source: trunk/GSASIIddataGUI.py @ 1799

Last change on this file since 1799 was 1799, checked in by vondreele, 8 years ago

trap missing data error
numpy array sph.harm. texture fit function & derivative routines - speedier
change pole figure titles
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Date Author Revision URL Id
File size: 38.4 KB
Line 
1# -*- coding: utf-8 -*-
2#GSASII - phase data display routines
3########### SVN repository information ###################
4# $Date: 2015-04-20 21:05:49 +0000 (Mon, 20 Apr 2015) $
5# $Author: vondreele $
6# $Revision: 1799 $
7# $URL: trunk/GSASIIddataGUI.py $
8# $Id: GSASIIddataGUI.py 1799 2015-04-20 21:05:49Z vondreele $
9########### SVN repository information ###################
10'''
11*GSASIIddataGUI: Phase Diffraction Data GUI*
12--------------------------------------------
13
14Module to create the GUI for display of diffraction data * phase
15information that is shown in the data display window
16(when a phase is selected.)
17
18'''
19import wx
20import math
21import copy
22import time
23import sys
24import GSASIIpath
25GSASIIpath.SetVersionNumber("$Revision: 1799 $")
26import GSASIIlattice as G2lat
27import GSASIIspc as G2spc
28import GSASIIElem as G2elem
29import GSASIIElemGUI as G2elemGUI
30import GSASIIplot as G2plt
31import GSASIIgrid as G2gd
32import GSASIIIO as G2IO
33import GSASIImath as G2mth
34import GSASIIpwd as G2pwd
35import GSASIIphsGUI as G2phsGUI
36import GSASIIctrls as G2G
37import numpy as np
38
39WACV = wx.ALIGN_CENTER_VERTICAL
40VERY_LIGHT_GREY = wx.Colour(235,235,235)
41WHITE = wx.Colour(255,255,255)
42BLACK = wx.Colour(0,0,0)
43mapDefault = {'MapType':'','RefList':'','Resolution':0.5,'Show bonds':True,
44                'rho':[],'rhoMax':0.,'mapSize':10.0,'cutOff':50.,'Flip':False}
45
46################################################################################
47##### DData routines
48################################################################################       
49def UpdateDData(G2frame,DData,data,hist=''):
50    '''Display the Diffraction Data associated with a phase
51    (items where there is a value for each histogram and phase)
52
53    :param wx.frame G2frame: the main GSAS-II frame object
54
55    :param wx.ScrolledWindow DData: notebook page to be used for the display
56
57    :param dict data: all the information on the phase in a dictionary
58
59    '''
60    G2frame.dataFrame.SetStatusText('')
61    keyList = G2frame.GetHistogramNames(['PWDR','HKLF'])
62    UseList = data['Histograms']
63    if UseList:
64        G2frame.dataFrame.DataMenu.Enable(G2gd.wxID_DATADELETE,True)
65        for item in G2frame.Refine: item.Enable(True)
66    else:
67        G2frame.dataFrame.DataMenu.Enable(G2gd.wxID_DATADELETE,False)
68        for item in G2frame.Refine: item.Enable(False)
69    generalData = data['General']
70    PhaseName = generalData['Name']       
71    SGData = generalData['SGData']
72    if not hist and len(keyList):
73        hist = keyList[0]
74    PWDR = any(['PWDR' in item for item in keyList])
75    Indx = {}
76   
77    def PlotSizer():
78
79        def OnPlotSel(event):
80            Obj = event.GetEventObject()
81            generalData['Data plot type'] = Obj.GetStringSelection()
82            G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
83            wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
84           
85        def OnPOhkl(event):
86            Obj = event.GetEventObject()
87            Saxis = Obj.GetValue().split()
88            try:
89                hkl = [int(Saxis[i]) for i in range(3)]
90            except (ValueError,IndexError):
91                hkl = generalData['POhkl']
92            if not np.any(np.array(hkl)):
93                hkl = generalData['POhkl']
94            generalData['POhkl'] = hkl
95            h,k,l = hkl
96            Obj.SetValue('%3d %3d %3d'%(h,k,l)) 
97            G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
98       
99        plotSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
100        choice = ['None','Mustrain','Size','Preferred orientation']
101        plotSel = wx.RadioBox(DData,-1,'Select plot type:',choices=choice,
102            majorDimension=1,style=wx.RA_SPECIFY_COLS)
103        plotSel.SetStringSelection(generalData['Data plot type'])
104        plotSel.Bind(wx.EVT_RADIOBOX,OnPlotSel)   
105        plotSizer.Add(plotSel)
106        if generalData['Data plot type'] == 'Preferred orientation':
107            POhklSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
108            POhklSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Plot preferred orientation for H K L: '),0,WACV)
109            h,k,l = generalData['POhkl']
110            poAxis = wx.TextCtrl(DData,-1,'%3d %3d %3d'%(h,k,l),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
111            poAxis.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnPOhkl)
112            poAxis.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnPOhkl)
113            POhklSizer.Add(poAxis,0,WACV)
114            plotSizer.Add(POhklSizer)           
115        return plotSizer
116       
117    def ScaleSizer():
118       
119        def OnScaleRef(event):
120            Obj = event.GetEventObject()
121            UseList[hist]['Scale'][1] = Obj.GetValue()
122           
123        def OnScaleVal(event):
124            Obj = event.GetEventObject()
125            try:
126                scale = float(Obj.GetValue())
127                if scale > 0:
128                    UseList[hist]['Scale'][0] = scale
129            except ValueError:
130                pass
131            Obj.SetValue("%.4f"%(UseList[hist]['Scale'][0]))          #reset in case of error
132                       
133        scaleSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
134        if 'PWDR' in hist:
135            scaleRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' Phase fraction: ')
136        elif 'HKLF' in hist:
137            scaleRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' Scale factor: ')               
138        scaleRef.SetValue(UseList[hist]['Scale'][1])
139        scaleRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnScaleRef)
140        scaleSizer.Add(scaleRef,0,WACV)
141        scaleVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
142            '%.4f'%(UseList[hist]['Scale'][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
143        scaleVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnScaleVal)
144        scaleVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnScaleVal)
145        scaleSizer.Add(scaleVal,0,WACV)
146        return scaleSizer
147       
148    def OnUseData(event):
149        Obj = event.GetEventObject()
150        UseList[hist]['Use'] = Obj.GetValue()
151       
152    def OnLGmixRef(event):
153        Obj = event.GetEventObject()
154        hist,name = Indx[Obj.GetId()]
155        UseList[hist][name][2][2] = Obj.GetValue()
156       
157    def OnLGmixVal(event):
158        Obj = event.GetEventObject()
159        hist,name = Indx[Obj.GetId()]
160        try:
161            value = float(Obj.GetValue())
162            if 0 <= value <= 1:
163                UseList[hist][name][1][2] = value
164            else:
165                raise ValueError
166        except ValueError:
167            pass
168        Obj.SetValue("%.4f"%(UseList[hist][name][1][2]))          #reset in case of error
169
170    def OnSizeType(event):
171        Obj = event.GetEventObject()
172        UseList[hist]['Size'][0] = Obj.GetValue()
173        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
174        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
175       
176    def OnSizeRef(event):
177        Obj = event.GetEventObject()
178        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
179        if UseList[hist]['Size'][0] == 'ellipsoidal':
180            UseList[hist]['Size'][5][pid] = Obj.GetValue()               
181        else:
182            UseList[hist]['Size'][2][pid] = Obj.GetValue()
183       
184    def OnSizeVal(event):
185        Obj = event.GetEventObject()
186        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
187        if UseList[hist]['Size'][0] == 'ellipsoidal':
188            try:
189                size = float(Obj.GetValue())
190                if pid < 3 and size <= 0.001:            #10A lower limit!
191                    raise ValueError
192                UseList[hist]['Size'][4][pid] = size                   
193            except ValueError:
194                pass
195            Obj.SetValue("%.5f"%(UseList[hist]['Size'][4][pid]))          #reset in case of error
196        else:
197            try:
198                size = float(Obj.GetValue())
199                if size <= 0.001:            #10A lower limit!
200                    raise ValueError
201                UseList[hist]['Size'][1][pid] = size
202            except ValueError:
203                pass
204            Obj.SetValue("%.5f"%(UseList[hist]['Size'][1][pid]))          #reset in case of error
205        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
206       
207    def OnSizeAxis(event):           
208        Obj = event.GetEventObject()
209        Saxis = Obj.GetValue().split()
210        try:
211            hkl = [int(Saxis[i]) for i in range(3)]
212        except (ValueError,IndexError):
213            hkl = UseList[hist]['Size'][3]
214        if not np.any(np.array(hkl)):
215            hkl = UseList[hist]['Size'][3]
216        UseList[hist]['Size'][3] = hkl
217        h,k,l = hkl
218        Obj.SetValue('%3d %3d %3d'%(h,k,l)) 
219                   
220    def OnResetSize(event):
221        Obj = event.GetEventObject()
222        Obj.SetValue(False)
223        item,name = Indx[Obj.GetId()]
224        if name == 'isotropic':
225            UseList[item]['Size'][1][0] = 1.0
226        elif name == 'uniaxial':
227            UseList[item]['Size'][1][0] = 1.0
228            UseList[item]['Size'][1][1] = 1.0
229        elif name == 'ellipsoidal':
230            for i in range(3):
231                UseList[item]['Size'][4][i] = 1.0
232                UseList[item]['Size'][4][i+3] = 0.0
233        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,item)
234        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
235           
236    def OnStrainType(event):
237        Obj = event.GetEventObject()
238        UseList[hist]['Mustrain'][0] = Obj.GetValue()
239        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
240        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
241       
242    def OnStrainRef(event):
243        Obj = event.GetEventObject()
244        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
245        if UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'generalized':
246            UseList[hist]['Mustrain'][5][pid] = Obj.GetValue()
247        else:
248            UseList[hist]['Mustrain'][2][pid] = Obj.GetValue()
249       
250    def OnStrainVal(event):
251        Snames = G2spc.MustrainNames(SGData)
252        Obj = event.GetEventObject()
253        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
254        try:
255            strain = float(Obj.GetValue())
256            if UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'generalized':
257                if '4' in Snames[pid] and strain < 0:
258                    raise ValueError
259                UseList[hist]['Mustrain'][4][pid] = strain
260            else:
261                if strain <= 0:
262                    raise ValueError
263                UseList[hist]['Mustrain'][1][pid] = strain
264        except ValueError:
265            pass
266        if UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'generalized':
267            Obj.SetValue("%.3f"%(UseList[hist]['Mustrain'][4][pid]))          #reset in case of error
268        else:
269            Obj.SetValue("%.1f"%(UseList[hist]['Mustrain'][1][pid]))          #reset in case of error
270        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
271       
272    def OnStrainAxis(event):
273        Obj = event.GetEventObject()
274        Saxis = Obj.GetValue().split()
275        try:
276            hkl = [int(Saxis[i]) for i in range(3)]
277        except (ValueError,IndexError):
278            hkl = UseList[hist]['Mustrain'][3]
279        if not np.any(np.array(hkl)):
280            hkl = UseList[hist]['Mustrain'][3]
281        UseList[hist]['Mustrain'][3] = hkl
282        h,k,l = hkl
283        Obj.SetValue('%3d %3d %3d'%(h,k,l)) 
284        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
285       
286    def OnResetStrain(event):
287        Obj = event.GetEventObject()
288        Obj.SetValue(False)
289        item,name = Indx[Obj.GetId()]
290        if name == 'isotropic':
291            UseList[item]['Mustrain'][1][0] = 1000.0
292        elif name == 'uniaxial':
293            UseList[item]['Mustrain'][1][0] = 1000.0
294            UseList[item]['Mustrain'][1][1] = 1000.0
295        elif name == 'generalized':
296            muiso = 1000.
297            cell = generalData['Cell'][1:7]
298            vals = G2spc.Muiso2Shkl(muiso,SGData,cell)
299            nTerm = len(UseList[item]['Mustrain'][4])
300            for i in range(nTerm):
301                UseList[item]['Mustrain'][4][i] = vals[i]
302        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,item)
303        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
304           
305    def OnHstrainRef(event):
306        Obj = event.GetEventObject()
307        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
308        UseList[hist]['HStrain'][1][pid] = Obj.GetValue()
309       
310    def OnHstrainVal(event):
311        Snames = G2spc.HStrainNames(SGData)
312        Obj = event.GetEventObject()
313        hist,pid = Indx[Obj.GetId()]
314        try:
315            strain = float(Obj.GetValue())
316            UseList[hist]['HStrain'][0][pid] = strain
317        except ValueError:
318            pass
319        Obj.SetValue("%.3g"%(UseList[hist]['HStrain'][0][pid]))          #reset in case of error
320
321    def OnPOVal(event):
322        Obj = event.GetEventObject()
323        try:
324            mdVal = float(Obj.GetValue())
325            if mdVal > 0:
326                UseList[hist]['Pref.Ori.'][1] = mdVal
327        except ValueError:
328            pass
329        Obj.SetValue("%.3f"%(UseList[hist]['Pref.Ori.'][1]))          #reset in case of error
330       
331    def OnPOAxis(event):
332        Obj = event.GetEventObject()
333        Saxis = Obj.GetValue().split()
334        try:
335            hkl = [int(Saxis[i]) for i in range(3)]
336        except (ValueError,IndexError):
337            hkl = UseList[hist]['Pref.Ori.'][3]
338        if not np.any(np.array(hkl)):
339            hkl = UseList[hist]['Pref.Ori.'][3]
340        UseList[hist]['Pref.Ori.'][3] = hkl
341        h,k,l = hkl
342        Obj.SetValue('%3d %3d %3d'%(h,k,l)) 
343       
344    def OnPOOrder(event):
345        Obj = event.GetEventObject()
346        Order = int(Obj.GetValue())
347        UseList[hist]['Pref.Ori.'][4] = Order
348        UseList[hist]['Pref.Ori.'][5] = SetPOCoef(Order,hist)
349        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
350
351    def OnPOType(event):
352        Obj = event.GetEventObject()
353        if 'March' in Obj.GetValue():
354            UseList[hist]['Pref.Ori.'][0] = 'MD'
355        else:
356            UseList[hist]['Pref.Ori.'][0] = 'SH'
357        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
358
359    def OnPORef(event):
360        Obj = event.GetEventObject()
361        UseList[hist]['Pref.Ori.'][2] = Obj.GetValue()
362           
363    def SetPOCoef(Order,hist):
364        cofNames = G2lat.GenSHCoeff(SGData['SGLaue'],'0',Order,False)     #cylindrical & no M
365        newPOCoef = dict(zip(cofNames,np.zeros(len(cofNames))))
366        POCoeff = UseList[hist]['Pref.Ori.'][5]
367        for cofName in POCoeff:
368            if cofName in  cofNames:
369                newPOCoef[cofName] = POCoeff[cofName]
370        return newPOCoef
371       
372    def OnExtRef(event):
373        Obj = event.GetEventObject()
374        UseList[hist]['Extinction'][1] = Obj.GetValue()
375       
376    def OnExtVal(event):
377        Obj = event.GetEventObject()
378        try:
379            ext = float(Obj.GetValue())
380            if ext >= 0:
381                UseList[hist]['Extinction'][0] = ext
382        except ValueError:
383            pass
384        Obj.SetValue("%.2f"%(UseList[hist]['Extinction'][0]))
385
386    def OnBabRef(event):
387        Obj = event.GetEventObject()
388        item,bab = Indx[Obj.GetId()]
389        UseList[item]['Babinet']['Bab'+bab][1] = Obj.GetValue()
390       
391    def OnBabVal(event):
392        Obj = event.GetEventObject()
393        item,bab = Indx[Obj.GetId()]
394        try:
395            val = float(Obj.GetValue())
396            if val >= 0:
397                UseList[item]['Babinet']['Bab'+bab][0] = val
398        except ValueError:
399            pass
400        Obj.SetValue("%.3f"%(UseList[item]['Babinet']['Bab'+bab][0]))
401
402    def OnTbarVal(event):
403        Obj = event.GetEventObject()
404        try:
405            tbar = float(Obj.GetValue())
406            if tbar > 0:
407                UseList[hist]['Extinction'][2]['Tbar'] = tbar
408        except ValueError:
409            pass
410        Obj.SetValue("%.3f"%(UseList[hist]['Extinction'][2]['Tbar']))
411
412    def OnCos2TM(event):
413        Obj = event.GetEventObject()
414        try:
415            val = float(Obj.GetValue())
416            if 0. < val <= 1.:
417                UseList[hist]['Extinction'][2]['Cos2TM'] = val
418        except ValueError:
419            pass
420        Obj.SetValue("%.3f"%(UseList[hist]['Extinction'][2]['Cos2TM']))
421       
422    def OnEval(event):
423        Obj = event.GetEventObject()
424        item = Indx[Obj.GetId()]
425        try:
426            val = float(Obj.GetValue())
427            if val > 0:
428                UseList[item[0]]['Extinction'][2][item[1]][0] = val
429        except ValueError:
430            pass
431        Obj.SetValue("%10.3e"%(UseList[item[0]]['Extinction'][2][item[1]][0]))
432       
433    def OnEref(event):
434        Obj = event.GetEventObject()
435        item = Indx[Obj.GetId()]
436        UseList[item[0]]['Extinction'][2][item[1]][1] = Obj.GetValue()
437
438    def OnSCExtType(event):
439        Obj = event.GetEventObject()
440        item = Indx[Obj.GetId()]
441        UseList[item[0]]['Extinction'][item[1]] = Obj.GetValue()
442        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
443           
444    def checkAxis(axis):
445        if not np.any(np.array(axis)):
446            return False
447        return axis
448       
449    def TopSizer(name,choices,parm,OnType):
450        topSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
451        topSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,name),0,WACV)
452        sizeType = wx.ComboBox(DData,wx.ID_ANY,value=UseList[hist][parm][0],choices=choices,
453            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
454        sizeType.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnType)
455        topSizer.Add(sizeType)
456        topSizer.Add((5,0),0)
457        return topSizer
458       
459    def LGmixSizer(name,OnVal,OnRef):
460        lgmixSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
461        lgmixRef = wx.CheckBox(DData,-1,label='LGmix')
462        lgmixRef.thisown = False
463        lgmixRef.SetValue(UseList[hist][name][2][2])
464        Indx[lgmixRef.GetId()] = [hist,name]
465        lgmixRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRef)
466        lgmixSizer.Add(lgmixRef,0,WACV)
467        lgmixVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
468            '%.4f'%(UseList[hist][name][1][2]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
469        Indx[lgmixVal.GetId()] = [hist,name]
470        lgmixVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnVal)
471        lgmixVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnVal)
472        lgmixSizer.Add(lgmixVal,0,WACV)
473        return lgmixSizer
474                   
475    def ResetSizer(name,OnReset):
476        resetSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
477        resetSizer.Add((5,0),0)
478        reset = wx.CheckBox(DData,-1,label='Reset?')
479        reset.thisown = False
480        reset.SetValue(False)
481        Indx[reset.GetId()] = [hist,name]
482        reset.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnReset)
483        resetSizer.Add(reset,0,WACV)
484        return resetSizer
485       
486    def IsoSizer(name,parm,fmt,OnVal,OnRef):
487        isoSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
488        sizeRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=name)
489        sizeRef.thisown = False
490        sizeRef.SetValue(UseList[hist][parm][2][0])
491        Indx[sizeRef.GetId()] = [hist,0]
492        sizeRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRef)
493        isoSizer.Add(sizeRef,0,WACV)
494        sizeVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
495            fmt%(UseList[hist][parm][1][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
496        Indx[sizeVal.GetId()] = [hist,0]
497        sizeVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnVal)
498        sizeVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnVal)
499        isoSizer.Add(sizeVal,0,WACV)
500        return isoSizer
501       
502    def UniSizer(parm,OnAxis):
503        uniSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
504        uniSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Unique axis, H K L: '),0,WACV)
505        h,k,l = UseList[hist][parm][3]
506        Axis = wx.TextCtrl(DData,-1,'%3d %3d %3d'%(h,k,l),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
507        Axis.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnAxis)
508        Axis.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnAxis)
509        uniSizer.Add(Axis,0,WACV)
510        return uniSizer
511       
512    def UniDataSizer(parmName,parm,fmt,OnVal,OnRef):
513        dataSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
514        parms = zip([' Equatorial '+parmName,' Axial '+parmName],
515            UseList[hist][parm][1],UseList[hist][parm][2],range(2))
516        for Pa,val,ref,id in parms:
517            sizeRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=Pa)
518            sizeRef.thisown = False
519            sizeRef.SetValue(ref)
520            Indx[sizeRef.GetId()] = [hist,id]
521            sizeRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnRef)
522            dataSizer.Add(sizeRef,0,WACV)
523            sizeVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,fmt%(val),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
524            Indx[sizeVal.GetId()] = [hist,id]
525            sizeVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnVal)
526            sizeVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnVal)
527            dataSizer.Add(sizeVal,0,WACV)
528            dataSizer.Add((5,0),0)
529        return dataSizer
530       
531    def EllSizeDataSizer():
532        parms = zip(['S11','S22','S33','S12','S13','S23'],UseList[hist]['Size'][4],
533            UseList[hist]['Size'][5],range(6))
534        dataSizer = wx.FlexGridSizer(0,6,5,5)
535        for Pa,val,ref,id in parms:
536            sizeRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=Pa)
537            sizeRef.thisown = False
538            sizeRef.SetValue(ref)
539            Indx[sizeRef.GetId()] = [hist,id]
540            sizeRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnSizeRef)
541            dataSizer.Add(sizeRef,0,WACV)
542            sizeVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,'%.3f'%(val),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
543            Indx[sizeVal.GetId()] = [hist,id]
544            sizeVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnSizeVal)
545            sizeVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnSizeVal)
546            dataSizer.Add(sizeVal,0,WACV)
547        return dataSizer
548       
549    def GenStrainDataSizer():
550        Snames = G2spc.MustrainNames(SGData)
551        numb = len(Snames)
552        if len(UseList[hist]['Mustrain'][4]) < numb:
553            UseList[hist]['Mustrain'][4] = numb*[0.0,]
554            UseList[hist]['Mustrain'][5] = numb*[False,]
555        parms = zip(Snames,UseList[hist]['Mustrain'][4],UseList[hist]['Mustrain'][5],range(numb))
556        dataSizer = wx.FlexGridSizer(0,6,5,5)
557        for Pa,val,ref,id in parms:
558            strainRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=Pa)
559            strainRef.thisown = False
560            strainRef.SetValue(ref)
561            Indx[strainRef.GetId()] = [hist,id]
562            strainRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnStrainRef)
563            dataSizer.Add(strainRef,0,WACV)
564            strainVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,'%.5f'%(val),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
565            Indx[strainVal.GetId()] = [hist,id]
566            strainVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnStrainVal)
567            strainVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnStrainVal)
568            dataSizer.Add(strainVal,0,WACV)
569        return dataSizer
570
571    def HstrainSizer():
572        hstrainSizer = wx.FlexGridSizer(0,6,5,5)
573        Hsnames = G2spc.HStrainNames(SGData)
574        parms = zip(Hsnames,UseList[hist]['HStrain'][0],UseList[hist]['HStrain'][1],range(len(Hsnames)))
575        for Pa,val,ref,id in parms:
576            hstrainRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=Pa)
577            hstrainRef.thisown = False
578            hstrainRef.SetValue(ref)
579            Indx[hstrainRef.GetId()] = [hist,id]
580            hstrainRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnHstrainRef)
581            hstrainSizer.Add(hstrainRef,0,WACV)
582            hstrainVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,'%.3g'%(val),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
583            Indx[hstrainVal.GetId()] = [hist,id]
584            hstrainVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnHstrainVal)
585            hstrainVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnHstrainVal)
586            hstrainSizer.Add(hstrainVal,0,WACV)
587        return hstrainSizer
588       
589    def PoTopSizer(POData):
590        poSizer = wx.FlexGridSizer(0,6,5,5)
591        choice = ['March-Dollase','Spherical harmonics']
592        POtype = choice[['MD','SH'].index(POData[0])]
593        poSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Preferred orientation model '),0,WACV)
594        POType = wx.ComboBox(DData,wx.ID_ANY,value=POtype,choices=choice,
595            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
596        POType.Bind(wx.EVT_COMBOBOX, OnPOType)
597        poSizer.Add(POType)
598        if POData[0] == 'SH':
599            poSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Harmonic order: '),0,WACV)
600            poOrder = wx.ComboBox(DData,wx.ID_ANY,value=str(POData[4]),choices=[str(2*i) for i in range(18)],
601                style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
602            poOrder.Bind(wx.EVT_COMBOBOX,OnPOOrder)
603            poSizer.Add(poOrder,0,WACV)
604            poRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' Refine? ')
605            poRef.SetValue(POData[2])
606            poRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnPORef)
607            poSizer.Add(poRef,0,WACV)
608        return poSizer
609       
610    def MDDataSizer(POData):
611        poSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
612        poRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' March-Dollase ratio: ')
613        poRef.SetValue(POData[2])
614        poRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX,OnPORef)
615        poSizer.Add(poRef,0,WACV)
616        poVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
617            '%.3f'%(POData[1]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
618        poVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnPOVal)
619        poVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnPOVal)
620        poSizer.Add(poVal,0,WACV)
621        poSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Unique axis, H K L: '),0,WACV)
622        h,k,l =POData[3]
623        poAxis = wx.TextCtrl(DData,-1,'%3d %3d %3d'%(h,k,l),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
624        poAxis.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnPOAxis)
625        poAxis.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnPOAxis)
626        poSizer.Add(poAxis,0,WACV)
627        return poSizer
628       
629    def SHDataSizer(POData):
630       
631        def OnODFValue(event):
632            Obj = event.GetEventObject()
633            odf = ODFIndx[Obj.GetId()]
634            try:
635                value = float(Obj.GetValue())
636                POData[5][odf] = value
637            except ValueError:
638                pass
639            Obj.SetValue('%8.3f'%(POData[5][odf]))
640            G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
641   
642        textJ = G2lat.textureIndex(POData[5])
643        mainSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Spherical harmonic coefficients: '+'Texture index: %.3f'%(textJ)),0,WACV)
644        mainSizer.Add((0,5),0)
645        ODFSizer = wx.FlexGridSizer(0,8,2,2)
646        ODFIndx = {}
647        ODFkeys = POData[5].keys()
648        ODFkeys.sort()
649        for odf in ODFkeys:
650            ODFSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,odf),0,WACV)
651            ODFval = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,'%8.3f'%(POData[5][odf]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
652            ODFIndx[ODFval.GetId()] = odf
653            ODFval.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnODFValue)
654            ODFval.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnODFValue)
655            ODFSizer.Add(ODFval,0,WACV)
656        return ODFSizer
657       
658    def SHPenalty(POData):
659       
660        def OnHKLList(event):
661            dlg = G2G.G2MultiChoiceDialog(G2frame, 'Select penalty hkls',
662                'Penalty hkls',hkls,filterBox=False)
663            try:
664                if dlg.ShowModal() == wx.ID_OK:
665                    POData[6] = [hkls[i] for i in dlg.GetSelections()]
666                    if not POData[6]:
667                        POData[6] = ['',]
668                else:
669                    return
670            finally:
671                dlg.Destroy()
672            wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data)
673           
674        def OnshToler(event):
675            try:
676                value = float(shToler.GetValue())
677                POData[7] = value
678            except ValueError:
679                pass
680            shToler.SetValue('%.2f'%(POData[7]))
681       
682        A = G2lat.cell2A(generalData['Cell'][1:7])
683        hkls = G2lat.GenPfHKLs(10,SGData,A)   
684        shPenalty = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
685        shPenalty.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Negative MRD penalty list: '),0,WACV)
686        shPenalty.Add(wx.ComboBox(DData,value=POData[6][0],choices=POData[6],
687            style=wx.CB_DROPDOWN),0,WACV)
688        hklList = wx.Button(DData,label='Select penalty hkls')
689        hklList.Bind(wx.EVT_BUTTON,OnHKLList)
690        shPenalty.Add(hklList,0,WACV)
691        shPenalty.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Zero MRD tolerance: '),0,WACV)
692        shToler = wx.TextCtrl(DData,-1,'%.2f'%(POData[7]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
693        shToler.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnshToler)
694        shToler.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnshToler)
695        shPenalty.Add(shToler,0,WACV)
696        return shPenalty   
697       
698    def ExtSizer():           
699        extSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
700        extRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' Extinction: ')
701        extRef.SetValue(UseList[hist]['Extinction'][1])
702        extRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnExtRef)
703        extSizer.Add(extRef,0,WACV)
704        extVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
705            '%.2f'%(UseList[hist]['Extinction'][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
706        extVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnExtVal)
707        extVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnExtVal)
708        extSizer.Add(extVal,0,WACV)
709        return extSizer
710   
711    def SCExtSizer():
712        extSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
713        typeSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)           
714        typeSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Extinction type: '),0,WACV)
715        Choices = ['None','Primary','Secondary Type I','Secondary Type II','Secondary Type I & II']
716        typeTxt = wx.ComboBox(DData,-1,choices=Choices,value=UseList[hist]['Extinction'][1],
717            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
718        Indx[typeTxt.GetId()] = [hist,1]
719        typeTxt.Bind(wx.EVT_COMBOBOX,OnSCExtType)
720        typeSizer.Add(typeTxt)
721        typeSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Approx: '),0,WACV)
722        Choices=['Lorentzian','Gaussian']
723        approxTxT = wx.ComboBox(DData,-1,choices=Choices,value=UseList[hist]['Extinction'][0],
724            style=wx.CB_READONLY|wx.CB_DROPDOWN)
725        Indx[approxTxT.GetId()] = [hist,0]
726        approxTxT.Bind(wx.EVT_COMBOBOX,OnSCExtType)
727        typeSizer.Add(approxTxT)
728        extSizer.Add(typeSizer,0,WACV)
729        if UseList[hist]['Extinction'][1] != 'None':
730            extSizer.Add((0,5),)
731            if 'Tbar' in UseList[hist]['Extinction'][2]:       #skipped for TOF   
732                valSizer =wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
733                valSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Tbar(mm):'),0,WACV)
734                tbarVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
735                    '%.3f'%(UseList[hist]['Extinction'][2]['Tbar']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
736                tbarVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnTbarVal)
737                tbarVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnTbarVal)
738                valSizer.Add(tbarVal,0,WACV)
739                valSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' cos(2ThM):'),0,WACV)
740                cos2tm = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
741                    '%.3f'%(UseList[hist]['Extinction'][2]['Cos2TM']),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
742                cos2tm.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnCos2TM)
743                cos2tm.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnCos2TM)
744                valSizer.Add(cos2tm,0,WACV)
745                extSizer.Add(valSizer,0,WACV)
746            val2Sizer =wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
747            if 'Primary' in UseList[hist]['Extinction'][1]:
748                Ekey = ['Ep',]
749            elif 'Secondary Type II' == UseList[hist]['Extinction'][1]:
750                Ekey = ['Es',]
751            elif 'Secondary Type I' == UseList[hist]['Extinction'][1]:
752                Ekey = ['Eg',]
753            else:
754                Ekey = ['Eg','Es']
755            for ekey in Ekey:
756                Eref = wx.CheckBox(DData,-1,label=ekey+' : ')
757                Eref.SetValue(UseList[hist]['Extinction'][2][ekey][1])
758                Indx[Eref.GetId()] = [hist,ekey]
759                Eref.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnEref)
760                val2Sizer.Add(Eref,0,WACV)
761                Eval = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
762                    '%10.3e'%(UseList[hist]['Extinction'][2][ekey][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
763                Indx[Eval.GetId()] = [hist,ekey]
764                Eval.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnEval)
765                Eval.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnEval)
766                val2Sizer.Add(Eval,0,WACV)
767
768            extSizer.Add(val2Sizer,0,WACV)
769        return extSizer
770       
771    def BabSizer():
772        babSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
773        for bab in ['A','U']:
774            babRef = wx.CheckBox(DData,-1,label=' Babinet '+bab+': ')
775            babRef.SetValue(UseList[hist]['Babinet']['Bab'+bab][1])
776            Indx[babRef.GetId()] = [hist,bab]
777            babRef.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnBabRef)
778            babSizer.Add(babRef,0,WACV)
779            babVal = wx.TextCtrl(DData,wx.ID_ANY,
780                '%.3f'%(UseList[hist]['Babinet']['Bab'+bab][0]),style=wx.TE_PROCESS_ENTER)
781            Indx[babVal.GetId()] = [hist,bab]
782            babVal.Bind(wx.EVT_TEXT_ENTER,OnBabVal)
783            babVal.Bind(wx.EVT_KILL_FOCUS,OnBabVal)
784            babSizer.Add(babVal,0,WACV)
785            babSizer.Add((5,5),0)
786        return babSizer
787       
788    def OnSelect(event):
789        hist = keyList[select.GetSelection()]
790        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
791        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data,hist)
792       
793    def OnSelSpin(event):
794        hist = keyList[selSpin.GetValue()]
795        selSpin.Destroy() # remove button to discourage pressing too fast
796        G2plt.PlotSizeStrainPO(G2frame,data,hist)
797        wx.CallLater(100,UpdateDData,G2frame,DData,data,hist)
798       
799    DData.DestroyChildren()
800    if DData.GetSizer():
801        DData.GetSizer().Clear(True)
802    if not UseList:
803        return 
804    mainSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
805    mainSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Histogram data for '+PhaseName+':'),0,WACV)
806    DData.G2hist = hist         #so can be used in G2phsGUI for Copy, etc.
807    if hist != '':
808        topSizer = wx.FlexGridSizer(1,2,5,5)
809        selSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)   
810        selSpin = wx.SpinButton(DData,size=(20,100),style=wx.SP_VERTICAL|wx.SP_WRAP)
811        selSpin.SetValue(keyList.index(hist))
812        selSpin.SetRange(0,len(keyList)-1)
813        selSpin.Bind(wx.EVT_SPIN,OnSelSpin)
814        selSizer.Add(selSpin)
815        select = wx.ListBox(DData,choices=keyList,style=wx.LB_SINGLE,size=(-1,100))
816        select.SetSelection(keyList.index(hist))
817        select.SetFirstItem(keyList.index(hist))
818        select.Bind(wx.EVT_LISTBOX,OnSelect)
819        selSizer.Add(select,0,WACV)
820        topSizer.Add(selSizer)
821        if PWDR:
822            topSizer.Add(PlotSizer())
823        mainSizer.Add(topSizer)       
824       
825        try:
826            histData = UseList[hist]
827        except KeyError:
828            G2frame.ErrorDialog('Missing data error',
829                    hist+' not in GSAS-II data tree')
830            return
831           
832        if 'Use' not in UseList[hist]:      #patch
833            UseList[hist]['Use'] = True
834        if 'Babinet' not in UseList[hist]:
835            UseList[hist]['Babinet'] = {'BabA':[0.0,False],'BabU':[0.0,False]}
836        mainSizer.Add((5,5),0)
837        showSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
838        useData = wx.CheckBox(DData,-1,label='Use Histogram: '+hist+' ?')
839        showSizer.Add(useData,0,WACV)
840        useData.Bind(wx.EVT_CHECKBOX, OnUseData)
841        useData.SetValue(UseList[hist]['Use'])
842        mainSizer.Add((5,5),0)
843        mainSizer.Add(showSizer,0,WACV)
844        mainSizer.Add((0,5),0)
845       
846        mainSizer.Add(ScaleSizer())
847        mainSizer.Add((0,5),0)
848           
849        if hist[:4] == 'PWDR':
850            if UseList[hist]['Size'][0] == 'isotropic':
851                isoSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
852                isoSizer.Add(TopSizer(' Domain size model: ',['isotropic','uniaxial','ellipsoidal'],
853                    'Size',OnSizeType),0,WACV)
854                isoSizer.Add(LGmixSizer('Size',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
855                isoSizer.Add(ResetSizer('isotropic',OnResetSize),0,WACV)
856                mainSizer.Add(isoSizer)
857                mainSizer.Add(IsoSizer(u'size(\xb5m): ','Size','%.5f',
858                    OnSizeVal,OnSizeRef),0,WACV)
859            elif UseList[hist]['Size'][0] == 'uniaxial':
860                uniSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
861                uniSizer.Add(TopSizer(' Domain size model: ',['isotropic','uniaxial','ellipsoidal'],
862                    'Size',OnSizeType),0,WACV)
863                uniSizer.Add(LGmixSizer('Size',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
864                uniSizer.Add(ResetSizer('uniaxial',OnResetSize),0,WACV)
865                mainSizer.Add(UniSizer('Size',OnSizeAxis),0,WACV)
866                mainSizer.Add(uniSizer)
867                mainSizer.Add(UniDataSizer(u'size(\xb5m): ','Size','%.5f',OnSizeVal,OnSizeRef))
868            elif UseList[hist]['Size'][0] == 'ellipsoidal':
869                ellSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
870                ellSizer.Add(TopSizer(' Domain size model: ',['isotropic','uniaxial','ellipsoidal'],
871                    'Size',OnSizeType),0,WACV)
872                ellSizer.Add(LGmixSizer('Size',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
873                ellSizer.Add(ResetSizer('ellipsoidal',OnResetSize),0,WACV)
874                mainSizer.Add(ellSizer)
875                mainSizer.Add(EllSizeDataSizer())
876            mainSizer.Add((0,5),0)                   
877           
878            if UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'isotropic':
879                isoSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
880                isoSizer.Add(TopSizer(' Mustrain model: ',['isotropic','uniaxial','generalized',],
881                    'Mustrain',OnStrainType),0,WACV)
882                isoSizer.Add(LGmixSizer('Mustrain',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
883                isoSizer.Add(ResetSizer('isotropic',OnResetStrain),0,WACV)
884                mainSizer.Add(isoSizer)
885                mainSizer.Add(IsoSizer(' microstrain: ','Mustrain','%.1f',
886                    OnStrainVal,OnStrainRef),0,WACV)                   
887                mainSizer.Add((0,5),0)
888            elif UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'uniaxial':
889                uniSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
890                uniSizer.Add(TopSizer(' Mustrain model: ',['isotropic','uniaxial','generalized',],
891                    'Mustrain',OnStrainType),0,WACV)
892                uniSizer.Add(LGmixSizer('Mustrain',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
893                uniSizer.Add(ResetSizer('uniaxial',OnResetStrain),0,WACV)
894                mainSizer.Add(uniSizer)
895                mainSizer.Add(UniSizer('Mustrain',OnStrainAxis),0,WACV)
896                mainSizer.Add(UniDataSizer('mustrain: ','Mustrain','%.1f',OnStrainVal,OnStrainRef))
897            elif UseList[hist]['Mustrain'][0] == 'generalized':
898                genSizer = wx.BoxSizer(wx.HORIZONTAL)
899                genSizer.Add(TopSizer(' Mustrain model: ',['isotropic','uniaxial','generalized',],
900                    'Mustrain',OnStrainType),0,WACV)
901                genSizer.Add(LGmixSizer('Mustrain',OnLGmixVal,OnLGmixRef))
902                genSizer.Add(ResetSizer('generalized',OnResetStrain),0,WACV)
903                mainSizer.Add(genSizer)
904                mainSizer.Add(GenStrainDataSizer())                       
905            mainSizer.Add((0,5),0)
906           
907            mainSizer.Add(wx.StaticText(DData,-1,' Hydrostatic/elastic strain:'))
908            mainSizer.Add(HstrainSizer())
909               
910            poSizer = wx.BoxSizer(wx.VERTICAL)
911            POData = UseList[hist]['Pref.Ori.']
912# patch - add penalty items
913            if len(POData) < 7:
914                POData.append(['',])
915                POData.append(0.1)
916            if not POData[6]:
917                POData[6] = ['',]
918# end patch
919            poSizer.Add(PoTopSizer(POData))
920            if POData[0] == 'MD':
921                poSizer.Add(MDDataSizer(POData))
922            else:           #'SH'
923                if POData[4]:       #SH order > 0
924                    poSizer.Add(SHDataSizer(POData))
925                    poSizer.Add(SHPenalty(POData))
926                   
927            mainSizer.Add(poSizer)
928            mainSizer.Add((0,5),0)               
929            mainSizer.Add(ExtSizer())
930            mainSizer.Add((0,5),0)
931            mainSizer.Add(BabSizer())
932            mainSizer.Add((0,5),0)
933        elif hist[:4] == 'HKLF':
934            mainSizer.Add((0,5),0)               
935            mainSizer.Add(SCExtSizer())
936            mainSizer.Add((0,5),0)
937            mainSizer.Add(BabSizer())
938            mainSizer.Add((0,5),0)
939            pass
940   
941    mainSizer.Add((5,5),0)
942    G2phsGUI.SetPhaseWindow(G2frame.dataFrame,DData,mainSizer)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.