source: branches/sandbox/export_drawxtl.tcl

Last change on this file was 1250, checked in by toby, 7 years ago

use svn ps svn:eol-style "native" expgui to change line ends
  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:keywords set to Author Date Revision Id
File size: 26.4 KB
Line 
1# export a phase to DRAWXTL
2#
3# $Id: export_drawxtl.tcl 1250 2014-03-10 21:23:13Z toby $
4# set local variables that define the proc to execute and the menu label
5set label "export to DRAWXTL (.str) file"
6set action export_drawxtl
7set ::DXTLcolorlist "White Red Green Blue Yellow Cyan Magenta Black Orange Brown Grey Silver White"
8set ::DXTL(bonds) 0
9set ::DXTL(coords) 1
10set ::DXTL(blackarrow) Green
11set ::DXTL(redarrow) Red
12foreach a {X Y Z} {
13    set ::DXTL(${a}dispMin) 0.0
14    set ::DXTL(${a}dispMax) 1.0
15}
16set ::DXTL(mtype) ""
17set ::DXTL(mfil) ""
18set ::DXTL(FourierRange) ""
19
20proc export_drawxtl {} {
21    global expmap expgui
22    # don't bother if there are no phases to write
23    if {[llength $expmap(phaselist)] == 0} {
24        MyMessageBox -parent . -title "No phases" \
25                -message "Sorry, no phases are present to write" \
26                -icon warning
27        return
28    }
29    foreach t [trace vinfo ::expgui(export_phase)] {
30        eval trace vdelete ::expgui(export_phase) $t
31    }
32    MakeExportBox .export "Export coordinates to program DRAWXTL" ""
33#           "MakeWWWHelp expgui.html export"
34
35    # trigger a quit on window delete
36    wm protocol .export WM_DELETE_WINDOW {set expgui(export_phase) 0; destroy .export }
37    set bx .export.special
38    set row 1
39    grid [label $bx.1 -text "Title:"] -column 1 -row $row -sticky e
40    grid [entry $bx.2 -textvariable ::DXTL(title) -width 40] \
41        -row $row -column 2 -columnspan 5 -sticky w
42    set ::DXTL(title) [expinfo title]
43    incr row
44    grid [checkbutton $bx.3 -text "Include coordinates in .str file" \
45              -variable ::DXTL(coords)] \
46        -row $row -column 1 -columnspan 5 -sticky w
47    incr row
48    set ::DXTL(arrowbox) $bx.4
49    grid [checkbutton $bx.4 -text "Display arrows for magnetic atoms" \
50              -variable ::DXTL(genarrows) -state disabled] \
51        -row $row -column 1 -columnspan 5 -sticky w
52    incr row
53    set ::DXTL(arrowcolorbox) $bx.4a
54    set ::DXTL(arrowcolorbox_row) $row
55    grid [frame $bx.4a] -sticky ew -row $::DXTL(arrowcolorbox_row) \
56        -column 1 -columnspan 5 
57    grid [label $bx.4a.h -text "Arrow colors: "] -column 0 -row 1 -sticky w
58    grid [label $bx.4a.bll -text "   generated by Black operator "] -column 0 -row 2
59    eval tk_optionMenu $bx.4a.bl ::DXTL(blackarrow) $::DXTLcolorlist
60    grid $bx.4a.bl -column 2 -row 2
61    grid [label $bx.4a.redl -text "  generated by Red operator "] -column 0 -row 3
62    eval tk_optionMenu $bx.4a.red ::DXTL(redarrow) $::DXTLcolorlist
63    grid $bx.4a.red -column 2 -row 3
64    incr row
65    # is DRAWxtl installed?
66    set app {}
67    if {![catch {set fp [open [file join $::env(HOME) .drawxtlrc] r]}]} {
68        # line 12 is name of executable
69        set i 0
70        while {$i < 12} {
71            incr i
72            gets $fp appname
73        }
74        close $fp
75        set app [auto_execok $appname]
76    }
77    if {$app != ""} {
78        set show normal
79        set ::DXTL(app) $appname
80        set ::DXTL(launch) 1
81    } else {
82        set show disabled
83        set ::DXTL(launch) 0
84    }
85    grid [checkbutton $bx.l -text "Launch DRAWxtl" \
86              -variable ::DXTL(launch) -state $show] \
87        -row $row -column 1 -columnspan 5 -sticky w
88    incr row
89    grid [frame $bx.c -relief groove -bd 4] -row $row -column 0 -columnspan 5
90    grid [label $bx.c.0 -text "Range of fractional coordinates to include" \
91              -anchor center] -row 0 -column 0 -columnspan 8
92    foreach v {x y z} V {X Y Z} {
93        incr row
94        grid [label $bx.c.${v}1 -text "${V} min:"] -column 1 -row $row
95        grid [entry $bx.c.${v}2 -textvariable ::DXTL(${v}min) -width 4] -column 2 -row $row
96        grid [scale $bx.c.${v}3 -resolution 0.1 -variable ::DXTL(${v}min) \
97                  -showvalue 0 -orient h -from -2 -to 1] -column 3 -row $row
98        set ::DXTL(${v}min) -0.1
99        grid [label $bx.c.${v}4 -text " max:"] -column 4 -row $row
100        grid [entry $bx.c.${v}5 -textvariable ::DXTL(${v}max) -width 4] -column 5 -row $row
101        grid [scale $bx.c.${v}6 -resolution 0.1 -variable ::DXTL(${v}max) \
102                  -showvalue 0 -orient h -from 0 -to 3] -column 6 -row $row
103        set ::DXTL(${v}max) 1.1
104    }
105    # atom type box
106    grid [frame $bx.s -relief groove -bd 4] -row $row -column 0 -columnspan 5 -sticky nsew
107    grid rowconfigure $bx $row -weight 1
108    grid [label $bx.s.0 -text "Atom representation" \
109              -anchor w] -row 0 -column 0 -sticky w
110    grid [canvas $bx.s.canvas -relief sunk -bd 2 \
111              -scrollregion {0 0 5000 500} -width 250 -height 70 \
112              -yscrollcommand "$bx.s.scroll set" ] \
113        -column 0 -row [incr row] -sticky nsew
114    grid rowconfigure $bx.s $row -weight 1
115    grid columnconfig $bx.s 0 -weight 1
116    frame [set ::DXTL(lb) $bx.s.canvas.fr]
117    $bx.s.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $::DXTL(lb)
118    grid [scrollbar $bx.s.scroll \
119              -command "$bx.s.canvas yview"] -sticky ns -row $row -column 1
120    # bond box
121    incr row
122    grid [frame $bx.b -relief groove -bd 4] -row $row -column 0 -columnspan 5 -sticky ew
123    grid rowconfigure $bx $row -weight 1
124    grid [frame $bx.b.0] -row 0 -column 0 -columnspan 7 -sticky ew
125    grid [label $bx.b.0.1 -text "Bond List" \
126              -anchor w] -row 0 -column 0 -sticky w
127    grid columnconfig $bx.b.0 0 -weight 1
128    grid [button $bx.b.0.b -text "Add Bond" -command DXTLaddBond \
129             ] -row 0 -column 1 -sticky e
130    grid [canvas $bx.b.canvas -relief sunk -bd 2 \
131              -scrollregion {0 0 5000 500} -width 250 -height 70 \
132              -yscrollcommand "$bx.b.scroll set" ] \
133        -column 0 -row [incr row] -sticky nsew
134    grid rowconfigure $bx.b $row -weight 1
135    grid columnconfig $bx.b 0 -weight 1
136    frame [set ::DXTL(Blst) $bx.b.canvas.fr]
137    $bx.b.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $::DXTL(Blst)
138    grid [scrollbar $bx.b.scroll \
139              -command "$bx.b.canvas yview"] -sticky ns -row $row -column 1
140    # Fourier Box
141    incr row
142    grid [frame $bx.f -relief groove -bd 4] -row $row -column 0 -columnspan 5 -sticky nsew
143    grid [frame $bx.f.0] -column 0 -columnspan 3 -row 0 -sticky news
144    grid columnconfig $bx.f.0 0 -weight 1
145    grid [label $bx.f.0.l1 -text "Fourier display" \
146              -anchor w] -row 0 -column 0 -sticky w
147    set ::DXTL(FourierRange) "Range: unknown"
148    grid [label $bx.f.0.l2 -textvariable ::DXTL(FourierRange) \
149              -anchor w] -row 0 -column 1 -sticky e
150    grid [frame $bx.f.1] -column 0 -columnspan 3 -row 1 -sticky news
151    grid [frame $bx.f.2] -column 0 -columnspan 3 -row 2 -sticky news
152    grid [canvas $bx.f.canvas -relief sunk -bd 2 \
153              -scrollregion {0 0 5000 500} -width 250 -height 70 \
154              -yscrollcommand "$bx.f.scroll set" ] \
155        -column 0 -row 3 -sticky nsew
156    grid rowconfigure $bx $row -weight 1
157    grid rowconfigure $bx.f 3 -weight 1
158    grid columnconfig $bx.f 0 -weight 1
159    frame [set ::DXTL(fb) $bx.f.canvas.fr]
160    $bx.f.canvas create window 0 0 -anchor nw -window $::DXTL(fb)
161    grid [scrollbar $bx.f.scroll \
162              -command "$bx.f.canvas yview"] -sticky ns -row 3 -column 2
163    grid [button $bx.f.1.1 -text "Setup\nFourier" \
164              -command {EditFourier $::expgui(export_phase); SetupFourierButtons} \
165             ] -column 0 -row 0
166    grid [button [set ::DXTL(FourCompute) $bx.f.1.2] -text "Compute\nFourier" \
167              -command {DXTLwritegrd $expgui(export_phase)}] -column 1 -row 0
168    grid [label $bx.f.1.3 -text "Select\nMap"] -column 3 -row 0
169    set ::DXTL(fmenu) [tk_optionMenu $bx.f.1.4 ::DXTL(mtype) test]
170    grid $bx.f.1.4 -column 4 -row 0
171    grid [button [set ::DXTL(AddContour) $bx.f.1.5] -text "Add\nContour" \
172              -command AddContour] -column 5 -row 0
173    grid [frame $bx.f.1.f] -column 0 -columnspan 9 -row 1
174    grid [label $bx.f.1.f.0 -text "display\nlimits"] -column 0 -row 0
175    set col 0
176    foreach a {X Y Z} {
177        incr col
178        grid [label $bx.f.1.f.$col -text $a] -column $col -row 0
179        incr col
180        grid [entry $bx.f.1.f.$col -textvariable ::DXTL(${a}dispMin) \
181                  -width 6] -column $col -row 0
182        incr col
183        grid [entry $bx.f.1.f.$col -textvariable ::DXTL(${a}dispMax) \
184                  -width 6] -column $col -row 0
185    }
186    set ::DXTL(contours) 0
187    trace variable ::expgui(export_phase) w OnNewFourierPhase
188    OnNewFourierPhase
189    # this appears to be needed by OSX
190    ResizeWin .export
191    # force the window to stay on top
192    putontop .export
193    SetDXTLatoms
194
195    # Wait for the Write or Quit button to be pressed
196    tkwait window .export
197    afterputontop
198    # test for Quit
199    if {$expgui(export_phase) == 0} {return}
200
201    # now open the file and write it
202    set phase $expgui(export_phase)
203    if [catch {
204        set filnam [file rootname $expgui(expfile)]_${phase}.str
205        set fp [open $filnam w]
206        # deal with macromolecular phases
207        if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
208            MyMessageBox -parent . -title "MM phase" \
209                -message "Sorry, macromolecular phases cannot be processed" \
210                -icon warning
211            return
212        }
213        catch {unset typelist}
214        foreach atom $expmap(atomlist_$phase) {
215            set typelist([atominfo $phase $atom type]) 1
216        }
217        # title info from GSAS title & phase title
218        puts $fp "REM  created by EXPGUI from $expgui(expfile) on [clock format [clock seconds]]"
219        puts $fp "title \"$::DXTL(title)\""
220        puts $fp "pack $::DXTL(xmin) $::DXTL(xmax) $::DXTL(ymin) $::DXTL(ymax) $::DXTL(zmin) $::DXTL(zmax)"
221        puts $fp "edges 0.02 Black"
222        puts $fp "phong 1.0 30."
223        foreach type [array names typelist] {
224            if {$::DXTL(display_$type) == "sphere"} {
225                puts $fp "sphere $type $::DXTL(radius_$type) $::DXTL(color_$type)"
226            } elseif {$::DXTL(display_$type) == "polyhedron"} {
227                puts $fp "polysz $type $::DXTL(radius_$type) $::DXTL(color_$type)"
228            } elseif {$::DXTL(display_$type) == "ellipsoid"} {
229                puts $fp "ellipcolor $type * $::DXTL(color_$type)"
230            }
231        }
232        if {$::DXTL(coords)} {
233            # write out cell parameters
234            puts -nonewline $fp "cell"
235            foreach p {a b c alpha beta gamma} {
236                puts -nonewline $fp " [phaseinfo $phase $p]"
237            }
238            puts $fp ""
239            # write out GSAS spacegroup
240            puts $fp "spgp [phaseinfo $phase spacegroup]"
241            # now loop over atoms
242            foreach atom $expmap(atomlist_$phase) {
243                puts -nonewline $fp "atom [atominfo $phase $atom type] $atom "
244                foreach v {x y z} {
245                    puts -nonewline $fp "[atominfo $phase $atom $v] "
246                }
247                puts $fp ""
248               
249                set uiso [atominfo $phase $atom Uiso]
250                # are there anisotropic atoms? If so convert them to Uequiv
251                if {[atominfo $phase $atom temptype] == "A"} {
252                    puts -nonewline $fp "Uij [atominfo $phase $atom type] $atom "
253                    foreach v {U11 U22 U33 U12 U13 U23} {
254                        puts -nonewline $fp "[atominfo $phase $atom $v] "
255                    }
256                    puts $fp ""
257                }
258            }
259        } else {
260            puts $fp "import gsas [file tail $expgui(expfile)] $phase"
261        }
262        for {set i 1} {$i <= $::DXTL(bonds)} {incr i} {
263            puts $fp "bond $::DXTL(ba_$i) $::DXTL(bb_$i) $::DXTL(bw_$i) $::DXTL(bmin_$i) $::DXTL(bmax_$i) $::DXTL(bc_$i)"
264        }
265        # list arrows, when requested
266        if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] != 1 && \
267                $::DXTL(genarrows)} {
268            DXTLwriteArrows $fp $phase
269        }
270        DXTLwriteFourierCommands $fp
271        puts $fp "END"
272        close $fp
273        if {$::DXTL(launch)} {
274            exec $::DXTL(app) $filnam &
275        }
276    } errmsg] {
277        MyMessageBox -parent . -title "Export error" \
278                -message "Export error: $errmsg" -icon warning
279    } else {
280        MyMessageBox -parent . -title "Done" \
281                -message "File [file tail $filnam] was written"
282    }
283    #catch {unset DXTL}
284    foreach t [trace vinfo expgui(export_phase)] {
285        eval trace vdelete expgui(export_phase) $t
286    }
287 }
288
289# resize windows -- this appears to be needed by OSX 10.2
290proc ResizeWin {win} {
291    update
292    wm geom $win [winfo reqwidth $win]x[winfo reqheight $win]
293    # center the EXPGUI window
294    wm withdraw $win
295    set x [expr [winfo screenwidth $win]/2 - [winfo reqwidth $win]/2 ]
296    set y [expr [winfo screenheight $win]/2 - [winfo reqheight $win]/2]
297    wm geom $win +$x+$y
298    wm deiconify $win
299}
300
301
302# add atoms to atom representation list
303proc SetDXTLatoms {args} {
304    global expgui expmap
305    eval destroy [winfo children $::DXTL(lb)]
306    eval destroy [winfo children $::DXTL(Blst)]
307    set ::DXTL(bonds) 0
308    if {$expgui(export_phase) == 0} {return}
309    set phase $expgui(export_phase)
310    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 4} {
311        MyMessageBox -parent . -title "MM phase" \
312            -message "Sorry, macromolecular phases cannot be processed" \
313            -icon warning
314        return
315    }
316    if {[lindex $expmap(phasetype) [expr {$phase - 1}]] == 1} {
317        set ::DXTL(genarrows) 0
318        $::DXTL(arrowbox) configure -state disabled
319        grid forget $::DXTL(arrowcolorbox) 
320    } else {
321        set ::DXTL(genarrows) 1
322        $::DXTL(arrowbox) configure -state normal
323        grid $::DXTL(arrowcolorbox) -sticky ew -row $::DXTL(arrowcolorbox_row) \
324            -column 1 -columnspan 5
325    }
326    catch {unset typelist}
327    set ::DXTL(title)  [phaseinfo $phase name]
328    foreach atom $expmap(atomlist_$phase) {
329        set typelist([atominfo $phase $atom type]) 1
330    }
331    set ::DXTL(typelist) [array names typelist]
332    set row 0
333    grid [label $::DXTL(lb).l$row -text "type " -bg yellow\
334             ] -column 0 -row $row  -sticky ew
335    grid [label $::DXTL(lb).d$row -text " representation " -bg yellow
336         ] -column 1 -row $row -sticky ew
337    grid [label $::DXTL(lb).e$row -text " radius " -bg yellow\
338             ] -column 2 -row $row -sticky ew
339    grid [label $::DXTL(lb).c$row -text " color " -bg yellow\
340             ] -column 3 -row $row -sticky ew
341    foreach type [array names typelist] {
342        incr row
343        grid [label $::DXTL(lb).l$row -text $type] -column 0 -row $row
344        tk_optionMenu $::DXTL(lb).d$row ::DXTL(display_$type) sphere polyhedron ellipsoid none
345        grid $::DXTL(lb).d$row -column 1 -row $row
346        grid [entry $::DXTL(lb).e$row -textvariable ::DXTL(radius_$type) \
347                -width 5] -column 2 -row $row
348        eval tk_optionMenu $::DXTL(lb).c$row ::DXTL(color_$type) $::DXTLcolorlist
349        grid $::DXTL(lb).c$row -column 3 -row $row
350        set ::DXTL(display_$type) sphere
351        set ::DXTL(radius_$type) 0.2
352        set ::DXTL(color_$type) [lindex $::DXTLcolorlist $row]
353    }
354    # Resize the list
355    update idletasks
356    foreach i {lb Blst fb} {
357        set sizes [grid bbox $::DXTL($i)]
358        [winfo parent $::DXTL($i)] config -scrollregion $sizes  \
359            -width [lindex $sizes 2]
360    }
361    wm geom [winfo toplevel $::DXTL(Blst)] {}
362}
363
364# add bonds to bond list
365proc DXTLaddBond {} {
366    if {$::DXTL(bonds) == 0} {
367        # insert header
368        set row 0
369        grid [label $::DXTL(Blst).a$row -text "from " -bg yellow\
370                 ] -column 1 -row $row  -sticky ew
371        grid [label $::DXTL(Blst).b$row -text " to " -bg yellow\
372                 ] -column 2 -row $row  -sticky ew
373        grid [label $::DXTL(Blst).c$row -text " width " -bg yellow\
374                 ] -column 3 -row $row  -sticky ew
375        grid [label $::DXTL(Blst).d$row -text " min " -bg yellow\
376             ] -column 4 -row $row  -sticky ew
377        grid [label $::DXTL(Blst).e$row -text " max " -bg yellow\
378                 ] -column 5 -row $row  -sticky ew
379        grid [label $::DXTL(Blst).f$row -text " color " -bg yellow\
380                 ] -column 6 -row $row  -sticky ew
381    }
382    set row [incr ::DXTL(bonds)]
383    eval tk_optionMenu $::DXTL(Blst).ta$row ::DXTL(ba_$row) $::DXTL(typelist)
384    grid $::DXTL(Blst).ta$row -column 1 -row $row
385    eval tk_optionMenu $::DXTL(Blst).tb$row ::DXTL(bb_$row) $::DXTL(typelist)
386    grid $::DXTL(Blst).tb$row -column 2 -row $row
387    grid [entry $::DXTL(Blst).w$row -textvariable ::DXTL(bw_$row) \
388              -width 5] -column 3 -row $row
389    grid [entry $::DXTL(Blst).mi$row -textvariable ::DXTL(bmin_$row) \
390              -width 5] -column 4 -row $row
391    grid [entry $::DXTL(Blst).mx$row -textvariable ::DXTL(bmax_$row) \
392              -width 5] -column 5 -row $row
393    eval tk_optionMenu $::DXTL(Blst).c$row ::DXTL(bc_$row) $::DXTLcolorlist
394    grid $::DXTL(Blst).c$row -column 6 -row $row
395    set ::DXTL(bw_$row) 0.02
396    set ::DXTL(bmin_$row) 1.0
397    set ::DXTL(bmax_$row) 2.0
398    set ::DXTL(bc_$row) [lindex $::DXTLcolorlist $row]
399    # Resize the list
400    update
401    set sizes [grid bbox $::DXTL(Blst)]
402    [winfo parent $::DXTL(Blst)] config -scrollregion $sizes \
403        -width [lindex $sizes 2]
404    #set can [winfo parent $::DXTL($i)]
405    #set scroll [winfo parent $can].scroll
406    #[winfo parent $::DXTL($i)] config -scrollregion $sizes
407}
408
409proc DXTLwriteArrows {out phase} {
410    global expgui expmap
411    set fp [open geom.in w]
412    puts $fp "N"
413    puts $fp "M"
414    if {[llength $expmap(phaselist)] > 1} {
415        puts $fp "$phase"
416    }
417    puts $fp "N"
418    puts $fp "X"
419    close $fp
420    catch {
421        if {$::tcl_platform(platform) == "windows"} {
422            exec [file join $expgui(gsasexe) geometry.exe] \
423                [file root $expgui(expfile)] < geom.in >& geom.out
424        } else {
425            exec [file join $expgui(gsasexe) geometry] \
426                [file root $expgui(expfile)] < geom.in >& geom.out
427        }
428        set fp [open geom.out r]
429        while {[gets $fp line] >= 0} {
430            if {[string match "*Geometry*,L,N,*" $line]} {
431                MyMessageBox -parent . -title "Old GSAS" \
432                    -message "Old GEOMETRY program: You are using an old version of GSAS that cannot export magnetic vectors. Upgrade GSAS to generate arrows." -icon warning
433                break
434            }
435            if {[string match "*name*elem*x *y *z*x *y *z*" $line]} {break}
436        }
437        set i 0
438        while {[gets $fp line] >= 0} {
439            if {[string match "*Enter Geometry option*" $line]} {break}
440            incr i
441            if {$i == 2} {
442                set name [string trim [string range $line 5 12]]
443                set tail [string trim [string range $line 22 end]]
444                set pos [lrange $tail 0 2]
445                set spin [lindex $tail end]
446            } elseif {$i == 5} {
447                set vec [string trim [string range $line 22 end]]
448                if {[catch {set count($name)}]} {set count($name) 0}
449                catch {
450                    set k ?
451                    incr count($name)
452                    set k $count($name)
453                }
454                puts $out "rem spin for atom $name # $k ($spin)"
455                if {$spin == "Red"} {
456                    puts $out "arrow $pos     $vec    1. 0.15 $::DXTL(redarrow)"
457                } else {
458                    puts $out "arrow $pos     $vec    1. 0.15 $::DXTL(blackarrow)"
459                }
460            } elseif {$i == 6} {
461                set i 1
462            }
463        }
464    }
465    catch {close $fp}
466    catch {file delete -force geom.in geom.out}
467    puts $out "mag_trans 1. 0 0  0 1. 0  0 0 1."
468}
469
470# Computes a Fourier map(s) and converts the maps from binary to ascii
471#   returns a list of Fourier map types
472proc DXTLwritegrd {phase} {
473    global expgui expmap
474    set lst [listFourier]
475    if {[llength $lst] < 1} {
476        MyMessageBox -parent . -title "No Fourier" \
477            -message "You have not set up to compute a Fourier map." \
478            -icon warning
479        return
480    }
481    set typelist {}
482    foreach l $lst {
483        lappend typelist [Fourierinfo $l type]
484    }
485    set hists [FourierHists $phase]
486    # make sure we have default limits
487    getFourierLimits $phase
488    if {[llength $hists] < 1} {
489        MyMessageBox -parent . -title "No Fourier" \
490            -message "You have not set up to compute a Fourier map for phase $phase." \
491            -icon warning
492        return
493    }
494    if {$::tcl_platform(platform) == "windows"} {
495        set map [file join $expgui(gsasexe) gsas2map.exe]
496        set fourier [file join $expgui(gsasexe) fourier.exe]
497    } else {
498        set map [file join $expgui(gsasexe) gsas2map]
499        set fourier [file join $expgui(gsasexe) fourier]
500    }
501    if {![file exists $map]} {
502        MyMessageBox -parent . -title "No Map Converter prog" \
503            -message "Error Fourier map converter program ($map) not found." \
504            -icon warning
505        return
506    }
507    if {![file exists $fourier]} {
508        MyMessageBox -parent . -title "No Fourier prog" \
509            -message "Error Fourier program ($fourier) not found." \
510            -icon warning
511        return
512    }
513    set fp [open f.in w]
514    if {[OutputFourierType]} {
515        puts $fp [lindex $typelist 0]
516    }
517    puts $fp "E"
518    foreach t [lrange $typelist 1 end] {
519        puts $fp "F $t"
520        puts $fp "E"
521    }
522    puts $fp "q"
523    close $fp
524    # delete any old grd files
525    foreach f [glob -nocomplain "[file root $expgui(expfile)]*.grd"] {
526        catch {file delete -force $f}
527    }
528    set deleteerror 0
529    if {[llength [glob -nocomplain "[file root $expgui(expfile)]*.grd"]] >0} {
530        MyMessageBox -parent . -title "Old grd files?" \
531            -message "Warning: Could not delete old .grd files; it will probably not be possible to overwrite them either. Be aware that map results may be out of date." \
532            -icon warning
533        set deleteerror 1
534    }
535    # Save the current exp file
536    savearchiveexp
537    # disable the file changed monitor
538    set expgui(expModifiedLast) 0
539    catch {
540        exec $fourier [file root $expgui(expfile)] >& f.out
541        exec $map [file root $expgui(expfile)] < f.in >>& f.out
542    }
543    # reset the file changed monitor
544    #loadexp $expgui(expfile)
545    set expgui(expModifiedLast) [file mtime $expgui(expfile)]
546
547    if {[llength [glob -nocomplain "[file root $expgui(expfile)]*.grd"]] == 0} {
548        set fp [open f.out r]
549        set lines {}
550        while {[gets $fp line] >= 0} {
551            append lines $line "\n"
552        }
553        close $fp
554        MyMessageBox -parent . -title "No grd files" \
555            -message "Error: no .grd files were created. See log file below\n\n$lines" \
556            -icon error
557        return {}
558    } else {
559        catch {close $fp}
560        catch {file delete -force f.in f.out}
561        SetupFourierButtons
562        return $typelist
563    }
564}
565
566# called when the phase # is set or changed
567# clean up old Fourier maps
568proc OnNewFourierPhase {args} {
569    SetDXTLatoms
570    if {[llength $::expmap(phaselist)] > 1} {
571        # there is more than one phase; delete any .grd files to make sure
572        # generate ones for the current phase
573        foreach f [glob -nocomplain "[file root $::expgui(expfile)]*.grd"] {
574            catch {file delete -force $f}
575        }
576    }
577    SetupFourierButtons
578    eval destroy [winfo children $::DXTL(fb)]
579    set ::DXTL(contours) 0
580}
581
582# this enables/disables Fourier buttons based on the Fourier setup
583# and the files that are present
584proc SetupFourierButtons {} {
585    if {[catch {
586        set phase $::expgui(export_phase)
587        $::DXTL(FourCompute) config -state disabled
588        $::DXTL(AddContour) config -state disabled
589        $::DXTL(fmenu) delete 0 end
590    }]} return
591    set ::DXTL(mtype) ""
592    set ::DXTL(mfil) ""
593    set ::DXTL(FourierRange) ""
594    # if the Fourier is not set up; return here
595    if {[llength [set nF [listFourier]]] < 1} return
596    # check that all phases are set to current phase
597    foreach i $nF {
598        set ph [Fourierinfo $i phase]
599        if {$ph != $phase} return
600    }
601    if {[llength [FourierHists $phase]] < 1} return
602    # make sure we have default limits
603    getFourierLimits $phase
604    $::DXTL(FourCompute) config -state normal
605    # if there are no maps, return now
606    set maps [glob -nocomplain "[file root $::expgui(expfile)]*.grd"]
607    if {[llength $maps] < 1} return
608    set types {}
609    foreach fil $maps {
610        lappend types [lindex [split [file root [file tail $fil]] "_"] end]
611    }
612    set i 0
613    foreach fil $maps lbl $types {
614        $::DXTL(fmenu) add command -label $lbl \
615            -command "set DXTL(mtype) $lbl; set DXTL(mfil) $fil; GetFourierRange"
616        if {$i == 0} {
617            $::DXTL(fmenu) invoke 0
618            $::DXTL(AddContour) config -state normal
619        }
620        incr i
621    }
622}
623
624proc AddContour {} {
625    # set a header
626    if {$::DXTL(contours) == 0} {
627        set row 0
628        grid [label $::DXTL(fb).a$row -text "Type" -bg yellow \
629                 ] -column 1 -row $row  -sticky ew
630        grid [label $::DXTL(fb).b$row -text "Contour Level" -bg yellow \
631                 ] -column 2 -row $row  -sticky ew
632        grid [label $::DXTL(fb).c$row -text "Color" -bg yellow \
633                 -anchor center] -column 3 -row $row  -sticky ew
634    }
635    set row [incr ::DXTL(contours)]
636    eval tk_optionMenu $::DXTL(fb).ta$row ::DXTL(fb_type_$row) {mesh solid}
637    grid $::DXTL(fb).ta$row -column 1 -row $row
638    grid [entry $::DXTL(fb).w$row -width 10 -textvariable ::DXTL(fb_val_$row) \
639         ] -column 2 -row $row
640    set menu [eval tk_optionMenu $::DXTL(fb).tb$row \
641                  ::DXTL(fb_color_$row) $::DXTLcolorlist]
642    $menu invoke $row
643    grid $::DXTL(fb).tb$row -column 3 -row $row
644    grid [button $::DXTL(fb).del$row -text "Delete"\
645             -command "DeleteFourierContour $row"] -column 4 -row $row
646    update idletasks
647    set sizes [grid bbox $::DXTL(fb)]
648    [winfo parent $::DXTL(fb)] config -scrollregion $sizes \
649        -width [lindex $sizes 2]
650}
651
652proc DeleteFourierContour {row} {
653    foreach i "$::DXTL(fb).ta$row $::DXTL(fb).w$row $::DXTL(fb).tb$row \
654$::DXTL(fb).tb$row $::DXTL(fb).del$row" {
655        catch {destroy $i}
656    }
657    set ::DXTL(fb_val_$i) ""
658    if {$::DXTL(contours) == $row} {incr ::DXTL(contours) -1}
659}
660
661proc GetFourierRange {} {
662    set fp [open f.in w]
663    set lst [listFourier]
664    if {[llength $lst] < 1} {
665        MyMessageBox -parent . -title "No Fourier" \
666            -message "You have not set up to compute a Fourier map." \
667            -icon warning
668        return
669    }
670    set typelist {}
671    foreach l $lst {
672        lappend typelist [Fourierinfo $l type]
673    }
674    if {[OutputFourierType]} {
675        puts $fp $::DXTL(mtype)
676    }
677    close $fp
678    if {$::tcl_platform(platform) == "windows"} {
679        set map [file join $::expgui(gsasexe) forsrh.exe]
680    } else {
681        set map [file join $::expgui(gsasexe) forsrh]
682    }
683    catch {
684        exec $map [file root $::expgui(expfile)] < f.in >& f.out
685    }
686    foreach {min max} {{} {}} {}
687    catch {
688        set fp [open "f.out" r]       
689        while {[gets $fp line] >= 0} {
690            if {[string first "range of map values" $line] != -1} {
691                set off [expr 4 + [string first " is " $line]]
692                foreach {min to max} [string trim [string range $line $off end]] {}
693                break
694            }
695        }
696    }
697    catch {
698        close $fp
699    }
700    if {$min != ""} {set ::DXTL(FourierRange) "Range: $min to $max"}
701}
702
703# is output of the current Fourier map type required as input to a program?
704# answer is yes when more than one map file is present
705proc OutputFourierType {} {
706    set i 0
707    foreach ext {DEL FCL FOB PTS DPT} {
708        if {[file exists [file root $::expgui(expfile)].$ext]} {
709            incr i
710        }
711        for {set i 2} {$i <= 9} {incr i} {
712            if {[file exists [file root $::expgui(expfile)].${i}FD]} {
713                incr i
714            }
715        }
716    }
717    if {$i > 1} {
718        return 1
719    }
720    return 0
721}
722
723proc DXTLwriteFourierCommands {fp} {
724    if {$::DXTL(mfil) == ""} return
725    if {![file exists $::DXTL(mfil)]} {
726        puts "file not found $::DXTL(mfil)"
727        return
728    }
729    set cntlist {}
730    for {set i 1} {$i <= $::DXTL(contours)} {incr i} {
731        set val ""
732        catch {set val $::DXTL(fb_val_$i)}
733        if {[catch {set val [expr 1.*$val]}]} continue
734        lappend cntlist [list $val $::DXTL(fb_type_$i) $::DXTL(fb_color_$i)]       }
735    if {[llength $cntlist] <= 0} return
736    puts $fp "mapread grd [file tail $::DXTL(mfil)] 4"
737    foreach item $cntlist {
738        puts $fp "mapcontour $item"
739    }
740    set s {}
741    foreach a {X Y Z} {
742        lappend s $::DXTL(${a}dispMin)
743        lappend s $::DXTL(${a}dispMax)
744    }
745    puts $fp "mapregion $s"
746}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.