source: trunk/GSASIIgrid.py @ 294

Last change on this file since 294 was 294, checked in by vondreele, 11 years ago

implement mask save & load
implement copy to all for masks
refactor load controls

  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 38.1 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2011-05-26 16:02:42 +0000 (Thu, 26 May 2011) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 294 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 294 2011-05-26 16:02:42Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import GSASIIpath
14import GSASIIplot as G2plt
15import GSASIIpwdGUI as G2pdG
16import GSASIIimgGUI as G2imG
17import GSASIIphsGUI as G2phG
18
19[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
20    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
21    wxID_RELOADDRAWATOMS,
22] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(9)]
23
24[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
25] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
26
27[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
28    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
29    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD,
30] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(10)]
31
32[ wxID_IMCALIBRATE, wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
33    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
34] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(7)]
35
36[ wxID_MASKCOPY, wxID_MASKSAVE, wxID_MASKLOAD,
37] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(3)]
38
39[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT,
40] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(2)]
41
42[ wxID_INSTPRMRESET,
43] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(1)]
44
45[ wxID_INDXRELOAD,
46] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
47
48[ wxID_UNDO,wxID_PEAKFIT,wxID_AUTOPEAKFIT,
49] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(3)]
50
51[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
52] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
53
54[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
55    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
57
58VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
59
60class DataFrame(wx.Frame):
61    def _init_coll_BlankMenu(self,parent):
62        parent.Append(menu=self.Blank,title='')
63       
64    def _init_coll_AtomsMenu(self,parent):
65        parent.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
66       
67    def _init_coll_DataMenu(self,parent):
68        parent.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
69       
70    def _init_coll_DrawAtomsMenu(self,parent):
71        parent.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
72
73    def _init_coll_PawleyMenu(self,parent):
74        parent.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Pawley Reflections Operations')
75     
76    def _init_coll_IndPeaksMenu(self,parent):
77        parent.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Index Peaks Operations')
78                   
79    def _init_coll_ImageMenu(self,parent):
80        parent.Append(menu=self.ImageEdit, title='Image Operations')
81       
82    def _init_coll_InstMenu(self,parent):
83        parent.Append(menu=self.InstEdit, title='Inst. Parm. Operations')
84       
85    def _init_coll_MaskMenu(self,parent):
86        parent.Append(menu=self.MaskEdit, title='Mask Operations')
87       
88    def _init_coll_PeakMenu(self,parent):
89        parent.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
90
91    def _init_coll_IndexMenu(self,parent):
92        parent.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
93       
94    def _init_coll_PDFMenu(self,parent):
95        parent.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
96
97    def _init_coll_Atom_Items(self,parent):
98        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
99            help='Inserted as an H atom')
100        parent.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
101            help='Inserted as an H atom')
102        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
103            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
104        parent.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
105            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
106        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
107            help='Select atoms to delete first')
108        parent.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
109            help='Select atoms to refine first')
110        parent.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
111            help='Select atoms to modify first')
112        parent.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
113            help='Select atoms to transform first')
114        parent.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
115            help='Reload atom drawing list')
116           
117    def _init_coll_Data_Items(self,parent):
118        parent.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
119            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
120        parent.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
121            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
122        parent.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
123            help='Delete histograms from use for this phase')
124           
125    def _init_coll_DrawAtom_Items(self,parent):
126        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
127            help='Select atoms first')
128        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
129            help='Select atoms first')
130        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
131            help='Select atoms first')
132        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
133            help='Resets all atom colors to defaults')
134        parent.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
135            help='View point is 1st atom selected')
136        parent.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
137            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
138        parent.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
139            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
140        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
141            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
142        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
143            help='Fill unit cell with selected atoms')
144        parent.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
145            help='Delete atoms from drawing set')
146
147    def _init_coll_Pawley_Items(self,parent):
148        parent.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
149            help='Initialize Pawley reflection list')
150        parent.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
151            help='Import Pawley reflection list')
152
153    def _init_coll_IndPeaks_Items(self,parent):
154        parent.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
155            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
156           
157    def _init_coll_Image_Items(self,parent):
158        parent.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
159            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
160        parent.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
161            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
162        parent.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
163            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
164        parent.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
165            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
166        parent.Append(help='Copy image controls to other images', 
167            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
168        parent.Append(help='Save image controls to file', 
169            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
170        parent.Append(help='Load image controls from file', 
171            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
172
173                   
174    def _init_coll_Mask_Items(self,parent):
175        parent.Append(help='Copy mask to other images', 
176            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
177        parent.Append(help='Save mask to file', 
178            id=wxID_MASKSAVE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save mask')
179        parent.Append(help='Load mask from file', 
180            id=wxID_MASKLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load mask')
181
182    def _init_coll_Inst_Items(self,parent):
183        parent.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
184            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
185
186    def _init_coll_Peak_Items(self,parent):
187        self.UnDo = parent.Append(help='Undo last least squares refinement', 
188            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
189        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_PEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='PeakFit', 
190            help='Do single cycle of peak fitting least-squares refinement' )
191        self.AutoPeakFit = parent.Append(id=wxID_AUTOPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
192            text='AutoPeakFit',help='Do peak fitting least-squares to convergence' )
193           
194    def _init_coll_Index_Items(self,parent):
195        self.IndexPeaks = parent.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
196            text='Index Cell')
197        self.CopyCell = parent.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
198            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
199        self.RefineCell = parent.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
200            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
201        self.MakeNewPhase = parent.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
202            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
203           
204    def _init_coll_PDF_Items(self,parent):
205        parent.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
206            text='Add element')
207        parent.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
208            text='Delete element')
209        parent.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
210            text='Copy controls')
211#        parent.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
212#            text='Load Controls')
213#        parent.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
214#            text='Save controls')
215        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
216            text='Compute PDF')
217        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
218            text='Compute all PDFs')
219       
220
221    def _init_utils(self):
222        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
223       
224        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
225        self.DataMenu = wx.MenuBar()
226        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
227        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
228        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
229        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
230        self.InstMenu = wx.MenuBar()
231        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
232        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
233        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
234        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
235        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
236        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
237        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
238        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
239        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
240        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
241        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
242        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
243        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
244        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
245        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
246        self._init_coll_AtomsMenu(self.AtomsMenu)
247        self._init_coll_Atom_Items(self.AtomEdit)
248        self._init_coll_DataMenu(self.DataMenu)
249        self._init_coll_Data_Items(self.DataEdit)
250        self._init_coll_DrawAtomsMenu(self.DrawAtomsMenu)
251        self._init_coll_DrawAtom_Items(self.DrawAtomEdit)
252        self._init_coll_PawleyMenu(self.PawleyMenu)
253        self._init_coll_Pawley_Items(self.PawleyEdit)
254        self._init_coll_ImageMenu(self.ImageMenu)
255        self._init_coll_Image_Items(self.ImageEdit)
256        self._init_coll_MaskMenu(self.MaskMenu)
257        self._init_coll_Mask_Items(self.MaskEdit)
258        self._init_coll_InstMenu(self.InstMenu)
259        self._init_coll_Inst_Items(self.InstEdit)
260        self._init_coll_PeakMenu(self.PeakMenu)
261        self._init_coll_Peak_Items(self.PeakEdit)
262        self._init_coll_IndPeaksMenu(self.IndPeaksMenu)
263        self._init_coll_IndPeaks_Items(self.IndPeaksEdit)
264        self._init_coll_IndexMenu(self.IndexMenu)
265        self._init_coll_Index_Items(self.IndexEdit)
266        self._init_coll_PDFMenu(self.PDFMenu)
267        self._init_coll_PDF_Items(self.PDFEdit)
268        self.UnDo.Enable(False)
269        self.PeakFit.Enable(False)
270        self.AutoPeakFit.Enable(False)
271        self.IndexPeaks.Enable(False)
272        self.CopyCell.Enable(False)
273        self.RefineCell.Enable(False)
274        self.MakeNewPhase.Enable(False)
275       
276    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
277        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
278            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
279        self._init_utils()
280        if name:
281            self.SetLabel(name)
282        self.Show()
283       
284    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
285        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
286        self.data = data
287        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
288        Size = self.GetSize()
289        xPos = clientSize[2]-Size[0]
290        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
291        self.dirname = ''
292        self.AtomGrid = []
293        self.selectedRow = 0
294       
295    def setSizePosLeft(self,Width):
296        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
297        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
298        self.SetSize(Width)
299        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
300       
301    def Clear(self):
302        self.ClearBackground()
303        self.DestroyChildren()
304                   
305class GSNoteBook(wx.Notebook):
306    def __init__(self, parent, name='',size = None):
307        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
308        if size: self.SetSize(size)
309                                                     
310    def Clear(self):       
311        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
312       
313    def FindPage(self,name):
314        numPage = self.GetPageCount()
315        for page in range(numPage):
316            if self.GetPageText(page) == name:
317                return page
318       
319class GSGrid(wg.Grid):
320    def __init__(self, parent, name=''):
321        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
322        self.SetSize(parent.GetClientSize())
323           
324    def Clear(self):
325        wg.Grid.ClearGrid(self)
326       
327    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
328        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
329        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
330       
331    def GetSelection(self):
332        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
333        return None
334                       
335class Table(wg.PyGridTableBase):
336    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
337        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
338        self.colLabels = colLabels
339        self.rowLabels = rowLabels
340        self.dataTypes = types
341        self.data = data
342       
343    def AppendRows(self, numRows=1):
344        self.data.append([])
345        return True
346       
347    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
348        if self.dataTypes:
349            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
350            if typeName == colType:
351                return True
352            else:
353                return False
354        else:
355            return False
356
357    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
358        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
359
360    def DeleteRow(self,pos):
361        data = self.GetData()
362        self.SetData([])
363        new = []
364        for irow,row in enumerate(data):
365            if irow <> pos:
366                new.append(row)
367        self.SetData(new)
368       
369    def GetColLabelValue(self, col):
370        if self.colLabels:
371            return self.colLabels[col]
372           
373    def GetData(self):
374        data = []
375        for row in range(self.GetNumberRows()):
376            data.append(self.GetRowValues(row))
377        return data
378       
379    def GetNumberCols(self):
380        try:
381            return len(self.colLabels)
382        except TypeError:
383            return None
384       
385    def GetNumberRows(self):
386        return len(self.data)
387       
388    def GetRowLabelValue(self, row):
389        if self.rowLabels:
390            return self.rowLabels[row]
391       
392    def GetRowValues(self, row):
393        data = []
394        for col in range(self.GetNumberCols()):
395            data.append(self.GetValue(row, col))
396        return data
397       
398    def GetTypeName(self, row, col):
399        try:
400            return self.dataTypes[col]
401        except TypeError:
402            return None
403
404    def GetValue(self, row, col):
405        try:
406            return self.data[row][col]
407        except IndexError:
408            return None
409           
410    def InsertRows(self, pos, rows):
411        for row in range(rows):
412            self.data.insert(pos,[])
413            pos += 1
414       
415    def IsEmptyCell(self,row,col):
416        try:
417            return not self.data[row][col]
418        except IndexError:
419            return True
420       
421    def OnKeyPress(self, event):
422        dellist = self.GetSelectedRows()
423        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
424            grid = self.GetView()
425            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
426               
427    def SetColLabelValue(self, col, label):
428        numcols = self.GetNumberCols()
429        if col > numcols-1:
430            self.colLabels.append(label)
431        else:
432            self.colLabels[col]=label
433       
434    def SetData(self,data):
435        for row in range(len(data)):
436            self.SetRowValues(row,data[row])
437               
438    def SetRowLabelValue(self, row, label):
439        self.rowLabels[row]=label
440           
441    def SetRowValues(self,row,data):
442        self.data[row] = data
443           
444    def SetValue(self, row, col, value):
445        def innerSetValue(row, col, value):
446            try:
447                self.data[row][col] = value
448            except TypeError:
449                return
450            except IndexError:
451                print row,col,value
452                # add a new row
453                if row > self.GetNumberRows():
454                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
455                elif col > self.GetNumberCols():
456                    for row in range(self.GetNumberRows):
457                        self.data[row].append('')
458                print self.data
459                self.data[row][col] = value
460        innerSetValue(row, col, value)
461               
462def UpdateNotebook(self,data):       
463    if data:
464        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
465        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
466            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
467        for line in data:
468            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
469            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
470           
471def UpdateControls(self,data):
472    '''
473    #Fourier controls
474    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
475    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
476    #distance/angle controls
477    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
478    '''
479       
480    def SetStatusLine(text):
481        Status.SetStatusText(text)
482                                     
483    def OnNumCycles(event):
484        try:
485            value = max(0,min(200,int(Ncyc.GetValue())))
486        except ValueError:
487            value = 3
488        data['Ncycles'] = value
489        Ncyc.SetValue('%d'%(value))
490       
491    def OnConvergence(event):
492        try:
493            value = max(0.01,min(100.,float(Cnvrg.GetValue())))
494        except ValueError:
495            value = 0.01
496        data['minSumShftESD'] = value
497        Cnvrg.SetValue('%.2f'%(value))
498       
499    def OnAtomShift(event):
500        try:
501            value = max(0.1,min(5.,float(AtShft.GetValue())))
502        except ValueError:
503            value = 2.0
504        data['maxShift'] = value
505        AtShft.SetValue('%.1f'%(value))
506       
507    def OnMarquardt(event):
508        try:
509            value = max(1.0,min(10.0,float(Marq.GetValue())))
510        except ValueError:
511            value = 1.0
512        data['Marquardt'] = value
513        Marq.SetValue('%.2f'%(value))
514       
515    def OnBandWidth(event):
516        try:
517            value = max(0,min(200,int(Band.GetValue())))
518        except ValueError:
519            value = 0
520        data['bandWidth'] = value
521        Band.SetValue('%d'%(value))
522       
523    def OnRestraint(event):
524        data['restraintWeight'] = Restraint.GetValue()
525
526    if self.dataDisplay:
527        self.dataDisplay.Destroy()
528    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
529        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
530    SetStatusLine('')
531    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
532    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
533    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
534    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
535    mainSizer.Add((5,5),0)
536    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
537    LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=4,vgap=5,hgap=5)
538    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max cycles: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
539    Ncyc = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['Ncycles']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
540    Ncyc.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnNumCycles)
541    Ncyc.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnNumCycles)
542    LSSizer.Add(Ncyc,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
543    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min sum(shift/esd)^2: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
544    Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['minSumShftESD']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
545    Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
546    Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
547    LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
548    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max atom shift: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
549    AtShft = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.1f'%(data['maxShift']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
550    AtShft.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnAtomShift)
551    AtShft.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnAtomShift)
552    LSSizer.Add(AtShft,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
553    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Marquardt factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
554    Marq = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['Marquardt']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
555    Marq.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnMarquardt)
556    Marq.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnMarquardt)
557    LSSizer.Add(Marq,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
558    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Matrix band width: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
559    Band = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['bandWidth']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
560    Band.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnBandWidth)
561    Band.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnBandWidth)
562    LSSizer.Add(Band,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
563    Restraint = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label='Modify restraint weights?')
564    Restraint.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRestraint)
565    Restraint.SetValue(data['restraintWeight'])
566    LSSizer.Add(Restraint,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
567   
568   
569    mainSizer.Add(LSSizer)
570    mainSizer.Add((5,5),0)
571    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
572
573    mainSizer.Add((5,5),0)
574    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Distance/angle Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
575       
576    mainSizer.Layout()   
577    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
578    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
579    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
580     
581def UpdateComments(self,data):                   
582    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
583    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
584        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
585    for line in data:
586        if line[-1] == '\n':
587            self.dataDisplay.AppendText(line)
588        else:
589            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
590             
591def UpdateHKLControls(self,data):
592   
593    def OnScaleSlider(event):
594        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
595        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
596        data['Scale'] = scale*10.
597        G2plt.PlotSngl(self)
598       
599    def OnLayerSlider(event):
600        layer = layerSel.GetValue()
601        data['Layer'] = layer
602        G2plt.PlotSngl(self)
603       
604    def OnSelZone(event):
605        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
606        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
607       
608    def OnSelType(event):
609        data['Type'] = typeSel.GetValue()
610        G2plt.PlotSngl(self)
611       
612    def SetStatusLine():
613        Status.SetStatusText("look at me!!!")
614                                     
615    if self.dataDisplay:
616        self.dataDisplay.Destroy()
617    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
618        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
619    SetStatusLine()
620    zones = ['100','010','001']
621    HKLmax = data['HKLmax']
622    HKLmin = data['HKLmin']
623    if data['ifFc']:
624        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
625    else:
626        typeChoices = ['Fosq','Fo']
627    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
628    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
629    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
630    mainSizer.Add((5,10),0)
631   
632    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
633    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
634        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
635    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
636        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
637    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
638    scaleSel.SetLineSize(100)
639    scaleSel.SetPageSize(900)
640    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
641    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
642   
643    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
644    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
645        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
646    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
647        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
648    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
649    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
650    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
651        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
652    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
653        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
654    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
655    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
656    zoneSizer.Add((10,0),0)   
657    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
658       
659    izone = zones.index(data['Zone'])
660    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
661    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
662        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
663    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
664        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
665    layerSel.SetLineSize(1)
666    layerSel.SetLineSize(5)
667    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
668    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
669    layerSizer.Add((10,0),0)   
670    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
671
672       
673    mainSizer.Layout()   
674    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
675    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
676    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
677       
678                         
679def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
680    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
681    while item:
682        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
683            return item
684        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
685    return 0               
686
687def MovePatternTreeToGrid(self,item):
688   
689#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
690   
691    oldPage = 0
692    if self.dataFrame:
693        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
694        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
695            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
696            self.dataDisplay.Clear() 
697            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
698            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
699        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
700            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
701            self.dataDisplay.Clear() 
702            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
703            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
704        if 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
705            if self.dataDisplay: 
706                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
707        self.dataFrame.Clear()
708        self.dataFrame.SetLabel('')
709    else:
710        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
711
712    self.dataFrame.Raise()           
713    self.PickId = 0
714    parentID = self.root
715    self.ExportPattern.Enable(False)
716    if item != self.root:
717        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
718    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
719        self.PatternId = item
720        self.PickId = item
721        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
722            self.PatternId = 0
723            self.ExportPattern.Enable(False)
724            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
725            UpdateNotebook(self,data)
726        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
727            self.PatternId = 0
728            self.ExportPattern.Enable(False)
729            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
730            if data == [0] or data == {}:           #fill in defaults
731                data = {
732                    #least squares controls
733                    'Ncycles':3,'maxShift':2.0,'bandWidth':0,'Marquardt':1.0,'restraintWeight':False,
734                    'minSumShftESD':0.01,
735                    #Fourier controls
736                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
737                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
738                    #distance/angle controls
739                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
740                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
741            self.Refine.Enable(True)
742            UpdateControls(self,data)
743        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
744            self.Image = item
745            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
746        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
747            G2plt.PlotPowderLines(self)
748        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
749            self.ExportPattern.Enable(True)
750            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
751        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
752            self.Sngl = item
753            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
754        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
755            self.PatternId = item
756            self.ExportPDF.Enable(True)
757            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
758           
759    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
760        self.PickId = item
761        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
762        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
763    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
764        self.PickId = item
765        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
766        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
767    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
768        self.PickId = item
769        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
770        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
771    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
772        self.PickId = item
773        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
774        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
775    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
776        self.PickId = item
777        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
778        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
779    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
780        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
781        self.PickId = item
782        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
783        UpdateComments(self,data)
784    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
785        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
786        self.PickId = item
787        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
788        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
789            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
790        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
791        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
792        G2plt.PlotImage(self)
793    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
794        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
795        self.PickId = item
796        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
797        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
798        G2imG.UpdateMasks(self,data)
799        G2plt.PlotImage(self)
800    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
801        self.PickId = item
802        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
803        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
804        UpdateHKLControls(self,data)
805        G2plt.PlotSngl(self)
806    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
807        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
808        self.ExportPDF.Enable(True)
809        self.PickId = item
810        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
811        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
812        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)')
813        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
814        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)')
815        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)')
816    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
817        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
818        self.ExportPeakList.Enable(True)
819        self.PickId = item
820        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
821        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
822        G2plt.PlotPatterns(self)
823    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
824        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
825        self.PickId = item
826        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
827        G2pdG.UpdateBackgroundGrid(self,data)
828        G2plt.PlotPatterns(self)
829    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
830        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
831        self.PickId = item
832        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
833        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
834        G2plt.PlotPatterns(self)
835    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
836        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
837        self.PickId = item
838        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
839        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
840        G2plt.PlotPeakWidths(self)
841    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
842        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
843        self.PickId = item
844        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
845
846        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
847            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
848                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,'Force':0.0}
849            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
850   
851        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
852        G2plt.PlotPatterns(self)
853    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
854        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
855        self.ExportPeakList.Enable(True)
856        self.PickId = item
857        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
858        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
859        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
860            G2plt.PlotPowderLines(self)
861        else:
862            G2plt.PlotPatterns(self)
863    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
864        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
865        self.PickId = item
866        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
867        if not data:
868            data.append([0,0.1,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, max zero error, max Nc/No, start volume
869            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
870            data.append([])                                 #empty cell list
871            data.append([])                                 #empty dmin
872            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
873        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
874        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
875            G2plt.PlotPowderLines(self)
876        else:
877            G2plt.PlotPatterns(self)
878     
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.