        self.PickId = item
1669        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1670        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
1671        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1672            G2plt.PlotPowderLines(self)
1673        else:
1674            G2plt.PlotPatterns(self)
1675    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
1676        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1677        self.PickId = item
1678        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1679        if not data:
1680            data.append([0,0.0,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, zero value, max Nc/No, start volume
1681            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
1682            data.append([])                                 #empty cell list
1683            data.append([])                                 #empty dmin
1684            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
1685        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
1686        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
1687            G2plt.PlotPowderLines(self)
1688        else:
1689            G2plt.PlotPatterns(self)
1690    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Reflection Lists':
1691        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
1692        self.PickId = item
1693        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
1694        self.RefList = ''
1695        if len(data):
1696            self.RefList = data.keys()[0]
1697        G2pdG.UpdateReflectionGrid(self,data)
1698        G2plt.PlotPatterns(self)
1699     
1700#def OnHelp(event):
1701#    Obj = event.GetEventObject()
1702#    line = 'Help on '+Obj.GetTitle()
1703#    for child in Obj.GetChildren():
1704#        if 'NoteBook' in str(type(child)):
1705#            notebook = child.GetCurrentPage().GetParent()
1706#            line = 'Help on '+notebook.GetPageText(notebook.GetSelection())
1707#    print line
1708#    print 'Real help will come here as HTML pages'
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.