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Parameter limits tutorial

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Line 
1********************************************************************************
2   General Structure Analysis System-II Crystal Structure Refinement
3              by Robert B. Von Dreele & Brian H. Toby
4                Argonne National Laboratory(C), 2010
5 This product includes software developed by the UChicago Argonne, LLC,
6            as Operator of Argonne National Laboratory.
7                          Please cite:
8   B.H. Toby & R.B. Von Dreele, J. Appl. Cryst. 46, 544-549 (2013)
9********************************************************************************
10 Least squares controls:
11 Refinement type: analytic Hessian
12 Maximum number of cycles: 3
13 Regularize hydrogens (if any): False
14 Initial shift factor: 1.000
15
16 Phases:
17
18 Phase name: CuCr2O4
19=======================================================================================================================================
20
21 X-ray scattering factors:
22   Symbol     fa                                      fb                                      fc
23---------------------------------------------------------------------------------------------------
24 Cu        13.33800   7.16760   5.61580   1.67350   3.58280   0.24700  11.39660  64.81260   1.19100
25 Cr        10.64060   7.35370   3.32400   1.49220   6.10380   0.39200  20.26260  98.73990   1.18320
26 O          3.04850   2.28680   1.54630   0.86700  13.27710   5.70110   0.32390  32.90890   0.25080
27
28 Neutron scattering factors:
29   Symbol   isotope       mass       b       resonant terms
30---------------------------------------------------------------------------------------------------
31 Cu      Nat. Abund.     63.546    0.772
32 Cr      Nat. Abund.     51.996    0.363
33 O       Nat. Abund.     15.999    0.581
34
35 Space Group: F d d d
36 The lattice is centrosymmetric F-centered orthorhombic
37 The Laue symmetry is mmm
38 The lattice point group is mmm
39 Multiplicity of a general site is 32
40 The inversion center is located at 0,0,0
41 
42 The equivalent positions are:
43
44 (0,0,0; 0,1/2,1/2; 1/2,0,1/2; 1/2,1/2,0)+
45
46 ( 1)     X,     Y,     Z
47 ( 2)    -X, 1/4+Y, 1/4+Z
48 ( 3) 1/4+X,    -Y, 1/4+Z
49 ( 4) 3/4-X, 1/4-Y, 1/2+Z
50
51 Atoms:
52   name    type  refine?   x         y         z      frac site sym  mult I/A   Uiso     U11     U22     U33     U12     U13     U23
53---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
54     Cu     Cu     XU   0.12500   0.12500   0.12500   1.000    222    8    I 0.00015                                               
55     Cr     Cr     XU   0.50000   0.50000   0.50000   1.000     -1   16    I 0.00005                                               
56      O      O     XU   0.24576   0.26834   0.26731   1.000      1   32    I-0.00419                                               
57
58 Unit cell: a = 7.71269 b = 8.54329 c = 8.53643 alpha = 90.000 beta = 90.000 gamma = 90.000 volume = 562.480 Refine? True
59
60 Spherical harmonics texture: Order:0
61
62 Phase name: CuO
63=======================================================================================================================================
64
65 X-ray scattering factors:
66   Symbol     fa                                      fb                                      fc
67---------------------------------------------------------------------------------------------------
68 Cu+2      11.81680   7.11181   5.78135   1.14523   3.37484   0.24408   7.98760  19.89700   1.14431
69 O-2        3.76936   2.53342   1.91579   1.55094  15.07970   6.30430  40.34450   0.31291   0.22789
70
71 Neutron scattering factors:
72   Symbol   isotope       mass       b       resonant terms
73---------------------------------------------------------------------------------------------------
74 Cu+2    Nat. Abund.     63.546    0.772
75 O-2     Nat. Abund.     15.999    0.581
76
77 Space Group: C 1 2/c 1
78 The lattice is centrosymmetric C-centered monoclinic
79 The Laue symmetry is 2/m
80 The lattice point group is 2/m
81 Multiplicity of a general site is 8
82 The unique monoclinic axis is b
83 The inversion center is located at 0,0,0
84 
85 The equivalent positions are:
86
87 (0,0,0; 1/2,1/2,0)+
88
89 ( 1)     X,     Y,     Z
90 ( 2)    -X,     Y, 1/2-Z
91
92 Atoms:
93   name    type  refine?   x         y         z      frac site sym  mult I/A   Uiso     U11     U22     U33     U12     U13     U23
94---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
95    Cu1   Cu+2          0.25000   0.25000   0.00000   1.000     -1    4    I 0.00100                                               
96     O1    O-2          0.00000   0.41840   0.25000   1.000   2(y)    4    I 0.00100                                               
97
98 Unit cell: a = 4.67959 b = 3.42073 c = 5.12526 alpha = 90.000 beta = 99.828 gamma = 90.000 volume = 80.839 Refine? True
99
100 Spherical harmonics texture: Order:0
101
102 Phase: CuCr2O4 in histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1
103=======================================================================================================================================
104 Phase fraction  :     1.0000 Refine? False
105 Extinction coeff:     0.0000 Refine? False
106 March-Dollase PO:     1.0000 Refine? False Axis: 0 0 1
107
108 Size model    : isotropic equatorial:       3.196 Refine? True
109         LG mixing coeff.:       1.0000 Refine? False
110
111 Mustrain model:  uniaxial equatorial:      1823.4 Refine? True axial:       978.5 Refine? True
112         LG mixing coeff.:      1.0000 Refine? False
113
114 Hydrostatic/elastic strain:
115 names :         D11         D22         D33
116 values:           0           0           0
117 refine:       False       False       False
118 Layer Displacement:      0.000 Refine? False
119
120 Phase: CuO in histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1
121=======================================================================================================================================
122 Phase fraction  :     0.0283 Refine? True
123 Extinction coeff:     0.0000 Refine? False
124 March-Dollase PO:     1.0000 Refine? False Axis: 0 0 1
125
126 Size model    : isotropic equatorial:       1.000 Refine? False
127         LG mixing coeff.:       1.0000 Refine? False
128
129 Mustrain model: isotropic equatorial:      1000.0 Refine? False
130         LG mixing coeff.:      1.0000 Refine? False
131
132 Hydrostatic/elastic strain:
133 names :         D11         D22         D33         D13
134 values:           0           0           0           0
135 refine:       False       False       False       False
136 Layer Displacement:      0.000 Refine? False
137
138 Histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1 histogram Id: 0
139=======================================================================================================================================
140 Instrument type: Debye-Scherrer
141 Histogram limits:     4.68 deg to    26.10 deg
142
143 Sample Parameters:
144 Goniometer omega = 0.00, chi = 0.00, phi = 0.00
145 name  :         Scale    Absorption     DisplaceX     DisplaceY
146 value :        0.5162        0.0000       21.6484        0.0000
147 refine:          True         False          True         False
148
149 Instrument Parameters:
150 name  :     Azimuth        Bank         Lam    Polariz.        SH/L           U           V
151 value :    0.000000    1.000000    0.413263    0.990000    0.002000    1.163000   -0.126000
152 refine:                   False       False       False       False       False       False
153
154 name  :           W           X           Y           Z        Zero
155 value :    0.063000    0.000000    0.000000    0.000000    0.000000
156 refine:       False       False       False       False       False
157
158 Background function: chebyschev-1 Refine? True
159 Coefficients:     12.117    -3.093    -2.064     1.007    -2.356     0.188
160
161 Single peak coefficients
162 names :   BkPkpos refine? BkPkint refine? BkPksig refine? BkPkgam refine?
163 peak 0:       5.066  True   37197.208  True   14317.430  True       0.100 False
164
165 Refinement results:
166---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
167 Number of function calls: 5 No. of observations: 10708 No. of parameters: 28 User rejected: 0 Sp. gp. extinct: 0
168 Refinement time =    2.168s,    2.168s/cycle, for 1 cycles
169 wR =   13.99%, chi**2 =      12594.1, GOF =   1.09
170
171 Phases:
172 Result for phase: CuCr2O4
173=======================================================================================================================================
174 Reciprocal metric tensor:
175  names :            A11            A22            A33            A12            A13            A23
176  values:    0.016810777    0.013700923    0.013722957    0.000000000    0.000000000    0.000000000
177  esds  :    0.000000151    0.000000125    0.000000148                                             
178 New unit cell:
179  names :           a           b           c       alpha        beta       gamma      Volume
180  values:    7.712694    8.543289    8.536427     90.0000     90.0000     90.0000     562.480
181  esds  :    0.000035    0.000039    0.000046                                           0.006
182
183 Atoms:
184   name      x         y         z      frac   Uiso     U11     U22     U33     U12     U13     U23
185---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
186     Cu     Cu:
187 values:   0.12500   0.12500   0.12500   1.000 0.00018
188 sig   :                                       0.00022
189     Cr     Cr:
190 values:   0.50000   0.50000   0.50000   1.000 0.00008
191 sig   :                                       0.00023
192      O      O:
193 values:   0.24575   0.26835   0.26730   1.000-0.00419
194 sig   :   0.00022   0.00042   0.00045         0.00048
195
196 Density: 5.468230.4 g/cm**3
197 Result for phase: CuO
198=======================================================================================================================================
199 Reciprocal metric tensor:
200  names :            A11            A22            A33            A12            A13            A23
201  values:    0.047035002    0.085458418    0.039210963    0.000000000    0.014659677    0.000000000
202  esds  :    0.000007356    0.000013335    0.000007412                   0.000008278               
203 New unit cell:
204  names :           a           b           c       alpha        beta       gamma      Volume
205  values:    4.679605    3.420760    5.125261     90.0000     99.8273     90.0000      80.840
206  esds  :    0.001025    0.000267    0.001246                  0.0056                   0.007
207
208 Atoms:
209   name      x         y         z      frac   Uiso     U11     U22     U33     U12     U13     U23
210---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
211    Cu1   Cu+2:
212 values:   0.25000   0.25000   0.00000   1.000 0.00100
213 sig   :                                             
214     O1    O-2:
215 values:   0.00000   0.41840   0.25000   1.000 0.00100
216 sig   :                                             
217
218 Density: 6.535732.4 g/cm**3
219
220 Phase: CuCr2O4 in histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1
221=======================================================================================================================================
222 Final refinement RF, RF^2 = 3.68%, 7.31% on 102 reflections
223 Durbin-Watson statistic = 0.776
224 Bragg intensity sum = 4.25e+05
225
226 Size model:     isotropic equatorial:     3.19039, sig:  0.4131 LG mix coeff.:      1.0000
227
228 Mustrain model:  uniaxial
229 equatorial:      1823.3, sig:    19.8 axial:       978.3, sig:    15.6 LG mix coeff.:      1.0000
230
231 Phase: CuO in histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1
232=======================================================================================================================================
233 Final refinement RF, RF^2 = 23.01%, 57.96% on 55 reflections
234 Durbin-Watson statistic = 0.776
235 Bragg intensity sum = 2.56e+03
236 Phase fraction  :    0.02829, sig    0.00108 Weight fraction  :  0.00484, sig    0.00018
237
238 Histogram: PWDR OH_00.fxye Bank 1 histogram Id: 0
239=======================================================================================================================================
240 PWDR histogram weight factor = 1.000
241 Final refinement wR = 13.99% on 10708 observations in this histogram
242 Other residuals: R = 10.32%, R-bkg = 8.87%, wR-bkg = 13.99% wRmin = 12.90%
243 Instrument type: Debye-Scherrer
244
245 Resonant form factors:(ref: D.T. Cromer & D.A. Liberman (1981), Acta Cryst. A37, 267-268.)
246 Element:       Cu       Cr        O     Cu+2      O-2
247 f'     :    0.244    0.162    0.002    0.244    0.002
248 f"     :    0.471    0.222    0.002    0.471    0.002
249
250 Sample Parameters:
251 names :         Scale    Absorption     DisplaceX     DisplaceY
252 values:        0.5165        0.0000       21.6424        0.0000
253 sig   :        0.0016                      1.5933             
254
255 Background function: chebyschev-1
256 value :      12.03    -2.919    -2.199     1.104    -2.409    0.2122
257 sig   :     0.8414     1.604     1.269    0.9119    0.4867    0.2409
258
259 Single peak coefficients:
260 peak no.    BkPkpos        esd        BkPkint        esd        BkPksig        esd        BkPkgam        esd     
261    0         5.0589      0.1482     37660.928    9942.746     14428.059    2616.655         0.100           
262 Background sums: empirical 1.38e+05, Debye 0, peaks 3.77e+04, Total 1.76e+05
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.