source: trunk/addcmds.tcl @ 922

Last change on this file since 922 was 922, checked in by toby, 11 years ago

# on 2008/07/14 01:14:23, toby did:
Add CIF import to Add Hist window

  • Property rcs:author set to toby
  • Property rcs:date set to 2008/07/14 01:14:23
  • Property rcs:lines set to +16 -1
  • Property rcs:rev set to 1.44
  • Property rcs:state set to Exp
  • Property svn:keywords set to Author Date Revision Id
File size: 82.1 KB
Line 
1# $Id: addcmds.tcl 922 2009-12-04 23:14:22Z toby $
2
3#----------- Add Phase routines ----------------------------------------
4
5proc MakeAddPhaseBox {} {
6    global expmap expgui
7
8    set expgui(coordList) {}
9    set nextphase ""
10    foreach p {1 2 3 4 5 6 7 8 9} {
11        if {[lsearch $expmap(phaselist) $p] == -1} {
12            set nextphase $p
13            break
14        }
15    }
16
17    # no more room
18    if {$nextphase == ""} {
19        MyMessageBox -parent . -title "Add Phase Error" \
20                -message "There are already 9 phases. You cannot add more." \
21                -icon error
22        return
23    }
24
25    set np .newphase
26    catch {destroy $np}
27    toplevel $np
28    bind $np <Key-F1> "MakeWWWHelp expgui2.html addphase"
29
30    grid [label $np.l1 -text "Adding phase #$nextphase"] \
31            -column 0 -row 0 -sticky w
32    grid [label $np.l2 -text "Phase title:"] -column 0 -row 1 
33    grid [entry $np.t1 -width 68] -column 1 -row 1 -columnspan 8
34    grid [label $np.l3 -text "Space Group:"] -column 0 -row 2 
35    grid [entry $np.t2 -width 12] -column 1 -row 2 
36    grid [frame $np.ct -bd 2 -relief groove] -column 3 -row 2
37    grid [frame $np.f -bd 4 -relief groove] -column 4 -row 2 -columnspan 8
38    grid [label $np.ct.l -text "Cell\nType"] -column 0 -row 2 
39    set menu [tk_optionMenu $np.ct.s expgui(addPhaseCellType) ""]
40    $menu delete 0
41    foreach val {Any Cubic Tetragonal Hexagonal Rhombohedral Orthorhombic Monoclinic} \
42        lbl {Any Cubic Tetrag Hexag Rhomb. Ortho Mono} {
43            $menu add radiobutton -value $lbl -label $val \
44                -command "set expgui(addPhaseCellType) $lbl"
45        }
46    grid $np.ct.s
47    foreach v [ trace vinfo expgui(addPhaseCellType)] {
48        eval trace vdelete expgui(addPhaseCellType) $v
49    }
50    #set expgui(addPhaseCellType) Any
51    $menu invoke 0
52    trace variable expgui(addPhaseCellType) w "SetAddCellSymConstr $np.f"
53
54    set col -1
55    foreach i {a b c} {
56        grid [label $np.f.l1$i -text " $i "] -column [incr col] -row 1
57        grid [entry $np.f.e1$i -width 12] -column [incr col]  -row 1
58    }
59    set col -1
60    foreach i {a b g} {
61        grid [label $np.f.l2$i -text $i] -column [incr col] -row 2
62        set font [$np.f.l2$i cget -font]
63        $np.f.l2$i config -font "Symbol [lrange $font 1 end]"
64        grid [entry $np.f.e2$i -width 12] -column [incr col]  -row 2
65        $np.f.e2$i insert 0 90.
66    }   
67   
68    grid [frame $np.bf] -row 3 -column 0 -columnspan 10 -sticky ew
69    grid [button $np.bf.b1 -text Add \
70            -command "addphase $np"] -column 2 -row 3
71    bind $np <Return> "addphase $np"
72    grid [button $np.bf.b2 -text Cancel \
73            -command "destroy $np"] -column 3 -row 3
74    grid columnconfig $np.bf 4 -weight 1
75    grid [button $np.bf.help -text Help -bg yellow \
76            -command "MakeWWWHelp expgui2.html addphase"] \
77            -column 4 -row 3
78
79    # get the input formats if not already defined
80    GetImportFormats
81    if {[llength $expgui(importFormatList)] > 0} {
82        grid [frame $np.bf.fr -bd 4 -relief groove] -column 5 -row 3
83        grid [button $np.bf.fr.b3 -text "Import phase from: " \
84                -command "ImportPhase \$expgui(importFormat) $np"] \
85                -column 0 -row 0 -sticky e
86        set menu [eval tk_optionMenu $np.bf.fr.b4 expgui(importFormat) \
87                $expgui(importFormatList)]
88        for {set i 0} {$i <= [$menu index end]} {incr i} {
89            $menu entryconfig $i -command "ImportPhase \$expgui(importFormat) $np"
90        }
91        grid $np.bf.fr.b4 -column 1 -row 0 -sticky w
92        grid rowconfig $np.bf.fr 0 -pad 10
93        grid columnconfig $np.bf.fr 0 -pad 10
94        grid columnconfig $np.bf.fr 1 -pad 10
95    }
96    wm title $np "add new phase"
97
98    # set grab, etc.
99    putontop $np
100   
101    tkwait window $np
102   
103    # fix grab...
104    afterputontop
105}
106proc SetAddCellSymConstr {box args} {
107    switch $::expgui(addPhaseCellType) {
108        Any {
109            foreach i {a b c} {
110                $box.e1$i configure -textvariable "" -state normal
111            }
112            foreach i {a b g} {
113                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
114            }
115        }
116        Cubic {
117            set ::expgui(AddCella) [$box.e1a get]
118            foreach i {a b c} {
119                $box.e1$i configure -textvariable expgui(AddCella) -state normal
120            }
121            foreach i {a b g} {
122                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
123                $box.e2$i delete 0 end
124                $box.e2$i insert 0 90.
125                $box.e2$i configure -textvariable "" -state disabled
126            }
127        }
128        Tetrag {
129            set ::expgui(AddCella) [$box.e1a get]
130            foreach i {a b} {
131                $box.e1$i configure -textvariable expgui(AddCella) -state normal
132            }
133            $box.e1c configure -textvariable "" -state normal
134            foreach i {a b g} {
135                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
136                $box.e2$i delete 0 end
137                $box.e2$i insert 0 90.
138                $box.e2$i configure -textvariable "" -state disabled
139            }
140        }
141        Hexag {
142            set ::expgui(AddCella) [$box.e1a get]
143            foreach i {a b} {
144                $box.e1$i configure -textvariable expgui(AddCella) -state normal
145            }
146            $box.e1c configure -textvariable "" -state normal
147            foreach i {a b g} {
148                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
149                $box.e2$i delete 0 end
150                if {$i == "g"} {
151                    $box.e2$i insert 0 120.
152                } else {
153                    $box.e2$i insert 0 90.
154                }
155                $box.e2$i configure -textvariable "" -state disabled
156            }
157        }
158        Rhomb. {
159            set ::expgui(AddCella) [$box.e1a get]
160            foreach i {a b c} {
161                $box.e1$i configure -textvariable expgui(AddCella) -state normal
162            }
163            set ::expgui(AddCellalpha) [$box.e2a get]
164            foreach i {a b g} {
165                $box.e2$i configure -textvariable expgui(AddCellalpha) -state normal
166            }
167        }
168        Ortho {
169            foreach i {a b c} {
170                $box.e1$i configure -textvariable "" -state normal
171            }
172            foreach i {a b g} {
173                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
174                $box.e2$i delete 0 end
175                $box.e2$i insert 0 90.
176                $box.e2$i configure -textvariable "" -state disabled
177            }
178        }
179        Mono {
180            foreach i {a b c} {
181                $box.e1$i configure -textvariable "" -state normal
182            }
183            foreach i {a g} {
184                $box.e2$i configure -textvariable "" -state normal
185                $box.e2$i delete 0 end
186                $box.e2$i insert 0 90.
187                $box.e2$i configure -textvariable "" -state disabled
188            }
189            $box.e2b configure -textvariable "" -state normal
190        }
191    }
192}
193
194
195proc addphase {np} {
196    global expgui expmap
197    # validate the input
198    set err {}
199    set title [$np.t1 get]
200    if {[string trim $title] == ""} {
201        append err "  Title cannot be blank\n"
202    }
203    set spg [$np.t2 get]
204    if {[string trim $spg] == ""} {
205        append err "  Space group cannot be blank\n"
206    }
207    foreach i {a b c} {
208        set cell($i) [$np.f.e1$i get]
209        if {[string trim $cell($i)] == ""} {
210            append err "  $i cannot be blank\n"
211        } elseif {[catch {expr $cell($i)}]} {
212            append err "  $i is not valid\n"
213        }
214    }
215
216    foreach i {a b g} lbl {alpha beta gamma} {
217        set cell($lbl) [$np.f.e2$i get]
218        if {[string trim $cell($lbl)] == ""} {
219            append err "  $lbl cannot be blank\n"
220        } elseif {[catch {expr $cell($lbl)}]} {
221            append err "  $lbl is not valid\n"
222        }
223    }
224
225    if {$expgui(addPhaseCellType) == "Rhomb."} {
226        # check for proper use of space group in Rhomb. setting
227        if {[string toupper [string range [string trim $spg] 0 0]] != "R"} {
228            append err "Rhombohedral cell specified, but space group does not start with R\n"
229        }
230        if {[string toupper [string range [string trim $spg] end end]] != "R"} {
231            append spg " R"
232            if {$err == ""} {
233                # no need to warn on error
234                MyMessageBox -parent $np -title "Space Group Fix" \
235                -message "Adding a final 'R' to the space group for rhombohedral space group set in rhombohedral cell, as required in GSAS" \
236                -icon warning
237            }
238        }
239    }
240    if {$err != ""} {
241        MyMessageBox -parent . -title "Add Phase Error" \
242                -message "The following error(s) were found in your input:\n$err" \
243                -icon error
244        set expgui(oldphaselist) -1
245        return
246    }
247
248    # check the space group
249    set fp [open spg.in w]
250    puts $fp "N"
251    puts $fp "N"
252    puts $fp $spg
253    puts $fp "Q"
254    close $fp
255    global tcl_platform
256    catch {
257        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
258            exec [file join $expgui(gsasexe) spcgroup.exe] < spg.in >& spg.out
259        } else {
260            exec [file join $expgui(gsasexe) spcgroup] < spg.in >& spg.out
261        }
262    }
263    set fp [open spg.out r]
264    set out [read $fp]
265    close $fp
266    # attempt to parse out the output (fix up if parse did not work)
267    if {[regexp "space group symbol.*>(.*)Enter a new space group symbol" \
268            $out a b ] != 1} {set b $out}
269    if {[string first Error $b] != -1} {
270        # got an error, show it
271        ShowBigMessage \
272                 $np.error \
273                 "Error processing space group\nReview error message below" \
274                 $b OK "" 1
275        set expgui(oldphaselist) -1
276        return
277    } else {
278        # show the result and confirm
279        set opt [ShowBigMessage \
280                $np.check \
281                "Check the symmetry operators in the output below" \
282                $b \
283                {Continue Redo} ]
284        if {$opt > 1} {
285            set expgui(oldphaselist) -1
286            return
287        }
288    }
289    file delete spg.in spg.out
290    # ok do it!
291    set errmsg [runAddPhase $title $spg \
292                    $cell(a) $cell(b) $cell(c) \
293                    $cell(alpha) $cell(beta) $cell(gamma)]
294    RecordMacroEntry "runAddPhase [list $title] [list $spg] \
295                    $cell(a) $cell(b) $cell(c) \
296                    $cell(alpha) $cell(beta) $cell(gamma)" 0
297    destroy $np
298    if {$expgui(showexptool) || $errmsg != ""} {
299        if {$errmsg != ""} {
300            set err 1
301            append errmsg "\n" $expgui(exptoolout) 
302        } else {
303            set err 0
304            set errmsg $expgui(exptoolout) 
305        }
306        set msg "Please review the result from adding the phase" 
307        if { $errmsg != ""} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
308        ShowBigMessage $np $msg $errmsg OK "" $err
309    }
310    # set the powpref warning (2 = required)
311    set expgui(needpowpref) 2
312    set msg "A phase was added" 
313    if {[string first $msg $expgui(needpowpref_why)] == -1} {
314        append expgui(needpowpref_why) "\t$msg\n"
315    }
316    # now select the new phase
317    SelectOnePhase [lindex $expmap(phaselist) end]   
318}
319
320proc runAddPhase {title spg a b c alpha beta gamma} {
321    global expgui expmap tcl_platform
322    set fp [open exptool.in w]
323    puts $fp "P"
324    puts $fp $title
325    puts $fp $spg
326    puts $fp "$a $b $c $alpha $beta $gamma"
327    puts $fp "/"
328    close $fp
329    # Save the current exp file
330    savearchiveexp
331    # disable the file changed monitor
332    set expgui(expModifiedLast) 0
333    set expnam [file root [file tail $expgui(expfile)]]
334    # save the previous phase list
335    set expgui(oldphaselist) $expmap(phaselist)
336    set err [catch {
337        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
338            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool.exe] $expnam \
339                    < exptool.in >& exptool.out
340        } else {
341            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool] $expnam \
342                    < exptool.in >& exptool.out
343        }
344    } errmsg]
345    # load the revised exp file
346    set oldphaselist $expmap(phaselist)
347    loadexp $expgui(expfile)
348    set fp [open exptool.out r]
349    set expgui(exptoolout) [read $fp]
350    close $fp
351    catch {file delete exptool.in exptool.out}
352
353    if {[llength $oldphaselist] == [llength $expmap(phaselist)]} {
354        set err 1
355        if {$errmsg == ""} {set errmsg "No phase added"}
356    }
357    if {$err} {
358        return $errmsg
359    } else {
360        return ""
361    }
362}
363
364
365#----------- Add Histogram routines --------------------------------------
366proc LabelInstParm {args} {
367    global newhist
368    switch $newhist(insttype) {
369        TOF {
370            set newhist(instfiletext) "Neutron Time of Flight"
371            catch {
372                set b $newhist(setnum)
373                append newhist(instfiletext) ", 2theta = $newhist(inst${b}Angle)"
374            }
375        }
376        ED {set newhist(instfiletext) "X-ray Energy Dispersive"}
377        "CW X" {set newhist(instfiletext) "CW X-ray"}
378        "CW N" {set newhist(instfiletext) "CW Neutron"}
379    }
380}
381trace variable newhist(setnum) w LabelInstParm
382trace variable newhist(LimitMode) w ClearHistLimit
383set newhist(LimitMode_boxes) {}
384
385proc ClearHistLimit {args} {
386    global newhist
387    if {$newhist(LimitMode) == 1} {return}
388    foreach box $newhist(LimitMode_boxes) {
389        catch {$box delete 0 end}
390    }
391}
392
393proc MakeAddHistBox {} {
394    global expmap newhist
395
396    # --> should check here if room for another histogram, but only texture
397    # folks will ever need that
398
399
400    # set if the CIF import loads OK
401    set OK 1
402    catch {
403        if {[info procs ReadCIF4GSAS] == ""} {
404            set OK 0
405            source [file join $::expgui(scriptdir) cif2fxye.tcl]
406        }
407    } errmsg
408
409    set np .newhist
410    catch {destroy $np}
411    toplevel $np
412    bind $np <Key-F1> "MakeWWWHelp expgui3.html AddHist"
413
414    grid [label $np.l0 -text "Adding a new histogram"] \
415            -column 0 -row 0 -sticky ew -columnspan 7
416    grid [checkbutton $np.d0 -text "Dummy Histogram" -variable newhist(dummy) \
417            -command "PostDummyOpts $np" \
418            ] -column 2 -row 0 -columnspan 99 -sticky e
419    grid [label $np.l1 -text "Data file:"] -column 0 -row 2
420    grid [label $np.t1 -textvariable newhist(rawfile) -bd 2 -relief ridge] \
421            -column 1 -row 2 -columnspan 3 -sticky ew
422    grid [button $np.b1 -text "Select File" \
423            -command "getrawfile $np" \
424            ] -column 4 -row 2
425    if {$OK} {
426        grid [button $np.b1a -text "Import CIF" \
427                  -command "ReadCIF4GSAS $np" \
428                 ] -column 5 -row 2
429    }
430
431    grid [label $np.lbank -text "Select bank" -anchor w] -column 1 -row 3 -sticky w
432    grid [frame $np.bank]  -column 2 -row 3 -columnspan 7 -sticky ew
433
434    grid [label $np.l2 -text "Instrument\nParameter file:"] -column 0 -row 5
435    grid [label $np.t2 -textvariable newhist(instfile) -bd 2 -relief ridge] \
436            -column 1 -row 5 -columnspan 3 -sticky ew
437    grid [button $np.b2 -text "Select File" \
438            -command "getinstfile $np" \
439            ] -column 4 -row 5
440    grid [button $np.edit -text "Edit file" \
441            -command {EditInstFile $newhist(instfile)}] \
442            -column 5 -row 5
443
444    grid [label $np.lset -text "Select set" -anchor w] -column 1 -row 6 -sticky w
445    grid [frame $np.set]  -column 2 -row 6 -columnspan 7 -sticky ew
446    grid [label $np.t2a -textvariable newhist(instfiletext) \
447            -justify center -anchor center -fg blue] \
448            -column 0 -row 8 -columnspan 99 -sticky ew
449
450    grid [button $np.f6a -text "Run\nRAWPLOT" -command "RunRawplot $np"] \
451            -column 4 -row 18 -rowspan 2
452    grid [label $np.l3 -text "Usable data limit:"] -column 0 -row 18 -rowspan 3 
453    grid [entry $np.e3 -width 12 -textvariable newhist(2tLimit) \
454            ] -column 1 -row 18 -rowspan 3
455    grid [radiobutton $np.cb3 -text "d-min" -variable newhist(LimitMode) \
456            -value 0] -column 2 -row 18 -sticky w
457    grid [radiobutton $np.cb4 -textvariable newhist(limitLbl)  \
458            -variable newhist(LimitMode) -anchor w -justify l \
459            -value 1] -column 2 -row 20 -sticky w
460    set newhist(LimitMode_boxes) $np.e3
461    grid [radiobutton $np.cb5 -text "Q-max" -variable newhist(LimitMode) \
462            -value 2] -column 2 -row 19 -sticky w
463    set newhist(limitLbl) "TOF-min\n2-Theta Max"
464    # spacers
465    grid [frame $np.sp0 -bg white] \
466            -columnspan 20 -column 0 -row 1 -sticky nsew -ipady 2
467    grid [frame $np.sp1 -bg white] \
468            -columnspan 20 -column 0 -row 4 -sticky nsew -ipady 2
469    grid [frame $np.sp2 -bg white] \
470            -columnspan 20 -column 0 -row 17 -sticky nsew -ipady 2
471    grid [frame $np.sp3 -bg white] \
472            -columnspan 20 -column 0 -row 98 -sticky nsew -ipady 2
473    grid [frame $np.f6] -column 0 -row 99 -columnspan 5 -sticky ew
474    grid [button $np.f6.b6a -text Add \
475            -command "addhist $np"] -column 0 -row 0
476    bind $np <Return> "addhist $np"
477    grid [button $np.f6.b6b -text Cancel \
478            -command "destroy $np"] -column 1 -row 0
479    grid [button $np.f6.b6c -text "Add multiple banks" \
480            -command "addMultiplehist $np" -state disabled] -column 2 -row 0
481    grid [button $np.f6.help -text Help -bg yellow \
482            -command "MakeWWWHelp expgui3.html AddHist"] \
483            -column 2 -row 0 -sticky e
484    grid columnconfigure $np.f6 2 -weight 1
485    grid columnconfigure $np 3 -weight 1
486
487    # dummy histogram stuff
488    frame $np.d1
489    grid [label $np.d1.l1 -text min] -column 1 -row 1
490    grid [label $np.d1.l2 -text max] -column 2 -row 1
491    grid [label $np.d1.l3 -text step] -column 3 -row 1
492    grid [label $np.d1.lu -text ""] -column 4 -row 1 -rowspan 2
493    grid [entry $np.d1.e1 -width 10 -textvariable newhist(tmin)] -column 1 -row 2
494    grid [entry $np.d1.e2 -width 10 -textvariable newhist(tmax)] -column 2 -row 2
495    grid [entry $np.d1.e3 -width 10 -textvariable newhist(tstep)] -column 3 -row 2
496    grid [label $np.d1.m1 -anchor w] -column 1 -row 3 -sticky ew
497    grid [label $np.d1.m2 -anchor w] -column 2 -row 3 -sticky ew
498    label $np.dl1 -text "Data range:"
499    label $np.dl2 -text "Allowed"
500    label $np.dl3 -text "\n" -justify left -fg blue
501    wm title $np "add new histogram"
502
503    set newhist(banknum) {}
504    set newhist(setnum) {}
505    if {[string trim $newhist(rawfile)] != {}} {
506        validaterawfile $np $newhist(rawfile)
507    }
508    if {[string trim $newhist(instfile)] != {}} {
509        validateinstfile $np $newhist(instfile)
510    }
511
512    PostDummyOpts $np
513    # set grab, etc.
514    putontop $np
515
516    tkwait window $np
517
518    # fix grab...
519    afterputontop
520}
521
522# convert a file to Win-95 direct access
523proc WinCvt {file win} {
524    global expgui
525    if ![file exists $file] {
526        MyMessageBox -parent $win -title "Convert Error" \
527                -message "File $file does not exist" -icon error
528        return
529    }
530
531    set tmpname "[file join [file dirname $file] tempfile.xxx]"
532    set oldname "[file rootname $file].org"
533    if [file exists $oldname] {
534        set ans [MyMessageBox -parent $win -title "OK to overwrite?" \
535                -message "File [file tail $oldname] exists in [file dirname $oldname]. OK to overwrite?" \
536                -icon question -type yesno -default yes]
537        if {$ans == "no"} return
538        catch {file delete $oldname}
539    }
540
541    if [catch {
542        set in [open $file r]
543        # needed to test under UNIX
544        set out [open $tmpname w]
545        fconfigure $out -translation crlf
546        set len [gets $in line]
547        if {$len > 160} {
548            # this is an old-style UNIX file. Hope there are no control characters
549            set i 0
550            set j 79
551            while {$j < $len} {
552                puts $out [string range $line $i $j]
553                incr i 80
554                incr j 80
555            }
556        } else {
557            while {$len >= 0} {
558                append line "                                        "
559                append line "                                        "
560                set line [string range $line 0 79]
561                puts $out $line
562                set len [gets $in line]
563            }
564        }
565        close $in
566        close $out
567        file rename $file $oldname
568        file rename $tmpname $file
569    } errmsg] {
570        MyMessageBox -parent $win -title Notify \
571                -message "Error in conversion:\n$errmsg" -icon warning
572    }
573    return $file
574}
575
576proc getrawfile {np} {
577    global newhist tcl_platform
578    if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
579        set inp [
580        tk_getOpenFile -parent $np -initialfile $newhist(rawfile) -filetypes {
581            {"Data files" .GSAS} {"Data files" .GSA} 
582            {"Data files" .RAW}  {"Data files" .FXYE} {"All files" *}
583        }
584        ]
585    } else {
586        set inp [
587        tk_getOpenFile -parent $np -initialfile $newhist(rawfile) -filetypes {
588            {"Data files" .GSA*} {"Data files" .RAW} 
589            {"Data files" .gsa*} {"Data files" .raw} {"Data files" .fxye}   
590            {"All files" *}
591        } 
592        ]
593    }
594    validaterawfile $np $inp
595}
596
597proc validaterawfile {np inp} {
598    global expgui newhist
599    if {$inp == ""} return
600    if [catch {set in [open $inp r]}] {
601        MyMessageBox -parent $np -title "Open error" \
602                -message "Unable to open file $inp" -icon error
603        return 
604    }
605    set newhist(banklist) {}
606    foreach child [winfo children $np.bank] {destroy $child}
607    # is this a properly formatted file?
608    # -- are lines the correct length & terminated with a CR-LF?   
609    fconfigure $in -translation lf
610    set i 0
611    while {[set len [gets $in line]] > 0} {
612        incr i
613        #if {$len != 81 || [string range $line end end] != "\r"} {
614        #    set ans [MyMessageBox -parent $np -title "Convert?" \
615        #           -message "File $inp is not in the correct format for GSAS.\nOK to convert?" \
616        #           -icon warning -type {OK Quit} -default OK]
617        #    if {$ans == "ok"} {
618        #       # convert and reopen the file
619        #       close $in
620        #       WinCvt $inp $np
621        #       set i 0
622        #       set in [open $inp r]
623        #       fconfigure $in -translation lf
624        #       set line {}
625        #    } else {
626        #       return
627        #    }
628        #}
629        # scan for BANK lines
630        if {[string first BANK $line] == 0} {
631            scan $line "BANK%d" num
632            lappend newhist(banklist) $num
633            # compute last point
634            set tmin 0
635            set tmax 0
636            catch {
637                scan $line "BANK%d%d%d%s%f%f" num nchan nrec rest start step
638                set tmin [expr $start/100.]
639                set tmax [expr ($start + $step*($nchan-1))/100.]
640            }
641            set newhist(tmin$num) $tmin
642            set newhist(tmax$num) $tmax
643        }
644        # check for "Instrument parameter file" line
645        if {$i == 2 && [string first "Instrument parameter" $line] == 0} {
646            validateinstfile $np \
647                    [file join [file dirname $inp] \
648                    [string trim [string range $line 26 end]]]
649        }
650    }
651    # were banks found?
652    if {$newhist(banklist) == ""} {
653        MyMessageBox -parent $np -title "Read error" \
654                -message "File $inp has no BANK lines.\nThis is not a valid GSAS data file." \
655                -icon warning
656        return
657    }
658    # don't use a full path unless needed
659    if {[pwd] == [file dirname $inp]} {
660        set newhist(rawfile) [file tail $inp]
661    } else {
662        set newhist(rawfile) $inp
663    }
664    set row 0
665    set col -1
666    set flag 0
667    foreach i $newhist(banklist) {
668        if {$col > 8} {
669            set col -1
670            incr row
671        }
672        grid [radiobutton $np.bank.$i -text $i -command SetTmax \
673                -variable newhist(banknum) -value $i] \
674                -column [incr col] -row $row -sticky w
675        # only 1 choice, so set it
676        if {[llength $newhist(banklist)] == 1} {
677            set newhist(banknum) $i
678            SetTmax
679        } else {
680            set flag 1
681        }
682    }
683    if {$flag} {
684        set newhist(2tLimit) {}
685        set newhist(LimitMode) {}
686    }
687    SetMultipleAdd $np
688}
689
690proc SetTmax {} {
691    global newhist
692    set num $newhist(banknum)
693    if {$newhist(insttype) == "TOF"} {
694        set newhist(2tLimit) [expr {$newhist(tmin$num) / 10.}]
695        if {[llength $newhist(banklist)] == $newhist(instbanks)} {
696            set newhist(setnum) $newhist(banknum)
697        }
698    } else {
699        set newhist(2tLimit) $newhist(tmax$num)
700    }
701    set newhist(LimitMode) 1
702
703}
704
705proc getinstfile {np} {
706    global newhist tcl_platform
707    if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
708        set inp [
709        tk_getOpenFile -parent $np -initialfile $newhist(instfile) -filetypes {
710            {"Inst files" .INST} {"Inst files" .INS} 
711            {"Inst files" .PRM} {"All files" *}
712        }
713        ]
714    } else {
715        set inp [
716        tk_getOpenFile -parent $np -initialfile $newhist(instfile) -filetypes {
717            {"Inst files" .INS*} {"Inst files" .ins*} 
718            {"Inst files" .PRM}  {"Inst files" .prm} 
719            {"All files" *}
720        }
721        ]
722    }
723    set newhist(setnum) {}
724    validateinstfile $np $inp
725}
726
727proc validateinstfile {np inp} {
728    global expgui newhist
729    if {$inp == ""} return
730    if [catch {set in [open $inp r]}] {
731        MyMessageBox -parent $np -title "Open error" \
732                -message "Unable to open file $inp" -icon error
733        return 
734    }
735    set newhist(instbanks) {}
736    foreach child [winfo children $np.set] {destroy $child}
737    # is this a properly formatted file?
738    # -- are lines the correct length & terminated with a CR-LF?   
739    fconfigure $in -translation lf
740    while {[set len [gets $in line]] >= 0} {
741        if {$len != 81 || [string range $line end end] != "\r"} {
742            set ans [MyMessageBox -parent $np -title "Convert?" \
743                    -message "File $inp is not in the correct format for GSAS.\nOK to convert?" \
744                    -icon warning -type {OK Quit} -default OK]
745            if {$ans == "ok"} {
746                # convert and reopen the file
747                close $in
748                WinCvt $inp $np
749                set in [open $inp r]
750                fconfigure $in -translation lf
751                set line {}
752            } else {
753                return
754            }
755        }
756        # scan for the INS   BANK line
757        if {[string first "INS   BANK" $line] == 0} {
758            set newhist(instbanks) \
759                    [string trim [string range $line 12 end]]
760        }
761        # scan for the INS   HTYPE line
762        if {[string first "INS   HTYPE" $line] == 0} {
763            if {[string index [lindex $line 2] 2] == "T"} {
764                set newhist(insttype) TOF
765            } elseif {[string index [lindex $line 2] 2] == "E"} {
766                set newhist(insttype) ED
767            } elseif {[string index [lindex $line 2] 1] == "X"} {
768                set newhist(insttype) "CW X"
769            } else {
770                set newhist(insttype) "CW N"
771            }
772        }
773        # scan for the instrument constants
774        if {[regexp {INS ([ 1-9][0-9]) ICONS(.*)} $line a b c]} {
775            set b [string trim $b]
776            set newhist(inst${b}ICONS) [string trim $c]
777        }
778        if {[regexp {INS ([ 1-9][0-9])I ITYP(.*)} $line a b c]} {
779            set b [string trim $b]
780            set newhist(inst${b}ITYP) [string trim $c]
781        }
782        if {[regexp {INS ([ 1-9][0-9])BNKPAR(.*)} $line a b c]} {
783            set b [string trim $b]
784            set newhist(inst${b}Angle) [string trim [lindex $c 1]]
785        }
786    }
787    # were banks found?
788    if {$newhist(instbanks) == ""} {
789        MyMessageBox -parent $np -title "Read error" -message \
790                "File $inp has no \"INS   BANK\" line.\nThis is not a valid GSAS Instrument Parameter file." \
791                -icon warning
792        return
793    }
794    # don't use a full path unless needed
795    if {[pwd] == [file dirname $inp]} {
796        set newhist(instfile) [file tail $inp]
797    } else {
798        set newhist(instfile) $inp
799    }
800    set col -1
801    set row 0
802    for {set i 1} {$i <= $newhist(instbanks)} {incr i} {
803        if {$col > 8} {
804            set col -1
805            incr row
806        }
807        grid [radiobutton $np.set.$i -text $i \
808                -command "PostDummyOpts $np; ValidateDummyHist $np" \
809                -variable newhist(setnum) -value $i] \
810                -column [incr col] -row $row -sticky w
811        if {$newhist(instbanks) == 1} {set newhist(setnum) $i}
812    }
813    if {$newhist(dummy)} {PostDummyOpts $np; ValidateDummyHist $np}
814    LabelInstParm
815    SetMultipleAdd $np
816}
817
818proc addhist {np} {
819    global expgui newhist tcl_platform expmap
820    if {$newhist(dummy)} {
821        AddDummyHist $np
822        return
823    }
824    # validate the input
825    set err {}
826    if {[string trim $newhist(rawfile)] == ""} {
827        append err "  No data file specified\n"
828    }
829    if {[string trim $newhist(instfile)] == ""} {
830        append err "  No instrument parameter file specified\n"
831    }
832    if {[string trim $newhist(banknum)] == ""} {
833            append err "  Bank number must be specified\n"
834    } elseif {[catch {expr $newhist(banknum)}]} {
835            append err "  Bank number is not valid\n"
836    }
837    if {[string trim $newhist(setnum)] == ""} {
838        append err "  Parameter set number must be specified\n"
839    } elseif {[catch {expr $newhist(setnum)}]} {
840        append err "  Parameter set number is not valid\n"
841    }
842    if {[string trim $newhist(2tLimit)] == ""} {
843        append err "  2Theta/d-space limit must be specified\n"
844    } elseif {[catch {expr $newhist(2tLimit)}]} {
845        append err "  The 2Theta/d-space limit is not valid\n"
846    } elseif {$newhist(2tLimit) <= 0} {
847        append err "  The 2Theta/d-space limit is not valid\n"
848    }
849    if {[string trim $newhist(LimitMode)] == ""} {
850        append err "  Please choose between either a 2Theta, Q or d-space limit\n"
851    }
852
853    if {$err != ""} {
854        MyMessageBox -parent $np -title  "Add Histogram Error" \
855                -message "The following error(s) were found in your input:\n$err" \
856                -icon error -type ok -default ok \
857                -helplink "expgui3.html AddHistErr"
858        return
859    }
860
861    if {$newhist(LimitMode) == 1} {
862        set mode "T"
863        set value $newhist(2tLimit)
864    } elseif {$newhist(LimitMode) == 2} {
865        set mode "D"
866        set Q 100
867        catch {set Q [expr {4*acos(0)/$newhist(2tLimit)}]}
868        set value $Q
869    } else {
870        set mode "D"
871        set value $newhist(2tLimit)
872    }
873
874    # ok do it!
875    set errmsg [runAddHist $newhist(rawfile) $newhist(instfile) $newhist(banknum) $newhist(setnum) $mode $value]
876    # save call to Macro file
877    RecordMacroEntry "runAddHist [list $newhist(rawfile)] [list $newhist(instfile)] $newhist(banknum) $newhist(setnum) $mode $value" 0
878   
879    destroy $np
880    if {$expgui(showexptool) || $errmsg != ""} {
881        if {$errmsg != ""} {
882            set err 1
883            append errmsg "\n" $expgui(exptoolout)
884        } else {
885            set err 0
886            set errmsg $expgui(exptoolout) 
887        }
888        set msg "Please review the result from adding the histogram" 
889        if {$errmsg != ""} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
890        ShowBigMessage $np $msg $errmsg OK "" $err
891    }
892    # set the powpref warning (2 = required)
893    set expgui(needpowpref) 2
894    set msg "A histogram was added" 
895    if {[string first $msg $expgui(needpowpref_why)] == -1} {
896        append expgui(needpowpref_why) "\t$msg\n"
897    }
898    # select the most recently added histogram
899    if {!$err != ""} {
900        set i [llength $expmap(histlistboxcontents)]
901        if {$i > 0} {
902            incr i -1
903            set expgui(curhist) $i
904            sethistlist
905        }
906    }
907}
908proc runAddHist {rawfile instfile banknum setnum mode value} {
909    global expgui expmap tcl_platform
910    set fp [open exptool.in w]
911    puts $fp "H"
912    if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
913        puts $fp [file attributes $rawfile -shortname]
914        puts $fp [file attributes $instfile -shortname]
915    } else {
916        puts $fp $rawfile
917        puts $fp $instfile
918    }
919    puts $fp $banknum
920    puts $fp $setnum
921    puts $fp $mode
922    puts $fp "$value"
923    puts $fp "/"
924    puts $fp "X"
925    puts $fp "X"
926    close $fp
927    # Save the current exp file
928    savearchiveexp
929    # disable the file changed monitor
930    set expgui(expModifiedLast) 0
931    set expnam [file root [file tail $expgui(expfile)]]
932    set err [catch {
933        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
934            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool.exe] $expnam \
935                    < exptool.in >& exptool.out
936        } else {
937            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool] $expnam \
938                    < exptool.in >& exptool.out
939        }
940    } errmsg]
941    # load the revised exp file
942    set oldpowderlist $expmap(powderlist)
943    loadexp $expgui(expfile)
944    if {[llength $oldpowderlist] == [llength $expmap(powderlist)]} {
945        append errmsg "\nNo histogram added"
946        set err 1
947    }
948    set fp [open exptool.out r]
949    set expgui(exptoolout) [read $fp]
950    close $fp
951    catch {file delete exptool.in exptool.out}
952    if {$err} {
953        return $errmsg
954    } else {
955        return ""
956    }
957}
958
959proc RunRawplot {parent} {
960    global newhist tcl_platform
961    set f1 $newhist(rawfile)
962    set f2 $newhist(instfile)
963    # for Windows put a message on top, in case file names must be shortened
964    if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
965        catch {set f1 [file nativename \
966                    [file attributes $newhist(rawfile) -shortname]]}
967        catch {set f2 [file nativename \
968                [file attributes $newhist(instfile) -shortname]]}
969    }
970    if {$f1 != "" || $f2 != ""} {
971        #set msg "Note: input to RAWPLOT\n"
972        #if {$f1 != ""} {append msg "data file: $f1\n"}
973        #if {$f2 != ""} {append msg "instrument file: $f2"}
974        catch {toplevel $parent.msg}
975        catch {eval destroy [winfo children $parent.msg]}
976        wm title $parent.msg "File names"
977        grid [label $parent.msg.1 \
978                -text "File names to be input to RAWPLOT" \
979                -justify center -anchor center] \
980                -column 0 -row 0 -columnspan 2
981        if {$f1 != ""} {
982            grid [label $parent.msg.2a \
983                    -text "Raw histogram: $f1" \
984                    -justify center -anchor e] \
985                    -column 0 -row 1
986            grid [button $parent.msg.2b \
987                    -command "clipboard clear; clipboard append $f1" \
988                    -text "put name\nin clipboard"] \
989                    -column 1 -row 1
990        }           
991        if {$f2 != ""} {
992            grid [label $parent.msg.3a \
993                    -text "Raw histogram: $f2" \
994                    -justify center -anchor e] \
995                    -column 0 -row 2
996            grid [button $parent.msg.3b \
997                    -command "clipboard clear; clipboard append $f2" \
998                    -text "put name\nin clipboard"] \
999                    -column 1 -row 2
1000        }           
1001        grid [button $parent.msg.4 \
1002                -command "destroy $parent.msg" \
1003                -text "Close"] \
1004                -column 0 -columnspan 2 -row 9
1005    }
1006    # start RAWPLOT
1007    runGSASprog rawplot 1
1008    if {[winfo exists $parent.msg]} {raise $parent.msg}
1009    update
1010}
1011#--- Dummy histogram stuff
1012proc PostDummyOpts {np} {
1013    global newhist
1014    if {$newhist(dummy)} {
1015        trace variable newhist(tmin) w "ValidateDummyHist $np"
1016        trace variable newhist(tmax) w "ValidateDummyHist $np"
1017        trace variable newhist(tstep) w "ValidateDummyHist $np"
1018        foreach w {l1 t1 lbank} {
1019            $np.$w config -fg grey
1020        }
1021        $np.d1.m1 config -text {}
1022        $np.d1.m2 config -text {}
1023        $np.b1 config -state disabled
1024        grid forget $np.l3 $np.e3 $np.cb3 $np.cb4 $np.cb5 $np.bank $np.f6a
1025        grid $np.dl1 -column 0 -row 18
1026        grid $np.d1 -column 1 -row 18 -rowspan 2 -columnspan 4 -sticky e
1027        grid $np.dl3 -column 0 -columnspan 99 -row 20 -sticky ew
1028        if {$newhist(insttype) == "TOF"} {
1029            $np.dl1 config -text "Data range:\n(TOF)"
1030            $np.d1.lu config -text millisec
1031            grid $np.dl2 -column 0 -row 19
1032            catch {
1033                set s $newhist(setnum)
1034                foreach {x tmin tmax x} $newhist(inst${s}ITYP) {}
1035                $np.d1.m1 config -text $tmin
1036                $np.d1.m2 config -text $tmax
1037            }
1038        } elseif {[lindex $newhist(insttype) 0] == "CW"} {
1039            $np.dl1 config -text "Data range:\n(2Theta)"
1040            $np.d1.lu config -text degrees
1041            #grid forget $np.dl2
1042            $np.d1.m1 config -text >0.
1043            $np.d1.m2 config -text <180.
1044        } elseif {$newhist(insttype) == "ED"} {
1045            $np.dl1 config -text "Data range:\n(Energy)"
1046            $np.d1.lu config -text KeV
1047            $np.d1.m1 config -text 1.
1048            $np.d1.m2 config -text 200.
1049            grid $np.dl2 -column 0 -row 19
1050        } else {
1051            $np.dl1 config -text "No file\nselected"
1052            $np.d1.lu config -text {}
1053        }
1054    } else {
1055        foreach var {tmin tmax tstep} {
1056            foreach v [ trace vinfo newhist($var)] {
1057                eval trace vdelete newhist($var) $v
1058            }
1059        }
1060        grid forget $np.dl1 $np.d1 $np.dl2 $np.dl3
1061        foreach w {l1 t1 lbank} {
1062            $np.$w config -fg black
1063        }
1064        $np.b1 config -state normal
1065        grid $np.bank -column 2 -row 3 -columnspan 7 -sticky ew
1066        grid $np.f6a -column 4 -row 18 -rowspan 3
1067        grid $np.l3 -column 0 -row 18 -rowspan 3
1068        grid $np.e3 -column 1 -row 18 -rowspan 3 
1069        grid $np.cb3 -column 2 -row 18 -sticky w
1070        grid $np.cb4 -column 2 -row 20 -sticky w
1071        grid $np.cb5 -column 2 -row 19 -sticky w
1072     }
1073}
1074
1075proc ValidateDummyHist {np args} {
1076    # validate input
1077    global newhist
1078    set msg {}
1079    $np.dl3 config -text "\n"
1080    foreach e {e1 e2 e3} v {tmin tmax tstep} {
1081        if [catch {expr $newhist($v)}] {
1082            $np.d1.$e config -fg red
1083            append msg "Value of $newhist($v) is invalid for $v\n"
1084        } else {
1085            $np.d1.$e config -fg black
1086        }
1087    }
1088    if {[catch {expr $newhist(setnum)}]} {
1089        append msg "An instrument file bank number must be selected\n"
1090    } elseif {$newhist(setnum) <= 0 || \
1091            $newhist(setnum) > $newhist(instbanks)} {
1092        append msg "An invalid instrument file bank has been selected\n"
1093    }
1094
1095    if {$msg != ""} {return $msg}
1096
1097    if {$newhist(tmax) <= $newhist(tmin)} {
1098        $np.d1.e1 config -fg red
1099        $np.d1.e2 config -fg red
1100        return "Tmax <= Tmin\n"
1101    }
1102
1103
1104    set dmin -1
1105    set dmax -1
1106    if {$newhist(insttype) == "TOF"} {
1107        catch {
1108            set s $newhist(setnum)
1109            foreach {x tmin tmax x} $newhist(inst${s}ITYP) {}
1110            if {$newhist(tmin) <$tmin } {
1111                $np.d1.e1 config -fg red
1112                append msg "Min value of $newhist(tmin) msec is invalid.\n"
1113            }
1114            if {$newhist(tmax) >$tmax } {
1115                $np.d1.e2 config -fg red
1116                append msg "Max value of $newhist(tmax) msec is invalid.\n"
1117            }
1118            set s $newhist(setnum)
1119            set dmin [expr {1000. * $newhist(tmin) / \
1120                    [lindex $newhist(inst${s}ICONS) 0]}]
1121            set dmax [expr {1000. * $newhist(tmax) / \
1122                    [lindex $newhist(inst${s}ICONS) 0]}]
1123        }
1124    } elseif {[lindex $newhist(insttype) 0] == "CW"} {
1125        if {$newhist(tmin) <= 0 } {
1126            $np.d1.e1 config -fg red
1127            append msg "Min value of $newhist(tmin) degrees is invalid.\n"
1128        }
1129        if {$newhist(tmax) >=180 } {
1130            $np.d1.e2 config -fg red
1131            append msg "Max value of $newhist(tmax) degrees is invalid.\n"
1132        }
1133        catch {
1134            set s $newhist(setnum)
1135            set dmin [expr {[lindex $newhist(inst${s}ICONS) 0]\
1136                    * 0.5 / sin(acos(0.)*$newhist(tmax)/180.)}]
1137            set dmax [expr {[lindex $newhist(inst${s}ICONS) 0]\
1138                    * 0.5 / sin(acos(0.)*$newhist(tmin)/180.)}]
1139        }
1140    } else {
1141        if {$newhist(tmin) <1 } {
1142            $np.d1.e1 config -fg red
1143            append msg "Min value of $newhist(tmin) KeV is invalid.\n"
1144        }
1145        if {$newhist(tmax) >200 } {
1146            $np.d1.e2 config -fg red
1147            append msg "Max value of $newhist(tmax) KeV is invalid.\n"
1148        }
1149        catch {
1150            set s $newhist(setnum)
1151            set ang [lindex $newhist(inst${s}ICONS) 0]
1152            set dmin [expr {12.398/ (2.0*sin($ang*acos(0.)/180) * \
1153                    $newhist(tmax))}]
1154            set dmax [expr {12.398/ (2.0*sin($ang*acos(0.)/180) * \
1155                    $newhist(tmin))}]
1156        }
1157    }
1158    if {$msg != ""} {return $msg}
1159    set pnts -1
1160    catch {
1161        set pnts [expr {1+int(($newhist(tmax) - $newhist(tmin))/$newhist(tstep))}]
1162        set qmin [expr {4.*acos(0)/$dmax}]
1163        set qmax [expr {4.*acos(0)/$dmin}]
1164    }
1165    if {$pnts <= 0} {
1166        $np.d1.e3 config -fg red
1167        append msg "Step value of $newhist(tstep) is invalid.\n"
1168    }
1169    if {$pnts >20000} {
1170        $np.d1.e3 config -fg red
1171        append msg "Step value of $newhist(tstep) is too small (>20000 points).\n"
1172    }
1173    if {$msg != ""} {return $msg}
1174    if {$dmin > 0 && $dmax > 0} {
1175        catch {
1176            set msg [format \
1177                    {  %d points.%s  D-space range: %.2f-%.2f A,  Q: %.2f-%.2f/A} \
1178                    $pnts "\n" $dmin $dmax $qmin $qmax]
1179            $np.dl3 config -text $msg
1180        }
1181    }
1182    if {$msg != ""} {return ""}
1183    $np.dl3 config -text [format {  %d points.%s  Range: ?} $pnts "\n"]
1184    return "Invalid data range -- something is wrong!"
1185}
1186
1187proc AddDummyHist {np} {
1188    global newhist expgui expmap
1189    global tcl_platform
1190    set msg [ValidateDummyHist $np]
1191    if {$msg != ""} {
1192        MyMessageBox -parent $np -title  "Add Histogram Error" \
1193                -message "The following error(s) were found in your input:\n$msg" \
1194                -icon error -type ok -default ok \
1195                -helplink "expgui3.html AddHistErr"
1196        return
1197    }
1198
1199    set errmsg [runAddDummyHist $newhist(instfile) $newhist(setnum) \
1200                    $newhist(insttype) \
1201                    $newhist(tmin) $newhist(tmax) $newhist(tstep)]
1202    RecordMacroEntry "runAddDummyHist [list $newhist(instfile)] $newhist(setnum) $newhist(insttype) $newhist(tmin) $newhist(tmax) $newhist(tstep)" 0
1203
1204    if {$errmsg != ""} {
1205        append errmsg "\n" $out
1206    } else {
1207        set errmsg $out
1208    }
1209    if {[regexp {\(P,H,A\)} $expgui(exptoolout)]} {
1210        set msg {You must upgrade the EXPTOOL program.}
1211        append msg { This version cannot add dummy histograms.}
1212        MyMessageBox -icon error -title "Old EXPTOOL program" \
1213                -message $msg -parent $np \
1214                -helplink "expguierr.html OldEXPTOOL"
1215        # update the documentation & link
1216        destroy $np
1217    } elseif {$expgui(showexptool) || $errmsg != ""} {
1218        if {$errmsg != ""} {
1219            set err 1
1220            append errmsg "\n" $expgui(exptoolout) 
1221        } else {
1222            set err 0
1223            set errmsg $expgui(exptoolout) 
1224        }
1225        set msg "Please review the result from adding the dummy histogram" 
1226        if {$err} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
1227        ShowBigMessage $np $msg $errmsg OK "" $err
1228    } else {
1229        destroy $np
1230    }
1231    file delete exptool.in exptool.out
1232    # set the powpref warning (2 = required)
1233    set expgui(needpowpref) 2
1234    set msg "A histogram was added" 
1235    if {[string first $msg $expgui(needpowpref_why)] == -1} {
1236        append expgui(needpowpref_why) "\t$msg\n"
1237    }
1238}
1239proc runAddDummyHist {instfile setnum insttype tmin tmax tstep} {
1240    global expgui expmap tcl_platform
1241    set fp [open exptool.in w]
1242    puts $fp "D"
1243    puts $fp $instfile
1244    puts $fp $setnum
1245    if {$insttype == "TOF"} {
1246        puts $fp "C"
1247    }
1248    puts $fp $tmin
1249    puts $fp $tmax
1250    puts $fp $tstep
1251    puts $fp "X"
1252    puts $fp "0"
1253    close $fp
1254    # Save the current exp file
1255    savearchiveexp
1256    # disable the file changed monitor
1257    set expgui(expModifiedLast) 0
1258    set expnam [file root [file tail $expgui(expfile)]]
1259    set err [catch {
1260        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
1261            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool.exe] $expnam \
1262                    < exptool.in >& exptool.out
1263        } else {
1264            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool] $expnam \
1265                    < exptool.in >& exptool.out
1266        }
1267    } errmsg ]
1268    # load the revised exp file
1269    set oldpowderlist $expmap(powderlist)
1270    loadexp $expgui(expfile)
1271    set fp [open exptool.out r]
1272    set expgui(exptoolout) [read $fp]
1273    close $fp
1274    catch {file delete exptool.in exptool.out}
1275    if {[llength $oldpowderlist] == [llength $expmap(powderlist)]} {
1276        set err 1
1277        if {$errmsg == ""} {set errmsg "No histogram added"}
1278    }
1279    if {$err} {
1280        return $errmsg
1281    } else {
1282        return ""
1283    }
1284}
1285
1286#--- multiple histogram stuff
1287proc SetMultipleAdd {np} {
1288    global newhist
1289    $np.f6.b6c configure -state disabled
1290    catch {
1291        if {$newhist(instbanks) == [llength $newhist(banklist)] \
1292                && $newhist(instbanks) > 1} {
1293            $np.f6.b6c configure -state normal
1294        }
1295    }
1296}
1297
1298proc addMultiplehist {np} {
1299    global newhist
1300    # should not happen, but just in case
1301    if {$newhist(instbanks) != [llength $newhist(banklist)]} {
1302        $np.f6.b6c configure -state disable
1303        return
1304    }
1305    catch {destroy [set top $np.addMult]}
1306    toplevel $top
1307    grid [canvas $top.canvas \
1308            -scrollregion {0 0 5000 500} -width 0 -height 250 \
1309            -yscrollcommand "$top.scroll set"] \
1310            -column 0 -columnspan 2 -row 2 -sticky ns
1311    grid columnconfigure $top 0 -weight 1
1312    grid rowconfigure $top 2 -weight 1
1313    scrollbar $top.scroll \
1314            -command "$top.canvas yview"
1315    frame [set cfr $top.canvas.fr]
1316    $top.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $cfr
1317    grid [label $top.top -text "Select banks to add" -bg beige] \
1318            -column 0 -columnspan 3 -row 0 -sticky ew
1319    grid [frame $top.vartyp -bd 2 -relief groove] \
1320            -column 0 -columnspan 3 -row 1 -sticky ew
1321    grid [label $top.vartyp.top -text "Data limit units:"] -column 0 -row 0 -columnspan 3 -sticky w
1322    grid [radiobutton $top.vartyp.cb3 -text "d-min" -variable newhist(LimitMode) \
1323            -value 0] -column 0 -row 1 -sticky w
1324    grid [radiobutton $top.vartyp.cb4 -textvariable newhist(datalimlbl)  \
1325            -variable newhist(LimitMode) -anchor w -justify l \
1326            -value 1] -column 1 -row 1 -sticky w
1327    grid [radiobutton $top.vartyp.cb5 -text "Q-max" -variable newhist(LimitMode) \
1328            -value 2] -column 2 -row 1 -sticky w
1329    set newhist(LimitMode) 1
1330   
1331    grid [button $top.add -text Add -command "destroy $np"] -column 0 -row 3
1332    grid [button $top.cancel -text Cancel -command "destroy $top"] \
1333            -column 1 -row 3 -columnspan 2
1334    set row 1
1335    grid [label $cfr.t1 -text "Bank\n#"] -column 0 -row 0
1336    switch $newhist(insttype) {
1337        TOF {set newhist(datalimlbl) "T-min\n(ms)"}
1338        ED  {set newhist(datalimlbl) "E-max\n(KeV)"}
1339        default {set newhist(datalimlbl) "2theta\nmax"}
1340    }
1341    grid [label $cfr.t2 -textvariable newhist(datalimlbl)] -column 1 -row 0
1342    foreach i $newhist(banklist) {
1343        grid [checkbutton $cfr.c$i -text $i \
1344                -variable newhist(usebank$i)] \
1345                -column 0 -row [incr row] -sticky w
1346        set newhist(usebank$i) 1
1347        grid [entry $cfr.e$i -width 8 -textvariable newhist(tlimit$i)] \
1348            -column 1 -row $row -sticky w
1349        lappend newhist(LimitMode_boxes) $cfr.e$i
1350        if {$newhist(insttype) == "TOF"} {
1351            set newhist(tlimit$i) $newhist(tmin$i)
1352        } else {
1353            set newhist(tlimit$i) $newhist(tmax$i)
1354        }
1355    }
1356    # resize the list
1357    update
1358    set sizes [grid bbox $top.canvas.fr]
1359    $top.canvas config -scrollregion $sizes -width [lindex $sizes 2]
1360    # use the scroll for BIG lists
1361    if {[lindex $sizes 3] > [winfo height $top.canvas]} {
1362        grid $top.scroll -sticky ns -column 3 -row 2
1363    } else {
1364        grid forget $top.scroll 
1365    }
1366    update
1367    putontop $top
1368    tkwait window $top
1369    afterputontop
1370
1371    if {[winfo exists $np]} return
1372
1373    # validate the input
1374    set err {}
1375    if {[string trim $newhist(rawfile)] == ""} {
1376        append err "  No data file specified\n"
1377    }
1378    if {[string trim $newhist(instfile)] == ""} {
1379        append err "  No instrument parameter file specified\n"
1380    }
1381    foreach i $newhist(banklist) {
1382        if {$newhist(usebank$i)} {
1383            if {[catch {expr $newhist(tlimit$i)}]} {
1384                append err "  The Max/Min limit is not valid for bank $i\n"
1385            } elseif {$newhist(tlimit$i) <= 0} {
1386                append err "  The Max/Min limit is not valid for bank $i\n"
1387            }
1388        }
1389    }
1390    if {$err != ""} {
1391        MyMessageBox -parent $np -title  "Add Histogram Error" \
1392                -message "The following error(s) were found in your input:\n$err" \
1393                -icon error -type ok -default ok \
1394                -helplink "expgui3.html AddHistErr"
1395        return
1396    }
1397
1398    # ok do it!
1399    global tcl_platform expmap expgui
1400    # Save the current exp file
1401    savearchiveexp
1402    set oldpowderlist $expmap(powderlist)
1403    # disable the file changed monitor
1404    set expgui(expModifiedLast) 0
1405    set k 0
1406    set added 0
1407    set outlog {}
1408    set err 0
1409    pleasewait "adding histograms" expgui(temp)
1410    foreach i $newhist(banklist) {
1411        incr k
1412        if {$newhist(usebank$i)} {
1413            incr added
1414            set expgui(temp) "adding bank $i"
1415            update
1416
1417            if {$newhist(LimitMode) == 1} {
1418                set mode "T"
1419                set value $newhist(tlimit$i)
1420            } elseif {$newhist(LimitMode) == 2} {
1421                set mode "D"
1422                set Q 100
1423                catch {set Q [expr {4*acos(0)/$newhist(tlimit$i)}]}
1424                set value $Q
1425            } else {
1426                set mode "D"
1427                set value $newhist(tlimit$i)
1428            }
1429            set errmsg [runAddHist $newhist(rawfile) $newhist(instfile) $i $k $mode $value]
1430            # save call to Macro file
1431            RecordMacroEntry "runAddHist [list $newhist(rawfile)] [list $newhist(instfile)] $i $k $mode $value" 0
1432            if {$errmsg != ""} {
1433                append outlog "\n\n\nNOTE ERROR:\n" $errmsg $expgui(exptoolout)
1434                set err 1
1435            } else {
1436                append outlog $expgui(exptoolout)
1437            }
1438        }
1439    }
1440    # load the revised exp file
1441    loadexp $expgui(expfile)
1442    if {[llength $oldpowderlist]+$added != [llength $expmap(powderlist)]} {
1443        set err 1
1444    }
1445    # set the powpref warning (2 = required)
1446    set expgui(needpowpref) 2
1447    set msg "A histogram was added" 
1448    if {[string first $msg $expgui(needpowpref_why)] == -1} {
1449        append expgui(needpowpref_why) "\t$msg\n"
1450    }
1451    donewait 
1452    if {$expgui(showexptool) || $err} {
1453        set msg "Please review the result from adding the histogram" 
1454        if {$err} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
1455        ShowBigMessage $np $msg $outlog OK "" $err
1456    }
1457    # select the most recently added histogram
1458    if {!$err} {
1459        set i [llength $expmap(histlistboxcontents)]
1460        if {$i > 0} {
1461            incr i -1
1462            set expgui(curhist) $i
1463            sethistlist
1464        }
1465    }
1466}
1467
1468#----------- Add Atoms routines ----------------------------------------
1469proc MakeAddAtomsBox {phase "atomlist {}"} {
1470    global expmap expgui
1471
1472    # is there room for more atoms? Well, we will check this someday
1473    if {$phase == ""} return
1474    if {[llength $phase] != 1} return
1475
1476    set top .newatoms
1477    catch {destroy $top}
1478    toplevel $top
1479    bind $top <Key-F1> "MakeWWWHelp expgui2.html addatoms"
1480
1481    grid [label $top.l1 -relief groove -bd 4 -anchor center\
1482            -text "Adding atoms to phase #$phase"] \
1483            -column 0 -row 0 \
1484            -sticky we -columnspan 10
1485   
1486    grid [canvas $top.canvas \
1487            -scrollregion {0 0 5000 500} -width 0 -height 250 \
1488            -yscrollcommand "$top.scroll set"] \
1489            -column 0 -row 2 -columnspan 4 -sticky nsew
1490    grid columnconfigure $top 3 -weight 1
1491    grid rowconfigure $top 2 -weight 1
1492    grid rowconfigure $top 1 -pad 5
1493    scrollbar $top.scroll \
1494            -command "$top.canvas yview"
1495    frame $top.canvas.fr
1496    $top.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $top.canvas.fr
1497
1498    set np $top.canvas.fr
1499    set row 0
1500    set col 0
1501    grid [label $np.l_${row}0 -text "  #  "] -column $col -row $row
1502    foreach i {Atom\ntype Name x y z Occ Uiso} \
1503            var {type name x y z occ uiso} {
1504        grid [button $np.l_${row}$i -text $i -padx 0 -pady 0 \
1505                -command "sortAddAtoms $phase $top $var"] \
1506                -column [incr col] -row $row -sticky nsew
1507    }
1508    grid [label $np.l_${row}Use -text Use\nFlag] -column [incr col] -row $row
1509
1510    set expgui(SetAddAtomsScroll) 0
1511    set i [llength $atomlist]
1512    if {$i == 0} {incr i}
1513    for {set j 0} {$j < $i} {incr j} {
1514        MakeAddAtomsRow $top
1515    }
1516    set row 0
1517    foreach item $atomlist {
1518        incr row
1519        foreach val $item w {n x y z t o u} {
1520            if {$val != ""} {
1521                $np.e${row}$w delete 0 end
1522                $np.e${row}$w insert end $val
1523            }
1524        }
1525    }
1526    bind $top <Configure> "SetAddAtomsScroll $top"
1527    grid rowconfigure $top 3 -min 10
1528    grid [button $top.b1 -text "Add Atoms"\
1529            -command "addatom $phase $top"] -column 0 -row 5 -sticky w
1530    bind $top <Return> "addatom $phase $top"
1531    grid [button $top.b2 -text Cancel \
1532            -command "destroy $top"] -column 1 -row 5 -sticky w
1533    grid [button $top.help -text Help -bg yellow \
1534            -command "MakeWWWHelp expgui2.html addatoms"] \
1535            -column 0 -columnspan 2 -row 4
1536
1537    # get the input formats if not already defined
1538    GetImportFormats
1539    if {[llength $expgui(importFormatList)] > 0} {
1540        grid [frame $top.fr -bd 4 -relief groove] \
1541                -column 3 -row 5 -columnspan 2 -sticky e
1542        grid [button $top.fr.b3 -text "Import atoms from: " \
1543                -command "ImportAtoms \$expgui(importFormat) $top $phase"] \
1544                -column 0 -row 0 -sticky e
1545        set menu [eval tk_optionMenu $top.fr.b4 expgui(importFormat) \
1546                $expgui(importFormatList)]
1547        for {set i 0} {$i <= [$menu index end]} {incr i} {
1548            $menu entryconfig $i -command "ImportAtoms \$expgui(importFormat) $top $phase"
1549        }
1550        grid $top.fr.b4 -column 1 -row 0 -sticky w
1551        grid rowconfig $top.fr 0 -pad 10
1552        grid columnconfig $top.fr 0 -pad 10
1553        grid columnconfig $top.fr 1 -pad 10
1554    }
1555
1556    grid [button $top.b3 -text  "More atom boxes" \
1557            -command "MakeAddAtomsRow $top"] -column 3 \
1558            -columnspan 2 -row 4 -sticky e
1559   
1560    wm title $top "add new atom"
1561
1562    # set grab, etc.
1563    putontop $top
1564
1565    tkwait window $top
1566
1567    # fix grab...
1568    afterputontop
1569}
1570
1571proc MakeAddAtomsRow {top} {
1572    set np $top.canvas.fr
1573    set col -1
1574    set row 1
1575    # find an empty row
1576    while {![catch {grid info $np.e${row}t}]} {incr row}
1577    grid [label $np.e${row}num -text $row] -column [incr col]  -row $row
1578    grid [entry $np.e${row}t -width 5] -column [incr col]  -row $row
1579    grid [entry $np.e${row}n -width 8] -column [incr col]  -row $row
1580    foreach i {x y z o u} {
1581        grid [entry $np.e${row}$i -width 9] -column [incr col] -row $row
1582    }
1583    grid [checkbutton $np.e${row}use -variable expgui(UseAtom$row)] \
1584            -column [incr col] -row $row
1585    # default occupancy
1586    $np.e${row}o delete 0 end
1587    $np.e${row}o insert end 1.0
1588    # default Uiso
1589    $np.e${row}u delete 0 end
1590    $np.e${row}u insert end 0.025
1591    # default label
1592    $np.e${row}n delete 0 end
1593    $np.e${row}n insert end (default)
1594    # use by default
1595    $np.e${row}use select
1596
1597    SetAddAtomsScroll $top
1598    return $row
1599}
1600
1601proc SetAddAtomsScroll {top} {
1602    global expgui
1603    if $expgui(SetAddAtomsScroll) return
1604    # prevent reentrance
1605    set expgui(SetAddAtomsScroll) 1
1606    update
1607    set sizes [grid bbox $top.canvas.fr]
1608    $top.canvas config -scrollregion $sizes -width [lindex $sizes 2]
1609    # use the scroll for BIG atom lists
1610    if {[lindex $sizes 3] > [winfo height $top.canvas]} {
1611        grid $top.scroll -sticky ns -column 4 -row 2
1612    } else {
1613        grid forget $top.scroll 
1614    }
1615    update
1616    set expgui(SetAddAtomsScroll) 0
1617}
1618
1619# Validate the atoms in the atoms add/phase replace box
1620# returns a null string on error or a list of atoms
1621proc ValidateAtomsBox {top np} {
1622    global expgui
1623    set row 0
1624    # loop over the defined rows
1625    set err {}
1626    set atomlist {}
1627    set validatmtypes {
1628        H H-1 H_1 H_2 D H_3 HE HE_3 HE_4 LI LI+1 LI_6 LI_7 BE BE+2 B B_10
1629        B_11 C CV C_12 C_13 N N_14 N_15 O O-1 O-2 O_16 O_17 O_18 F F-1 F_19 NE
1630        NE_20 NE_21 NE_22 NA NA+1 NA_23 MG MG+2 MG_24 MG_25 MG_26 AL AL+3
1631        AL_27 SI SI+4 SIV SI_28 SI_29 SI_30 P P_31 S S_32 S_33 S_34 CL CL-1
1632        CL_35 CL_37 AR AR_36 AR_40 K K+1 K_39 K_41 CA CA+2 CA_40 CA_44 SC SC+3
1633        SC_45 TI TI+2 TI+3 TI+4 TI_46 TI_47 TI_48 TI_49 TI_50 V V+2 V+3 V+5
1634        V_51 CR CR+2 CR+3 CR_50 CR_52 CR_53 CR_54 MN MN+2 MN+3 MN+4 MN_55 FE
1635        FE+2 FE+3 FE_54 FE_56 FE_57 FE_58 CO CO+2 CO+3 CO_59 NI NI+2 NI+3
1636        NI_58 NI_60 NI_61 NI_62 NI_64 CU CU+1 CU+2 CU_63 CU_65 ZN ZN+2 ZN_64
1637        ZN_66 ZN_67 ZN_68 GA GA+3 GE GE+4 AS AS_75 SE BR BR-1 BR_79 BR_81 KR
1638        RB RB+1 SR SR+2 Y Y+3 Y_89 ZR ZR+4 NB NB+3 NB+5 NB_93 MO MO+3 MO+5
1639        MO+6 TC TC_98 RU RU+3 RU+4 RH RH+3 RH+4 RH_103 PD PD+2 PD+4 AG AG+1
1640        AG+2 CD CD+2 CD_112 CD_113 CD_114 CD_116 IN IN+3 IN_113 IN_115 SN SN+2
1641        SN+4 SB SB+3 SB+5 TE I I-1 I_127 XE CS CS+1 CS_133 BA BA+2 LA LA+3 CE
1642        CE+3 CE+4 PR PR+3 PR+4 PR_141 ND ND+3 PM PM+3 PM_147 SM SM+3 SM_152
1643        SM_154 EU EU+2 EU+3 EU_153 GD GD+3 GD_160 TB TB+3 TB_159 DY DY+3 HO
1644        HO+3 HO_165 ER ER+3 TM TM+3 TM_169 YB YB+2 YB+3 LU LU+3 HF HF+4 TA
1645        TA+5 TA_181 W W+6 RE OS OS+4 IR IR+3 IR+4 PT PT+2 PT+4 AU AU+1 AU+3
1646        AU_197 HG HG+1 HG+2 TL TL+1 TL+3 PB PB+2 PB+4 BI BI+3 BI+5 BI_209 PO
1647        PO_210 AT AT_210 RN RN_222 FR FR_223 RA RA+2 RA_226 AC AC+3 AC_227 TH
1648        TH+4 TH_232 PA PA_231 U U+3 U+4 U+6 U_235 U_238 NP NP+3 NP+4 NP+6
1649        NP_237 PU PU+3 PU+4 PU+6 PU_239 PU_240 PU_242 AM AM_243 CM CM_244 BK
1650        BK_247 CF CF_249
1651    }
1652    # loop over the defined rows
1653    while {![catch {grid info $np.e[incr row]t}]} {
1654        if !{$expgui(UseAtom$row)} continue
1655        # ignore blank entries
1656        set line {}
1657        foreach i {t x y z} {
1658            append line [string trim [$np.e${row}$i get]]
1659        }
1660        if {$line == ""} continue
1661
1662        # validate the input
1663        if {[set type [string trim [$np.e${row}t get]]] == ""} {
1664            append err "  line $row: No atom type specified\n"
1665        }
1666        if {[lsearch $validatmtypes [string toupper $type]] == -1} {
1667            append err "  line $row: Atom type $type is not defined for x-rays in GSAS. If you are fitting magnetic scattering, this could be defined. If so, use a different type and use EXPEDT to change the type back.\n\n"
1668        }
1669        set name [string trim [$np.e${row}n get]]
1670        if {$name == "(default)"} {set name "/"}
1671        if {$name == ""} {set name "/"}
1672        foreach i {x y z o u} n {x y z Occ Uiso} {
1673            if {[set $i [string trim [$np.e${row}$i get]]] == ""} {
1674                append err "  line $row: No value specified for $n\n"
1675            } elseif {[catch {expr [set $i]}]} {
1676                append err "  line $row: The value for $n is invalid\n"
1677            }
1678        }
1679        lappend atomlist "$type $x $y $z $o $name I $u"
1680    }
1681    if {$err != ""} {
1682        MyMessageBox -icon warning -message "Note Errors:\n$err" -parent $top
1683        return {}
1684    }
1685    if {[llength $atomlist] == 0} {
1686        MyMessageBox -icon warning -message "No atoms to load!" -parent $top
1687        return {}
1688    }
1689    return $atomlist
1690}
1691
1692proc runAddAtoms {phase atomlist} {
1693    global expgui env expmap tcl_platform
1694    # needed in UNIX
1695    set env(ATOMDATA) [file join $expgui(gsasdir) data atmdata.dat]
1696    set env(gsas) [file nativename $expgui(gsasdir)]
1697    # needed in Windows
1698    set env(GSAS) [file nativename $expgui(gsasdir)]
1699
1700    set fp [open exptool.in w]
1701    puts $fp "A"
1702    puts $fp $phase
1703    # number of atoms
1704    puts $fp [llength $atomlist]
1705    foreach atomline $atomlist {
1706        puts $fp $atomline
1707    }
1708    close $fp
1709 
1710    # Save the current exp file
1711    savearchiveexp
1712    # disable the file changed monitor
1713    set expgui(expModifiedLast) 0
1714    set expnam [file root [file tail $expgui(expfile)]]
1715
1716    set err [catch {
1717        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
1718            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool.exe] $expnam \
1719                    < exptool.in >& exptool.out
1720        } else {
1721            exec [file join $expgui(gsasexe) exptool] $expnam \
1722                    < exptool.in >& exptool.out
1723        }
1724    } errmsg]
1725    # load the revised exp file
1726    set oldatomlist $expmap(atomlist_$phase)
1727    loadexp $expgui(expfile)
1728    set fp [open exptool.out r]
1729    set expgui(exptoolout) [read $fp]
1730    close $fp
1731    catch {file delete exptool.in exptool.out}
1732    if {[llength $oldatomlist] == [llength $expmap(atomlist_$phase))]} {
1733        set err 1
1734        if {$errmsg == ""} {set errmsg "No atom(s) added"}
1735    }
1736}
1737
1738proc addatom {phase top} {
1739    global expgui env expmap
1740    set np $top.canvas.fr
1741    # validate the atoms info
1742    set atomlist [ValidateAtomsBox $top $np]
1743    if {$atomlist == ""} return
1744
1745    # ok add the atoms!
1746    set errmsg [runAddAtoms $phase $atomlist]
1747    RecordMacroEntry "runAddAtoms $phase [list $atomlist]" 0
1748
1749    destroy $top
1750    set err 0
1751    if {$errmsg != ""} {
1752        append errmsg "\n" $expgui(exptoolout)
1753        set err 1
1754    } else {
1755        set errmsg $expgui(exptoolout)
1756    }
1757    if {$expgui(showexptool) || $err} {
1758        set msg "Please review the result from adding the atom(s)" 
1759        if {$err} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
1760        ShowBigMessage $top $msg $errmsg OK "" $err
1761    }
1762}
1763
1764#---------------------------------------------------------------------------
1765# commands to modify a group of selected atoms
1766#---------------------------------------------------------------------------
1767
1768# make the dialog to choose an action
1769proc MakeXformAtomsBox {phase} {
1770    global expgui expmap
1771    set numberList {}
1772    set p $expgui(curPhase)
1773    foreach AtomIndex $expgui(selectedatomlist) {
1774        # get atom number & phase
1775        set tuple [lindex $expmap(atomlistboxcontents) $AtomIndex]
1776        lappend numberList [lindex $tuple 0]
1777    }
1778    if {$numberList == ""} return
1779    if {[llength $numberList] > 1} {
1780        set suffix s
1781        set suffixy "ies"
1782    } else {
1783        set suffix ""
1784        set suffixy "y"
1785    }
1786    set w .global
1787    catch {destroy $w}
1788    toplevel $w
1789    wm title $w "Edit Atomic Parameter -- phase #$phase"
1790    bind $w <Key-F1> "MakeWWWHelp expgui2.html xform"
1791    # this needs to track by phase
1792    grid [label $w.0 \
1793            -text "Modifying atom${suffix} [CompressList $numberList] Phase $phase" \
1794            -bg yellow -anchor center] -row 0 -column 0 -columnspan 10 \
1795            -sticky nsew
1796    grid rowconfigure $w 0 -pad 5
1797    grid rowconfigure $w 1 -minsize 2
1798
1799    grid [TitleFrame $w.1 -bd 6 -relief groove -text "Modify coordinates"] \
1800            -row 2 -column 0 -columnspan 10 -sticky news
1801    set w1 [$w.1 getframe]
1802    set row 0
1803    foreach v {x y z} {
1804        incr row
1805        set col -1
1806        grid [label $w1.l$v -text "new $v   =   "] -column [incr col] -row $row
1807        foreach o {x y z} {
1808            grid [entry $w1.e${v}${o} -width 6] -column [incr col] -row $row
1809            $w1.e${v}${o} delete 0 end
1810            if {$v == $o} {
1811                $w1.e${v}${o} insert end "1.0"
1812            } else {
1813                $w1.e${v}${o} insert end "0."
1814            }
1815            grid [label $w1.p${v}${o} -text " $o  +  "] \
1816                    -column [incr col] -row $row
1817        }
1818        grid [entry $w1.e${v} -width 6] -column [incr col] -row $row
1819        $w1.e${v} delete 0 end
1820        $w1.e${v} insert end "0."
1821    }
1822    grid [button $w1.do -text "Transform Coordinates" \
1823            -command "XformAtomsCoord $phase [list $numberList] $w1" \
1824            ] -row [incr row] -column 0 -columnspan 10
1825
1826    set shift [GetOrigin1Shift $phase]
1827    grid [button $w1.d1 -text "Xform Origin 1 to Origin 2" \
1828              -command "XformAtoms2Origin2 $phase [list $numberList] $w1 [list $shift]" \
1829             ] -row [incr row] -column 3 -columnspan 10 -sticky e
1830    if {$shift == ""} {$w1.d1 config -state disabled}
1831
1832    grid [button $w1.d4 -text "Reset Multiplicities" \
1833                -command "ResetMultiplicities $phase $w" \
1834                ] -row $row -column 0 -columnspan 3 -sticky w
1835
1836
1837    grid rowconfigure $w 3 -minsize 5
1838    grid [TitleFrame $w.4 -bd 6 -relief groove -text "Modify occupanc${suffixy}"] \
1839            -row 4 -column 0 -columnspan 10 -sticky news
1840    set w2 [$w.4 getframe]
1841    grid [label $w2.1 -text "Occupancy: "] -row 1 -column 0
1842    grid [entry $w2.e -width 10] -column 1 -row 1
1843    $w2.e delete 0 end
1844    $w2.e insert end 1.0
1845    grid columnconfigure $w2 2 -weight 1
1846    grid [button $w2.do -text "Set Occupanc${suffixy}" \
1847            -command "XformAtomsOcc $phase [list $numberList] $w2" \
1848            ] -row 2 -column 0 -columnspan 10
1849
1850    grid rowconfigure $w 5 -minsize 5
1851    grid [TitleFrame $w.6 -bd 6 -relief groove \
1852            -text "Modify Displacement Parameter$suffix"] \
1853            -row 6 -column 0 -columnspan 10 -sticky news
1854    set w2 [$w.6 getframe]
1855    grid [entry $w2.e -width 10] -column 1 -row 1
1856    $w2.e delete 0 end
1857    $w2.e insert end 0.025
1858    grid columnconfigure $w2 2 -weight 1
1859    grid [button $w2.do -text "Set U" \
1860            -command "XformAtomsU $phase [list $numberList] $w2" \
1861            ] -row 2 -column 0 -columnspan 10
1862    grid [frame $w2.f] -row 3 -column 0 -columnspan 10
1863
1864    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$p - 1}]] != 4} {
1865        grid [label $w2.1 -text "Uiso or Uequiv: "] -row 1 -column 0
1866        grid [button $w2.f.iso -text "Set Isotropic" \
1867                -command "XformAtomsU $phase [list $numberList] iso" \
1868                ] -row 0 -column 0
1869        grid [button $w2.f.aniso -text "Set Anisotropic" \
1870                -command "XformAtomsU $phase [list $numberList] aniso" \
1871                ] -row 0 -column 1
1872    } else {
1873        grid [label $w2.1 -text "Uiso: "] -row 1 -column 0
1874    }
1875
1876    grid rowconfigure $w 7 -minsize 5
1877    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$p - 1}]] != 4} {
1878        grid [TitleFrame $w.8 -bd 6 -relief groove \
1879                -text "Erase Atom$suffix"] \
1880                -row 8 -column 0 -columnspan 10 -sticky news
1881        set w2 [$w.8 getframe]
1882        grid [button $w2.do -text "Erase Atom${suffix}" \
1883                -command "EraseAtoms $phase [list $numberList] $w" \
1884                ] -row 2 -column 0 -columnspan 10
1885    }
1886
1887    grid rowconfigure $w 11 -minsize 5
1888    grid [frame $w.b] -row 12 -column 0 -columnspan 10 -sticky ew
1889    pack [button $w.b.3 -text Close -command "destroy $w"] -side left \
1890            -padx 5 -pady 5
1891    pack [button $w.b.help -text Help -bg yellow \
1892            -command "MakeWWWHelp expgui2.html xform"] -side right \
1893            -padx 5 -pady 5
1894    bind $w <Return> "destroy $w"
1895
1896    # force the window to stay on top
1897    putontop $w
1898    focus $w.b.3
1899    tkwait window $w
1900    afterputontop
1901    # if there are selected atoms, reset their display
1902    if {[llength $expgui(selectedatomlist)] != 0} editRecord
1903}
1904
1905# transform the coordinates
1906proc XformAtomsCoord {phase numberList w1} {
1907    global expgui expmap
1908    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
1909        set cmd mmatominfo
1910    } else {
1911        set cmd atominfo
1912    }
1913    # get the matrix
1914    foreach v {x y z} {
1915        foreach o {x y z} {
1916            set matrix(${v}${o}) [$w1.e${v}${o} get]
1917        }
1918        set matrix(${v}) [$w1.e${v} get]
1919    }
1920    foreach atom $numberList {
1921        foreach v {x y z} {
1922            set $v [$cmd $phase $atom $v]
1923        }
1924        foreach v {x y z} {
1925            set new$v $matrix(${v})
1926            foreach o {x y z} {
1927                set new$v [expr [set new$v] + $matrix(${v}${o})*[set $o]]
1928            }
1929            $cmd $phase $atom $v set [set new$v]
1930            RecordMacroEntry "$cmd $phase $atom $v set [set new$v]" 0
1931        }
1932        incr expgui(changed)
1933    }
1934    RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0
1935    # update multiplicities for the phase
1936    set parent [winfo toplevel $w1]
1937    ResetMultiplicities $phase $parent
1938    SelectOnePhase $phase
1939    MyMessageBox -parent $parent -type OK -default ok -title "Transform applied" \
1940        -message "The coordinates of atoms [CompressList $numberList] have been transformed"
1941#    UpdateAtomLine $numberList $phase
1942    destroy $parent
1943}
1944
1945# set the occupancies to a single value
1946proc XformAtomsOcc {phase numberList w2} {
1947    global expgui expmap
1948    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
1949        set cmd mmatominfo
1950    } else {
1951        set cmd atominfo
1952    }
1953    # get the value
1954    set val [$w2.e get]
1955    foreach atom $numberList {
1956        $cmd $phase $atom frac set $val
1957        RecordMacroEntry "$cmd $phase $atom frac set $val" 0
1958        incr expgui(changed)
1959    }
1960    RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0
1961    UpdateAtomLine $numberList $phase
1962}
1963
1964# transform Uiso or Uij; if anisotropic set Uequiv to Uij
1965proc XformAtomsU {phase numberList w2} {
1966    global expgui
1967    set istart $expgui(changed)
1968    if {$w2 == "iso"} {
1969        foreach atom $numberList {
1970            if {[atominfo $phase $atom temptype] != "I"} {
1971                atominfo $phase $atom temptype set I
1972                RecordMacroEntry "atominfo $phase $atom temptype set I" 0
1973                incr expgui(changed)
1974            }
1975        }
1976    } elseif {$w2 == "aniso"} {
1977        foreach atom $numberList {
1978            if {[atominfo $phase $atom temptype] == "I"} {
1979                atominfo $phase $atom temptype set A
1980                RecordMacroEntry "atominfo $phase $atom temptype set A" 0
1981                incr expgui(changed)
1982            }
1983        }
1984    } else {
1985        # get the value
1986        set val [$w2.e get]
1987        foreach atom $numberList {
1988            global expmap
1989            if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
1990                mmatominfo $phase $atom Uiso set $val
1991                RecordMacroEntry "mmatominfo $phase $atom Uiso set $val" 0
1992            } elseif {[atominfo $phase $atom temptype] == "I"} {
1993                atominfo $phase $atom Uiso set $val
1994                RecordMacroEntry "atominfo $phase $atom Uiso set $val" 0
1995            } else {
1996                foreach var {U11 U22 U33} {
1997                    atominfo $phase $atom $var set $val
1998                    RecordMacroEntry "atominfo $phase $atom $var set $val" 0
1999                }
2000                foreach var {U12 U13 U23} {
2001                    atominfo $phase $atom $var set 0.0
2002                    RecordMacroEntry "atominfo $phase $atom $var set 0.0" 0
2003                }
2004            }
2005            incr expgui(changed)
2006        }
2007    }
2008    if {$istart != $expgui(changed)} {RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0}
2009    UpdateAtomLine $numberList $phase
2010}
2011
2012# confirm and erase atoms
2013proc EraseAtoms {phase numberList w2} {
2014    global expgui
2015    if {[llength $numberList] <= 0} return
2016    # make a list of atoms
2017    foreach atom $numberList {
2018        append atomlist "\n\t$atom  [atominfo $phase $atom label]"
2019    }
2020    set msg "OK to remove the following [llength $numberList] atoms from phase $phase:$atomlist"
2021    set val [MyMessageBox -parent $w2 -type okcancel -icon warning \
2022            -default cancel -title "Confirm Erase" -message $msg]
2023    if {$val == "ok"} {
2024        foreach atom $numberList {
2025            EraseAtom $atom $phase
2026            RecordMacroEntry "EraseAtom $atom $phase" 0
2027            incr expgui(changed)
2028        }
2029        RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0
2030        mapexp
2031        RecordMacroEntry "mapexp" 0
2032        DisplayAllAtoms $phase
2033        destroy $w2
2034    }
2035}
2036
2037#----------- more Add Phase routines (import) -------------------------------
2038proc ImportPhase {format np} {
2039    global expgui
2040    if {[llength $expgui(extensions_$format)] == 1} {
2041        lappend typelist [list $format $expgui(extensions_$format)]
2042    } else {
2043        foreach item $expgui(extensions_$format) {
2044            lappend typelist [list "All $format" $item]
2045            lappend typelist [list "$format $item" $item]
2046        }
2047    }
2048    lappend typelist [list "All files" *]
2049    set file [tk_getOpenFile -parent $np -filetypes $typelist]
2050    if {![file exists $file]} return
2051    # read in the file
2052    set input [$expgui(proc_$format) $file]
2053    catch {
2054        $np.bf.b1 config -text "Continue" -command "addphase $np; AddAtomsList"
2055        bind $np <Return> "addphase $np; AddAtomsList"
2056    }
2057    catch {
2058        $np.t1 delete 0 end
2059        $np.t1 insert end "from $file"
2060    }
2061    $np.t2 delete 0 end
2062    $np.t2 insert end [lindex $input 0]
2063    foreach i {.e1a .e1b .e1c .e2a .e2b .e2g} val [lindex $input 1] {
2064        $np.f$i delete 0 end
2065        $np.f$i insert end $val
2066    }
2067    set expgui(coordList) [lindex $input 2]
2068    set msg [lindex $input 3]
2069    if {$msg != ""} {
2070        catch {destroy $np.msg}
2071        grid [label $np.msg -text $msg -fg red -anchor center -bd 4 -relief raised] \
2072                -column 0 -columnspan 99 -row 20 -sticky ew
2073    }
2074}
2075
2076proc ImportAtoms {format top phase} {
2077    global expgui
2078    if {[llength $expgui(extensions_$format)] == 1} {
2079        lappend typelist [list $format $expgui(extensions_$format)]
2080    } else {
2081        foreach item $expgui(extensions_$format) {
2082            lappend typelist [list "All $format" $item]
2083            lappend typelist [list "$format $item" $item]
2084        }
2085    }
2086    lappend typelist [list "All files" *]
2087    set file [tk_getOpenFile -parent $top -filetypes $typelist]
2088    if {![file exists $file]} return
2089    # disable during read
2090    catch {
2091        foreach b "$top.b1 $top.b2 $top.fr.b3" {
2092            $b config -state disabled
2093        }
2094    }
2095    # read in the file
2096    set input [$expgui(proc_$format) $file]
2097    # add atoms to table
2098    foreach item [lindex $input 2] {
2099        set row [MakeAddAtomsRow $top]
2100        set np $top.canvas.fr
2101        foreach val $item w {n x y z t o u} {
2102            if {$val != ""} {
2103                $np.e${row}$w delete 0 end
2104                $np.e${row}$w insert end $val
2105            }
2106        }
2107    }
2108    # sort the atoms by number, so that empty entries are at the bottom
2109    sortAddAtoms $phase $top number
2110    # reenable
2111    catch {
2112        foreach b "$top.b1 $top.b2 $top.fr.b3" {
2113            $b config -state normal
2114        }
2115    }
2116}
2117
2118proc AddAtomsList {} {
2119    global expgui expmap
2120    # skip if we aborted out of addphase
2121    if {$expgui(oldphaselist) == -1} return
2122    # find the new phase
2123    set phase {}
2124    foreach p $expmap(phaselist) {
2125        if {[lsearch $expgui(oldphaselist) $p] == -1} {
2126            set phase $p
2127            break
2128        }
2129    }
2130    if {$phase == ""} return
2131    MakeAddAtomsBox $phase $expgui(coordList)
2132}
2133
2134# get the input formats by sourcing files named import_*.tcl
2135proc GetImportFormats {} {
2136    global expgui tcl_platform
2137    # only needs to be done once
2138    if [catch {set expgui(importFormatList)}] {
2139        set filelist [glob -nocomplain [file join $expgui(scriptdir) import_*.tcl]]
2140        foreach file $filelist {
2141            set description ""
2142            source $file
2143            if {$description != ""} {
2144                lappend expgui(importFormatList) $description
2145                if {$tcl_platform(platform) == "unix"} {
2146                    set extensions "[string tolower $extensions] [string toupper $extensions]"
2147                }
2148                set expgui(extensions_$description) $extensions
2149                set expgui(proc_$description) $procname
2150            }
2151        }
2152    }
2153}
2154
2155proc MakeReplacePhaseBox {} {
2156    global expmap expgui tcl_platform
2157
2158    set expgui(coordList) {}
2159    # ignore the command if no phase is selected
2160    foreach p {1 2 3 4 5 6 7 8 9} {
2161        if {[lsearch $expmap(phaselist) $expgui(curPhase)] == -1} {
2162            return
2163        }
2164    }
2165
2166    set top .newphase
2167    catch {destroy $top}
2168    toplevel $top
2169    bind $top <Key-F1> "MakeWWWHelp expgui2.html replacephase"
2170
2171    grid [label $top.l1 -text "Replacing phase #$expgui(curPhase)" \
2172            -bg yellow -anchor center] -column 0 -columnspan 8 -row 0 -sticky ew
2173    grid [label $top.l3a -text "Current Space Group: "] \
2174            -column 0 -row 2 -columnspan 2 -sticky e
2175    grid [label $top.l3b -text [phaseinfo $expgui(curPhase) spacegroup]\
2176            -bd 4 -relief groove] \
2177            -column 2 -row 2  -sticky ew
2178    grid [label $top.l4 -text "New Space Group: "] \
2179            -column 0 -row 3 -columnspan 2 -sticky e
2180    grid [entry $top.t2 -width 12] -column 2 -row 3 -sticky w
2181    grid [radiobutton $top.r1 -text "Reenter current atoms"\
2182            -variable expgui(DeleteAllAtoms) -value 0] \
2183            -column 1 -row 4 -columnspan 8 -sticky w
2184    grid [radiobutton $top.r2 -text "Delete current atoms" \
2185            -variable expgui(DeleteAllAtoms) -value 1] \
2186            -column 1 -row 5 -columnspan 8 -sticky w
2187   
2188    grid [frame $top.f -bd 4 -relief groove] \
2189            -column 3 -row 2 -columnspan 3 -rowspan 4
2190    set col -1
2191    foreach i {a b c} {
2192        grid [label $top.f.l1$i -text " $i "] -column [incr col] -row 1
2193        grid [entry $top.f.e1$i -width 12] -column [incr col]  -row 1
2194        $top.f.e1$i delete 0 end
2195        $top.f.e1$i insert 0 [phaseinfo $expgui(curPhase) $i]
2196    }
2197    set col -1
2198    foreach i {a b g} var {alpha beta gamma} {
2199        grid [label $top.f.l2$i -text $i] -column [incr col] -row 2
2200        set font [$top.f.l2$i cget -font]
2201        $top.f.l2$i config -font "Symbol [lrange $font 1 end]"
2202        grid [entry $top.f.e2$i -width 12] -column [incr col]  -row 2
2203        $top.f.e2$i delete 0 end
2204        $top.f.e2$i insert 0 [phaseinfo $expgui(curPhase) $var]
2205    } 
2206
2207    grid [button $top.b1 -text Continue \
2208            -command "replacephase1 $top $expgui(curPhase)"] \
2209            -column 0 -row 6 -sticky w
2210    bind $top <Return> "replacephase1 $top $expgui(curPhase)"
2211    grid [button $top.b2 -text Cancel \
2212            -command "destroy $top"] -column 1 -row 6 -sticky w
2213    grid [button $top.help -text Help -bg yellow \
2214            -command "MakeWWWHelp expgui2.html replacephase"] \
2215            -column 2 -row 6
2216
2217    # get the input formats if not already defined
2218    GetImportFormats
2219    if {[llength $expgui(importFormatList)] > 0} {
2220        grid [frame $top.fr -bd 4 -relief groove] \
2221                -column 2 -row 6 -columnspan 8 -sticky e
2222        grid [button $top.fr.b3 -text "Import phase from: " \
2223                -command "ImportPhase \$expgui(importFormat) $top"] \
2224                -column 0 -row 0 -sticky e
2225        set menu [eval tk_optionMenu $top.fr.b4 expgui(importFormat) \
2226                $expgui(importFormatList)]
2227        for {set i 0} {$i <= [$menu index end]} {incr i} {
2228            $menu entryconfig $i -command "ImportPhase \$expgui(importFormat) $top"
2229        }
2230        grid $top.fr.b4 -column 1 -row 0 -sticky w
2231        grid rowconfig $top.fr 0 -pad 10
2232        grid columnconfig $top.fr 0 -pad 10
2233        grid columnconfig $top.fr 1 -pad 10
2234#       grid columnconfig $top 4 -weight 1
2235        grid columnconfig $top 2 -weight 1
2236    }
2237   
2238    wm title $top "Replace phase $expgui(curPhase)"
2239
2240    # set grab, etc.
2241    putontop $top
2242
2243    tkwait window $top
2244
2245    # fix grab...
2246    afterputontop
2247}
2248
2249proc replacephase1 {top phase} {
2250    # validate cell & space group & save to pass
2251    global expgui expmap
2252    set expgui(SetAddAtomsScroll) 0
2253    # validate the input
2254    set err {}
2255    set spg [$top.t2 get]
2256    if {[string trim $spg] == ""} {
2257        append err "  Space group cannot be blank\n"
2258    }
2259    set cell {}
2260    foreach i {a b c a b g} lbl {a b c alpha beta gamma} n {1 1 1 2 2 2} {
2261        set $lbl [$top.f.e${n}$i get]
2262        if {[string trim [set $lbl]] == ""} {
2263            append err "  $lbl cannot be blank\n"
2264        } elseif {[catch {expr [set $lbl]}]} {
2265            append err "  [set $lbl] is not valid for $lbl\n"
2266        }
2267        lappend cell [set $lbl]
2268    }
2269
2270    if {$err != ""} {
2271        MyMessageBox -parent $top -title "Replace Phase Error" -icon warning \
2272                -message "The following error(s) were found in your input:\n$err" 
2273        return
2274    }
2275
2276    # check the space group
2277    set fp [open spg.in w]
2278    puts $fp "N"
2279    puts $fp "N"
2280    puts $fp $spg
2281    puts $fp "Q"
2282    close $fp
2283    global tcl_platform
2284    catch {
2285        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
2286            exec [file join $expgui(gsasexe) spcgroup.exe] < spg.in >& spg.out
2287        } else {
2288            exec [file join $expgui(gsasexe) spcgroup] < spg.in >& spg.out
2289        }
2290    }
2291    set fp [open spg.out r]
2292    set out [read $fp]
2293    close $fp
2294    # attempt to parse out the output (fix up if parse did not work)
2295    if {[regexp "space group symbol.*>(.*)Enter a new space group symbol" \
2296            $out a b ] != 1} {set b $out}
2297    if {[string first Error $b] != -1} {
2298        # got an error, show it
2299        ShowBigMessage \
2300                 $top.error \
2301                 "Error processing space group\nReview error message below" \
2302                 $b OK "" 1
2303        return
2304    } else {
2305        # show the result and confirm
2306        set opt [ShowBigMessage \
2307                $top.check \
2308                "Check the symmetry operators in the output below" \
2309                $b \
2310                {Continue Redo} ]
2311        if {$opt > 1} return
2312    }
2313    file delete spg.in spg.out
2314    # draw coordinates box
2315    eval destroy [winfo children $top]
2316    grid [label $top.l1 -relief groove -bd 4 -anchor center\
2317            -text "Atom list for phase #$phase"] \
2318            -column 0 -row 0 \
2319            -sticky we -columnspan 10
2320    grid [canvas $top.canvas \
2321            -scrollregion {0 0 5000 500} -width 0 -height 250 \
2322            -yscrollcommand "$top.scroll set"] \
2323            -column 0 -row 2 -columnspan 4 -sticky nsew
2324    grid columnconfigure $top 3 -weight 1
2325    grid rowconfigure $top 2 -weight 1
2326    grid rowconfigure $top 1 -pad 5
2327    scrollbar $top.scroll \
2328            -command "$top.canvas yview"
2329    frame $top.canvas.fr
2330    $top.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $top.canvas.fr
2331
2332    set np $top.canvas.fr
2333    set row 0
2334    set col 0
2335    grid [label $np.l_${row}0 -text "  #  "] -column $col -row $row
2336    foreach i {Atom\ntype Name x y z Occ Uiso} \
2337            var {type name x y z occ uiso} {
2338        grid [button $np.l_${row}$i -text $i -padx 0 -pady 0 \
2339                -command "sortAddAtoms $phase $top $var"] \
2340                -column [incr col] -row $row -sticky nsew
2341    }
2342    grid [label $np.l_${row}Use -text Use\nFlag] -column [incr col] -row $row
2343
2344    # add the old atoms, if appropriate
2345    if {!$expgui(DeleteAllAtoms)} {
2346        # loop over all atoms
2347        foreach atom $expmap(atomlist_$phase) {
2348            set row [MakeAddAtomsRow $top]
2349            # add all atoms in the current phase to the list
2350            foreach w {n x y z t o} var {label x y z type frac} {
2351                $np.e${row}$w delete 0 end
2352                $np.e${row}$w insert end [atominfo $phase $atom $var]
2353            }
2354            $np.e${row}u delete 0 end
2355            if {[atominfo $phase $atom temptype] == "I"} {
2356                $np.e${row}u insert end [atominfo $phase $atom Uiso]
2357            } else {
2358                $np.e${row}u insert end [expr ( \
2359                        [atominfo $phase $atom U11] + \
2360                        [atominfo $phase $atom U22] + \
2361                        [atominfo $phase $atom U33]) / 3.]
2362            }
2363        }
2364    }
2365
2366    # add coordinates that have been read in, if any
2367    foreach item $expgui(coordList) {
2368        set row [MakeAddAtomsRow $top]
2369        foreach val $item w {n x y z t o u} {
2370            if {$val != ""} {
2371                $np.e${row}$w delete 0 end
2372                $np.e${row}$w insert end $val
2373            }
2374        }
2375    }
2376    # a blank spot in the table
2377    MakeAddAtomsRow $top
2378
2379    bind $top <Configure> "SetAddAtomsScroll $top"
2380    grid rowconfigure $top 3 -min 10
2381    grid [button $top.b1 -text "Continue"\
2382            -command "replacephase2 $phase $top [list $spg] [list $cell]"] \
2383            -column 0 -row 5 -sticky w
2384    bind $top <Return> "replacephase2 $phase $top [list $spg] [list $cell]"
2385    grid [button $top.b2 -text Cancel \
2386            -command "destroy $top"] -column 1 -row 5 -sticky w
2387    if {[llength $expgui(importFormatList)] > 0} {
2388        grid [frame $top.fr -bd 4 -relief groove] \
2389                -column 3 -row 5 -columnspan 2 -sticky e
2390        grid [button $top.fr.b3 -text "Import atoms from: " \
2391                -command "ImportAtoms \$expgui(importFormat) $top $phase"] \
2392                -column 0 -row 0 -sticky e
2393        set menu [eval tk_optionMenu $top.fr.b4 expgui(importFormat) \
2394                $expgui(importFormatList)]
2395        for {set i 0} {$i <= [$menu index end]} {incr i} {
2396            $menu entryconfig $i -command "ImportAtoms \$expgui(importFormat) $top $phase"
2397        }
2398        grid $top.fr.b4 -column 1 -row 0 -sticky w
2399        grid rowconfig $top.fr 0 -pad 10
2400        grid columnconfig $top.fr 0 -pad 10
2401        grid columnconfig $top.fr 1 -pad 10
2402    }
2403
2404    grid [button $top.b3 -text  "More atom boxes" \
2405            -command "MakeAddAtomsRow $top"] -column 3 \
2406            -columnspan 2 -row 4 -sticky e
2407   
2408    wm title $top "Replacing phase: Enter atoms"
2409    SetAddAtomsScroll $top
2410
2411    # fix grab for old window
2412    afterputontop
2413    # set grab, etc.
2414    putontop $top
2415}
2416
2417proc replacephase2 {phase top spg cell} {
2418    global expgui expmap
2419    # validate coordinates
2420    set np $top.canvas.fr
2421    # validate the atoms info
2422    set atomlist [ValidateAtomsBox $top $np]
2423    if {$atomlist == ""} return
2424
2425    pleasewait "updating phase"
2426    replacephase3 $phase [list $spg] [list $cell] [list $atomlist]
2427
2428    set err 0
2429    if {[llength $atomlist] != [llength $expmap(atomlist_$phase))]} {
2430        set err 1
2431    }
2432    if {$errmsg != ""} {
2433        append errmsg "\n" $out
2434        set err 1
2435    } else {
2436        set errmsg $out
2437    }
2438    donewait 
2439    if {$expgui(showexptool) || $err} {
2440        set msg "Please review the result from adding the atom(s)" 
2441        if {$err} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
2442        ShowBigMessage $top $msg $errmsg OK "" $err
2443    }
2444    # set the powpref warning (2 = required)
2445    set expgui(needpowpref) 2
2446    set msg "A phase was replaced"
2447    if {[string first $msg $expgui(needpowpref_why)] == -1} {
2448        append expgui(needpowpref_why) "\t$msg\n"
2449    }
2450    destroy $top
2451}
2452
2453
2454proc replacephase3 {phase spg cell atomlist} {
2455    global expgui expmap
2456    # replace spacegroup and cell
2457    phaseinfo $phase spacegroup set $spg
2458    RecordMacroEntry "phaseinfo $phase spacegroup set [list $spg]" 0
2459    foreach val $cell var {a b c alpha beta gamma} {
2460        phaseinfo $phase $var set $val
2461        RecordMacroEntry "phaseinfo $phase $var set $val" 0
2462    }
2463    incr expgui(changed) 
2464    # delete all atoms
2465    foreach i $expmap(atomlist_$phase) {
2466        EraseAtom $i $phase
2467        RecordMacroEntry "EraseAtom $i $phase" 0
2468        incr expgui(changed)
2469    }
2470    RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0
2471    # write new atoms from table as input to exptool
2472    set errmsg [runAddAtoms $phase $atomlist]
2473    RecordMacroEntry "runAddAtoms $phase [list $atomlist]" 0
2474}
2475
2476proc sortAddAtoms {phase top sortvar} {
2477    global expgui
2478    set np $top.canvas.fr
2479    set validlist {}
2480    set invalidlist {}
2481    set row 0
2482    while {![catch {grid info $np.e[incr row]t}]} {
2483        set valid 1
2484        set line $row
2485        if !{$expgui(UseAtom$row)} {set valid 0}
2486        lappend line $expgui(UseAtom$row)
2487        if {[set type [string trim [$np.e${row}t get]]] == ""} {set valid 0}
2488        lappend line [string trim [$np.e${row}t get]]
2489        lappend line [string trim [$np.e${row}n get]]
2490        foreach i {x y z o u} {
2491            set tmp [string trim [$np.e${row}$i get]]
2492            lappend line $tmp
2493            if {$tmp == "" || [catch {expr $tmp}]} {set valid 0}
2494        }
2495        if {$valid} {
2496            lappend validlist $line
2497        } else {
2498            lappend invalidlist $line
2499        }
2500    }
2501    switch $sortvar {
2502        type {set sortlist [lsort -index 2 -dictionary $validlist]}
2503        name {set sortlist [lsort -index 3 -dictionary $validlist]}
2504        x {set sortlist [lsort -index 4 -real $validlist]}
2505        y {set sortlist [lsort -index 5 -real $validlist]}
2506        z {set sortlist [lsort -index 6 -real $validlist]}
2507        occ {set sortlist [lsort -index 7 -real $validlist]}
2508        uiso  {set sortlist [lsort -index 8 -real $validlist]}
2509        default {set sortlist $validlist}
2510    }
2511
2512    if {[llength $invalidlist] > 0} {append sortlist " $invalidlist"}
2513    set row 0
2514    foreach line $sortlist {
2515        incr row
2516        set expgui(UseAtom$row) [lindex $line 1]
2517        foreach item [lrange $line 2 end] \
2518                var {t n x y z o u} {
2519            $np.e${row}$var delete 0 end
2520            $np.e${row}$var insert end $item
2521        }
2522    }
2523}
2524
2525proc EditInstFile {"filename {}"} {
2526    global expgui
2527    # on the first call, load the commands
2528    if {[catch {
2529        if {[info procs instMakeWindow] == ""} {
2530            source [file join $expgui(scriptdir) instedit.tcl]
2531        }
2532    } errmsg]} {
2533        MyMessageBox -parent . -title "Load error" \
2534                -message "Unexpected error while sourcing file instedit.tcl: $errmsg" \
2535                -icon error
2536    }
2537    instMakeWindow $filename
2538}
2539
2540# load a list of Origin 1/2 space groups
2541proc GetOrigin12List {} {
2542    # don't need to read the file twice
2543    if {[array names ::Origin1list] != ""} return
2544    set line {}
2545    set fp1 [open [file join $::expgui(scriptdir) spacegrp.ref] r]
2546    while {[lindex $line 1] != 230} {
2547        if {[gets $fp1 line] < 0} break
2548    }
2549    while {[gets $fp1 line] >= 0} {
2550        set key [string tolower [lindex $line 8]]
2551        regsub -all " " $key "" key
2552        regsub -- "-3" $key "3" key
2553        if {$key != ""} {
2554#       puts "$key -- [lindex $line 1] [lindex $line 8] [lindex $line 9]"
2555            set ::Origin1list($key) [lindex $line 9]
2556        }
2557    }
2558    close $fp1
2559}
2560
2561# get the shift to be added to origin 1 coordinates to obtain origin 2 settings
2562proc GetOrigin1Shift {phase} {
2563    GetOrigin12List
2564    set spg [string tolower [phaseinfo $phase spacegroup]]
2565    regsub -all " " $spg "" spg
2566    regsub -- "-3" $spg "3" spg
2567    if {[catch {set shift $::Origin1list($spg)}]} {
2568        return ""
2569    } else {
2570        return $shift
2571    }
2572}
2573
2574proc XformAtoms2Origin2 {phase numberList w1 shift} {
2575    global expgui expmap
2576    set parent [winfo toplevel $w1]
2577    if {[llength $numberList] != [llength $expmap(atomlist_$phase)]} {
2578        # not all atoms were selected in phase -- do a sanity check
2579        set msg {You have selected only some atoms to be shifted. Do you want to shift all atoms or only the selected atoms?}
2580        set val [MyMessageBox -parent $parent -icon warning \
2581                     -type "{Use all} {Use Selection}" -default "use all" \
2582                     -title "Shift all" -message $msg]
2583#       puts "$phase $numberList $w1 $shift"
2584        if {$val == "use all"} {set numberList $expmap(atomlist_$phase)}
2585    }
2586    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
2587        set cmd mmatominfo
2588    } else {
2589        set cmd atominfo
2590    }
2591    foreach atom $numberList {
2592        foreach v {x y z} vs $shift {
2593            set c [$cmd $phase $atom $v]
2594            $cmd $phase $atom $v set [expr {$c + $vs}]
2595            RecordMacroEntry "$cmd $phase $atom $v set [expr {$c + $vs}]" 0
2596        }
2597        incr expgui(changed)
2598    }
2599
2600    RecordMacroEntry "incr expgui(changed)" 0
2601    ResetMultiplicities $phase $parent
2602    SelectOnePhase $phase
2603    MyMessageBox -parent $parent -type OK -default ok -title "Shift applied" \
2604        -message "A shift of \"$shift\" has been added to coordinates of atoms [CompressList $numberList]"
2605#    UpdateAtomLine $numberList $phase
2606    destroy $parent
2607}
2608
2609# reset the site multiplicities using the EXPEDT program
2610proc ResetMultiplicities {phase parent} {
2611    global expgui
2612    set errmsg [RunResetMultiplicities $phase]
2613    RecordMacroEntry "RunResetMultiplicities $phase" 0
2614
2615    if {$expgui(showexptool) || $errmsg != ""} {
2616        if {$errmsg != ""} {
2617            set err 1
2618            append errmsg "\n" $expgui(exptoolout) 
2619        } else {
2620            set err 0
2621            set errmsg $expgui(exptoolout) 
2622        }
2623        set msg "Please review the result from listing the phase." 
2624        if {$errmsg != ""} {append msg "\nIt appears an error occurred!"}
2625        ShowBigMessage $parent.msg $msg $errmsg OK "" $err
2626    }
2627}
2628proc RunResetMultiplicities {phase} {
2629    global expgui tcl_platform
2630    set input [open resetmult.inp w]
2631    puts $input "Y"
2632    puts $input "l a p $phase"
2633    puts $input "l"
2634    puts $input "x x x"
2635    puts $input "x"
2636    close $input
2637    # Save the current exp file
2638    savearchiveexp
2639    # disable the file changed monitor
2640    set expgui(expModifiedLast) 0
2641    set expnam [file root [file tail $expgui(expfile)]]
2642    set err [catch {
2643        if {$tcl_platform(platform) == "windows"} {
2644            exec [file join $expgui(gsasexe) expedt.exe] $expnam < resetmult.inp >& resetmult.out
2645        } else {
2646            exec [file join $expgui(gsasexe) expedt] $expnam < resetmult.inp >& resetmult.out
2647        }
2648    } errmsg]
2649    loadexp $expgui(expfile)
2650    set fp [open resetmult.out r]
2651    set out [read $fp]
2652    close $fp
2653    set expgui(exptoolout) $out
2654    catch {file delete resetmult.inp resetmult.out}
2655    if {$err} {
2656        return $errmsg
2657    } else {
2658        return ""
2659    }
2660}
2661
2662# default values
2663set newhist(insttype) {}
2664set newhist(dummy) 0
2665set newhist(instfiletext) {}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.