source: trunk/GSASIIgrid.py @ 311

Last change on this file since 311 was 311, checked in by vondreele, 10 years ago

finish new indexing refinement stuff
more on texture plotting

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 38.2 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2011-06-27 15:27:29 +0000 (Mon, 27 Jun 2011) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 311 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 311 2011-06-27 15:27:29Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import GSASIIpath
14import GSASIIplot as G2plt
15import GSASIIpwdGUI as G2pdG
16import GSASIIimgGUI as G2imG
17import GSASIIphsGUI as G2phG
18
19[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
20    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
21    wxID_RELOADDRAWATOMS,
22] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(9)]
23
24[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
25] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
26
27[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
28    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
29    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD,
30] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(10)]
31
32[ wxID_IMCALIBRATE, wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
33    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
34] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(7)]
35
36[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
37] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
38
39[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT,
40] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(2)]
41
42[ wxID_INSTPRMRESET,
43] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(1)]
44
45[ wxID_INDXRELOAD,
46] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
47
48[ wxID_UNDO,wxID_LSQPEAKFIT,wxID_BFGSPEAKFIT,wxID_RESETSIGGAM,
49] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(4)]
50
51[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
52] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
53
54[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
55    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
57
58VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
59
60class DataFrame(wx.Frame):
61    def _init_coll_BlankMenu(self,parent):
62        parent.Append(menu=self.Blank,title='')
63       
64    def _init_coll_AtomsMenu(self,parent):
65        parent.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
66       
67    def _init_coll_DataMenu(self,parent):
68        parent.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
69       
70    def _init_coll_DrawAtomsMenu(self,parent):
71        parent.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
72
73    def _init_coll_PawleyMenu(self,parent):
74        parent.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Pawley Reflections Operations')
75     
76    def _init_coll_IndPeaksMenu(self,parent):
77        parent.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Index Peaks Operations')
78                   
79    def _init_coll_ImageMenu(self,parent):
80        parent.Append(menu=self.ImageEdit, title='Image Operations')
81       
82    def _init_coll_InstMenu(self,parent):
83        parent.Append(menu=self.InstEdit, title='Inst. Parm. Operations')
84       
85    def _init_coll_MaskMenu(self,parent):
86        parent.Append(menu=self.MaskEdit, title='Mask Operations')
87       
88    def _init_coll_PeakMenu(self,parent):
89        parent.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
90
91    def _init_coll_IndexMenu(self,parent):
92        parent.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
93       
94    def _init_coll_PDFMenu(self,parent):
95        parent.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
96
97    def _init_coll_Atom_Items(self,parent):
98        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
99            help='Inserted as an H atom')
100        parent.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
101            help='Inserted as an H atom')
102        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
103            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
104        parent.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
105            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
106        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
107            help='Select atoms to delete first')
108        parent.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
109            help='Select atoms to refine first')
110        parent.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
111            help='Select atoms to modify first')
112        parent.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
113            help='Select atoms to transform first')
114        parent.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
115            help='Reload atom drawing list')
116           
117    def _init_coll_Data_Items(self,parent):
118        parent.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
119            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
120        parent.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
121            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
122        parent.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
123            help='Delete histograms from use for this phase')
124           
125    def _init_coll_DrawAtom_Items(self,parent):
126        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
127            help='Select atoms first')
128        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
129            help='Select atoms first')
130        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
131            help='Select atoms first')
132        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
133            help='Resets all atom colors to defaults')
134        parent.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
135            help='View point is 1st atom selected')
136        parent.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
137            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
138        parent.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
139            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
140        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
141            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
142        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
143            help='Fill unit cell with selected atoms')
144        parent.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
145            help='Delete atoms from drawing set')
146
147    def _init_coll_Pawley_Items(self,parent):
148        parent.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
149            help='Initialize Pawley reflection list')
150        parent.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
151            help='Import Pawley reflection list')
152
153    def _init_coll_IndPeaks_Items(self,parent):
154        parent.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
155            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
156           
157    def _init_coll_Image_Items(self,parent):
158        parent.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
159            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
160        parent.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
161            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
162        parent.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
163            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
164        parent.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
165            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
166        parent.Append(help='Copy image controls to other images', 
167            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
168        parent.Append(help='Save image controls to file', 
169            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
170        parent.Append(help='Load image controls from file', 
171            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
172
173                   
174    def _init_coll_Mask_Items(self,parent):
175        parent.Append(help='Copy mask to other images', 
176            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
177        parent.Append(help='Save mask to file', 
178            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
179        parent.Append(help='Load mask from file', 
180            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
181
182    def _init_coll_Inst_Items(self,parent):
183        parent.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
184            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
185
186    def _init_coll_Peak_Items(self,parent):
187        self.UnDo = parent.Append(help='Undo last least squares refinement', 
188            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
189        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_LSQPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='LSQ PeakFit', 
190            help='Peak fitting via least-squares' )
191#        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_BFGSPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='BFGS PeakFit',
192#            help='Peak fitting via BFGS algorithm' )
193        self.ResetSigGam = parent.Append(id=wxID_RESETSIGGAM, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
194            text='Reset sig and gam',help='Reset sigma and gamma to global fit' )
195           
196    def _init_coll_Index_Items(self,parent):
197        self.IndexPeaks = parent.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
198            text='Index Cell')
199        self.CopyCell = parent.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
200            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
201        self.RefineCell = parent.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
202            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
203        self.MakeNewPhase = parent.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
204            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
205           
206    def _init_coll_PDF_Items(self,parent):
207        parent.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
208            text='Add element')
209        parent.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
210            text='Delete element')
211        parent.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
212            text='Copy controls')
213#        parent.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
214#            text='Load Controls')
215#        parent.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
216#            text='Save controls')
217        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
218            text='Compute PDF')
219        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
220            text='Compute all PDFs')
221       
222
223    def _init_utils(self):
224        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
225       
226        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
227        self.DataMenu = wx.MenuBar()
228        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
229        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
230        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
231        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
232        self.InstMenu = wx.MenuBar()
233        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
234        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
235        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
236        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
237        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
238        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
239        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
240        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
241        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
242        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
243        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
244        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
245        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
246        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
247        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
248        self._init_coll_AtomsMenu(self.AtomsMenu)
249        self._init_coll_Atom_Items(self.AtomEdit)
250        self._init_coll_DataMenu(self.DataMenu)
251        self._init_coll_Data_Items(self.DataEdit)
252        self._init_coll_DrawAtomsMenu(self.DrawAtomsMenu)
253        self._init_coll_DrawAtom_Items(self.DrawAtomEdit)
254        self._init_coll_PawleyMenu(self.PawleyMenu)
255        self._init_coll_Pawley_Items(self.PawleyEdit)
256        self._init_coll_ImageMenu(self.ImageMenu)
257        self._init_coll_Image_Items(self.ImageEdit)
258        self._init_coll_MaskMenu(self.MaskMenu)
259        self._init_coll_Mask_Items(self.MaskEdit)
260        self._init_coll_InstMenu(self.InstMenu)
261        self._init_coll_Inst_Items(self.InstEdit)
262        self._init_coll_PeakMenu(self.PeakMenu)
263        self._init_coll_Peak_Items(self.PeakEdit)
264        self._init_coll_IndPeaksMenu(self.IndPeaksMenu)
265        self._init_coll_IndPeaks_Items(self.IndPeaksEdit)
266        self._init_coll_IndexMenu(self.IndexMenu)
267        self._init_coll_Index_Items(self.IndexEdit)
268        self._init_coll_PDFMenu(self.PDFMenu)
269        self._init_coll_PDF_Items(self.PDFEdit)
270        self.UnDo.Enable(False)
271        self.PeakFit.Enable(False)
272        self.IndexPeaks.Enable(False)
273        self.CopyCell.Enable(False)
274        self.RefineCell.Enable(False)
275        self.MakeNewPhase.Enable(False)
276       
277    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
278        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
279            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
280        self._init_utils()
281        if name:
282            self.SetLabel(name)
283        self.Show()
284       
285    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
286        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
287        self.data = data
288        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
289        Size = self.GetSize()
290        xPos = clientSize[2]-Size[0]
291        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
292        self.dirname = ''
293        self.AtomGrid = []
294        self.selectedRow = 0
295       
296    def setSizePosLeft(self,Width):
297        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
298        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
299        self.SetSize(Width)
300        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
301       
302    def Clear(self):
303        self.ClearBackground()
304        self.DestroyChildren()
305                   
306class GSNoteBook(wx.Notebook):
307    def __init__(self, parent, name='',size = None):
308        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
309        if size: self.SetSize(size)
310                                                     
311    def Clear(self):       
312        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
313       
314    def FindPage(self,name):
315        numPage = self.GetPageCount()
316        for page in range(numPage):
317            if self.GetPageText(page) == name:
318                return page
319       
320class GSGrid(wg.Grid):
321    def __init__(self, parent, name=''):
322        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
323        self.SetSize(parent.GetClientSize())
324           
325    def Clear(self):
326        wg.Grid.ClearGrid(self)
327       
328    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
329        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
330        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
331       
332    def GetSelection(self):
333        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
334        return None
335                       
336class Table(wg.PyGridTableBase):
337    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
338        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
339        self.colLabels = colLabels
340        self.rowLabels = rowLabels
341        self.dataTypes = types
342        self.data = data
343       
344    def AppendRows(self, numRows=1):
345        self.data.append([])
346        return True
347       
348    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
349        if self.dataTypes:
350            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
351            if typeName == colType:
352                return True
353            else:
354                return False
355        else:
356            return False
357
358    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
359        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
360
361    def DeleteRow(self,pos):
362        data = self.GetData()
363        self.SetData([])
364        new = []
365        for irow,row in enumerate(data):
366            if irow <> pos:
367                new.append(row)
368        self.SetData(new)
369       
370    def GetColLabelValue(self, col):
371        if self.colLabels:
372            return self.colLabels[col]
373           
374    def GetData(self):
375        data = []
376        for row in range(self.GetNumberRows()):
377            data.append(self.GetRowValues(row))
378        return data
379       
380    def GetNumberCols(self):
381        try:
382            return len(self.colLabels)
383        except TypeError:
384            return None
385       
386    def GetNumberRows(self):
387        return len(self.data)
388       
389    def GetRowLabelValue(self, row):
390        if self.rowLabels:
391            return self.rowLabels[row]
392       
393    def GetRowValues(self, row):
394        data = []
395        for col in range(self.GetNumberCols()):
396            data.append(self.GetValue(row, col))
397        return data
398       
399    def GetTypeName(self, row, col):
400        try:
401            return self.dataTypes[col]
402        except TypeError:
403            return None
404
405    def GetValue(self, row, col):
406        try:
407            return self.data[row][col]
408        except IndexError:
409            return None
410           
411    def InsertRows(self, pos, rows):
412        for row in range(rows):
413            self.data.insert(pos,[])
414            pos += 1
415       
416    def IsEmptyCell(self,row,col):
417        try:
418            return not self.data[row][col]
419        except IndexError:
420            return True
421       
422    def OnKeyPress(self, event):
423        dellist = self.GetSelectedRows()
424        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
425            grid = self.GetView()
426            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
427               
428    def SetColLabelValue(self, col, label):
429        numcols = self.GetNumberCols()
430        if col > numcols-1:
431            self.colLabels.append(label)
432        else:
433            self.colLabels[col]=label
434       
435    def SetData(self,data):
436        for row in range(len(data)):
437            self.SetRowValues(row,data[row])
438               
439    def SetRowLabelValue(self, row, label):
440        self.rowLabels[row]=label
441           
442    def SetRowValues(self,row,data):
443        self.data[row] = data
444           
445    def SetValue(self, row, col, value):
446        def innerSetValue(row, col, value):
447            try:
448                self.data[row][col] = value
449            except TypeError:
450                return
451            except IndexError:
452                print row,col,value
453                # add a new row
454                if row > self.GetNumberRows():
455                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
456                elif col > self.GetNumberCols():
457                    for row in range(self.GetNumberRows):
458                        self.data[row].append('')
459                print self.data
460                self.data[row][col] = value
461        innerSetValue(row, col, value)
462               
463def UpdateNotebook(self,data):       
464    if data:
465        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
466        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
467            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
468        for line in data:
469            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
470            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
471           
472def UpdateControls(self,data):
473    '''
474    #Fourier controls
475    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
476    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
477    #distance/angle controls
478    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
479    '''
480       
481    def SetStatusLine(text):
482        Status.SetStatusText(text)
483                                     
484    def OnNumCycles(event):
485        try:
486            value = max(0,min(200,int(Ncyc.GetValue())))
487        except ValueError:
488            value = 3
489        data['Ncycles'] = value
490        Ncyc.SetValue('%d'%(value))
491       
492    def OnConvergence(event):
493        try:
494            value = max(0.01,min(100.,float(Cnvrg.GetValue())))
495        except ValueError:
496            value = 0.01
497        data['minSumShftESD'] = value
498        Cnvrg.SetValue('%.2f'%(value))
499       
500    def OnAtomShift(event):
501        try:
502            value = max(0.1,min(5.,float(AtShft.GetValue())))
503        except ValueError:
504            value = 2.0
505        data['maxShift'] = value
506        AtShft.SetValue('%.1f'%(value))
507       
508    def OnMarquardt(event):
509        try:
510            value = max(1.0,min(10.0,float(Marq.GetValue())))
511        except ValueError:
512            value = 1.0
513        data['Marquardt'] = value
514        Marq.SetValue('%.2f'%(value))
515       
516    def OnBandWidth(event):
517        try:
518            value = max(0,min(200,int(Band.GetValue())))
519        except ValueError:
520            value = 0
521        data['bandWidth'] = value
522        Band.SetValue('%d'%(value))
523       
524    def OnRestraint(event):
525        data['restraintWeight'] = Restraint.GetValue()
526
527    if self.dataDisplay:
528        self.dataDisplay.Destroy()
529    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
530        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
531    SetStatusLine('')
532    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
533    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
534    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
535    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
536    mainSizer.Add((5,5),0)
537    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
538    LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=4,vgap=5,hgap=5)
539    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max cycles: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
540    Ncyc = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['Ncycles']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
541    Ncyc.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnNumCycles)
542    Ncyc.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnNumCycles)
543    LSSizer.Add(Ncyc,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
544    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min sum(shift/esd)^2: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
545    Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['minSumShftESD']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
546    Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
547    Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
548    LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
549    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max atom shift: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
550    AtShft = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.1f'%(data['maxShift']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
551    AtShft.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnAtomShift)
552    AtShft.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnAtomShift)
553    LSSizer.Add(AtShft,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
554    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Marquardt factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
555    Marq = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['Marquardt']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
556    Marq.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnMarquardt)
557    Marq.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnMarquardt)
558    LSSizer.Add(Marq,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
559    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Matrix band width: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
560    Band = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['bandWidth']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
561    Band.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnBandWidth)
562    Band.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnBandWidth)
563    LSSizer.Add(Band,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
564    Restraint = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label='Modify restraint weights?')
565    Restraint.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRestraint)
566    Restraint.SetValue(data['restraintWeight'])
567    LSSizer.Add(Restraint,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
568   
569   
570    mainSizer.Add(LSSizer)
571    mainSizer.Add((5,5),0)
572    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
573
574    mainSizer.Add((5,5),0)
575    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Distance/angle Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
576       
577    mainSizer.Layout()   
578    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
579    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
580    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
581     
582def UpdateComments(self,data):                   
583    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
584    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
585        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
586    for line in data:
587        if line[-1] == '\n':
588            self.dataDisplay.AppendText(line)
589        else:
590            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
591             
592def UpdateHKLControls(self,data):
593   
594    def OnScaleSlider(event):
595        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
596        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
597        data['Scale'] = scale*10.
598        G2plt.PlotSngl(self)
599       
600    def OnLayerSlider(event):
601        layer = layerSel.GetValue()
602        data['Layer'] = layer
603        G2plt.PlotSngl(self)
604       
605    def OnSelZone(event):
606        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
607        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
608       
609    def OnSelType(event):
610        data['Type'] = typeSel.GetValue()
611        G2plt.PlotSngl(self)
612       
613    def SetStatusLine():
614        Status.SetStatusText("look at me!!!")
615                                     
616    if self.dataDisplay:
617        self.dataDisplay.Destroy()
618    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
619        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
620    SetStatusLine()
621    zones = ['100','010','001']
622    HKLmax = data['HKLmax']
623    HKLmin = data['HKLmin']
624    if data['ifFc']:
625        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
626    else:
627        typeChoices = ['Fosq','Fo']
628    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
629    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
630    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
631    mainSizer.Add((5,10),0)
632   
633    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
634    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
635        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
636    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
637        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
638    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
639    scaleSel.SetLineSize(100)
640    scaleSel.SetPageSize(900)
641    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
642    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
643   
644    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
645    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
646        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
647    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
648        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
649    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
650    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
651    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
652        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
653    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
654        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
655    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
656    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
657    zoneSizer.Add((10,0),0)   
658    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
659       
660    izone = zones.index(data['Zone'])
661    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
662    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
663        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
664    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
665        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
666    layerSel.SetLineSize(1)
667    layerSel.SetLineSize(5)
668    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
669    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
670    layerSizer.Add((10,0),0)   
671    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
672
673       
674    mainSizer.Layout()   
675    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
676    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
677    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
678       
679                         
680def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
681    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
682    while item:
683        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
684            return item
685        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
686    return 0               
687
688def MovePatternTreeToGrid(self,item):
689   
690#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
691   
692    oldPage = 0
693    if self.dataFrame:
694        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
695        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
696            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
697            self.dataDisplay.Clear() 
698            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
699            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
700        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
701            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
702            self.dataDisplay.Clear() 
703            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
704            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
705        if 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
706            if self.dataDisplay: 
707                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
708        self.dataFrame.Clear()
709        self.dataFrame.SetLabel('')
710    else:
711        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
712
713    self.dataFrame.Raise()           
714    self.PickId = 0
715    parentID = self.root
716    self.ExportPattern.Enable(False)
717    if item != self.root:
718        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
719    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
720        self.PatternId = item
721        self.PickId = item
722        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
723            self.PatternId = 0
724            self.ExportPattern.Enable(False)
725            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
726            UpdateNotebook(self,data)
727        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
728            self.PatternId = 0
729            self.ExportPattern.Enable(False)
730            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
731            if data == [0] or data == {}:           #fill in defaults
732                data = {
733                    #least squares controls
734                    'Ncycles':3,'maxShift':2.0,'bandWidth':0,'Marquardt':1.0,'restraintWeight':False,
735                    'minSumShftESD':0.01,
736                    #Fourier controls
737                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
738                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
739                    #distance/angle controls
740                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
741                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
742            self.Refine.Enable(True)
743            UpdateControls(self,data)
744        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
745            self.Image = item
746            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
747        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
748            G2plt.PlotPowderLines(self)
749        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
750            self.ExportPattern.Enable(True)
751            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
752        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
753            self.Sngl = item
754            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
755        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
756            self.PatternId = item
757            self.ExportPDF.Enable(True)
758            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
759           
760    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
761        self.PickId = item
762        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
763        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
764    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
765        self.PickId = item
766        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
767        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
768    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
769        self.PickId = item
770        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
771        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
772    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
773        self.PickId = item
774        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
775        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
776    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
777        self.PickId = item
778        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
779        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
780    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
781        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
782        self.PickId = item
783        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
784        UpdateComments(self,data)
785    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
786        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
787        self.PickId = item
788        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
789        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
790            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
791        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
792        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
793        G2plt.PlotImage(self)
794    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
795        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
796        self.PickId = item
797        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
798        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
799        G2imG.UpdateMasks(self,data)
800        G2plt.PlotImage(self)
801    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
802        self.PickId = item
803        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
804        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
805        UpdateHKLControls(self,data)
806        G2plt.PlotSngl(self)
807    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
808        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
809        self.ExportPDF.Enable(True)
810        self.PickId = item
811        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
812        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
813        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
814        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
815        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
816        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
817    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
818        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
819        self.ExportPeakList.Enable(True)
820        self.PickId = item
821        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
822        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
823        G2plt.PlotPatterns(self)
824    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
825        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
826        self.PickId = item
827        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
828        G2pdG.UpdateBackgroundGrid(self,data)
829        G2plt.PlotPatterns(self)
830    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
831        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
832        self.PickId = item
833        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
834        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
835        G2plt.PlotPatterns(self)
836    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
837        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
838        self.PickId = item
839        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
840        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
841        G2plt.PlotPeakWidths(self)
842    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
843        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
844        self.PickId = item
845        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
846
847        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
848            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
849                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,'Force':0.0}
850            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
851   
852        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
853        G2plt.PlotPatterns(self)
854    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
855        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
856        self.ExportPeakList.Enable(True)
857        self.PickId = item
858        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
859        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
860        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
861            G2plt.PlotPowderLines(self)
862        else:
863            G2plt.PlotPatterns(self)
864    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
865        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
866        self.PickId = item
867        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
868        if not data:
869            data.append([0,0.0,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, zero value, max Nc/No, start volume
870            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
871            data.append([])                                 #empty cell list
872            data.append([])                                 #empty dmin
873            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
874        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
875        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
876            G2plt.PlotPowderLines(self)
877        else:
878            G2plt.PlotPatterns(self)
879     
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.