source: trunk/GSASIIgrid.py @ 271

Last change on this file since 271 was 271, checked in by vondreele, 12 years ago

make g77 versions of fortran for binwin2.7 - faster than gfortran!
fix to histogram2d.for
GSASII.py - allow 2D offset in multiplots, fix for large file lists
GSASIIimgGUI.py - more stuff in save/load controls
GSASIIplot.py - 2D offset in multiplots, fix bad behavior in structure drawings
GSASIIpwd.py - more mods to PDF calcs
  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 37.7 KB
Line 
1#GSASII - data display routines
2########### SVN repository information ###################
3# $Date: 2011-04-28 18:11:32 +0000 (Thu, 28 Apr 2011) $
4# $Author: vondreele $
5# $Revision: 271 $
6# $URL: trunk/GSASIIgrid.py $
7# $Id: GSASIIgrid.py 271 2011-04-28 18:11:32Z vondreele $
8########### SVN repository information ###################
9import wx
10import wx.grid as wg
11import time
12import cPickle
13import GSASIIpath
14import GSASIIplot as G2plt
15import GSASIIpwdGUI as G2pdG
16import GSASIIimgGUI as G2imG
17import GSASIIphsGUI as G2phG
18
19[ wxID_ATOMSEDITADD, wxID_ATOMSEDITINSERT, wxID_ATOMSEDITDELETE, wxID_ATOMSREFINE, 
20    wxID_ATOMSMODIFY, wxID_ATOMSTRANSFORM, wxID_ATOMSTESTADD, wxID_ATONTESTINSERT,
21    wxID_RELOADDRAWATOMS,
22] = [wx.NewId() for _init_coll_Atom_Items in range(9)]
23
24[ wxID_PWDRADD, wxID_HKLFADD, wxID_DATADELETE,
25] = [wx.NewId() for _init_coll_Data_Items in range(3)]
26
27[ wxID_DRAWATOMSTYLE, wxID_DRAWATOMLABEL, wxID_DRAWATOMCOLOR, wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, 
28    wxID_DRAWVIEWPOINT, wxID_DRAWTRANSFORM, wxID_DRAWDELETE, wxID_DRAWFILLCELL, 
29    wxID_DRAWADDEQUIV, wxID_DRAWFILLCOORD,
30] = [wx.NewId() for _init_coll_DrawAtom_Items in range(10)]
31
32[ wxID_IMCALIBRATE, wxID_IMINTEGRATE, wxID_IMCLEARCALIB, 
33    wxID_IMCOPYCONTROLS, wxID_INTEGRATEALL, wxID_IMSAVECONTROLS, wxID_IMLOADCONTROLS,
34] = [wx.NewId() for _init_coll_IMAGE_Items in range(7)]
35
36[ wxID_MASKCOPY,
37] = [wx.NewId() for _init_coll_MASK_Items in range(1)]
38
39[ wxID_PAWLEYLOAD, wxID_PAWLEYIMPORT,
40] = [wx.NewId() for _init_coll_PAWLEY_Items in range(2)]
41
42[ wxID_INSTPRMRESET,
43] = [wx.NewId() for _init_coll_INST_Items in range(1)]
44
45[ wxID_INDXRELOAD,
46] = [wx.NewId() for _init_coll_IndPeaks_Items in range(1)]
47
48[ wxID_UNDO,wxID_PEAKFIT,wxID_AUTOPEAKFIT,
49] = [wx.NewId() for _init_coll_PEAK_Items in range(3)]
50
51[  wxID_INDEXPEAKS, wxID_REFINECELL, wxID_COPYCELL, wxID_MAKENEWPHASE,
52] = [wx.NewId() for _init_coll_INDEX_Items in range(4)]
53
54[ wxID_PDFCOPYCONTROLS, wxID_PDFSAVECONTROLS, wxID_PDFLOADCONTROLS, 
55    wxID_PDFCOMPUTE, wxID_PDFCOMPUTEALL, wxID_PDFADDELEMENT, wxID_PDFDELELEMENT,
56] = [wx.NewId() for _init_coll_PDF_Items in range(7)]
57
58VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
59
60class DataFrame(wx.Frame):
61    def _init_coll_BlankMenu(self,parent):
62        parent.Append(menu=self.Blank,title='')
63       
64    def _init_coll_AtomsMenu(self,parent):
65        parent.Append(menu=self.AtomEdit, title='Edit')
66       
67    def _init_coll_DataMenu(self,parent):
68        parent.Append(menu=self.DataEdit, title='Edit')
69       
70    def _init_coll_DrawAtomsMenu(self,parent):
71        parent.Append(menu=self.DrawAtomEdit, title='Edit')
72
73    def _init_coll_PawleyMenu(self,parent):
74        parent.Append(menu=self.PawleyEdit,title='Pawley Reflections Operations')
75     
76    def _init_coll_IndPeaksMenu(self,parent):
77        parent.Append(menu=self.IndPeaksEdit,title='Index Peaks Operations')
78                   
79    def _init_coll_ImageMenu(self,parent):
80        parent.Append(menu=self.ImageEdit, title='Image Operations')
81       
82    def _init_coll_InstMenu(self,parent):
83        parent.Append(menu=self.InstEdit, title='Inst. Parm. Operations')
84       
85    def _init_coll_MaskMenu(self,parent):
86        parent.Append(menu=self.MaskEdit, title='Mask Operations')
87       
88    def _init_coll_PeakMenu(self,parent):
89        parent.Append(menu=self.PeakEdit, title='Peak Fitting')
90
91    def _init_coll_IndexMenu(self,parent):
92        parent.Append(menu=self.IndexEdit, title='Cell Index/Refine')
93       
94    def _init_coll_PDFMenu(self,parent):
95        parent.Append(menu=self.PDFEdit, title='PDF Controls')
96
97    def _init_coll_Atom_Items(self,parent):
98        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append atom',
99            help='Inserted as an H atom')
100        parent.Append(id=wxID_ATOMSTESTADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Append test point',
101            help='Inserted as an H atom')
102        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert atom',
103            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
104        parent.Append(id=wxID_ATONTESTINSERT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Insert test point',
105            help='Select atom row to insert before; inserted as an H atom')
106        parent.Append(id=wxID_ATOMSEDITDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atom',
107            help='Select atoms to delete first')
108        parent.Append(id=wxID_ATOMSREFINE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Set atom refinement flags',
109            help='Select atoms to refine first')
110        parent.Append(id=wxID_ATOMSMODIFY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Modify atom parameters',
111            help='Select atoms to modify first')
112        parent.Append(id=wxID_ATOMSTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
113            help='Select atoms to transform first')
114        parent.Append(id=wxID_RELOADDRAWATOMS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reload draw atoms',
115            help='Reload atom drawing list')
116           
117    def _init_coll_Data_Items(self,parent):
118        parent.Append(id=wxID_PWDRADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add powder histograms',
119            help='Select new powder histograms to be used for this phase')
120        parent.Append(id=wxID_HKLFADD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add single crystal histograms',
121            help='Select new single crystal histograms to be used for this phase')
122        parent.Append(id=wxID_DATADELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete histograms',
123            help='Delete histograms from use for this phase')
124           
125    def _init_coll_DrawAtom_Items(self,parent):
126        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMSTYLE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom style',
127            help='Select atoms first')
128        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMLABEL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom label',
129            help='Select atoms first')
130        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Atom color',
131            help='Select atoms first')
132        parent.Append(id=wxID_DRAWATOMRESETCOLOR, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset atom colors',
133            help='Resets all atom colors to defaults')
134        parent.Append(id=wxID_DRAWVIEWPOINT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='View point',
135            help='View point is 1st atom selected')
136        parent.Append(id=wxID_DRAWADDEQUIV, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Add atoms',
137            help='Add symmetry & cell equivalents to drawing set from selected atoms')
138        parent.Append(id=wxID_DRAWTRANSFORM, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Transform atoms',
139            help='Transform selected atoms by symmetry & cell translations')
140        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCOORD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill CN-sphere',
141            help='Fill coordination sphere for selected atoms')           
142        parent.Append(id=wxID_DRAWFILLCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Fill unit cell',
143            help='Fill unit cell with selected atoms')
144        parent.Append(id=wxID_DRAWDELETE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Delete atoms',
145            help='Delete atoms from drawing set')
146
147    def _init_coll_Pawley_Items(self,parent):
148        parent.Append(id=wxID_PAWLEYLOAD, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley create',
149            help='Initialize Pawley reflection list')
150        parent.Append(id=wxID_PAWLEYIMPORT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Pawley import',
151            help='Import Pawley reflection list')
152
153    def _init_coll_IndPeaks_Items(self,parent):
154        parent.Append(help='Load/Reload index peaks from peak list',id=wxID_INDXRELOAD, 
155            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load/Reload')
156           
157    def _init_coll_Image_Items(self,parent):
158        parent.Append(help='Calibrate detector by fitting to calibrant lines', 
159            id=wxID_IMCALIBRATE, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Calibrate')
160        parent.Append(help='Clear calibration data points and rings',id=wxID_IMCLEARCALIB, 
161            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Clear calibration')
162        parent.Append(help='Integrate selected image',id=wxID_IMINTEGRATE, 
163            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate')
164        parent.Append(help='Integrate all images selected from list',id=wxID_INTEGRATEALL,
165            kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Integrate all')
166        parent.Append(help='Copy image controls to other images', 
167            id=wxID_IMCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Controls')
168        parent.Append(help='Save image controls to file', 
169            id=wxID_IMSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Save Controls')
170        parent.Append(help='Load image controls from file', 
171            id=wxID_IMLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Load Controls')
172
173                   
174    def _init_coll_Mask_Items(self,parent):
175        parent.Append(help='Copy mask to other images', 
176            id=wxID_MASKCOPY, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy mask')
177
178    def _init_coll_Inst_Items(self,parent):
179        parent.Append(help='Reset instrument profile parameters to default', 
180            id=wxID_INSTPRMRESET, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Reset profile')
181
182    def _init_coll_Peak_Items(self,parent):
183        self.UnDo = parent.Append(help='Undo last least squares refinement', 
184            id=wxID_UNDO, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='UnDo')
185        self.PeakFit = parent.Append(id=wxID_PEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='PeakFit', 
186            help='Do single cycle of peak fitting least-squares refinement' )
187        self.AutoPeakFit = parent.Append(id=wxID_AUTOPEAKFIT, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
188            text='AutoPeakFit',help='Do peak fitting least-squares to convergence' )
189           
190    def _init_coll_Index_Items(self,parent):
191        self.IndexPeaks = parent.Append(help='', id=wxID_INDEXPEAKS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
192            text='Index Cell')
193        self.CopyCell = parent.Append( id=wxID_COPYCELL, kind=wx.ITEM_NORMAL,text='Copy Cell', 
194            help='Copy selected unit cell from indexing to cell refinement fields')
195        self.RefineCell = parent.Append( id=wxID_REFINECELL, kind=wx.ITEM_NORMAL, 
196            text='Refine Cell',help='Refine unit cell parameters from indexed peaks')
197        self.MakeNewPhase = parent.Append( id=wxID_MAKENEWPHASE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
198            text='Make new phase',help='Make new phase from selected unit cell')
199           
200    def _init_coll_PDF_Items(self,parent):
201        parent.Append(help='Add element to sample composition',id=wxID_PDFADDELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
202            text='Add element')
203        parent.Append(help='Delete element from sample composition',id=wxID_PDFDELELEMENT, kind=wx.ITEM_NORMAL,
204            text='Delete element')
205        parent.Append(help='Copy PDF controls', id=wxID_PDFCOPYCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
206            text='Copy controls')
207        parent.Append(help='Load PDF controls from file',id=wxID_PDFLOADCONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
208            text='Load Controls')
209        parent.Append(help='Save PDF controls to file', id=wxID_PDFSAVECONTROLS, kind=wx.ITEM_NORMAL,
210            text='Save controls')
211        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute PDF', id=wxID_PDFCOMPUTE, kind=wx.ITEM_NORMAL,
212            text='Compute PDF')
213        self.PDFCompute = parent.Append(help='Compute all PDFs', id=wxID_PDFCOMPUTEALL, kind=wx.ITEM_NORMAL,
214            text='Compute all PDFs')
215       
216
217    def _init_utils(self):
218        self.BlankMenu = wx.MenuBar()
219       
220        self.AtomsMenu = wx.MenuBar()
221        self.DataMenu = wx.MenuBar()
222        self.DrawAtomsMenu = wx.MenuBar()
223        self.PawleyMenu = wx.MenuBar()
224        self.ImageMenu = wx.MenuBar()
225        self.MaskMenu = wx.MenuBar()
226        self.InstMenu = wx.MenuBar()
227        self.PeakMenu = wx.MenuBar()
228        self.IndPeaksMenu = wx.MenuBar()
229        self.IndexMenu = wx.MenuBar()
230        self.PDFMenu = wx.MenuBar()
231        self.AtomEdit = wx.Menu(title='')
232        self.DataEdit = wx.Menu(title='')
233        self.DrawAtomEdit = wx.Menu(title='')
234        self.PawleyEdit = wx.Menu(title='')
235        self.ImageEdit = wx.Menu(title='')
236        self.MaskEdit = wx.Menu(title='')
237        self.InstEdit = wx.Menu(title='')
238        self.PeakEdit = wx.Menu(title='')
239        self.IndPeaksEdit = wx.Menu(title='')
240        self.IndexEdit = wx.Menu(title='')
241        self.PDFEdit = wx.Menu(title='')
242        self._init_coll_AtomsMenu(self.AtomsMenu)
243        self._init_coll_Atom_Items(self.AtomEdit)
244        self._init_coll_DataMenu(self.DataMenu)
245        self._init_coll_Data_Items(self.DataEdit)
246        self._init_coll_DrawAtomsMenu(self.DrawAtomsMenu)
247        self._init_coll_DrawAtom_Items(self.DrawAtomEdit)
248        self._init_coll_PawleyMenu(self.PawleyMenu)
249        self._init_coll_Pawley_Items(self.PawleyEdit)
250        self._init_coll_ImageMenu(self.ImageMenu)
251        self._init_coll_Image_Items(self.ImageEdit)
252        self._init_coll_MaskMenu(self.MaskMenu)
253        self._init_coll_Mask_Items(self.MaskEdit)
254        self._init_coll_InstMenu(self.InstMenu)
255        self._init_coll_Inst_Items(self.InstEdit)
256        self._init_coll_PeakMenu(self.PeakMenu)
257        self._init_coll_Peak_Items(self.PeakEdit)
258        self._init_coll_IndPeaksMenu(self.IndPeaksMenu)
259        self._init_coll_IndPeaks_Items(self.IndPeaksEdit)
260        self._init_coll_IndexMenu(self.IndexMenu)
261        self._init_coll_Index_Items(self.IndexEdit)
262        self._init_coll_PDFMenu(self.PDFMenu)
263        self._init_coll_PDF_Items(self.PDFEdit)
264        self.UnDo.Enable(False)
265        self.PeakFit.Enable(False)
266        self.AutoPeakFit.Enable(False)
267        self.IndexPeaks.Enable(False)
268        self.CopyCell.Enable(False)
269        self.RefineCell.Enable(False)
270        self.MakeNewPhase.Enable(False)
271       
272    def _init_ctrls(self, parent,name=None,size=None,pos=None):
273        wx.Frame.__init__(self,parent=parent,style=wx.DEFAULT_FRAME_STYLE ^ wx.CLOSE_BOX,
274            size=size,pos=pos,title='GSAS-II data display')
275        self._init_utils()
276        if name:
277            self.SetLabel(name)
278        self.Show()
279       
280    def __init__(self,parent,data=None,name=None, size=None,pos=None):
281        self._init_ctrls(parent,name,size,pos)
282        self.data = data
283        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
284        Size = self.GetSize()
285        xPos = clientSize[2]-Size[0]
286        self.SetPosition(wx.Point(xPos,clientSize[1]+250))
287        self.dirname = ''
288        self.AtomGrid = []
289        self.selectedRow = 0
290       
291    def setSizePosLeft(self,Width):
292        clientSize = wx.ClientDisplayRect()
293        Width[1] = min(Width[1],clientSize[2]-300)
294        self.SetSize(Width)
295        self.SetPosition(wx.Point(clientSize[2]-Width[0],clientSize[1]+250))
296       
297    def Clear(self):
298        self.ClearBackground()
299        self.DestroyChildren()
300                   
301class GSNoteBook(wx.Notebook):
302    def __init__(self, parent, name='',size = None):
303        wx.Notebook.__init__(self, parent, -1, name=name, style= wx.BK_TOP)
304        if size: self.SetSize(size)
305                                                     
306    def Clear(self):       
307        GSNoteBook.DeleteAllPages(self)
308       
309    def FindPage(self,name):
310        numPage = self.GetPageCount()
311        for page in range(numPage):
312            if self.GetPageText(page) == name:
313                return page
314       
315class GSGrid(wg.Grid):
316    def __init__(self, parent, name=''):
317        wg.Grid.__init__(self,parent,-1,name=name)                   
318        self.SetSize(parent.GetClientSize())
319           
320    def Clear(self):
321        wg.Grid.ClearGrid(self)
322       
323    def SetCellStyle(self,r,c,color="white",readonly=True):
324        self.SetCellBackgroundColour(r,c,color)
325        self.SetReadOnly(r,c,isReadOnly=readonly)
326       
327    def GetSelection(self):
328        #this is to satisfy structure drawing stuff in G2plt when focus changes
329        return None
330                       
331class Table(wg.PyGridTableBase):
332    def __init__(self, data=[], rowLabels=None, colLabels=None, types = None):
333        wg.PyGridTableBase.__init__(self)
334        self.colLabels = colLabels
335        self.rowLabels = rowLabels
336        self.dataTypes = types
337        self.data = data
338       
339    def AppendRows(self, numRows=1):
340        self.data.append([])
341        return True
342       
343    def CanGetValueAs(self, row, col, typeName):
344        if self.dataTypes:
345            colType = self.dataTypes[col].split(':')[0]
346            if typeName == colType:
347                return True
348            else:
349                return False
350        else:
351            return False
352
353    def CanSetValueAs(self, row, col, typeName):
354        return self.CanGetValueAs(row, col, typeName)
355
356    def DeleteRow(self,pos):
357        data = self.GetData()
358        self.SetData([])
359        new = []
360        for irow,row in enumerate(data):
361            if irow <> pos:
362                new.append(row)
363        self.SetData(new)
364       
365    def GetColLabelValue(self, col):
366        if self.colLabels:
367            return self.colLabels[col]
368           
369    def GetData(self):
370        data = []
371        for row in range(self.GetNumberRows()):
372            data.append(self.GetRowValues(row))
373        return data
374       
375    def GetNumberCols(self):
376        try:
377            return len(self.colLabels)
378        except TypeError:
379            return None
380       
381    def GetNumberRows(self):
382        return len(self.data)
383       
384    def GetRowLabelValue(self, row):
385        if self.rowLabels:
386            return self.rowLabels[row]
387       
388    def GetRowValues(self, row):
389        data = []
390        for col in range(self.GetNumberCols()):
391            data.append(self.GetValue(row, col))
392        return data
393       
394    def GetTypeName(self, row, col):
395        try:
396            return self.dataTypes[col]
397        except TypeError:
398            return None
399
400    def GetValue(self, row, col):
401        try:
402            return self.data[row][col]
403        except IndexError:
404            return None
405           
406    def InsertRows(self, pos, rows):
407        for row in range(rows):
408            self.data.insert(pos,[])
409            pos += 1
410       
411    def IsEmptyCell(self,row,col):
412        try:
413            return not self.data[row][col]
414        except IndexError:
415            return True
416       
417    def OnKeyPress(self, event):
418        dellist = self.GetSelectedRows()
419        if event.GetKeyCode() == wx.WXK_DELETE and dellist:
420            grid = self.GetView()
421            for i in dellist: grid.DeleteRow(i)
422               
423    def SetColLabelValue(self, col, label):
424        numcols = self.GetNumberCols()
425        if col > numcols-1:
426            self.colLabels.append(label)
427        else:
428            self.colLabels[col]=label
429       
430    def SetData(self,data):
431        for row in range(len(data)):
432            self.SetRowValues(row,data[row])
433               
434    def SetRowLabelValue(self, row, label):
435        self.rowLabels[row]=label
436           
437    def SetRowValues(self,row,data):
438        self.data[row] = data
439           
440    def SetValue(self, row, col, value):
441        def innerSetValue(row, col, value):
442            try:
443                self.data[row][col] = value
444            except TypeError:
445                return
446            except IndexError:
447                print row,col,value
448                # add a new row
449                if row > self.GetNumberRows():
450                    self.data.append([''] * self.GetNumberCols())
451                elif col > self.GetNumberCols():
452                    for row in range(self.GetNumberRows):
453                        self.data[row].append('')
454                print self.data
455                self.data[row][col] = value
456        innerSetValue(row, col, value)
457       
458def UpdateNotebook(self,data):       
459    if data:
460        self.dataFrame.SetLabel('Notebook')
461        self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
462            style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
463        for line in data:
464            self.dataDisplay.AppendText(line+"\n")
465            self.dataDisplay.AppendText('Notebook entry @ '+time.ctime()+"\n")
466           
467def UpdateControls(self,data):
468    '''
469    #Fourier controls
470    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
471    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
472    #distance/angle controls
473    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
474    '''
475       
476    def SetStatusLine(text):
477        Status.SetStatusText(text)
478                                     
479    def OnNumCycles(event):
480        try:
481            value = max(0,min(200,int(Ncyc.GetValue())))
482        except ValueError:
483            value = 3
484        data['Ncycles'] = value
485        Ncyc.SetValue('%d'%(value))
486       
487    def OnConvergence(event):
488        try:
489            value = max(0.01,min(100.,float(Cnvrg.GetValue())))
490        except ValueError:
491            value = 0.01
492        data['minSumShftESD'] = value
493        Cnvrg.SetValue('%.2f'%(value))
494       
495    def OnAtomShift(event):
496        try:
497            value = max(0.1,min(5.,float(AtShft.GetValue())))
498        except ValueError:
499            value = 2.0
500        data['maxShift'] = value
501        AtShft.SetValue('%.1f'%(value))
502       
503    def OnMarquardt(event):
504        try:
505            value = max(1.0,min(10.0,float(Marq.GetValue())))
506        except ValueError:
507            value = 1.0
508        data['Marquardt'] = value
509        Marq.SetValue('%.2f'%(value))
510       
511    def OnBandWidth(event):
512        try:
513            value = max(0,min(200,int(Band.GetValue())))
514        except ValueError:
515            value = 0
516        data['bandWidth'] = value
517        Band.SetValue('%d'%(value))
518       
519    def OnRestraint(event):
520        data['restraintWeight'] = Restraint.GetValue()
521
522    if self.dataDisplay:
523        self.dataDisplay.Destroy()
524    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
525        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
526    SetStatusLine('')
527    self.dataFrame.SetLabel('Controls')
528    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
529    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
530    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
531    mainSizer.Add((5,5),0)
532    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Refinement Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
533    LSSizer = wx.FlexGridSizer(cols=4,vgap=5,hgap=5)
534    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max cycles: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
535    Ncyc = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['Ncycles']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
536    Ncyc.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnNumCycles)
537    Ncyc.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnNumCycles)
538    LSSizer.Add(Ncyc,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
539    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Min sum(shift/esd)^2: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
540    Cnvrg = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['minSumShftESD']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
541    Cnvrg.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnConvergence)
542    Cnvrg.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnConvergence)
543    LSSizer.Add(Cnvrg,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
544    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Max atom shift: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
545    AtShft = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.1f'%(data['maxShift']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
546    AtShft.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnAtomShift)
547    AtShft.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnAtomShift)
548    LSSizer.Add(AtShft,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
549    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Marquardt factor: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
550    Marq = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%.2f'%(data['Marquardt']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
551    Marq.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnMarquardt)
552    Marq.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnMarquardt)
553    LSSizer.Add(Marq,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
554    LSSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Matrix band width: '),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
555    Band = wx.TextCtrl(self.dataDisplay,-1,value='%d'%(data['bandWidth']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
556    Band.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnBandWidth)
557    Band.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnBandWidth)
558    LSSizer.Add(Band,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
559    Restraint = wx.CheckBox(self.dataDisplay,-1,label='Modify restraint weights?')
560    Restraint.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRestraint)
561    Restraint.SetValue(data['restraintWeight'])
562    LSSizer.Add(Restraint,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
563   
564   
565    mainSizer.Add(LSSizer)
566    mainSizer.Add((5,5),0)
567    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Density Map Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
568
569    mainSizer.Add((5,5),0)
570    mainSizer.Add(wx.StaticText(self.dataDisplay,label=' Distance/angle Controls:'),0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
571       
572    mainSizer.Layout()   
573    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
574    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
575    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
576     
577def UpdateComments(self,data):                   
578    self.dataFrame.SetLabel('Comments')
579    self.dataDisplay = wx.TextCtrl(parent=self.dataFrame,size=self.dataFrame.GetClientSize(),
580        style=wx.TE_MULTILINE|wx.TE_PROCESS_ENTER | wx.TE_DONTWRAP)
581    for line in data:
582        if line[-1] == '\n':
583            self.dataDisplay.AppendText(line)
584        else:
585            self.dataDisplay.AppendText(line+'\n')
586             
587def UpdateHKLControls(self,data):
588   
589    def OnScaleSlider(event):
590        scale = int(scaleSel.GetValue())/1000.
591        scaleSel.SetValue(int(scale*1000.))
592        data['Scale'] = scale*10.
593        G2plt.PlotSngl(self)
594       
595    def OnLayerSlider(event):
596        layer = layerSel.GetValue()
597        data['Layer'] = layer
598        G2plt.PlotSngl(self)
599       
600    def OnSelZone(event):
601        data['Zone'] = zoneSel.GetValue()
602        G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
603       
604    def OnSelType(event):
605        data['Type'] = typeSel.GetValue()
606        G2plt.PlotSngl(self)
607       
608    def SetStatusLine():
609        Status.SetStatusText("look at me!!!")
610                                     
611    if self.dataDisplay:
612        self.dataDisplay.Destroy()
613    if not self.dataFrame.GetStatusBar():
614        Status = self.dataFrame.CreateStatusBar()
615    SetStatusLine()
616    zones = ['100','010','001']
617    HKLmax = data['HKLmax']
618    HKLmin = data['HKLmin']
619    if data['ifFc']:
620        typeChoices = ['Fosq','Fo','|DFsq|/sig','|DFsq|>sig','|DFsq|>3sig']
621    else:
622        typeChoices = ['Fosq','Fo']
623    self.dataDisplay = wx.Panel(self.dataFrame)
624    self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
625    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
626    mainSizer.Add((5,10),0)
627   
628    scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
629    scaleSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Scale'),0,
630        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
631    scaleSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=1000,minValue=100,
632        style=wx.SL_HORIZONTAL,value=int(data['Scale']*100))
633    scaleSizer.Add(scaleSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
634    scaleSel.SetLineSize(100)
635    scaleSel.SetPageSize(900)
636    scaleSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnScaleSlider)
637    mainSizer.Add(scaleSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
638   
639    zoneSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
640    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Zone  '),0,
641        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
642    zoneSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Zone'],choices=['100','010','001'],
643        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
644    zoneSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelZone)
645    zoneSizer.Add(zoneSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
646    zoneSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Plot type  '),0,
647        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)       
648    typeSel = wx.ComboBox(parent=self.dataDisplay,value=data['Type'],choices=typeChoices,
649        style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
650    typeSel.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnSelType)
651    zoneSizer.Add(typeSel,0,wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
652    zoneSizer.Add((10,0),0)   
653    mainSizer.Add(zoneSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
654       
655    izone = zones.index(data['Zone'])
656    layerSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
657    layerSizer.Add(wx.StaticText(parent=self.dataDisplay,label=' Layer'),0,
658        wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL|wx.EXPAND)
659    layerSel = wx.Slider(parent=self.dataDisplay,maxValue=HKLmax[izone],minValue=HKLmin[izone],
660        style=wx.SL_HORIZONTAL|wx.SL_AUTOTICKS|wx.SL_LABELS,value=0)
661    layerSel.SetLineSize(1)
662    layerSel.SetLineSize(5)
663    layerSel.Bind(wx.EVT_SLIDER, OnLayerSlider)   
664    layerSizer.Add(layerSel,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT|wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL)
665    layerSizer.Add((10,0),0)   
666    mainSizer.Add(layerSizer,1,wx.EXPAND|wx.RIGHT)
667
668       
669    mainSizer.Layout()   
670    self.dataDisplay.SetSizer(mainSizer)
671    self.dataDisplay.SetSize(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
672    self.dataFrame.setSizePosLeft(mainSizer.Fit(self.dataFrame))
673       
674                         
675def GetPatternTreeItemId(self, parentId, itemText):
676    item, cookie = self.PatternTree.GetFirstChild(parentId)
677    while item:
678        if self.PatternTree.GetItemText(item) == itemText:
679            return item
680        item, cookie = self.PatternTree.GetNextChild(parentId, cookie)
681    return 0               
682
683def MovePatternTreeToGrid(self,item):
684   
685#    print self.PatternTree.GetItemText(item)
686   
687    oldPage = 0
688    if self.dataFrame:
689        self.dataFrame.SetMenuBar(self.dataFrame.BlankMenu)
690        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Comments':
691            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
692            self.dataDisplay.Clear() 
693            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Comments')
694            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
695        if self.dataFrame.GetLabel() == 'Notebook':
696            data = [self.dataDisplay.GetValue()]
697            self.dataDisplay.Clear() 
698            Id = GetPatternTreeItemId(self,self.root, 'Notebook')
699            if Id: self.PatternTree.SetItemPyData(Id,data)
700        if 'Phase Data for' in self.dataFrame.GetLabel():
701            if self.dataDisplay: 
702                oldPage = self.dataDisplay.GetSelection()
703        self.dataFrame.Clear()
704        self.dataFrame.SetLabel('')
705    else:
706        self.dataFrame = DataFrame(parent=self.mainPanel)
707
708    self.dataFrame.Raise()           
709    self.PickId = 0
710    parentID = self.root
711    self.ExportPattern.Enable(False)
712    if item != self.root:
713        parentID = self.PatternTree.GetItemParent(item)
714    if self.PatternTree.GetItemParent(item) == self.root:
715        self.PatternId = item
716        self.PickId = item
717        if self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Notebook':
718            self.PatternId = 0
719            self.ExportPattern.Enable(False)
720            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
721            UpdateNotebook(self,data)
722        elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Controls':
723            self.PatternId = 0
724            self.ExportPattern.Enable(False)
725            data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
726            if data == [0] or data == {}:           #fill in defaults
727                data = {
728                    #least squares controls
729                    'Ncycles':3,'maxShift':2.0,'bandWidth':0,'Marquardt':1.0,'restraintWeight':False,
730                    'minSumShftESD':0.01,
731                    #Fourier controls
732                    'mapType':'Fobs','d-max':100.,'d-min':0.2,'histograms':[],
733                    'stepSize':[0.5,0.5,0.5],'minX':[0.,0.,0.],'maxX':[1.0,1.0,1.0],
734                    #distance/angle controls
735                    'distMax':0.0,'angleMax':0.0,'useMapPeaks':False}
736                self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
737            self.Refine.Enable(True)
738            UpdateControls(self,data)
739        elif 'IMG' in self.PatternTree.GetItemText(item):
740            self.Image = item
741            G2plt.PlotImage(self,newPlot=True)
742        elif 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(item):
743            G2plt.PlotPowderLines(self)
744        elif 'PWDR' in self.PatternTree.GetItemText(item):
745            self.ExportPattern.Enable(True)
746            G2plt.PlotPatterns(self,newPlot=True)
747        elif 'HKLF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
748            self.Sngl = item
749            G2plt.PlotSngl(self,newPlot=True)
750        elif 'PDF' in self.PatternTree.GetItemText(item):
751            self.PatternId = item
752            self.ExportPDF.Enable(True)
753            G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
754           
755    elif 'I(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
756        self.PickId = item
757        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
758        G2plt.PlotISFG(self,type='I(Q)',newPlot=True)
759    elif 'S(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
760        self.PickId = item
761        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
762        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)',newPlot=True)
763    elif 'F(Q)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
764        self.PickId = item
765        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
766        G2plt.PlotISFG(self,type='F(Q)',newPlot=True)
767    elif 'G(R)' in self.PatternTree.GetItemText(item):
768        self.PickId = item
769        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
770        G2plt.PlotISFG(self,type='G(R)',newPlot=True)           
771    elif self.PatternTree.GetItemText(parentID) == 'Phases':
772        self.PickId = item
773        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)           
774        G2phG.UpdatePhaseData(self,item,data,oldPage)
775    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Comments':
776        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
777        self.PickId = item
778        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
779        UpdateComments(self,data)
780    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Image Controls':
781        self.dataFrame.SetTitle('Image Controls')
782        self.PickId = item
783        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
784        masks = self.PatternTree.GetItemPyData(
785            GetPatternTreeItemId(self,self.Image, 'Masks'))
786        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
787        G2imG.UpdateImageControls(self,data,masks)
788        G2plt.PlotImage(self)
789    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Masks':
790        self.dataFrame.SetTitle('Masks')
791        self.PickId = item
792        self.Image = self.PatternTree.GetItemParent(item)
793        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
794        G2imG.UpdateMasks(self,data)
795        G2plt.PlotImage(self)
796    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'HKL Plot Controls':
797        self.PickId = item
798        self.Sngl = self.PatternTree.GetItemParent(item)
799        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
800        UpdateHKLControls(self,data)
801        G2plt.PlotSngl(self)
802    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'PDF Controls':
803        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
804        self.ExportPDF.Enable(True)
805        self.PickId = item
806        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
807        G2pdG.UpdatePDFGrid(self,data)
808        G2plt.PlotISFG(self,type='S(Q)')
809    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Peak List':
810        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
811        self.ExportPeakList.Enable(True)
812        self.PickId = item
813        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
814        G2pdG.UpdatePeakGrid(self,data)
815        G2plt.PlotPatterns(self)
816    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Background':
817        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
818        self.PickId = item
819        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
820        G2pdG.UpdateBackgroundGrid(self,data)
821        G2plt.PlotPatterns(self)
822    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Limits':
823        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
824        self.PickId = item
825        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
826        G2pdG.UpdateLimitsGrid(self,data)
827        G2plt.PlotPatterns(self)
828    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Instrument Parameters':
829        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
830        self.PickId = item
831        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
832        G2pdG.UpdateInstrumentGrid(self,data)
833        G2plt.PlotPeakWidths(self)
834    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Sample Parameters':
835        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
836        self.PickId = item
837        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
838
839        if 'Temperature' not in data:           #temp fix for old gpx files
840            data = {'Scale':[1.0,True],'Type':'Debye-Scherrer','Absorption':[0.0,False],'DisplaceX':[0.0,False],
841                'DisplaceY':[0.0,False],'Diffuse':[],'Temperature':300.,'Pressure':1.0,'Humidity':0.0,'Voltage':0.0,'Force':0.0}
842            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)
843   
844        G2pdG.UpdateSampleGrid(self,data)
845        G2plt.PlotPatterns(self)
846    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Index Peak List':
847        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
848        self.ExportPeakList.Enable(True)
849        self.PickId = item
850        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
851        G2pdG.UpdateIndexPeaksGrid(self,data)
852        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
853            G2plt.PlotPowderLines(self)
854        else:
855            G2plt.PlotPatterns(self)
856    elif self.PatternTree.GetItemText(item) == 'Unit Cells List':
857        self.PatternId = self.PatternTree.GetItemParent(item)
858        self.PickId = item
859        data = self.PatternTree.GetItemPyData(item)
860        if not data:
861            data.append([0,0.1,4,25.0,0,'P1',1,1,1,90,90,90]) #zero error flag, max zero error, max Nc/No, start volume
862            data.append([0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0])      #Bravais lattice flags
863            data.append([])                                 #empty cell list
864            data.append([])                                 #empty dmin
865            self.PatternTree.SetItemPyData(item,data)                             
866        G2pdG.UpdateUnitCellsGrid(self,data)
867        if 'PKS' in self.PatternTree.GetItemText(self.PatternId):
868            G2plt.PlotPowderLines(self)
869        else:
870            G2plt.PlotPatterns(self)
871     
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.